MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 106632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_015136	CGG	2	6	1097883	1097888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525341
28502	NC_015136	CCGCA	2	10	1097947	1097956	20 %	0 %	20 %	60 %	323525341
28503	NC_015136	GCT	2	6	1097974	1097979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525341
28504	NC_015136	CGC	2	6	1098021	1098026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525341
28505	NC_015136	GC	3	6	1098037	1098042	0 %	0 %	50 %	50 %	323525341
28506	NC_015136	CGA	2	6	1098073	1098078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525341
28507	NC_015136	CGT	2	6	1098093	1098098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525341
28508	NC_015136	CGA	2	6	1098199	1098204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525341
28509	NC_015136	TCGT	2	8	1098275	1098282	0 %	50 %	25 %	25 %	323525341
28510	NC_015136	GCG	2	6	1098294	1098299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525341
28511	NC_015136	ATC	2	6	1098329	1098334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525341
28512	NC_015136	CGG	2	6	1098366	1098371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525341
28513	NC_015136	CGA	2	6	1098421	1098426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525341
28514	NC_015136	TG	3	6	1098509	1098514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28515	NC_015136	CGC	2	6	1098538	1098543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28516	NC_015136	TAT	2	6	1098567	1098572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28517	NC_015136	TC	3	6	1098577	1098582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28518	NC_015136	GCT	2	6	1098618	1098623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28519	NC_015136	GCTA	2	8	1098639	1098646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28520	NC_015136	GTT	2	6	1098674	1098679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_015136	GTGG	2	8	1098708	1098715	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28522	NC_015136	CTT	2	6	1098803	1098808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28523	NC_015136	TTGC	2	8	1098867	1098874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28524	NC_015136	CAG	2	6	1098883	1098888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28525	NC_015136	TCG	2	6	1098926	1098931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28526	NC_015136	GT	3	6	1099045	1099050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28527	NC_015136	GTT	2	6	1099085	1099090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28528	NC_015136	AT	3	6	1099100	1099105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28529	NC_015136	TAAC	2	8	1099113	1099120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28530	NC_015136	T	6	6	1099150	1099155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28531	NC_015136	AGTGG	2	10	1099168	1099177	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28532	NC_015136	CA	3	6	1099235	1099240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28533	NC_015136	CCGT	2	8	1099275	1099282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28534	NC_015136	GGA	2	6	1099396	1099401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28535	NC_015136	CTGC	2	8	1099580	1099587	0 %	25 %	25 %	50 %	323525342
28536	NC_015136	GC	3	6	1099586	1099591	0 %	0 %	50 %	50 %	323525342
28537	NC_015136	CGA	2	6	1099606	1099611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525342
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28539	NC_015136	GTCC	2	8	1099695	1099702	0 %	25 %	25 %	50 %	323525342
28540	NC_015136	GGC	2	6	1099851	1099856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525342
28541	NC_015136	TGA	2	6	1099890	1099895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323525342
28542	NC_015136	GC	3	6	1099943	1099948	0 %	0 %	50 %	50 %	323525342
28543	NC_015136	CGG	2	6	1100007	1100012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525342
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28545	NC_015136	G	6	6	1100249	1100254	0 %	0 %	100 %	0 %	323525342
28546	NC_015136	ATCT	2	8	1100267	1100274	25 %	50 %	0 %	25 %	323525342
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28549	NC_015136	GC	3	6	1100554	1100559	0 %	0 %	50 %	50 %	323525342
28550	NC_015136	ACA	2	6	1100565	1100570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323525342
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28553	NC_015136	GTT	2	6	1100710	1100715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323525342
28554	NC_015136	CGGTC	2	10	1100852	1100861	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28555	NC_015136	GAGC	2	8	1100933	1100940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28556	NC_015136	TCG	2	6	1100966	1100971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28557	NC_015136	GAC	2	6	1101019	1101024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28558	NC_015136	GCG	2	6	1101062	1101067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28559	NC_015136	GAC	2	6	1101078	1101083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28560	NC_015136	GAG	2	6	1101095	1101100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28561	NC_015136	TAG	2	6	1101131	1101136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28562	NC_015136	CGAC	2	8	1101204	1101211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28563	NC_015136	GCG	2	6	1101215	1101220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28564	NC_015136	CGC	2	6	1101227	1101232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28565	NC_015136	GA	3	6	1101260	1101265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28566	NC_015136	TGA	2	6	1101275	1101280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28569	NC_015136	TGA	2	6	1101349	1101354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28570	NC_015136	GAC	2	6	1101444	1101449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28571	NC_015136	TTTG	2	8	1101482	1101489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28572	NC_015136	AGCG	2	8	1101538	1101545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28573	NC_015136	TTG	2	6	1101577	1101582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28574	NC_015136	GCCG	2	8	1101609	1101616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28575	NC_015136	GAT	2	6	1101665	1101670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28576	NC_015136	GAG	2	6	1101713	1101718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28577	NC_015136	GTC	3	9	1101887	1101895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525343
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28581	NC_015136	CGAT	2	8	1102095	1102102	25 %	25 %	25 %	25 %	323525343
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28589	NC_015136	CGA	2	6	1102588	1102593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
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28591	NC_015136	GAG	2	6	1102754	1102759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323525343
28592	NC_015136	GC	3	6	1102790	1102795	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28593	NC_015136	TCCA	2	8	1102817	1102824	25 %	25 %	0 %	50 %	323525343
28594	NC_015136	CGA	2	6	1102843	1102848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
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28596	NC_015136	GCGA	2	8	1102895	1102902	25 %	0 %	50 %	25 %	323525343
28597	NC_015136	GC	3	6	1102944	1102949	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
