MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 plasmid pMC1

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017189	GAG	2	6	160	165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017189	G	6	6	196	201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017189	CGCC	2	8	224	231	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017189	GAA	2	6	359	364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162395
5	NC_017189	AGA	3	9	406	414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162395
6	NC_017189	ATAC	2	8	415	422	50 %	25 %	0 %	25 %	384162395
7	NC_017189	GGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017189	ACTC	2	8	517	524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017189	CCA	2	6	529	534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017189	CAAA	2	8	551	558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017189	GTTT	2	8	562	569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017189	C	6	6	590	595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_017189	GAA	2	6	596	601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017189	G	6	6	604	609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017189	G	6	6	612	617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017189	CCGT	2	8	641	648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017189	TGG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017189	GTT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162396
19	NC_017189	TGC	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162396
20	NC_017189	AG	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	384162396
21	NC_017189	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	384162396
22	NC_017189	AG	3	6	809	814	50 %	0 %	50 %	0 %	384162396
23	NC_017189	TCC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017189	T	6	6	846	851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017189	TAA	2	6	921	926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017189	A	7	7	925	931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017189	A	7	7	994	1000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017189	T	6	6	1026	1031	0 %	100 %	0 %	0 %	384162397
29	NC_017189	GTT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162397
30	NC_017189	CTC	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162397
31	NC_017189	TCGT	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	384162397
32	NC_017189	AAG	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162397
33	NC_017189	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	384162397
34	NC_017189	TGAT	2	8	1235	1242	25 %	50 %	25 %	0 %	384162398
35	NC_017189	T	7	7	1331	1337	0 %	100 %	0 %	0 %	384162398
36	NC_017189	TAG	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162398
37	NC_017189	TGA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
38	NC_017189	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162399
39	NC_017189	GTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
40	NC_017189	TTC	2	6	1487	1492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
41	NC_017189	T	6	6	1598	1603	0 %	100 %	0 %	0 %	384162399
42	NC_017189	AT	3	6	1671	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	384162399
43	NC_017189	T	6	6	1759	1764	0 %	100 %	0 %	0 %	384162399
44	NC_017189	AAAC	2	8	1773	1780	75 %	0 %	0 %	25 %	384162399
45	NC_017189	TTTC	2	8	1825	1832	0 %	75 %	0 %	25 %	384162399
46	NC_017189	TTG	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
47	NC_017189	GTA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
48	NC_017189	TCA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162399
49	NC_017189	TTC	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
50	NC_017189	ATG	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
51	NC_017189	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
52	NC_017189	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	384162399
53	NC_017189	ATA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162399
54	NC_017189	TCT	2	6	2190	2195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
55	NC_017189	GGCTTT	2	12	2198	2209	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162399
56	NC_017189	TGT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
57	NC_017189	TGT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
58	NC_017189	TGA	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
59	NC_017189	CTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
60	NC_017189	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017189	ACTG	2	8	2564	2571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017189	GAAA	2	8	2591	2598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017189	TG	3	6	2614	2619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017189	AAT	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017189	T	6	6	2703	2708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017189	A	8	8	2710	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017189	GAA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017189	A	7	7	2766	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017189	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017189	TA	3	6	2844	2849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017189	ACA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017189	A	6	6	2866	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017189	TGTC	2	8	2886	2893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017189	GTT	2	6	2904	2909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017189	TAT	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017189	CA	3	6	2949	2954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017189	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017189	T	7	7	2993	2999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017189	GACG	2	8	3085	3092	25 %	0 %	50 %	25 %	384162400
