MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA02

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015168	ATTTT	2	10	21	30	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015168	TG	3	6	133	138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015168	TA	3	6	191	196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015168	TA	3	6	229	234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015168	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015168	TAA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015168	T	8	8	272	279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015168	ATA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015168	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976988
10	NC_015168	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976988
11	NC_015168	T	6	6	452	457	0 %	100 %	0 %	0 %	324976988
12	NC_015168	ATC	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976988
13	NC_015168	GCA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976988
14	NC_015168	GGTC	2	8	659	666	0 %	25 %	50 %	25 %	324976988
15	NC_015168	GACA	2	8	674	681	50 %	0 %	25 %	25 %	324976988
16	NC_015168	GGGA	2	8	692	699	25 %	0 %	75 %	0 %	324976988
17	NC_015168	AACA	2	8	700	707	75 %	0 %	0 %	25 %	324976988
18	NC_015168	GGC	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976988
19	NC_015168	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976988
20	NC_015168	CTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976988
21	NC_015168	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
22	NC_015168	GGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
23	NC_015168	A	6	6	1075	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015168	GAC	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015168	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976989
26	NC_015168	AGG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976989
27	NC_015168	AG	3	6	1423	1428	50 %	0 %	50 %	0 %	324976989
28	NC_015168	CAA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
29	NC_015168	CCA	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976989
30	NC_015168	T	6	6	1762	1767	0 %	100 %	0 %	0 %	324976989
31	NC_015168	ACA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
32	NC_015168	GAAT	2	8	1780	1787	50 %	25 %	25 %	0 %	324976989
33	NC_015168	TGC	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976989
34	NC_015168	A	6	6	1827	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	324976989
35	NC_015168	TTGT	2	8	1892	1899	0 %	75 %	25 %	0 %	324976990
36	NC_015168	TGA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
37	NC_015168	TC	3	6	1953	1958	0 %	50 %	0 %	50 %	324976990
38	NC_015168	GTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
39	NC_015168	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976990
40	NC_015168	T	7	7	2261	2267	0 %	100 %	0 %	0 %	324976990
41	NC_015168	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
42	NC_015168	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976990
43	NC_015168	AACGTG	2	12	2502	2513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	324976990
44	NC_015168	T	6	6	2566	2571	0 %	100 %	0 %	0 %	324976990
45	NC_015168	T	7	7	2615	2621	0 %	100 %	0 %	0 %	324976990
46	NC_015168	GT	3	6	2700	2705	0 %	50 %	50 %	0 %	324976990
47	NC_015168	T	6	6	2785	2790	0 %	100 %	0 %	0 %	324976990
48	NC_015168	ATG	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
49	NC_015168	ACT	3	9	2856	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
50	NC_015168	GTT	2	6	2867	2872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
51	NC_015168	T	8	8	2871	2878	0 %	100 %	0 %	0 %	324976990
52	NC_015168	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015168	TAT	3	9	2933	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015168	ATA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015168	A	6	6	3005	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015168	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015168	TTCT	2	8	3063	3070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015168	TAAT	2	8	3072	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015168	A	6	6	3108	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015168	TA	3	6	3123	3128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015168	T	6	6	3158	3163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015168	GAAAAG	2	12	3207	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015168	TA	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015168	TTGT	2	8	3333	3340	0 %	75 %	25 %	0 %	324976991
65	NC_015168	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
66	NC_015168	T	6	6	3477	3482	0 %	100 %	0 %	0 %	324976991
67	NC_015168	AAC	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976991
68	NC_015168	TCCTGC	2	12	3777	3788	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	324976991
69	NC_015168	GGCT	2	8	3814	3821	0 %	25 %	50 %	25 %	324976991
70	NC_015168	GCC	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976991
71	NC_015168	GCT	2	6	3912	3917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
72	NC_015168	CTT	2	6	3926	3931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
73	NC_015168	TCC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
74	NC_015168	CCTG	2	8	3954	3961	0 %	25 %	25 %	50 %	324976991
75	NC_015168	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976991
76	NC_015168	CGTC	2	8	4183	4190	0 %	25 %	25 %	50 %	324976991
77	NC_015168	GT	3	6	4290	4295	0 %	50 %	50 %	0 %	324976991
78	NC_015168	TCC	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
79	NC_015168	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
80	NC_015168	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
81	NC_015168	TCC	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
82	NC_015168	TGC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
