MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 50327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016626	GCG	2	6	22	27	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016626	GCG	2	6	42	47	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016626	TGACG	2	10	91	100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016626	GTCCG	2	10	187	196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016626	CGG	2	6	261	266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016626	AGT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016626	CGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016626	GAC	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016626	ACG	2	6	483	488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016626	TCCT	2	8	584	591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016626	GCG	2	6	613	618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016626	CGG	2	6	622	627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016626	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810594
14	NC_016626	GC	3	6	689	694	0 %	0 %	50 %	50 %	377810594
15	NC_016626	ATC	2	6	705	710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810594
16	NC_016626	CCG	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810594
17	NC_016626	TCGA	2	8	738	745	25 %	25 %	25 %	25 %	377810594
18	NC_016626	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810594
19	NC_016626	TTC	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810594
20	NC_016626	CAT	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810594
21	NC_016626	CACGC	2	10	845	854	20 %	0 %	20 %	60 %	377810594
22	NC_016626	TCG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810594
23	NC_016626	GAT	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810594
24	NC_016626	GCG	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810594
25	NC_016626	CAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810594
26	NC_016626	TTTG	2	8	1015	1022	0 %	75 %	25 %	0 %	377810594
27	NC_016626	TGA	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810594
28	NC_016626	GTGC	2	8	1168	1175	0 %	25 %	50 %	25 %	377810594
29	NC_016626	GGC	2	6	1378	1383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810594
30	NC_016626	CTT	2	6	1427	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810594
31	NC_016626	C	6	6	1514	1519	0 %	0 %	0 %	100 %	377810594
32	NC_016626	TC	3	6	1635	1640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016626	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016626	AG	3	6	1697	1702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016626	ACG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810595
36	NC_016626	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016626	CCGG	2	8	1852	1859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016626	GAT	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016626	GCA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016626	CGA	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016626	CAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016626	ATTGA	2	10	2157	2166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016626	CGG	2	6	2176	2181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016626	TCAG	2	8	2191	2198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016626	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016626	AGA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016626	CTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016626	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810596
49	NC_016626	GCT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
50	NC_016626	CGAAG	2	10	2369	2378	40 %	0 %	40 %	20 %	377810596
51	NC_016626	AGG	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
52	NC_016626	GCG	2	6	2418	2423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
53	NC_016626	GCA	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
54	NC_016626	GCG	2	6	2496	2501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
55	NC_016626	GCG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
56	NC_016626	GTC	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
57	NC_016626	GAG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
58	NC_016626	GCT	2	6	2612	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
59	NC_016626	TCT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810596
60	NC_016626	TGC	2	6	2644	2649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
61	NC_016626	CGT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
62	NC_016626	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810596
63	NC_016626	ATCGG	2	10	2743	2752	20 %	20 %	40 %	20 %	377810596
64	NC_016626	GCA	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
65	NC_016626	CGG	2	6	2794	2799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
66	NC_016626	GGC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
67	NC_016626	GCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
68	NC_016626	CAG	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
69	NC_016626	GAC	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
70	NC_016626	GC	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	377810596
71	NC_016626	GGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
72	NC_016626	GCAC	2	8	3163	3170	25 %	0 %	25 %	50 %	377810596
73	NC_016626	CGG	3	9	3245	3253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016626	CTG	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016626	CGC	2	6	3290	3295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016626	TGC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
77	NC_016626	TTC	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810597
78	NC_016626	CGA	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810597
79	NC_016626	TGGT	2	8	3570	3577	0 %	50 %	50 %	0 %	377810597
80	NC_016626	TGG	2	6	3688	3693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810597
81	NC_016626	TGC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
82	NC_016626	GGA	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810597
83	NC_016626	TCT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810597
84	NC_016626	TGG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810597
85	NC_016626	GCG	2	6	3886	3891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810597
86	NC_016626	TCG	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
87	NC_016626	TC	3	6	3970	3975	0 %	50 %	0 %	50 %	377810597
88	NC_016626	CTG	2	6	4014	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
89	NC_016626	CGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810597
90	NC_016626	GAT	2	6	4034	4039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810597
91	NC_016626	GGCT	2	8	4122	4129	0 %	25 %	50 %	25 %	377810597
92	NC_016626	CCG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810597
