MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 106632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_015136	CGGT	2	8	1308522	1308529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33502	NC_015136	CG	3	6	1308660	1308665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33503	NC_015136	CG	3	6	1308672	1308677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33504	NC_015136	TCCG	2	8	1308799	1308806	0 %	25 %	25 %	50 %	323525520
33505	NC_015136	CGT	2	6	1308951	1308956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33506	NC_015136	AGG	2	6	1308968	1308973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323525520
33507	NC_015136	CGC	2	6	1308995	1309000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525520
33508	NC_015136	GCA	2	6	1309038	1309043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33509	NC_015136	TCG	2	6	1309076	1309081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33510	NC_015136	ACG	2	6	1309088	1309093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33511	NC_015136	GCA	2	6	1309121	1309126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33512	NC_015136	CAT	2	6	1309137	1309142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525520
33513	NC_015136	GCG	2	6	1309148	1309153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525520
33514	NC_015136	CCT	2	6	1309293	1309298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323525520
33515	NC_015136	GTC	2	6	1309315	1309320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33516	NC_015136	GAC	2	6	1309342	1309347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525520
33517	NC_015136	CGGC	2	8	1309436	1309443	0 %	0 %	50 %	50 %	323525520
33518	NC_015136	CGCC	2	8	1309491	1309498	0 %	0 %	25 %	75 %	323525520
33519	NC_015136	AGAT	2	8	1309586	1309593	50 %	25 %	25 %	0 %	323525520
33520	NC_015136	CG	3	6	1309642	1309647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33521	NC_015136	TCC	2	6	1309662	1309667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33522	NC_015136	GGCTG	2	10	1309684	1309693	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33523	NC_015136	CGC	2	6	1309754	1309759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33524	NC_015136	GA	3	6	1309783	1309788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33525	NC_015136	TCGT	2	8	1309791	1309798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33526	NC_015136	GCG	2	6	1309806	1309811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33527	NC_015136	GTC	2	6	1309831	1309836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33528	NC_015136	G	6	6	1309921	1309926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33529	NC_015136	ACA	2	6	1309979	1309984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323525521
33530	NC_015136	GTC	2	6	1309994	1309999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525521
33531	NC_015136	CGC	2	6	1310033	1310038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525521
33532	NC_015136	AAC	2	6	1310076	1310081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323525521
33533	NC_015136	GCT	2	6	1310098	1310103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525521
33534	NC_015136	GGC	2	6	1310197	1310202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525521
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33536	NC_015136	CGGC	2	8	1310256	1310263	0 %	0 %	50 %	50 %	323525521
33537	NC_015136	GATGAC	2	12	1310266	1310277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	323525521
33538	NC_015136	TGC	2	6	1310313	1310318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525521
33539	NC_015136	CCG	3	9	1310328	1310336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525521
33540	NC_015136	CTCG	2	8	1310339	1310346	0 %	25 %	25 %	50 %	323525521
33541	NC_015136	GCC	2	6	1310373	1310378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525521
33542	NC_015136	GC	3	6	1310417	1310422	0 %	0 %	50 %	50 %	323525521
33543	NC_015136	GCC	2	6	1310444	1310449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525521
33544	NC_015136	GA	3	6	1310457	1310462	50 %	0 %	50 %	0 %	323525521
33545	NC_015136	GCC	2	6	1310472	1310477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525521
33546	NC_015136	CAT	2	6	1310482	1310487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525521
33547	NC_015136	TGCG	2	8	1310493	1310500	0 %	25 %	50 %	25 %	323525521
33548	NC_015136	CG	3	6	1310499	1310504	0 %	0 %	50 %	50 %	323525521
33549	NC_015136	ACC	2	6	1310586	1310591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33550	NC_015136	TC	3	6	1310598	1310603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33551	NC_015136	TCG	2	6	1310630	1310635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33552	NC_015136	TGG	2	6	1310651	1310656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33553	NC_015136	CTG	2	6	1310836	1310841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525522
33554	NC_015136	TGTCG	2	10	1310933	1310942	0 %	40 %	40 %	20 %	323525522
33555	NC_015136	GGA	2	6	1310946	1310951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323525522
33556	NC_015136	TTCG	2	8	1310967	1310974	0 %	50 %	25 %	25 %	323525522
33557	NC_015136	GC	3	6	1311027	1311032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33558	NC_015136	GGC	2	6	1311042	1311047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33559	NC_015136	CTG	2	6	1311122	1311127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33560	NC_015136	G	6	6	1311202	1311207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_015136	CT	3	6	1311216	1311221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33562	NC_015136	AAT	2	6	1311255	1311260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33563	NC_015136	T	6	6	1311269	1311274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33564	NC_015136	CGG	2	6	1311388	1311393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33565	NC_015136	GCG	2	6	1311421	1311426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33566	NC_015136	CG	3	6	1311425	1311430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33567	NC_015136	CAG	2	6	1311440	1311445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33568	NC_015136	GCTGG	2	10	1311446	1311455	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33569	NC_015136	CGGTC	2	10	1311474	1311483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33570	NC_015136	CGA	2	6	1311537	1311542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33572	NC_015136	ACG	2	6	1311616	1311621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525523
33573	NC_015136	CGA	2	6	1311626	1311631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525523
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33577	NC_015136	CGT	2	6	1311740	1311745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525523
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33579	NC_015136	GA	3	6	1311911	1311916	50 %	0 %	50 %	0 %	323525523