83	NC_015168	TGG	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015168	GCAA	2	8	4717	4724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015168	CGGA	2	8	4737	4744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015168	ATC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015168	CGA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015168	A	6	6	4970	4975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015168	TGG	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
90	NC_015168	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
91	NC_015168	AAG	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
92	NC_015168	GGT	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
93	NC_015168	TTG	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976992
94	NC_015168	ATCAAA	2	12	5250	5261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	324976993
95	NC_015168	GGGA	2	8	5276	5283	25 %	0 %	75 %	0 %	324976993
96	NC_015168	GGA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
97	NC_015168	CATT	2	8	5360	5367	25 %	50 %	0 %	25 %	324976993
98	NC_015168	GAA	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976993
99	NC_015168	CA	3	6	5414	5419	50 %	0 %	0 %	50 %	324976993
100	NC_015168	TGAACG	2	12	5478	5489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	324976993
101	NC_015168	AGG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
102	NC_015168	ACGAA	2	10	5546	5555	60 %	0 %	20 %	20 %	324976993
103	NC_015168	A	6	6	5574	5579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015168	GTAT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015168	GAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976994
106	NC_015168	A	6	6	5773	5778	100 %	0 %	0 %	0 %	324976994
107	NC_015168	GCTG	2	8	5931	5938	0 %	25 %	50 %	25 %	324976994
108	NC_015168	CGTG	2	8	6178	6185	0 %	25 %	50 %	25 %	324976994
109	NC_015168	CCA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976995
110	NC_015168	ATC	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
111	NC_015168	A	6	6	6434	6439	100 %	0 %	0 %	0 %	324976995
112	NC_015168	CGG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
113	NC_015168	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
114	NC_015168	CCTT	2	8	6647	6654	0 %	50 %	0 %	50 %	324976995
115	NC_015168	TG	3	6	6675	6680	0 %	50 %	50 %	0 %	324976995
116	NC_015168	CTT	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976995
117	NC_015168	GTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976995
118	NC_015168	TCCG	2	8	6796	6803	0 %	25 %	25 %	50 %	324976995
119	NC_015168	ATGTCG	2	12	6848	6859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	324976995
120	NC_015168	ATG	3	9	6863	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
121	NC_015168	TCC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976995
122	NC_015168	CGG	2	6	6918	6923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
123	NC_015168	GCC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976995
124	NC_015168	CCTG	2	8	6959	6966	0 %	25 %	25 %	50 %	324976995
125	NC_015168	AGT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
126	NC_015168	ATA	2	6	7045	7050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
127	NC_015168	CTG	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
128	NC_015168	TCT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
129	NC_015168	GCC	3	9	7177	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976996
130	NC_015168	TTG	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
131	NC_015168	TGC	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
132	NC_015168	TGA	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976996
133	NC_015168	TATC	2	8	7328	7335	25 %	50 %	0 %	25 %	324976996
134	NC_015168	TG	3	6	7418	7423	0 %	50 %	50 %	0 %	324976996
135	NC_015168	CATCTT	2	12	7488	7499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	324976996
136	NC_015168	AGC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
137	NC_015168	TTG	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
138	NC_015168	CAG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
139	NC_015168	GAA	2	6	7578	7583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976996
140	NC_015168	TGG	2	6	7649	7654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976996
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256	NC_015168	CGAA	2	8	12244	12251	50 %	0 %	25 %	25 %	324977004
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262	NC_015168	ACCAG	2	10	12544	12553	40 %	0 %	20 %	40 %	324977004
263	NC_015168	GCA	2	6	12641	12646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
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269	NC_015168	AGGACA	2	12	12910	12921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	324977004
270	NC_015168	GGACG	2	10	12944	12953	20 %	0 %	60 %	20 %	324977004
271	NC_015168	AGC	2	6	12984	12989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
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273	NC_015168	AT	3	6	13159	13164	50 %	50 %	0 %	0 %	324977004
274	NC_015168	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
275	NC_015168	A	6	6	13269	13274	100 %	0 %	0 %	0 %	324977004
276	NC_015168	AGA	2	6	13336	13341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
277	NC_015168	A	6	6	13416	13421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015168	GCG	2	6	13478	13483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324977005
279	NC_015168	TGCCT	2	10	13489	13498	0 %	40 %	20 %	40 %	324977005
280	NC_015168	GCA	2	6	13704	13709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
281	NC_015168	GACG	2	8	13785	13792	25 %	0 %	50 %	25 %	324977005
282	NC_015168	AAG	2	6	13852	13857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
283	NC_015168	TTC	2	6	13888	13893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977005
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312	NC_015168	GTCATT	2	12	15436	15447	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	324977005
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314	NC_015168	TGTC	2	8	15690	15697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
315	NC_015168	ATT	2	6	15773	15778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977006
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.