MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 18503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016146	GAAA	2	8	316948	316955	75 %	0 %	25 %	0 %	357420992
10002	NC_016146	AATTTT	2	12	317017	317028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420992
10003	NC_016146	TC	3	6	317088	317093	0 %	50 %	0 %	50 %	357420992
10004	NC_016146	AGG	2	6	317190	317195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420992
10005	NC_016146	T	6	6	317226	317231	0 %	100 %	0 %	0 %	357420992
10006	NC_016146	ATCA	2	8	317314	317321	50 %	25 %	0 %	25 %	357420992
10007	NC_016146	A	6	6	317321	317326	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10008	NC_016146	A	6	6	317328	317333	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10009	NC_016146	TGT	3	9	317334	317342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420992
10010	NC_016146	GAA	2	6	317374	317379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420992
10011	NC_016146	AAAG	2	8	317381	317388	75 %	0 %	25 %	0 %	357420992
10012	NC_016146	TTC	2	6	317444	317449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420992
10013	NC_016146	AGG	2	6	317472	317477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420992
10014	NC_016146	CAT	2	6	317515	317520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420992
10015	NC_016146	ATCA	2	8	317521	317528	50 %	25 %	0 %	25 %	357420992
10016	NC_016146	TGT	2	6	317568	317573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420992
10017	NC_016146	AAGTA	2	10	317670	317679	60 %	20 %	20 %	0 %	357420992
10018	NC_016146	ATT	2	6	317725	317730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420992
10019	NC_016146	TCT	2	6	317773	317778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420992
10020	NC_016146	TCT	2	6	317785	317790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420992
10021	NC_016146	AAAG	2	8	317851	317858	75 %	0 %	25 %	0 %	357420992
10022	NC_016146	AGC	2	6	317879	317884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420992
10023	NC_016146	GAA	2	6	318035	318040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420992
10024	NC_016146	TTCT	2	8	318095	318102	0 %	75 %	0 %	25 %	357420992
10025	NC_016146	AAG	2	6	318117	318122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420992
10026	NC_016146	A	6	6	318173	318178	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10027	NC_016146	ATTT	2	8	318218	318225	25 %	75 %	0 %	0 %	357420992
10028	NC_016146	AT	3	6	318237	318242	50 %	50 %	0 %	0 %	357420992
10029	NC_016146	AAG	2	6	318263	318268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420992
10030	NC_016146	GGAAAT	2	12	318270	318281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	357420992
10031	NC_016146	T	6	6	318303	318308	0 %	100 %	0 %	0 %	357420992
10032	NC_016146	A	8	8	318311	318318	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10033	NC_016146	A	6	6	318334	318339	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10034	NC_016146	A	6	6	318344	318349	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10035	NC_016146	TAA	2	6	318372	318377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420992
10036	NC_016146	A	8	8	318424	318431	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10037	NC_016146	AAT	2	6	318439	318444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420992
10038	NC_016146	A	6	6	318500	318505	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10039	NC_016146	A	8	8	318515	318522	100 %	0 %	0 %	0 %	357420992
10040	NC_016146	AC	3	6	318551	318556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_016146	AAG	2	6	318570	318575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_016146	AAT	2	6	318611	318616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_016146	AAC	2	6	318628	318633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_016146	GGT	2	6	318641	318646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016146	TATT	2	8	318647	318654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_016146	GCA	2	6	318701	318706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_016146	AGA	2	6	318730	318735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_016146	T	6	6	318740	318745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_016146	GTT	2	6	318825	318830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016146	GTAT	2	8	318852	318859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016146	A	6	6	318871	318876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_016146	TGG	2	6	318904	318909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016146	A	6	6	318958	318963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016146	ATT	2	6	318989	318994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_016146	TTA	2	6	318999	319004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016146	ATT	2	6	319022	319027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016146	AGCA	2	8	319031	319038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_016146	TATT	2	8	319066	319073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016146	TCA	2	6	319156	319161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_016146	AGAA	2	8	319216	319223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016146	T	7	7	319275	319281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016146	A	6	6	319319	319324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016146	CAT	2	6	319340	319345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_016146	TGT	2	6	319400	319405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016146	TTC	2	6	319408	319413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016146	TA	3	6	319422	319427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016146	GAA	2	6	319441	319446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016146	T	6	6	319458	319463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_016146	TATTT	2	10	319468	319477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_016146	TAA	2	6	319504	319509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_016146	AGA	2	6	319531	319536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_016146	TTTAGG	2	12	319567	319578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_016146	ATA	2	6	319653	319658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_016146	CTA	2	6	319692	319697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_016146	AGA	2	6	319748	319753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_016146	ATGGCT	2	12	319766	319777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10077	NC_016146	AGG	2	6	319804	319809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_016146	GCT	2	6	319835	319840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_016146	AT	4	8	319842	319849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_016146	GAT	3	9	319853	319861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_016146	A	6	6	319899	319904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_016146	A	6	6	319944	319949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016146	A	7	7	320001	320007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_016146	CAAG	2	8	320054	320061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_016146	AT	3	6	320074	320079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_016146	TCTT	2	8	320101	320108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_016146	TCA	2	6	320110	320115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_016146	TAT	3	9	320183	320191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_016146	TTC	2	6	320205	320210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_016146	GGC	2	6	320249	320254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_016146	ACC	2	6	320346	320351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_016146	AAC	2	6	320365	320370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_016146	AC	3	6	320369	320374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_016146	GAA	2	6	320377	320382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_016146	ATA	2	6	320387	320392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_016146	