MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 106632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015136	CAG	2	6	137223	137228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3502	NC_015136	GCG	2	6	137293	137298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3503	NC_015136	CAT	2	6	137316	137321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524496
3504	NC_015136	GCA	2	6	137378	137383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3505	NC_015136	GC	3	6	137387	137392	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3506	NC_015136	GCG	2	6	137438	137443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3507	NC_015136	GC	5	10	137451	137460	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3508	NC_015136	GC	3	6	137478	137483	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3509	NC_015136	GCC	2	6	137493	137498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3510	NC_015136	CGC	2	6	137505	137510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3511	NC_015136	GGC	2	6	137514	137519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3512	NC_015136	GAC	2	6	137544	137549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3513	NC_015136	CGA	2	6	137603	137608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3514	NC_015136	CG	4	8	137655	137662	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3515	NC_015136	TCG	2	6	137683	137688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3516	NC_015136	GCA	2	6	137702	137707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3517	NC_015136	GGC	2	6	137718	137723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3518	NC_015136	GC	3	6	137735	137740	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3519	NC_015136	GCCAT	2	10	137776	137785	20 %	20 %	20 %	40 %	323524496
3520	NC_015136	AGC	2	6	137791	137796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3521	NC_015136	GC	3	6	137795	137800	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3522	NC_015136	CCG	2	6	137824	137829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3523	NC_015136	CATGC	2	10	137838	137847	20 %	20 %	20 %	40 %	323524496
3524	NC_015136	ACG	2	6	137849	137854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3525	NC_015136	CAG	2	6	137955	137960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3526	NC_015136	ACG	2	6	137977	137982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3527	NC_015136	GCC	2	6	138001	138006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3528	NC_015136	GCC	2	6	138015	138020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3529	NC_015136	CG	3	6	138030	138035	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3530	NC_015136	CG	3	6	138049	138054	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3531	NC_015136	ACG	2	6	138059	138064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3532	NC_015136	GCC	2	6	138070	138075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3533	NC_015136	GCC	2	6	138090	138095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524496
3534	NC_015136	GAG	2	6	138105	138110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323524496
3535	NC_015136	TCG	2	6	138215	138220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524496
3536	NC_015136	CG	5	10	138224	138233	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3537	NC_015136	GC	3	6	138237	138242	0 %	0 %	50 %	50 %	323524496
3538	NC_015136	GCG	2	6	138265	138270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3539	NC_015136	GGC	2	6	138276	138281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524496
3540	NC_015136	GTCG	2	8	138285	138292	0 %	25 %	50 %	25 %	323524496
3541	NC_015136	AGA	2	6	138319	138324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_015136	GAAA	2	8	138332	138339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015136	GT	3	6	138419	138424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_015136	CGG	2	6	138444	138449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_015136	CG	3	6	138475	138480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_015136	ACGC	2	8	138504	138511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_015136	GCC	2	6	138547	138552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_015136	CCG	2	6	138554	138559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_015136	TTCA	2	8	138577	138584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_015136	CCG	2	6	138638	138643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524497
3551	NC_015136	CACG	2	8	138660	138667	25 %	0 %	25 %	50 %	323524497
3552	NC_015136	CG	3	6	138666	138671	0 %	0 %	50 %	50 %	323524497
3553	NC_015136	ATCC	2	8	138692	138699	25 %	25 %	0 %	50 %	323524497
3554	NC_015136	TGC	2	6	138701	138706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524497
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3557	NC_015136	GTC	2	6	138805	138810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524497
3558	NC_015136	TCG	2	6	138893	138898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524497
3559	NC_015136	CG	3	6	138897	138902	0 %	0 %	50 %	50 %	323524497
3560	NC_015136	CGG	2	6	138993	138998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524497
3561	NC_015136	CGG	2	6	139020	139025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524497
3562	NC_015136	CGA	2	6	139026	139031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524497
3563	NC_015136	CAGC	2	8	139164	139171	25 %	0 %	25 %	50 %	323524497
3564	NC_015136	CGC	2	6	139221	139226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524497
3565	NC_015136	AGA	2	6	139230	139235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524497
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3568	NC_015136	ACG	2	6	139328	139333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_015136	ATGAA	2	10	139352	139361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015136	TAAT	2	8	139402	139409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015136	CG	3	6	139426	139431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_015136	GCC	2	6	139473	139478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_015136	GC	3	6	139484	139489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_015136	ACT	2	6	139671	139676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524498
