MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 3

Total Repeats: 41268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016590	GGC	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016590	GCA	2	6	63	68	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016590	TGG	2	6	81	86	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016590	GGC	2	6	216	221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016590	TGG	2	6	241	246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016590	CGA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016590	GAC	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016590	GCA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016590	GT	3	6	392	397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016590	GAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016590	GAAA	2	8	434	441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016590	ATGG	2	8	456	463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016590	GAA	2	6	479	484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016590	CAG	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016590	G	6	6	655	660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016590	GGA	2	6	699	704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016590	GTT	2	6	818	823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016590	GAT	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016590	TACC	2	8	970	977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016590	CTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016590	TGC	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016590	GTC	2	6	1051	1056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016590	TCGTG	2	10	1060	1069	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016590	GGA	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016590	AC	3	6	1378	1383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016590	GTAG	2	8	1419	1426	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016590	AGG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016590	CCT	2	6	1519	1524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016590	TGT	2	6	1569	1574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016590	ATCC	2	8	1648	1655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016590	CAC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016590	GAT	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016590	GA	3	6	1703	1708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016590	GTC	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016590	TCC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016590	TGC	2	6	1845	1850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016590	GAA	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016590	GTA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016590	GTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016590	GA	3	6	2048	2053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016590	TGG	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016590	TCC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016590	AGT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016590	GCGA	2	8	2312	2319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016590	TCTT	2	8	2344	2351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016590	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016590	G	6	6	2472	2477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016590	TCC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016590	GGGAG	2	10	2554	2563	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016590	GCAT	2	8	2583	2590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016590	AGGC	2	8	2680	2687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016590	GGA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016590	AAAC	2	8	2851	2858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016590	TC	3	6	2874	2879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016590	TAC	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016590	GACA	2	8	3004	3011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016590	AAC	2	6	3042	3047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016590	AGG	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016590	AGC	2	6	3131	3136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016590	AAAG	2	8	3145	3152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016590	GTC	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016590	CGTA	2	8	3229	3236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016590	GT	3	6	3276	3281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016590	G	6	6	3481	3486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016590	CTT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016590	GAAGC	2	10	3596	3605	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016590	GA	3	6	3705	3710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016590	AGG	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016590	TGG	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016590	TAA	2	6	3833	3838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016590	ATG	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016590	TTGA	2	8	3927	3934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016590	CGG	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016590	TCC	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016590	TGA	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016590	TGG	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016590	ACC	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016590	GTTT	2	8	4227	4234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016590	TCC	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016590	GGA	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016590	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016590	CGG	2	6	4528	4533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016590	CTCAT	2	10	4555	4564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016590	CGT	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016590	GCT	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016590	GT	3	6	4889	4894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016590	GT	3	6	4957	4962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016590	ACC	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016590	CAC	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016590	CTT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016590	CAA	2	6	5105	5110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016590	TGA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016590	ACC	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016590	GAT	2	6	5186	5191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016590	CTC	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016590	CAAA	2	8	5241	5248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016590	ACCCC	2	10	5250	5259	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_016590	GCC	2	6	5303	5308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016590	GCC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016590	GTC	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016590	GTGC	2	8	5441	5448	0 %	25 %	50 %	25 %	377807393
102	NC_016590	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807393
103	NC_016590	TCGATC	2	12	5529	5540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377807393
104	NC_016590	TCG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807393
105	NC_016590	TGT	2	6	5701	5706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807393
106	NC_016590	CTC	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807393
107	NC_016590	CCG	2	6	5788	5793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016590	TCGTC	2	10	5980	5989	0 %	40 %	20 %	40 %	377807394
109	NC_016590	GCTG	2	8	6022	6029	0 %	25 %	50 %	25 %	377807394
110	NC_016590	TCA	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807394
111	NC_016590	ATC	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807394
112	NC_016590	CAG	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807394
113	NC_016590	GCA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807394
114	NC_016590	GGA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807394
115	NC_016590	GGCA	2	8	6250	6257	25 %	0 %	50 %	25 %	377807394
116	NC_016590	GC	3	6	6390	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	377807394
117	NC_016590	GGC	2	6	6413	6418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807394
118	NC_016590	GC	3	6	6434	6439	0 %	0 %	50 %	50 %	377807394
119	NC_016590	GCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807394
