MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 18503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016146	CAT	2	6	427631	427636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13502	NC_016146	CTT	2	6	427696	427701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13503	NC_016146	CAA	2	6	427879	427884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421108
13504	NC_016146	TCCA	2	8	427928	427935	25 %	25 %	0 %	50 %	357421108
13505	NC_016146	TAC	2	6	427943	427948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13506	NC_016146	AAT	2	6	427977	427982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13507	NC_016146	TCT	2	6	428070	428075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13508	NC_016146	TTC	2	6	428126	428131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13509	NC_016146	ATC	2	6	428138	428143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13510	NC_016146	TAA	2	6	428188	428193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13511	NC_016146	TTC	2	6	428269	428274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13512	NC_016146	CTT	2	6	428332	428337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13513	NC_016146	GAT	2	6	428403	428408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357421108
13514	NC_016146	GA	3	6	428443	428448	50 %	0 %	50 %	0 %	357421108
13515	NC_016146	ACA	2	6	428451	428456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421108
13516	NC_016146	T	7	7	428462	428468	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13517	NC_016146	T	6	6	428478	428483	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13518	NC_016146	CAT	2	6	428521	428526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13519	NC_016146	AGC	2	6	428627	428632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357421108
13520	NC_016146	TAGA	2	8	428674	428681	50 %	25 %	25 %	0 %	357421108
13521	NC_016146	TTC	2	6	428683	428688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13522	NC_016146	GAG	2	6	428731	428736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357421108
13523	NC_016146	T	6	6	428785	428790	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13524	NC_016146	ATT	2	6	428796	428801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13525	NC_016146	AGA	2	6	428807	428812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13526	NC_016146	ATT	2	6	428825	428830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13527	NC_016146	T	9	9	428904	428912	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13528	NC_016146	TCC	2	6	428949	428954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421108
13529	NC_016146	TGC	2	6	428975	428980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357421108
13530	NC_016146	CGT	2	6	428991	428996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357421108
13531	NC_016146	TC	3	6	429127	429132	0 %	50 %	0 %	50 %	357421108
13532	NC_016146	AGA	2	6	429137	429142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13533	NC_016146	CAT	2	6	429230	429235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13534	NC_016146	ATT	2	6	429344	429349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13535	NC_016146	TTA	2	6	429352	429357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13536	NC_016146	CTTG	2	8	429391	429398	0 %	50 %	25 %	25 %	357421108
13537	NC_016146	ATC	2	6	429425	429430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13538	NC_016146	TAA	2	6	429436	429441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13539	NC_016146	CCT	2	6	429465	429470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421108
13540	NC_016146	ATC	2	6	429503	429508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13541	NC_016146	AGT	2	6	429521	429526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357421108
13542	NC_016146	TC	3	6	429562	429567	0 %	50 %	0 %	50 %	357421108
13543	NC_016146	T	6	6	429575	429580	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13544	NC_016146	AT	3	6	429597	429602	50 %	50 %	0 %	0 %	357421108
13545	NC_016146	T	6	6	429608	429613	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13546	NC_016146	AAC	2	6	429617	429622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421108
13547	NC_016146	TTA	2	6	429624	429629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13548	NC_016146	AGT	2	6	429647	429652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357421108
13549	NC_016146	ATT	2	6	429677	429682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13550	NC_016146	CTA	2	6	429727	429732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13551	NC_016146	CCT	2	6	429757	429762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421108
13552	NC_016146	GAA	2	6	429765	429770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13553	NC_016146	TAT	2	6	429802	429807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13554	NC_016146	AT	3	6	429898	429903	50 %	50 %	0 %	0 %	357421108
13555	NC_016146	CAA	2	6	430100	430105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421108
13556	NC_016146	AAT	2	6	430166	430171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13557	NC_016146	T	7	7	430171	430177	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13558	NC_016146	AGA	2	6	430178	430183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13559	NC_016146	TCAA	2	8	430209	430216	50 %	25 %	0 %	25 %	357421108
13560	NC_016146	CTA	2	6	430297	430302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13561	NC_016146	AAT	2	6	430321	430326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13562	NC_016146	AAG	2	6	430340	430345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13563	NC_016146	CTT	2	6	430465	430470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13564	NC_016146	ATT	2	6	430538	430543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13565	NC_016146	ACG	2	6	430556	430561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357421108
