MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 50327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_016626	GGAT	2	8	1838046	1838053	25 %	25 %	50 %	0 %	377812165
48003	NC_016626	GGC	2	6	1838077	1838082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812165
48004	NC_016626	CGC	2	6	1838397	1838402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48005	NC_016626	CAT	2	6	1838404	1838409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48006	NC_016626	TGCT	2	8	1838433	1838440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48007	NC_016626	CCAG	2	8	1838490	1838497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48008	NC_016626	CGTA	2	8	1838859	1838866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48009	NC_016626	ATCC	2	8	1838959	1838966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48010	NC_016626	CAA	2	6	1839033	1839038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48011	NC_016626	GAT	2	6	1839052	1839057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48012	NC_016626	T	6	6	1839072	1839077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48013	NC_016626	AGC	2	6	1839227	1839232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48014	NC_016626	GAT	2	6	1839233	1839238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48015	NC_016626	TAA	3	9	1839248	1839256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48016	NC_016626	TG	3	6	1839330	1839335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48017	NC_016626	CGC	2	6	1839380	1839385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48018	NC_016626	GCA	2	6	1839461	1839466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48019	NC_016626	GAC	2	6	1839515	1839520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48020	NC_016626	CGT	2	6	1839637	1839642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812166
48021	NC_016626	TCTGG	2	10	1839657	1839666	0 %	40 %	40 %	20 %	377812166
48022	NC_016626	CAA	2	6	1839668	1839673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812166
48023	NC_016626	TCG	2	6	1839688	1839693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812166
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48026	NC_016626	CGGGCG	2	12	1839758	1839769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812166
48027	NC_016626	GCG	3	9	1839767	1839775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812166
48028	NC_016626	CG	4	8	1839794	1839801	0 %	0 %	50 %	50 %	377812166
48029	NC_016626	TGCGA	2	10	1840071	1840080	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48030	NC_016626	GCA	2	6	1840087	1840092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48031	NC_016626	TTA	2	6	1840311	1840316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48032	NC_016626	CGGC	2	8	1840319	1840326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48033	NC_016626	ACA	2	6	1840357	1840362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48034	NC_016626	TCA	2	6	1840439	1840444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48035	NC_016626	CGC	2	6	1840459	1840464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48036	NC_016626	T	6	6	1840479	1840484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48037	NC_016626	CG	3	6	1840513	1840518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48038	NC_016626	GCT	2	6	1840648	1840653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48039	NC_016626	GCG	2	6	1840654	1840659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48040	NC_016626	TG	3	6	1840702	1840707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48041	NC_016626	GC	3	6	1840755	1840760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48042	NC_016626	ACAA	2	8	1840773	1840780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48043	NC_016626	A	6	6	1840779	1840784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48044	NC_016626	TGG	2	6	1840834	1840839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48045	NC_016626	CG	3	6	1840891	1840896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48046	NC_016626	ACG	2	6	1840907	1840912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48047	NC_016626	ATT	2	6	1841008	1841013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48048	NC_016626	GTC	2	6	1841089	1841094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48049	NC_016626	AAC	2	6	1841178	1841183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48050	NC_016626	CG	3	6	1841317	1841322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48051	NC_016626	CGG	2	6	1841489	1841494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48052	NC_016626	TCA	2	6	1841504	1841509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48053	NC_016626	T	7	7	1841545	1841551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48054	NC_016626	ATA	2	6	1841559	1841564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48055	NC_016626	GAA	2	6	1841649	1841654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48057	NC_016626	GGGTC	2	10	1841794	1841803	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48058	NC_016626	GCCG	2	8	1841806	1841813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48059	NC_016626	GCC	2	6	1841826	1841831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48060	NC_016626	TTCG	2	8	1841843	1841850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48061	NC_016626	CGT	2	6	1841983	1841988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48062	NC_016626	GCT	2	6	1841997	1842002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48063	NC_016626	CGA	2	6	1842192	1842197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48064	NC_016626	A	6	6	1842304	1842309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48065	NC_016626	GAG	2	6	1842338	1842343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48073	NC_016626	CCG	2	6	1842569	1842574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48074	NC_016626	ACAGC	2	10	1842578	1842587	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48075	NC_016626	CAAA	2	8	1842593	1842600	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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48082	NC_016626	A	6	6	1842790	1842795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48083	NC_016626	TAT	2	6	1842869	1842874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48111	NC_016626	GCC	2	6	1843921	1843926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812167