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3577	NC_015136	CGG	3	9	139794	139802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524498
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3581	NC_015136	CGAATG	2	12	140155	140166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3582	NC_015136	CGGG	2	8	140233	140240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_015136	TTTC	2	8	140265	140272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_015136	CCG	2	6	140284	140289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524499
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3590	NC_015136	TCG	2	6	140650	140655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
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3592	NC_015136	TGC	2	6	140701	140706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
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3594	NC_015136	CGT	2	6	140773	140778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
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3596	NC_015136	GCG	3	9	140841	140849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524499
3597	NC_015136	TCG	2	6	140851	140856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
3598	NC_015136	TGG	2	6	140863	140868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524499
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3601	NC_015136	CTG	2	6	140961	140966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
3602	NC_015136	TGG	2	6	141028	141033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524499
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3604	NC_015136	TCG	2	6	141208	141213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
3605	NC_015136	GGC	2	6	141233	141238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524499
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3607	NC_015136	CATT	2	8	141266	141273	25 %	50 %	0 %	25 %	323524499
3608	NC_015136	TGC	2	6	141304	141309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
3609	NC_015136	GCCG	2	8	141330	141337	0 %	0 %	50 %	50 %	323524499
3610	NC_015136	GC	3	6	141394	141399	0 %	0 %	50 %	50 %	323524499
3611	NC_015136	TGC	2	6	141412	141417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524499
3612	NC_015136	GGA	2	6	141473	141478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323524499
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3614	NC_015136	GGC	2	6	141591	141596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_015136	AC	3	6	141600	141605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_015136	ACCG	2	8	141621	141628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_015136	GCA	2	6	141669	141674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524500
3618	NC_015136	CGA	2	6	141759	141764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524500
3619	NC_015136	CGC	2	6	141852	141857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524500
3620	NC_015136	GC	3	6	141891	141896	0 %	0 %	50 %	50 %	323524500
3621	NC_015136	CAG	2	6	141925	141930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524500
3622	NC_015136	GCC	2	6	141978	141983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524500
3623	NC_015136	GC	3	6	142036	142041	0 %	0 %	50 %	50 %	323524500
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3625	NC_015136	GA	3	6	142071	142076	50 %	0 %	50 %	0 %	323524500
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3857	NC_015136	AT	3	6	150396	150401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3873	NC_015136	TGG	2	6	150842	150847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524510
3874	NC_015136	GC	4	8	150853	150860	0 %	0 %	50 %	50 %	323524510
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3881	NC_015136	CGCC	2	8	151121	151128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3882	NC_015136	GC	3	6	151143	151148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3883	NC_015136	GCC	2	6	151157	151162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3885	NC_015136	A	7	7	151175	151181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3889	NC_015136	CG	3	6	151370	151375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3890	NC_015136	CGT	2	6	151406	151411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3958	NC_015136	ATC	3	9	153644	153652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524512
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3960	NC_015136	GCGAC	2	10	153675	153684	20 %	0 %	40 %	40 %	323524512
3961	NC_015136	CGT	2	6	153703	153708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524512
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3975	NC_015136	CCGGC	2	10	154048	154057	0 %	0 %	40 %	60 %	323524512
3976	NC_015136	CGTC	2	8	154095	154102	0 %	25 %	25 %	50 %	323524512
3977	NC_015136	ACA	2	6	154107	154112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524512
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3981	NC_015136	CAG	2	6	154279	154284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524512
3982	NC_015136	CAT	2	6	154300	154305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524512
3983	NC_015136	ACGTG	2	10	154323	154332	20 %	20 %	40 %	20 %	323524512
3984	NC_015136	CGGCAA	2	12	154384	154395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524512
3985	NC_015136	GCA	2	6	154398	154403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524512
3986	NC_015136	AGA	2	6	154439	154444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524512
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3988	NC_015136	G	7	7	154512	154518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_015136	GCCG	2	8	154533	154540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3990	NC_015136	CG	4	8	154553	154560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3991	NC_015136	CGA	2	6	154604	154609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_015136	GCC	2	6	154669	154674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3993	NC_015136	CGCGC	2	10	154678	154687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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