MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 18503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016146	TCTT	2	8	367085	367092	0 %	75 %	0 %	25 %	357421033
11502	NC_016146	CTC	2	6	367136	367141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421033
11503	NC_016146	TAT	2	6	367198	367203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_016146	TTGTTT	2	12	367213	367224	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	357421034
11505	NC_016146	T	8	8	367235	367242	0 %	100 %	0 %	0 %	357421034
11506	NC_016146	TCT	2	6	367267	367272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421034
11507	NC_016146	ATT	2	6	367274	367279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421034
11508	NC_016146	T	6	6	367298	367303	0 %	100 %	0 %	0 %	357421034
11509	NC_016146	AAG	2	6	367305	367310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421034
11510	NC_016146	TTC	2	6	367342	367347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421035
11511	NC_016146	TCTAA	2	10	367374	367383	40 %	40 %	0 %	20 %	357421035
11512	NC_016146	ATA	2	6	367539	367544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421035
11513	NC_016146	TAA	2	6	367545	367550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_016146	ATT	2	6	367551	367556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_016146	ACAA	2	8	367562	367569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_016146	ATTT	2	8	367577	367584	25 %	75 %	0 %	0 %	357421036
11517	NC_016146	CTA	2	6	367589	367594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421036
11518	NC_016146	ACT	2	6	367609	367614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421036
11519	NC_016146	TCA	4	12	367623	367634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421036
11520	NC_016146	TCG	2	6	367637	367642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357421036
11521	NC_016146	TAA	3	9	367643	367651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
11522	NC_016146	TAA	2	6	367654	367659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
11523	NC_016146	AT	4	8	367660	367667	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11524	NC_016146	TTG	2	6	367672	367677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357421036
11525	NC_016146	TAAT	2	8	367704	367711	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11526	NC_016146	TCC	2	6	367720	367725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421036
11527	NC_016146	TAA	2	6	367795	367800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
11528	NC_016146	TA	3	6	367840	367845	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11529	NC_016146	TCC	2	6	367885	367890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421036
11530	NC_016146	ATC	2	6	367903	367908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357421036
11531	NC_016146	TGGTA	2	10	367924	367933	20 %	40 %	40 %	0 %	357421036
11532	NC_016146	A	8	8	367944	367951	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11533	NC_016146	A	7	7	368020	368026	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11534	NC_016146	T	6	6	368027	368032	0 %	100 %	0 %	0 %	357421036
11535	NC_016146	A	6	6	368091	368096	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11536	NC_016146	CTG	2	6	368112	368117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357421036
11537	NC_016146	AT	3	6	368135	368140	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11538	NC_016146	A	6	6	368244	368249	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11539	NC_016146	A	8	8	368267	368274	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11540	NC_016146	TAA	2	6	368281	368286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
11541	NC_016146	A	7	7	368285	368291	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11542	NC_016146	TTA	2	6	368318	368323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421036
11543	NC_016146	TAAA	2	8	368436	368443	75 %	25 %	0 %	0 %	357421036
11544	NC_016146	TAT	2	6	368470	368475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421036
11545	NC_016146	TTC	2	6	368487	368492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421036
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11548	NC_016146	TTG	2	6	368554	368559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357421036
11549	NC_016146	AATT	2	8	368628	368635	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11550	NC_016146	AAT	2	6	368683	368688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
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11552	NC_016146	AT	3	6	368721	368726	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11553	NC_016146	ATA	2	6	368732	368737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421036
11554	NC_016146	AGA	2	6	368782	368787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421036
11555	NC_016146	AT	3	6	368873	368878	50 %	50 %	0 %	0 %	357421036
11556	NC_016146	A	6	6	368900	368905	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
11557	NC_016146	TTA	3	9	368913	368921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357421036
11558	NC_016146	T	7	7	368922	368928	0 %	100 %	0 %	0 %	357421036
11559	NC_016146	A	6	6	368969	368974	100 %	0 %	0 %	0 %	357421036
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11562	NC_016146	T	7	7	369116	369122	0 %	100 %	0 %	0 %	357421037
11563	NC_016146	T	7	7	369145	369151	0 %	100 %	0 %	0 %	357421037
11564	NC_016146	TAA	2	6	369154	369159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421037
11565	NC_016146	TCT	2	6	369169	369174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421037
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11567	NC_016146	TTTC	2	8	369221	369228	0 %	75 %	0 %	25 %	357421037
11568	NC_016146	TCC	2	6	369259	369264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421037
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11570	NC_016146	T	6	6	369392	369397	0 %	100 %	0 %	0 %	357421037
11571	NC_016146	CTTT	2	8	369409	369416	0 %	75 %	0 %	25 %	357421037
11572	NC_016146	A	6	6	369423	369428	100 %	0 %	0 %	0 %	357421037
11573	NC_016146	A	6	6	369440	369445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_016146	TA	3	6	369462	369467	50 %	50 %	0 %	0 %	357421038
11575	NC_016146	TCG	2	6	369537	369542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357421038
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11582	NC_016146	TAA	2	6	369843	369848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421038
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11589	NC_016146	T	7	7	370096	370102	0 %	100 %	0 %	0 %	357421039
11590	NC_016146	TC	3	6	370128	370133	0 %	50 %	0 %	50 %	357421039
11591	NC_016146	GAA	4	12	370136	370147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357421039
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11605	NC_016146	CTT	2	6	370533	370538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421040
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11607	NC_016146	TCT	2	6	370664	370669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357421040
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11995	NC_016146	CTC	2	6	382749	382754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357421061
11996	NC_016146	ATA	2	6	382761	382766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357421061
11997	NC_016146	CAA	2	6	382797	382802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357421061
11998	NC_016146	T	6	6	382824	382829	0 %	100 %	0 %	0 %	357421061
11999	NC_016146	ATTT	2	8	382858	382865	25 %	75 %	0 %	0 %	357421061
12000	NC_016146	T	6	6	382863	382868	0 %	100 %	0 %	0 %	357421061

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