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48121	NC_016626	GC	3	6	1844391	1844396	0 %	0 %	50 %	50 %	377812167
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48123	NC_016626	CACG	2	8	1844504	1844511	25 %	0 %	25 %	50 %	377812167
48124	NC_016626	GCG	4	12	1844585	1844596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812167
48125	NC_016626	TGC	2	6	1844610	1844615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812167
48126	NC_016626	AC	3	6	1844634	1844639	50 %	0 %	0 %	50 %	377812167
48127	NC_016626	CGT	2	6	1844649	1844654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812167
48128	NC_016626	GGC	2	6	1844710	1844715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812167
48129	NC_016626	CTTC	2	8	1844832	1844839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48130	NC_016626	CGC	2	6	1844860	1844865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48131	NC_016626	TCG	2	6	1844903	1844908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48132	NC_016626	GCT	2	6	1844916	1844921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48133	NC_016626	GGA	2	6	1844966	1844971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48134	NC_016626	CTAGG	2	10	1845005	1845014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48135	NC_016626	GTT	2	6	1845042	1845047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48136	NC_016626	TTC	2	6	1845179	1845184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48137	NC_016626	CCA	3	9	1845232	1845240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48138	NC_016626	CTT	2	6	1845311	1845316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48139	NC_016626	GCCG	2	8	1845326	1845333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48140	NC_016626	ATGGA	2	10	1845336	1845345	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48141	NC_016626	CCCT	2	8	1845351	1845358	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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48143	NC_016626	GTCGC	2	10	1845594	1845603	0 %	20 %	40 %	40 %	377812168
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48148	NC_016626	ATTC	2	8	1845685	1845692	25 %	50 %	0 %	25 %	377812168
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48152	NC_016626	GCT	2	6	1845877	1845882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812168
48153	NC_016626	CGA	2	6	1845928	1845933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812168
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48155	NC_016626	ATCA	2	8	1846034	1846041	50 %	25 %	0 %	25 %	377812168
48156	NC_016626	GCC	2	6	1846116	1846121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812168
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48160	NC_016626	GAA	2	6	1846500	1846505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48161	NC_016626	GGC	2	6	1846558	1846563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812169
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48224	NC_016626	TGTCC	2	10	1849677	1849686	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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48227	NC_016626	CA	3	6	1849810	1849815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48228	NC_016626	TCC	2	6	1849842	1849847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48230	NC_016626	TCA	2	6	1849924	1849929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48231	NC_016626	GAA	2	6	1850081	1850086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377812171
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48233	NC_016626	TCC	2	6	1850177	1850182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377812171
48234	NC_016626	AATG	2	8	1850192	1850199	50 %	25 %	25 %	0 %	377812171
48235	NC_016626	CGAATG	2	12	1850270	1850281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377812171
48236	NC_016626	TGA	2	6	1850305	1850310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812171
48237	NC_016626	CCG	2	6	1850329	1850334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812171
48238	NC_016626	GTC	2	6	1850373	1850378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812171
48239	NC_016626	AGGCC	2	10	1850413	1850422	20 %	0 %	40 %	40 %	377812171
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48241	NC_016626	AG	3	6	1850548	1850553	50 %	0 %	50 %	0 %	377812172
48242	NC_016626	CG	3	6	1850610	1850615	0 %	0 %	50 %	50 %	377812172
48243	NC_016626	GAA	2	6	1850637	1850642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377812172
48244	NC_016626	TTG	2	6	1850650	1850655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377812172
48245	NC_016626	TGA	2	6	1850707	1850712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812172
48246	NC_016626	CGTT	2	8	1850714	1850721	0 %	50 %	25 %	25 %	377812172
