MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p2

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017140	AAAG	2	8	3	10	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017140	TAA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017140	A	6	6	36	41	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017140	AGTTTA	2	12	52	63	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017140	TTC	2	6	88	93	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017140	AAAC	2	8	99	106	75 %	0 %	0 %	25 %	384044080
7	NC_017140	AAG	2	6	115	120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
8	NC_017140	A	7	7	159	165	100 %	0 %	0 %	0 %	384044080
9	NC_017140	A	8	8	173	180	100 %	0 %	0 %	0 %	384044080
10	NC_017140	TAC	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044080
11	NC_017140	AAAT	2	8	206	213	75 %	25 %	0 %	0 %	384044080
12	NC_017140	GAAA	2	8	257	264	75 %	0 %	25 %	0 %	384044080
13	NC_017140	GAA	2	6	316	321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
14	NC_017140	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
15	NC_017140	TTC	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044080
16	NC_017140	TA	4	8	436	443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017140	ATA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017140	TAT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017140	T	7	7	559	565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017140	TAG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017140	ATA	3	9	635	643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017140	ATTA	2	8	658	665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017140	TAT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017140	AAAC	2	8	736	743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017140	ATTA	2	8	752	759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017140	TAA	4	12	762	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017140	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017140	TA	4	8	804	811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017140	TAC	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017140	TTAAT	2	10	835	844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017140	CTA	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017140	TCA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017140	GGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017140	ATA	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017140	CTACA	2	10	1250	1259	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017140	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017140	TA	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017140	TC	3	6	1409	1414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017140	TAAA	2	8	1424	1431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017140	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017140	ATGA	2	8	1495	1502	50 %	25 %	25 %	0 %	384044081
42	NC_017140	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
43	NC_017140	TTA	2	6	1607	1612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
44	NC_017140	A	6	6	1623	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
45	NC_017140	A	7	7	1688	1694	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
46	NC_017140	TC	3	6	1699	1704	0 %	50 %	0 %	50 %	384044081
47	NC_017140	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044081
48	NC_017140	CA	3	6	1761	1766	50 %	0 %	0 %	50 %	384044081
49	NC_017140	A	7	7	1779	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
50	NC_017140	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
51	NC_017140	AAT	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044081
52	NC_017140	CAA	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
53	NC_017140	GCT	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044081
54	NC_017140	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
55	NC_017140	AACA	2	8	1978	1985	75 %	0 %	0 %	25 %	384044081
56	NC_017140	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
57	NC_017140	AAAT	2	8	2030	2037	75 %	25 %	0 %	0 %	384044081
58	NC_017140	ATG	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044081
59	NC_017140	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	384044081
60	NC_017140	TTC	2	6	2070	2075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044081
61	NC_017140	ACA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
62	NC_017140	AGC	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044081
63	NC_017140	ACA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
64	NC_017140	GAA	3	9	2128	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
65	NC_017140	A	8	8	2138	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
66	NC_017140	ATT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
67	NC_017140	TG	3	6	2237	2242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017140	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017140	CA	3	6	2253	2258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017140	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017140	T	6	6	2314	2319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017140	A	6	6	2326	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017140	TAA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017140	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017140	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017140	A	6	6	2503	2508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017140	ATG	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017140	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017140	AAT	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
80	NC_017140	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	384044082
81	NC_017140	T	6	6	2585	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	384044082
82	NC_017140	TTA	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044082
83	NC_017140	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
84	NC_017140	CAA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044082
85	NC_017140	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	384044082
86	NC_017140	TAA	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
87	NC_017140	A	6	6	2877	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	384044082
88	NC_017140	TTC	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
89	NC_017140	TTTC	2	8	2972	2979	0 %	75 %	0 %	25 %	384044083
90	NC_017140	CAAGTT	2	12	3030	3041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044083
91	NC_017140	TC	3	6	3074	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	384044083
92	NC_017140	TTTA	2	8	3100	3107	25 %	75 %	0 %	0 %	384044083
93	NC_017140	TCC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044083
94	NC_017140	GAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017140	TCCT	2	8	3208	3215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017140	AAG	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044084
97	NC_017140	ATC	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
98	NC_017140	TCA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
99	NC_017140	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044084
100	NC_017140	TCA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
101	NC_017140	TTC	2	6	3744	3749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017140	GCT	3	9	3766	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
103	NC_017140	CAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044085
104	NC_017140	ATCTT	2	10	3810	3819	20 %	60 %	0 %	20 %	384044085
105	NC_017140	T	6	6	3856	3861	0 %	100 %	0 %	0 %	384044085
106	NC_017140	CTT	3	9	3865	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
107	NC_017140	GTC	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
108	NC_017140	TTCT	2	8	3931	3938	0 %	75 %	0 %	25 %	384044085
109	NC_017140	TC	3	6	3941	3946	0 %	50 %	0 %	50 %	384044085
110	NC_017140	TGT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044085
111	NC_017140	TTC	2	6	3978	3983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
112	NC_017140	TCT	2	6	4005	4010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
113	NC_017140	GAA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044085
114	NC_017140	CTT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
115	NC_017140	CT	3	6	4074	4079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017140	TC	3	6	4136	4141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017140	TG	3	6	4205	4210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017140	ATG	3	9	4328	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017140	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017140	TCA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017140	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017140	GCT	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
123	NC_017140	GTG	2	6	4507	4512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
124	NC_017140	ATG	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
125	NC_017140	CAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
126	NC_017140	TGG	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
127	NC_017140	CCAT	2	8	4792	4799	25 %	25 %	0 %	50 %	384044086
128	NC_017140	CAT	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044086
129	NC_017140	AGAA	2	8	4869	4876	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
130	NC_017140	CCAA	2	8	4984	4991	50 %	0 %	0 %	50 %	384044086
131	NC_017140	TTC	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044086
132	NC_017140	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
133	NC_017140	AGCG	2	8	5118	5125	25 %	0 %	50 %	25 %	384044086
134	NC_017140	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044086
135	NC_017140	A	6	6	5212	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	384044086
136	NC_017140	GAAA	2	8	5219	5226	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
137	NC_017140	AAG	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
138	NC_017140	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
139	NC_017140	CAA	3	9	5394	5402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
140	NC_017140	ATA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044086
141	NC_017140	TGA	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
142	NC_017140	CGT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
143	NC_017140	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044086
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257	NC_017140	TA	3	6	9685	9690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.