120	NC_016590	ATC	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807394
121	NC_016590	ACTT	2	8	6479	6486	25 %	50 %	0 %	25 %	377807394
122	NC_016590	GCC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807394
123	NC_016590	GCT	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807394
124	NC_016590	CAT	3	9	6617	6625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807394
125	NC_016590	GTA	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807395
126	NC_016590	CG	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
127	NC_016590	GTT	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807395
128	NC_016590	CGC	2	6	6788	6793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807395
129	NC_016590	ACG	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807395
130	NC_016590	GAGAGC	2	12	6822	6833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	377807395
131	NC_016590	CG	3	6	6888	6893	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
132	NC_016590	GC	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
133	NC_016590	GCC	2	6	6911	6916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807395
134	NC_016590	CTG	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807395
135	NC_016590	GCC	2	6	6975	6980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807395
136	NC_016590	CGA	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807395
137	NC_016590	GGT	2	6	6998	7003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807395
138	NC_016590	TGGC	2	8	7032	7039	0 %	25 %	50 %	25 %	377807395
139	NC_016590	CAA	2	6	7058	7063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377807395
140	NC_016590	GC	3	6	7085	7090	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
141	NC_016590	CG	3	6	7185	7190	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
142	NC_016590	GCGG	2	8	7306	7313	0 %	0 %	75 %	25 %	377807395
143	NC_016590	CGT	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807395
144	NC_016590	GC	3	6	7361	7366	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
145	NC_016590	ACC	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807395
146	NC_016590	GCAG	2	8	7437	7444	25 %	0 %	50 %	25 %	377807395
147	NC_016590	CG	3	6	7464	7469	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
148	NC_016590	CG	4	8	7490	7497	0 %	0 %	50 %	50 %	377807395
149	NC_016590	GGTCGG	2	12	7507	7518	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	377807395
150	NC_016590	ATC	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807395
151	NC_016590	GC	3	6	7527	7532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016590	CTTT	2	8	7572	7579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016590	TTG	2	6	7604	7609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016590	GTC	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016590	ACT	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807396
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157	NC_016590	TGC	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807396
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159	NC_016590	CGA	2	6	7912	7917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807396
160	NC_016590	AGA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807396
161	NC_016590	TGC	2	6	7985	7990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807396
162	NC_016590	GAG	2	6	8086	8091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807396
163	NC_016590	ACCT	2	8	8149	8156	25 %	25 %	0 %	50 %	377807396
164	NC_016590	TCA	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807396
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167	NC_016590	AGCG	2	8	8406	8413	25 %	0 %	50 %	25 %	377807396
168	NC_016590	TGC	2	6	8459	8464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807396
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172	NC_016590	CGCT	2	8	8678	8685	0 %	25 %	25 %	50 %	377807396
173	NC_016590	GCT	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807396
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180	NC_016590	GAG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807397
181	NC_016590	ACC	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807397
182	NC_016590	TTC	2	6	9183	9188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807397
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184	NC_016590	CGC	2	6	9215	9220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807397
185	NC_016590	CAC	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807397
186	NC_016590	TCGA	2	8	9245	9252	25 %	25 %	25 %	25 %	377807397
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188	NC_016590	GCG	3	9	9539	9547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807397
189	NC_016590	GAC	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807397
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191	NC_016590	GGA	2	6	9603	9608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807397
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197	NC_016590	TCATC	2	10	9913	9922	20 %	40 %	0 %	40 %	377807397
198	NC_016590	TC	3	6	9932	9937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
199	NC_016590	ATC	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_016590	AAC	2	6	10053	10058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_016590	CGG	2	6	10060	10065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
202	NC_016590	AGC	3	9	10134	10142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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204	NC_016590	CGC	2	6	10249	10254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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206	NC_016590	CT	3	6	10327	10332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
207	NC_016590	ACA	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NC_016590	TCG	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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210	NC_016590	AGC	2	6	10545	10550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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212	NC_016590	CGA	2	6	10628	10633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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216	NC_016590	TAC	2	6	10777	10782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_016590	TCT	2	6	11885	11890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_016590	CG	3	6	11917	11922	0 %	0 %	50 %	50 %	377807400
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243	NC_016590	GCAA	2	8	12194	12201	50 %	0 %	25 %	25 %	377807400
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259	NC_016590	CGG	2	6	13347	13352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807401
260	NC_016590	ACGA	2	8	13354	13361	50 %	0 %	25 %	25 %	377807401
261	NC_016590	CG	3	6	13402	13407	0 %	0 %	50 %	50 %	377807401
262	NC_016590	AGC	3	9	13447	13455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807401
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265	NC_016590	TCG	2	6	13645	13650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807401
266	NC_016590	TG	3	6	13759	13764	0 %	50 %	50 %	0 %	377807401
267	NC_016590	GAC	2	6	13779	13784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807401
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269	NC_016590	GCG	2	6	13865	13870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807401
270	NC_016590	TCGA	2	8	13942	13949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
271	NC_016590	TTC	2	6	13985	13990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807402
272	NC_016590	TCG	2	6	14147	14152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807402
273	NC_016590	GAGTTC	2	12	14197	14208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377807402
274	NC_016590	CCT	2	6	14331	14336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807402
275	NC_016590	TGGG	2	8	14516	14523	0 %	25 %	75 %	0 %	377807402
276	NC_016590	CGA	2	6	14532	14537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807402
277	NC_016590	C	6	6	14540	14545	0 %	0 %	0 %	100 %	377807402
278	NC_016590	AC	3	6	14567	14572	50 %	0 %	0 %	50 %	377807402
279	NC_016590	ACGA	2	8	14581	14588	50 %	0 %	25 %	25 %	377807402
280	NC_016590	GCGT	2	8	14752	14759	0 %	25 %	50 %	25 %	377807402
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390	NC_016590	CAAG	2	8	20496	20503	50 %	0 %	25 %	25 %	377807404
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401	NC_016590	AGA	2	6	21205	21210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807404
402	NC_016590	GC	3	6	21236	21241	0 %	0 %	50 %	50 %	377807404
403	NC_016590	GGGA	2	8	21269	21276	25 %	0 %	75 %	0 %	377807404
404	NC_016590	GGCGG	2	10	21292	21301	0 %	0 %	80 %	20 %	377807404
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