MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. S23321

Total Repeats: 180391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017082	CGC	2	6	644646	644651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768889
16003	NC_017082	CAG	2	6	644652	644657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768889
16004	NC_017082	GC	3	6	644667	644672	0 %	0 %	50 %	50 %	383768889
16005	NC_017082	GC	5	10	644677	644686	0 %	0 %	50 %	50 %	383768889
16006	NC_017082	GGC	2	6	644784	644789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768889
16007	NC_017082	GAT	2	6	644814	644819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768889
16008	NC_017082	CGC	2	6	644825	644830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768889
16009	NC_017082	CG	3	6	645147	645152	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16010	NC_017082	CG	3	6	645184	645189	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16011	NC_017082	GCT	2	6	645323	645328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768890
16012	NC_017082	CGA	2	6	645383	645388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768890
16013	NC_017082	GC	3	6	645392	645397	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16014	NC_017082	CG	3	6	645410	645415	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16015	NC_017082	CCGCG	2	10	645416	645425	0 %	0 %	40 %	60 %	383768890
16016	NC_017082	CG	3	6	645489	645494	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16017	NC_017082	ACG	2	6	645496	645501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768890
16018	NC_017082	CG	3	6	645504	645509	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16019	NC_017082	CGG	2	6	645515	645520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768890
16020	NC_017082	GCT	2	6	645533	645538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768890
16021	NC_017082	CGC	2	6	645557	645562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768890
16022	NC_017082	AGCCG	2	10	645569	645578	20 %	0 %	40 %	40 %	383768890
16023	NC_017082	CAG	2	6	645585	645590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768890
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16027	NC_017082	TGC	2	6	645652	645657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768890
16028	NC_017082	CG	3	6	645692	645697	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16029	NC_017082	GCG	2	6	645750	645755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768890
16030	NC_017082	GGT	2	6	645774	645779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768890
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16033	NC_017082	CG	4	8	645910	645917	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16034	NC_017082	CG	3	6	645940	645945	0 %	0 %	50 %	50 %	383768890
16035	NC_017082	TCG	2	6	645988	645993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768890
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16039	NC_017082	GC	4	8	646225	646232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_017082	TTC	2	6	646282	646287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768891
16041	NC_017082	CGTC	2	8	646295	646302	0 %	25 %	25 %	50 %	383768891
16042	NC_017082	GCAG	2	8	646426	646433	25 %	0 %	50 %	25 %	383768891
16043	NC_017082	GCC	2	6	646477	646482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768891
16044	NC_017082	CGC	2	6	646491	646496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768891
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16048	NC_017082	CGA	2	6	646682	646687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768891
16049	NC_017082	CGC	2	6	646749	646754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768891
16050	NC_017082	CG	3	6	646825	646830	0 %	0 %	50 %	50 %	383768891
16051	NC_017082	AGC	2	6	646843	646848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768891
16052	NC_017082	CGG	2	6	646875	646880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768891
16053	NC_017082	CAG	2	6	646901	646906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768891
16054	NC_017082	GCCT	2	8	646989	646996	0 %	25 %	25 %	50 %	383768891
16055	NC_017082	GTCAGC	2	12	646999	647010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383768891
16056	NC_017082	CGG	2	6	647078	647083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768891
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16058	NC_017082	GGC	2	6	647106	647111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768891
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16061	NC_017082	CAT	2	6	647319	647324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768892
16062	NC_017082	CGA	2	6	647420	647425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768892
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16069	NC_017082	ATC	2	6	647684	647689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768892
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16072	NC_017082	CGG	2	6	647727	647732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768892
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16082	NC_017082	GCG	2	6	648033	648038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768893
16083	NC_017082	GCC	2	6	648040	648045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768893
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16088	NC_017082	CAT	2	6	648193	648198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768893
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16090	NC_017082	CCGGA	2	10	648224	648233	20 %	0 %	40 %	40 %	383768893
16091	NC_017082	CG	3	6	648291	648296	0 %	0 %	50 %	50 %	383768893
16092	NC_017082	GCC	2	6	648336	648341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16093	NC_017082	CGC	3	9	648361	648369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768894
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16099	NC_017082	GCCG	2	8	648588	648595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_017082	GGC	2	6	648609	648614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_017082	CGA	2	6	648638	648643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_017082	TCG	2	6	648687	648692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_017082	CGG	2	6	648759	648764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768895
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16105	NC_017082	GCGA	2	8	648818	648825	25 %	0 %	50 %	25 %	383768895
16106	NC_017082	GAG	2	6	648918	648923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768895
16107	NC_017082	GTT	2	6	648983	648988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_017082	GTT	2	6	649013	649018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_017082	CAG	2	6	649063	649068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_017082	CGG	3	9	649091	649099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_017082	CTC	2	6	649111	649116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_017082	C	6	6	649148	649153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16113	NC_017082	GTC	2	6	649171	649176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_017082	GCA	2	6	649210	649215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_017082	CA	3	6	649230	649235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16116	NC_017082	TCCG	2	8	649338	649345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_017082	GCC	2	6	649373	649378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_017082	CAC	2	6	649410	649415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_017082	CT	3	6	649491	649496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16120	NC_017082	GCT	2	6	649532	649537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_017082	GTC	2	6	649595	649600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768896