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48250	NC_016626	GATC	2	8	1850831	1850838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48251	NC_016626	CCGC	2	8	1850900	1850907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48252	NC_016626	CGG	2	6	1850936	1850941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48253	NC_016626	CTT	2	6	1851058	1851063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48254	NC_016626	GAA	2	6	1851065	1851070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48255	NC_016626	CGA	2	6	1851077	1851082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48257	NC_016626	ATGT	2	8	1851151	1851158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48258	NC_016626	TTC	2	6	1851196	1851201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48263	NC_016626	T	6	6	1851406	1851411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48272	NC_016626	GC	3	6	1851957	1851962	0 %	0 %	50 %	50 %	377812173
48273	NC_016626	CA	3	6	1851964	1851969	50 %	0 %	0 %	50 %	377812173
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48281	NC_016626	TCG	2	6	1852440	1852445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812173
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48351	NC_016626	GC	4	8	1856317	1856324	0 %	0 %	50 %	50 %	377812178
48352	NC_016626	CCT	2	6	1856353	1856358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377812178
48353	NC_016626	GCG	2	6	1856507	1856512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48354	NC_016626	GTG	2	6	1856554	1856559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48355	NC_016626	CGG	2	6	1856594	1856599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48356	NC_016626	CAC	2	6	1856669	1856674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48357	NC_016626	AGT	2	6	1856704	1856709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48359	NC_016626	CTG	3	9	1856761	1856769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48360	NC_016626	CAA	2	6	1856814	1856819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48361	NC_016626	GAT	2	6	1856843	1856848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48362	NC_016626	TGA	2	6	1856899	1856904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48363	NC_016626	TCC	2	6	1856923	1856928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48364	NC_016626	GAG	2	6	1856934	1856939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48365	NC_016626	GCAG	2	8	1856966	1856973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48366	NC_016626	CTT	2	6	1856984	1856989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48368	NC_016626	CG	3	6	1857129	1857134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48369	NC_016626	GC	3	6	1857210	1857215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48370	NC_016626	TGC	2	6	1857344	1857349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48373	NC_016626	CTG	2	6	1857508	1857513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48377	NC_016626	TAT	2	6	1857692	1857697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48402	NC_016626	ACGA	2	8	1858843	1858850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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48418	NC_016626	CGGG	2	8	1859520	1859527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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48453	NC_016626	GCTG	2	8	1861156	1861163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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48479	NC_016626	GCA	2	6	1862458	1862463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812181
48480	NC_016626	GTG	2	6	1862469	1862474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377812181
48481	NC_016626	CGG	2	6	1862527	1862532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812181
48482	NC_016626	CAG	2	6	1862543	1862548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812181
48483	NC_016626	TTG	2	6	1862563	1862568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377812181
48484	NC_016626	GAC	2	6	1862607	1862612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812181
48485	NC_016626	GCA	2	6	1862630	1862635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812181
48486	NC_016626	GCG	2	6	1862668	1862673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812181
48487	NC_016626	CTGGC	2	10	1862674	1862683	0 %	20 %	40 %	40 %	377812181
48488	NC_016626	GCA	2	6	1862750	1862755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812181
48489	NC_016626	CCG	2	6	1862761	1862766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48490	NC_016626	GT	3	6	1862828	1862833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48491	NC_016626	CGA	2	6	1862842	1862847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48492	NC_016626	GAT	2	6	1862857	1862862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48493	NC_016626	CCT	2	6	1862869	1862874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48494	NC_016626	GAG	2	6	1862879	1862884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48495	NC_016626	CGTT	2	8	1862981	1862988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48496	NC_016626	TCA	2	6	1863019	1863024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48497	NC_016626	GAT	2	6	1863165	1863170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812182
48498	NC_016626	C	6	6	1863305	1863310	0 %	0 %	0 %	100 %	377812182
48499	NC_016626	GGTG	2	8	1863372	1863379	0 %	25 %	75 %	0 %	377812182
48500	NC_016626	GCT	2	6	1863450	1863455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812182

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