MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC3

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016793	AGTG	2	8	6	13	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016793	TCC	2	6	27	32	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016793	AC	3	6	65	70	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016793	CTACCT	2	12	80	91	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016793	CT	3	6	138	143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016793	TTA	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016793	ACC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016793	A	7	7	204	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016793	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016793	ATA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016793	A	7	7	303	309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016793	CT	4	8	550	557	0 %	50 %	0 %	50 %	374858102
13	NC_016793	AGAT	2	8	572	579	50 %	25 %	25 %	0 %	374858102
14	NC_016793	A	6	6	595	600	100 %	0 %	0 %	0 %	374858102
15	NC_016793	ACT	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374858102
16	NC_016793	A	6	6	675	680	100 %	0 %	0 %	0 %	374858102
17	NC_016793	GAA	2	6	721	726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374858102
18	NC_016793	ATGG	2	8	803	810	25 %	25 %	50 %	0 %	374858102
19	NC_016793	ACCCA	2	10	861	870	40 %	0 %	0 %	60 %	374858102
20	NC_016793	TACT	2	8	879	886	25 %	50 %	0 %	25 %	374858102
21	NC_016793	CATG	2	8	968	975	25 %	25 %	25 %	25 %	374858102
22	NC_016793	ATT	3	9	1001	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374858102
23	NC_016793	AT	3	6	1088	1093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016793	TTATT	2	10	1154	1163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016793	TTTTA	2	10	1164	1173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016793	GTG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016793	GAAGC	2	10	1216	1225	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016793	GGT	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016793	A	6	6	1406	1411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016793	T	6	6	1420	1425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016793	A	6	6	1439	1444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016793	TAC	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016793	AT	3	6	1515	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016793	AGA	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016793	AT	3	6	1619	1624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016793	CTT	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016793	A	6	6	1690	1695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016793	A	6	6	1726	1731	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
39	NC_016793	A	6	6	1761	1766	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
40	NC_016793	ATT	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374858103
41	NC_016793	A	7	7	1792	1798	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
42	NC_016793	A	6	6	1815	1820	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
43	NC_016793	A	7	7	1828	1834	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
44	NC_016793	TTCA	2	8	1845	1852	25 %	50 %	0 %	25 %	374858103
45	NC_016793	TTTA	2	8	2083	2090	25 %	75 %	0 %	0 %	374858103
46	NC_016793	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
47	NC_016793	ACG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374858103
48	NC_016793	A	6	6	2169	2174	100 %	0 %	0 %	0 %	374858103
49	NC_016793	TA	4	8	2187	2194	50 %	50 %	0 %	0 %	374858103
50	NC_016793	GTA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016793	TTTA	2	8	2273	2280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016793	GTT	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374858104
53	NC_016793	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
54	NC_016793	TATC	2	8	2354	2361	25 %	50 %	0 %	25 %	374858104
55	NC_016793	TAA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374858104
56	NC_016793	T	7	7	2424	2430	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
57	NC_016793	T	6	6	2640	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
58	NC_016793	ATT	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374858104
59	NC_016793	CAA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374858104
60	NC_016793	CTTTTT	2	12	2729	2740	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374858104
61	NC_016793	T	7	7	2736	2742	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
62	NC_016793	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	374858104
63	NC_016793	AAC	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374858104
64	NC_016793	TTTTC	2	10	2768	2777	0 %	80 %	0 %	20 %	374858104
65	NC_016793	TC	4	8	2776	2783	0 %	50 %	0 %	50 %	374858104
66	NC_016793	TCGT	2	8	2811	2818	0 %	50 %	25 %	25 %	374858104
67	NC_016793	TTTTC	2	10	2837	2846	0 %	80 %	0 %	20 %	374858104
68	NC_016793	AAAG	2	8	2863	2870	75 %	0 %	25 %	0 %	374858104
69	NC_016793	T	7	7	2890	2896	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
70	NC_016793	ATTC	2	8	2903	2910	25 %	50 %	0 %	25 %	374858104
71	NC_016793	ATT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374858104
72	NC_016793	TCT	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374858104
73	NC_016793	CTT	2	6	2987	2992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374858104
74	NC_016793	ATC	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374858104
75	NC_016793	TTG	2	6	3039	3044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374858104
76	NC_016793	TG	3	6	3125	3130	0 %	50 %	50 %	0 %	374858104
77	NC_016793	TCA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374858104
78	NC_016793	ATGA	2	8	3147	3154	50 %	25 %	25 %	0 %	374858104
79	NC_016793	TTC	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374858104
80	NC_016793	ATC	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374858104
81	NC_016793	AAT	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374858104
82	NC_016793	T	7	7	3302	3308	0 %	100 %	0 %	0 %	374858104
83	NC_016793	TCA	2	6	3334	3339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374858104
84	NC_016793	TTTG	2	8	3359	3366	0 %	75 %	25 %	0 %	374858104
85	NC_016793	TTC	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374858104
86	NC_016793	ATTT	2	8	3437	3444	25 %	75 %	0 %	0 %	374858104
87	NC_016793	AAT	2	6	3458	3463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374858104
88	NC_016793	CTT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374858104
89	NC_016793	GA	3	6	3546	3551	50 %	0 %	50 %	0 %	374858104
90	NC_016793	A	6	6	3721	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016793	CTG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.