93	NC_016626	TCC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016626	GCT	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016626	TCA	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016626	GGT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016626	GAC	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016626	GCG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016626	CTA	3	9	4495	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016626	ATGC	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016626	TCG	2	6	4622	4627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016626	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016626	CAC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016626	ACC	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016626	GAG	3	9	4818	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016626	GGA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016626	T	6	6	4877	4882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016626	GAA	2	6	4925	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016626	CGA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016626	GCC	2	6	5030	5035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016626	TGG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016626	GA	3	6	5093	5098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016626	GCG	2	6	5114	5119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016626	CCT	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016626	GAG	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016626	CAAG	2	8	5257	5264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016626	CCT	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016626	CG	4	8	5288	5295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016626	AGG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016626	GAA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016626	ATCG	2	8	5446	5453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016626	TGG	2	6	5500	5505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016626	CCG	2	6	5579	5584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016626	ATC	2	6	5629	5634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016626	CCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016626	GAG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016626	CG	3	6	5818	5823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016626	GC	3	6	5825	5830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016626	CG	3	6	5841	5846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016626	GC	3	6	5848	5853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016626	A	6	6	5857	5862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016626	GCCG	2	8	5973	5980	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
133	NC_016626	CG	3	6	5991	5996	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
134	NC_016626	TCTGT	2	10	6051	6060	0 %	60 %	20 %	20 %	377810598
135	NC_016626	GGC	2	6	6144	6149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810598
136	NC_016626	GCCGG	2	10	6225	6234	0 %	0 %	60 %	40 %	377810598
137	NC_016626	GTC	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810598
138	NC_016626	GAC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810598
139	NC_016626	GCCG	2	8	6271	6278	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
140	NC_016626	TG	3	6	6326	6331	0 %	50 %	50 %	0 %	377810598
141	NC_016626	GC	3	6	6344	6349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016626	G	6	6	6450	6455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016626	CGA	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
144	NC_016626	CGC	2	6	6602	6607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810599
145	NC_016626	AGC	3	9	6634	6642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
146	NC_016626	CG	3	6	6652	6657	0 %	0 %	50 %	50 %	377810599
147	NC_016626	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
148	NC_016626	GGT	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810599
149	NC_016626	GC	3	6	6770	6775	0 %	0 %	50 %	50 %	377810599
150	NC_016626	TGC	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810599
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155	NC_016626	CGG	3	9	6976	6984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810599
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166	NC_016626	TTG	2	6	7626	7631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016626	CG	4	8	7708	7715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_016626	ACG	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_016626	GTGAGT	2	12	7743	7754	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016626	CG	3	6	7783	7788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_016626	CG	3	6	7909	7914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_016626	GC	3	6	7921	7926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_016626	G	6	6	7928	7933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016626	GAG	2	6	7981	7986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_016626	GGC	2	6	7992	7997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_016626	GCC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_016626	GAC	2	6	8010	8015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_016626	CGG	2	6	8023	8028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_016626	CTGA	2	8	8055	8062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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259	NC_016626	GC	3	6	11541	11546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
260	NC_016626	GAC	2	6	11581	11586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_016626	CGG	2	6	11639	11644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_016626	TGA	2	6	11656	11661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016626	GCTC	2	8	11713	11720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
264	NC_016626	CGT	2	6	11746	11751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810603
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268	NC_016626	CGT	2	6	11897	11902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810603
269	NC_016626	GCG	2	6	11924	11929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810603
270	NC_016626	GTC	2	6	11982	11987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810603
271	NC_016626	T	6	6	12010	12015	0 %	100 %	0 %	0 %	377810603
272	NC_016626	GA	3	6	12141	12146	50 %	0 %	50 %	0 %	377810603
273	NC_016626	TC	3	6	12162	12167	0 %	50 %	0 %	50 %	377810603
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275	NC_016626	GA	3	6	12278	12283	50 %	0 %	50 %	0 %	377810603
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278	NC_016626	ACC	2	6	12612	12617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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