TAC	2	6	320411	320416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_016146	GTC	2	6	320462	320467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_016146	AAG	2	6	320483	320488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_016146	ATAG	2	8	320653	320660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_016146	ACG	2	6	320676	320681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_016146	CTT	2	6	320737	320742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_016146	ACC	2	6	320871	320876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10103	NC_016146	AC	3	6	320953	320958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_016146	ACC	2	6	321015	321020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_016146	CAC	2	6	321035	321040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_016146	A	7	7	321082	321088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_016146	GGT	2	6	321090	321095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_016146	ATA	2	6	321126	321131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_016146	TTAA	2	8	321164	321171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_016146	GCC	2	6	321360	321365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_016146	CAT	2	6	321451	321456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_016146	GTC	2	6	321494	321499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_016146	AAGG	2	8	321526	321533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_016146	TC	3	6	321607	321612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_016146	TA	3	6	321753	321758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_016146	C	6	6	321820	321825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10117	NC_016146	AGTA	2	8	321838	321845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_016146	TC	3	6	321961	321966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_016146	ACA	2	6	322023	322028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_016146	AT	3	6	322087	322092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_016146	ATT	2	6	322103	322108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_016146	GCT	2	6	322162	322167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_016146	CTGT	2	8	322186	322193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_016146	TTGT	2	8	322205	322212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_016146	AT	3	6	322221	322226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_016146	TGA	2	6	322243	322248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_016146	GTT	2	6	322254	322259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_016146	ATA	2	6	322309	322314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_016146	TGA	2	6	322347	322352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_016146	TAT	2	6	322386	322391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_016146	TGC	2	6	322401	322406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_016146	TCC	2	6	322509	322514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10133	NC_016146	TTC	2	6	322574	322579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_016146	ACT	2	6	322629	322634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_016146	CGT	2	6	322682	322687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_016146	GAG	2	6	322804	322809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_016146	TGAT	2	8	322925	322932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_016146	CTA	2	6	322947	322952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_016146	T	6	6	322967	322972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_016146	TCGC	2	8	323028	323035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10141	NC_016146	ACT	2	6	323037	323042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_016146	TTTTC	2	10	323059	323068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10143	NC_016146	A	6	6	323115	323120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_016146	CTT	2	6	323220	323225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_016146	CCA	2	6	323247	323252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10146	NC_016146	CTTA	2	8	323259	323266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10147	NC_016146	TCTT	3	12	323273	323284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10148	NC_016146	TATG	2	8	323286	323293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10149	NC_016146	A	7	7	323306	323312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_016146	CCT	2	6	323340	323345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10151	NC_016146	CG	3	6	323406	323411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10152	NC_016146	TAA	2	6	323509	323514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_016146	A	6	6	323516	323521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_016146	A	7	7	323528	323534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_016146	GT	3	6	323667	323672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_016146	CAT	2	6	323698	323703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10157	NC_016146	GT	3	6	323837	323842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_016146	TGA	2	6	323863	323868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_016146	CGT	2	6	323874	323879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10161	NC_016146	GCA	2	6	324014	324019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10162	NC_016146	GTA	2	6	324062	324067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_016146	ATC	2	6	324097	324102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10164	NC_016146	CAA	2	6	324226	324231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10165	NC_016146	ATC	2	6	324238	324243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10166	NC_016146	TG	3	6	324348	324353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_016146	CA	3	6	324379	324384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10168	NC_016146	ACT	2	6	324457	324462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10171	NC_016146	TTC	2	6	324644	324649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10172	NC_016146	TCC	2	6	324678	324683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10173	NC_016146	CTG	2	6	324702	324707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10174	NC_016146	AACT	2	8	324806	324813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10175	NC_016146	TCT	2	6	324911	324916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10176	NC_016146	AGGT	2	8	324923	324930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10177	NC_016146	TCT	2	6	324972	324977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10178	NC_016146	AGA	2	6	324981	324986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10179	NC_016146	CGC	2	6	325022	325027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10181	NC_016146	TTA	3	9	325092	325100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10184	NC_016146	A	10	10	325185	325194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10185	NC_016146	T	9	9	325196	325204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10188	NC_016146	TTTC	2	8	325289	325296	0 %	75 %	0 %	25 %	357420993
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10219	NC_016146	A	7	7	326321	326327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10220	NC_016146	A	7	7	326333	326339	100 %	0 %	0 %	0 %	357420994
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10234	NC_016146	A	7	7	326794	326800	100 %	0 %	0 %	0 %	357420994
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10240	NC_016146	A	6	6	326924	326929	100 %	0 %	0 %	0 %	357420994
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10245	NC_016146	TTAT	2	8	327060	327067	25 %	75 %	0 %	0 %	357420994
10246	NC_016146	A	6	6	327118	327123	100 %	0 %	0 %	0 %	357420994
10247	NC_016146	A	9	9	327132	327140	100 %	0 %	0 %	0 %	357420994
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10255	NC_016146	A	7	7	327374	327380	100 %	0 %	0 %	0 %	357420995
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