33580	NC_015136	ATG	2	6	1311922	1311927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323525523
33581	NC_015136	T	6	6	1311955	1311960	0 %	100 %	0 %	0 %	323525523
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33586	NC_015136	CAT	2	6	1312111	1312116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33587	NC_015136	GCT	2	6	1312243	1312248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33588	NC_015136	TGG	2	6	1312361	1312366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323525524
33589	NC_015136	GTC	2	6	1312389	1312394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525524
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33591	NC_015136	CGATG	2	10	1312402	1312411	20 %	20 %	40 %	20 %	323525524
33592	NC_015136	ACA	2	6	1312434	1312439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323525524
33593	NC_015136	GTC	2	6	1312442	1312447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525524
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33597	NC_015136	CG	3	6	1312649	1312654	0 %	0 %	50 %	50 %	323525524
33598	NC_015136	GTG	2	6	1312673	1312678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323525524
33599	NC_015136	CG	4	8	1312738	1312745	0 %	0 %	50 %	50 %	323525524
33600	NC_015136	GCA	2	6	1312891	1312896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525524
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33602	NC_015136	CTCC	2	8	1312973	1312980	0 %	25 %	0 %	75 %	323525524
33603	NC_015136	GGC	2	6	1312995	1313000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525524
33604	NC_015136	AACGT	2	10	1313128	1313137	40 %	20 %	20 %	20 %	323525524
33605	NC_015136	CCA	2	6	1313169	1313174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323525524
33606	NC_015136	CGGA	2	8	1313235	1313242	25 %	0 %	50 %	25 %	323525524
33607	NC_015136	GAG	2	6	1313273	1313278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323525524
33608	NC_015136	GC	3	6	1313289	1313294	0 %	0 %	50 %	50 %	323525524
33609	NC_015136	CTT	2	6	1313318	1313323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323525524
33610	NC_015136	ATG	2	6	1313339	1313344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323525524
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33612	NC_015136	GCA	2	6	1313367	1313372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525524
33613	NC_015136	CAG	2	6	1313447	1313452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525524
33614	NC_015136	TCG	2	6	1313456	1313461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525524
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33617	NC_015136	GTT	2	6	1313669	1313674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323525525
33618	NC_015136	CACG	2	8	1313692	1313699	25 %	0 %	25 %	50 %	323525525
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33737	NC_015136	CGT	2	6	1320430	1320435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525529
33738	NC_015136	CGC	2	6	1320475	1320480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525529
33739	NC_015136	GCC	2	6	1320494	1320499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525529
33740	NC_015136	GAC	2	6	1320530	1320535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525529
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33742	NC_015136	TGA	2	6	1320630	1320635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323525529
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33749	NC_015136	GGC	2	6	1320953	1320958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33758	NC_015136	CT	3	6	1321541	1321546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33759	NC_015136	CTT	2	6	1321631	1321636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33765	NC_015136	AATGCG	2	12	1321844	1321855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	323525530
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33792	NC_015136	TGC	2	6	1323184	1323189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33797	NC_015136	AGTCC	2	10	1323385	1323394	20 %	20 %	20 %	40 %	323525532
33798	NC_015136	CGT	2	6	1323398	1323403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525532
33799	NC_015136	CGTC	2	8	1323408	1323415	0 %	25 %	25 %	50 %	323525532
33800	NC_015136	CGT	2	6	1323438	1323443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525532
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33815	NC_015136	CG	3	6	1323875	1323880	0 %	0 %	50 %	50 %	323525532
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33822	NC_015136	CGGT	2	8	1324260	1324267	0 %	25 %	50 %	25 %	323525532
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33832	NC_015136	CGG	2	6	1324495	1324500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525533
33833	NC_015136	CGG	2	6	1324506	1324511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525533
33834	NC_015136	GCA	3	9	1324519	1324527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525533
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33841	NC_015136	GCGT	2	8	1324713	1324720	0 %	25 %	50 %	25 %	323525533
33842	NC_015136	GCC	2	6	1324741	1324746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525533
33843	NC_015136	GAA	2	6	1324843	1324848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323525533
33844	NC_015136	TCA	2	6	1324875	1324880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525533
33845	NC_015136	GC	3	6	1324896	1324901	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33846	NC_015136	CGC	2	6	1324903	1324908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525533
33847	NC_015136	ACC	2	6	1324947	1324952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323525533
33848	NC_015136	CG	3	6	1324978	1324983	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33849	NC_015136	ATC	2	6	1324985	1324990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525533
33850	NC_015136	GAC	2	6	1325003	1325008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525533
33851	NC_015136	CGA	2	6	1325047	1325052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525533
33852	NC_015136	GC	4	8	1325059	1325066	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33853	NC_015136	GC	3	6	1325109	1325114	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33854	NC_015136	GC	3	6	1325162	1325167	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33855	NC_015136	GCG	2	6	1325169	1325174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525533
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33859	NC_015136	TCG	2	6	1325253	1325258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525533
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33861	NC_015136	CGGC	2	8	1325403	1325410	0 %	0 %	50 %	50 %	323525533
33862	NC_015136	CTCGAT	2	12	1325457	1325468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	323525534
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33932	NC_015136	CCTCG	2	10	1328112	1328121	0 %	20 %	20 %	60 %	323525537
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