80	NC_017189	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
81	NC_017189	TG	3	6	3268	3273	0 %	50 %	50 %	0 %	384162400
82	NC_017189	TTG	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162400
83	NC_017189	ACTG	2	8	3365	3372	25 %	25 %	25 %	25 %	384162400
84	NC_017189	GAT	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
85	NC_017189	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	384162400
86	NC_017189	ATC	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162400
87	NC_017189	TTA	2	6	3543	3548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162400
88	NC_017189	AGA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
89	NC_017189	ATG	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
90	NC_017189	TGT	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162400
91	NC_017189	GAT	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
92	NC_017189	CGG	2	6	3866	3871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162400
93	NC_017189	GGA	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162400
94	NC_017189	GAA	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
95	NC_017189	A	7	7	4024	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	384162400
96	NC_017189	T	7	7	4052	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017189	ATA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017189	A	6	6	4095	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017189	ATA	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017189	TTAT	2	8	4114	4121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017189	AGG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017189	AGG	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017189	GAA	2	6	4179	4184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
104	NC_017189	T	6	6	4207	4212	0 %	100 %	0 %	0 %	384162401
105	NC_017189	TGA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
106	NC_017189	GAT	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
107	NC_017189	GAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
108	NC_017189	GCG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162401
109	NC_017189	TTG	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162401
110	NC_017189	CTG	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162401
111	NC_017189	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	384162401
112	NC_017189	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
113	NC_017189	ATA	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162401
114	NC_017189	AT	3	6	4603	4608	50 %	50 %	0 %	0 %	384162401
115	NC_017189	GTTT	2	8	4652	4659	0 %	75 %	25 %	0 %	384162401
116	NC_017189	AAG	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
117	NC_017189	TGAT	2	8	4742	4749	25 %	50 %	25 %	0 %	384162401
118	NC_017189	AAG	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
119	NC_017189	TTA	2	6	4851	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162401
120	NC_017189	GGA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162401
121	NC_017189	CTG	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162401
122	NC_017189	CAG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162401
123	NC_017189	TA	3	6	4940	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	384162401
124	NC_017189	TAA	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162401
125	NC_017189	GAA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017189	CTTT	2	8	5103	5110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017189	TTA	2	6	5145	5150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017189	GAA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017189	TCT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162402
130	NC_017189	CGG	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162402
131	NC_017189	TG	3	6	5311	5316	0 %	50 %	50 %	0 %	384162402
132	NC_017189	A	6	6	5362	5367	100 %	0 %	0 %	0 %	384162402
133	NC_017189	TC	3	6	5394	5399	0 %	50 %	0 %	50 %	384162402
134	NC_017189	TTCT	2	8	5409	5416	0 %	75 %	0 %	25 %	384162402
135	NC_017189	TCA	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162402
136	NC_017189	GCT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162402
137	NC_017189	TTCA	2	8	5691	5698	25 %	50 %	0 %	25 %	384162402
138	NC_017189	CGG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162402
139	NC_017189	TGA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162402
140	NC_017189	CAA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162403
141	NC_017189	GAT	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162403
142	NC_017189	AG	3	6	5988	5993	50 %	0 %	50 %	0 %	384162403
143	NC_017189	TG	3	6	6025	6030	0 %	50 %	50 %	0 %	384162403
144	NC_017189	CTG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
145	NC_017189	TTC	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162403
146	NC_017189	T	6	6	6107	6112	0 %	100 %	0 %	0 %	384162403
147	NC_017189	TTC	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162403
148	NC_017189	AG	3	6	6198	6203	50 %	0 %	50 %	0 %	384162403
149	NC_017189	T	6	6	6208	6213	0 %	100 %	0 %	0 %	384162403
150	NC_017189	TGC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
151	NC_017189	GTT	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162403
152	NC_017189	TCA	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162403
153	NC_017189	CTG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
154	NC_017189	GCTT	2	8	6467	6474	0 %	50 %	25 %	25 %	384162403
155	NC_017189	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162403
156	NC_017189	CAG	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162403
157	NC_017189	TCTT	2	8	6555	6562	0 %	75 %	0 %	25 %	384162403
158	NC_017189	CGGA	2	8	6603	6610	25 %	0 %	50 %	25 %	384162403
159	NC_017189	T	6	6	6633	6638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017189	GT	3	6	6725	6730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.