13566	NC_016146	TCCA	2	8	430598	430605	25 %	25 %	0 %	50 %	357421108
13567	NC_016146	AGG	2	6	430628	430633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357421108
13568	NC_016146	AAT	2	6	430652	430657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13569	NC_016146	TCC	2	6	430673	430678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421108
13570	NC_016146	T	8	8	430680	430687	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13571	NC_016146	CTA	2	6	430705	430710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421108
13572	NC_016146	ATTT	2	8	430852	430859	25 %	75 %	0 %	0 %	357421108
13573	NC_016146	TTC	3	9	430919	430927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421108
13574	NC_016146	ATA	2	6	431006	431011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13575	NC_016146	TAA	2	6	431045	431050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421108
13576	NC_016146	GAA	2	6	431070	431075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421108
13577	NC_016146	AAC	2	6	431102	431107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421108
13578	NC_016146	CTC	2	6	431133	431138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421108
13579	NC_016146	T	6	6	431141	431146	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13580	NC_016146	A	6	6	431257	431262	100 %	0 %	0 %	0 %	357421108
13581	NC_016146	TC	4	8	431268	431275	0 %	50 %	0 %	50 %	357421108
13582	NC_016146	ATTG	2	8	431294	431301	25 %	50 %	25 %	0 %	357421108
13583	NC_016146	T	7	7	431371	431377	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13584	NC_016146	TAT	2	6	431383	431388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421108
13585	NC_016146	T	9	9	431388	431396	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13586	NC_016146	T	6	6	431404	431409	0 %	100 %	0 %	0 %	357421108
13587	NC_016146	ATA	2	6	431417	431422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_016146	CATAA	2	10	431468	431477	60 %	20 %	0 %	20 %	357421109
13589	NC_016146	ATT	2	6	431496	431501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421109
13590	NC_016146	CAT	2	6	431561	431566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421109
13591	NC_016146	AT	3	6	431594	431599	50 %	50 %	0 %	0 %	357421109
13592	NC_016146	CCT	2	6	431671	431676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421109
13593	NC_016146	GTT	2	6	431681	431686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357421109
13594	NC_016146	TAA	2	6	431690	431695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421109
13595	NC_016146	GCAT	2	8	431719	431726	25 %	25 %	25 %	25 %	357421109
13596	NC_016146	ATC	2	6	431730	431735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421109
13597	NC_016146	AT	4	8	431758	431765	50 %	50 %	0 %	0 %	357421109
13598	NC_016146	TC	4	8	431793	431800	0 %	50 %	0 %	50 %	357421109
13599	NC_016146	TCC	2	6	431805	431810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421109
13600	NC_016146	CAAA	2	8	431813	431820	75 %	0 %	0 %	25 %	357421109
13601	NC_016146	GTT	2	6	431824	431829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357421109
13602	NC_016146	T	6	6	431870	431875	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13603	NC_016146	AT	3	6	431952	431957	50 %	50 %	0 %	0 %	357421109
13604	NC_016146	TCT	2	6	432022	432027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421109
13605	NC_016146	TCT	2	6	432040	432045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421109
13606	NC_016146	CTA	2	6	432062	432067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421109
13607	NC_016146	CTTT	2	8	432114	432121	0 %	75 %	0 %	25 %	357421109
13608	NC_016146	T	8	8	432119	432126	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13609	NC_016146	T	7	7	432191	432197	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13610	NC_016146	ATT	2	6	432264	432269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421109
13611	NC_016146	CAT	2	6	432278	432283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421109
13612	NC_016146	AAT	2	6	432311	432316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421109
13613	NC_016146	TAT	2	6	432363	432368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421109
13614	NC_016146	ATT	2	6	432378	432383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421109
13615	NC_016146	T	7	7	432392	432398	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13616	NC_016146	TAA	2	6	432435	432440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421109
13617	NC_016146	T	6	6	432462	432467	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13618	NC_016146	T	6	6	432519	432524	0 %	100 %	0 %	0 %	357421109
13619	NC_016146	AAGG	2	8	432574	432581	50 %	0 %	50 %	0 %	357421109
13620	NC_016146	AAG	2	6	432593	432598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421109
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13995	NC_016146	AT	3	6	445910	445915	50 %	50 %	0 %	0 %	357421119
13996	NC_016146	CAA	2	6	445947	445952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421119
13997	NC_016146	ATA	2	6	445959	445964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421119
13998	NC_016146	TTC	2	6	445996	446001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421119
13999	NC_016146	TTA	2	6	446014	446019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421119
14000	NC_016146	ATA	2	6	446110	446115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421119

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