16122	NC_017082	GC	3	6	649624	649629	0 %	0 %	50 %	50 %	383768896
16123	NC_017082	CGA	2	6	649681	649686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768896
16124	NC_017082	GCT	2	6	649723	649728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768896
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16147	NC_017082	GCAA	2	8	650799	650806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16164	NC_017082	TAAG	2	8	651530	651537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16165	NC_017082	GCG	2	6	651540	651545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16167	NC_017082	GGA	2	6	651775	651780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16228	NC_017082	GACC	2	8	654112	654119	25 %	0 %	25 %	50 %	383768899
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16231	NC_017082	CGT	2	6	654172	654177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768899
16232	NC_017082	GCT	3	9	654181	654189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768899
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16237	NC_017082	CG	3	6	654330	654335	0 %	0 %	50 %	50 %	383768899
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16240	NC_017082	CAT	2	6	654394	654399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768899
16241	NC_017082	TGA	2	6	654450	654455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768899
16242	NC_017082	CTG	2	6	654467	654472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768899
16243	NC_017082	AGC	2	6	654534	654539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768899
16244	NC_017082	TGA	3	9	654549	654557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768899
16245	NC_017082	CGA	2	6	654577	654582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768899
16246	NC_017082	CAT	2	6	654634	654639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768899
16247	NC_017082	GAG	2	6	654641	654646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768899
16248	NC_017082	ATCGGC	2	12	654680	654691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383768899
16249	NC_017082	TGACG	2	10	654694	654703	20 %	20 %	40 %	20 %	383768899
16250	NC_017082	TAT	2	6	654707	654712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383768899
16251	NC_017082	CGC	2	6	654713	654718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768899
16252	NC_017082	GAA	2	6	654740	654745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383768899
16253	NC_017082	CGG	2	6	654748	654753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768899
16254	NC_017082	CCGG	2	8	654812	654819	0 %	0 %	50 %	50 %	383768899
16255	NC_017082	GC	3	6	654848	654853	0 %	0 %	50 %	50 %	383768900
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16263	NC_017082	CG	3	6	655055	655060	0 %	0 %	50 %	50 %	383768900
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16271	NC_017082	CG	3	6	655403	655408	0 %	0 %	50 %	50 %	383768900
16272	NC_017082	CGG	2	6	655433	655438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768900
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16281	NC_017082	GCT	2	6	655659	655664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768900
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16283	NC_017082	ATCG	2	8	655731	655738	25 %	25 %	25 %	25 %	383768900
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16290	NC_017082	GCT	3	9	655893	655901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768900
16291	NC_017082	TGG	2	6	655913	655918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768900
16292	NC_017082	GTC	2	6	655951	655956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16294	NC_017082	CCCT	2	8	656037	656044	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16295	NC_017082	TGCG	2	8	656060	656067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16296	NC_017082	GAC	2	6	656072	656077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16297	NC_017082	CG	3	6	656113	656118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16298	NC_017082	TCC	2	6	656213	656218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16299	NC_017082	GAA	2	6	656274	656279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383768901
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16301	NC_017082	GAC	2	6	656317	656322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768901
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16304	NC_017082	GCCG	2	8	656539	656546	0 %	0 %	50 %	50 %	383768901
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16315	NC_017082	GTC	2	6	656922	656927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768901
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16327	NC_017082	CATCG	2	10	657379	657388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16328	NC_017082	CTG	2	6	657429	657434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16330	NC_017082	GCG	2	6	657655	657660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768902
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16346	NC_017082	GC	4	8	658166	658173	0 %	0 %	50 %	50 %	383768903
16347	NC_017082	TGA	2	6	658181	658186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768903
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16349	NC_017082	CGG	2	6	658276	658281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16350	NC_017082	GAT	2	6	658291	658296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16351	NC_017082	GAT	2	6	658305	658310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16352	NC_017082	GCG	2	6	658353	658358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16353	NC_017082	GGAGGG	2	12	658392	658403	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
16354	NC_017082	CG	3	6	658409	658414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16355	NC_017082	GGGGT	2	10	658425	658434	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16356	NC_017082	TC	3	6	658437	658442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16357	NC_017082	CACCC	2	10	658474	658483	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16358	NC_017082	CCCTCC	2	12	658514	658525	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	383768904
16359	NC_017082	CAC	2	6	658646	658651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768904
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16361	NC_017082	CG	3	6	658684	658689	0 %	0 %	50 %	50 %	383768904
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16363	NC_017082	CGC	2	6	658922	658927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768904
16364	NC_017082	TCG	2	6	658929	658934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768904
16365	NC_017082	ATC	2	6	658935	658940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768904
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16373	NC_017082	ATGG	2	8	659267	659274	25 %	25 %	50 %	0 %	383768904
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16387	NC_017082	TGG	2	6	659909	659914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16403	NC_017082	GC	3	6	660320	660325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16481	NC_017082	CAA	2	6	664753	664758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16489	NC_017082	CGG	2	6	665056	665061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16490	NC_017082	GCA	2	6	665163	665168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16491	NC_017082	AGG	2	6	665190	665195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16492	NC_017082	AGA	2	6	665263	665268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16493	NC_017082	GT	3	6	665309	665314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_017082	CAAA	2	8	665318	665325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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