MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus F837/76 plasmid pF837_10

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016780	TCTTT	2	10	13	22	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016780	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016780	CCGG	2	8	49	56	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016780	ACC	2	6	135	140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016780	TCGCT	2	10	209	218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016780	T	6	6	290	295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016780	AAT	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269860
8	NC_016780	GAA	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269860
9	NC_016780	T	7	7	408	414	0 %	100 %	0 %	0 %	376269860
10	NC_016780	GAA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269860
11	NC_016780	TCT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269860
12	NC_016780	TAA	2	6	541	546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016780	T	8	8	547	554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016780	AT	3	6	564	569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016780	CA	3	6	593	598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016780	TTA	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016780	TGTA	2	8	647	654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016780	TAA	2	6	660	665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016780	T	6	6	774	779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016780	GTCAA	2	10	833	842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016780	A	7	7	850	856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016780	ATA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016780	TATTT	2	10	925	934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016780	AT	3	6	982	987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016780	A	7	7	1008	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	376269861
26	NC_016780	AGA	4	12	1167	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269861
27	NC_016780	GAAA	2	8	1191	1198	75 %	0 %	25 %	0 %	376269861
28	NC_016780	AG	3	6	1203	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	376269861
29	NC_016780	AAC	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269861
30	NC_016780	ATT	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269861
31	NC_016780	ACG	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016780	ATGT	2	8	1555	1562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016780	AAG	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016780	GTT	2	6	1615	1620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016780	TAA	2	6	1624	1629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016780	AAATA	2	10	1630	1639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016780	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016780	ATA	2	6	1806	1811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269862
39	NC_016780	TC	3	6	1812	1817	0 %	50 %	0 %	50 %	376269862
40	NC_016780	CAA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269862
41	NC_016780	A	6	6	1992	1997	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
42	NC_016780	TCC	2	6	2012	2017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376269862
43	NC_016780	TAG	3	9	2049	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269862
44	NC_016780	TGA	3	9	2071	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269862
45	NC_016780	TTG	2	6	2120	2125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269862
46	NC_016780	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269862
47	NC_016780	TTC	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269862
48	NC_016780	TGC	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269862
49	NC_016780	TGC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269862
50	NC_016780	CAG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269862
51	NC_016780	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
52	NC_016780	AAAT	2	8	2329	2336	75 %	25 %	0 %	0 %	376269862
53	NC_016780	TCAT	2	8	2415	2422	25 %	50 %	0 %	25 %	376269862
54	NC_016780	GTCCTA	2	12	2461	2472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376269862
55	NC_016780	T	7	7	2552	2558	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
56	NC_016780	T	6	6	2586	2591	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
57	NC_016780	TC	4	8	2599	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	376269862
58	NC_016780	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
59	NC_016780	CAT	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376269862
60	NC_016780	T	6	6	2717	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
61	NC_016780	AT	3	6	2727	2732	50 %	50 %	0 %	0 %	376269862
62	NC_016780	TCC	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016780	ATTTT	2	10	2753	2762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016780	AT	4	8	2800	2807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016780	TA	3	6	2810	2815	50 %	50 %	0 %	0 %	376269863
66	NC_016780	TTC	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269863
67	NC_016780	TTTTG	2	10	2886	2895	0 %	80 %	20 %	0 %	376269863
68	NC_016780	TTAT	2	8	2990	2997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016780	ATT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016780	AAG	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016780	GT	3	6	3113	3118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016780	AATT	2	8	3127	3134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016780	A	6	6	3168	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016780	AGG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016780	GAA	2	6	3218	3223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016780	GGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016780	TTGCC	2	10	3322	3331	0 %	40 %	20 %	40 %	376269864
78	NC_016780	GGA	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376269864
79	NC_016780	AAT	3	9	3365	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269864
80	NC_016780	T	6	6	3381	3386	0 %	100 %	0 %	0 %	376269864
81	NC_016780	AAG	2	6	3434	3439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269864
82	NC_016780	ACAGA	2	10	3530	3539	60 %	0 %	20 %	20 %	376269864
83	NC_016780	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269864
84	NC_016780	CAA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269864
85	NC_016780	ATA	2	6	3647	3652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269864
86	NC_016780	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269864
87	NC_016780	AGC	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269864
88	NC_016780	GTC	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269864
89	NC_016780	TAAA	2	8	3766	3773	75 %	25 %	0 %	0 %	376269864
90	NC_016780	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016780	AAG	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016780	TTTA	2	8	3806	3813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016780	CTT	2	6	3833	3838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016780	ATGAT	2	10	3868	3877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016780	T	6	6	3880	3885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016780	TA	3	6	3968	3973	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
97	NC_016780	T	6	6	3974	3979	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
98	NC_016780	TTTAA	2	10	3988	3997	40 %	60 %	0 %	0 %	376269865
99	NC_016780	TTG	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
100	NC_016780	TTA	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
101	NC_016780	T	6	6	4074	4079	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
102	NC_016780	TATTTT	2	12	4130	4141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	376269865
103	NC_016780	TAT	2	6	4149	4154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
104	NC_016780	CATT	2	8	4178	4185	25 %	50 %	0 %	25 %	376269865
105	NC_016780	TTAA	2	8	4258	4265	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
106	NC_016780	TA	3	6	4362	4367	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
107	NC_016780	T	6	6	4420	4425	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
108	NC_016780	TAG	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269865
109	NC_016780	TGT	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
110	NC_016780	T	6	6	4531	4536	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
111	NC_016780	TAT	3	9	4559	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
112	NC_016780	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
113	NC_016780	CCT	2	6	4624	4629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376269865
114	NC_016780	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
115	NC_016780	T	6	6	4675	4680	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
116	NC_016780	AAG	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269865
117	NC_016780	TTTTC	2	10	4753	4762	0 %	80 %	0 %	20 %	376269865
118	NC_016780	ACTTGA	2	12	4795	4806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	376269865
119	NC_016780	T	8	8	4812	4819	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
120	NC_016780	GA	3	6	4826	4831	50 %	0 %	50 %	0 %	376269865
121	NC_016780	TTG	2	6	4835	4840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
122	NC_016780	TATTT	2	10	4845	4854	20 %	80 %	0 %	0 %	376269865
123	NC_016780	T	6	6	4852	4857	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
124	NC_016780	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376269865
125	NC_016780	AAT	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269865
126	NC_016780	AGC	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269865
127	NC_016780	TTC	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269865
128	NC_016780	A	6	6	4999	5004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016780	TTG	2	6	5053	5058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016780	GTG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016780	TAT	2	6	5169	5174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016780	TAT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269866
133	NC_016780	AAT	3	9	5307	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269866
134	NC_016780	T	6	6	5401	5406	0 %	100 %	0 %	0 %	376269867
135	NC_016780	TAT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269867
136	NC_016780	ATT	2	6	5498	5503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269867
137	NC_016780	TAA	2	6	5508	5513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269867
138	NC_016780	T	6	6	5519	5524	0 %	100 %	0 %	0 %	376269867
139	NC_016780	GAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016780	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016780	CTT	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016780	TTTTA	2	10	5663	5672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016780	AGA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016780	A	6	6	5766	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016780	T	7	7	5794	5800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.