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28604	NC_015136	GC	4	8	1103213	1103220	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28605	NC_015136	CCG	2	6	1103255	1103260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525343
28606	NC_015136	CGG	2	6	1103278	1103283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525343
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28608	NC_015136	TGCCGC	2	12	1103301	1103312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	323525343
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28610	NC_015136	GC	4	8	1103371	1103378	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28611	NC_015136	CGG	2	6	1103470	1103475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525343
28612	NC_015136	CAT	2	6	1103491	1103496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525343
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28617	NC_015136	CGA	2	6	1103707	1103712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
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28620	NC_015136	ATC	2	6	1103798	1103803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525343
28621	NC_015136	CGAA	2	8	1103841	1103848	50 %	0 %	25 %	25 %	323525343
28622	NC_015136	AGC	2	6	1103900	1103905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28623	NC_015136	AGG	2	6	1103907	1103912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323525343
28624	NC_015136	ACC	2	6	1103939	1103944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323525343
28625	NC_015136	ACG	2	6	1103991	1103996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28626	NC_015136	CAT	2	6	1104007	1104012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525343
28627	NC_015136	CGAG	2	8	1104018	1104025	25 %	0 %	50 %	25 %	323525343
28628	NC_015136	CGA	2	6	1104166	1104171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28629	NC_015136	GGCC	2	8	1104226	1104233	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28630	NC_015136	CCT	2	6	1104250	1104255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323525343
28631	NC_015136	GAC	2	6	1104272	1104277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28632	NC_015136	ACCG	2	8	1104314	1104321	25 %	0 %	25 %	50 %	323525343
28633	NC_015136	GAA	2	6	1104332	1104337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323525343
28634	NC_015136	CG	3	6	1104340	1104345	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28635	NC_015136	TCG	2	6	1104369	1104374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28636	NC_015136	CGA	2	6	1104381	1104386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28637	NC_015136	CGGAAG	2	12	1104468	1104479	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	323525343
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28639	NC_015136	GAAG	2	8	1104562	1104569	50 %	0 %	50 %	0 %	323525343
28640	NC_015136	CGA	3	9	1104577	1104585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28641	NC_015136	AAGG	2	8	1104602	1104609	50 %	0 %	50 %	0 %	323525343
28642	NC_015136	CCG	2	6	1104610	1104615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323525343
28643	NC_015136	TCT	2	6	1104618	1104623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323525343
28644	NC_015136	GCG	2	6	1104627	1104632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525343
28645	NC_015136	CGT	2	6	1104654	1104659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28646	NC_015136	CG	3	6	1104694	1104699	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28647	NC_015136	GGC	2	6	1104745	1104750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525343
28648	NC_015136	GC	3	6	1104749	1104754	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
28649	NC_015136	TGC	2	6	1104855	1104860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525343
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28651	NC_015136	ATC	2	6	1104944	1104949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525343
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28656	NC_015136	TGC	2	6	1105230	1105235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525343
28657	NC_015136	GGGCA	2	10	1105256	1105265	20 %	0 %	60 %	20 %	323525343
28658	NC_015136	GC	3	6	1105313	1105318	0 %	0 %	50 %	50 %	323525343
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28672	NC_015136	CGT	2	6	1105994	1105999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525344
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28674	NC_015136	CCGC	2	8	1106107	1106114	0 %	0 %	25 %	75 %	323525344
28675	NC_015136	ACG	2	6	1106120	1106125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525344
28676	NC_015136	CTG	2	6	1106136	1106141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525344
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28679	NC_015136	AGG	2	6	1106301	1106306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28680	NC_015136	A	6	6	1106368	1106373	100 %	0 %	0 %	0 %	323525345
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28682	NC_015136	GCT	2	6	1106457	1106462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525345
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28684	NC_015136	GCA	2	6	1106496	1106501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525345
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28692	NC_015136	GCA	2	6	1106751	1106756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525345
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28699	NC_015136	GC	3	6	1107169	1107174	0 %	0 %	50 %	50 %	323525345
28700	NC_015136	GC	3	6	1107195	1107200	0 %	0 %	50 %	50 %	323525345
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28704	NC_015136	CG	3	6	1107414	1107419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28705	NC_015136	GCGCT	2	10	1107429	1107438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28706	NC_015136	GGCC	2	8	1107521	1107528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28707	NC_015136	ACG	2	6	1107559	1107564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28708	NC_015136	CGA	3	9	1107565	1107573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28709	NC_015136	TAA	2	6	1107643	1107648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28710	NC_015136	CGG	2	6	1107662	1107667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28711	NC_015136	GCT	2	6	1107673	1107678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28712	NC_015136	ACT	2	6	1107819	1107824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28713	NC_015136	ACT	2	6	1107940	1107945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28714	NC_015136	CG	3	6	1107983	1107988	0 %	0 %	50 %	50 %	323525346
28715	NC_015136	CAA	2	6	1108026	1108031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323525346
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28720	NC_015136	AGA	2	6	1108149	1108154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323525346
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28723	NC_015136	A	7	7	1108588	1108594	100 %	0 %	0 %	0 %	323525346
28724	NC_015136	GAC	2	6	1108636	1108641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323525346
28725	NC_015136	GA	3	6	1108657	1108662	50 %	0 %	50 %	0 %	323525346
28726	NC_015136	GCT	2	6	1108681	1108686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525346
28727	NC_015136	GC	3	6	1108703	1108708	0 %	0 %	50 %	50 %	323525346
28728	NC_015136	GTC	2	6	1108729	1108734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525346
28729	NC_015136	TCG	2	6	1108816	1108821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525346
28730	NC_015136	GCG	2	6	1108829	1108834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525346
28731	NC_015136	TGA	2	6	1108881	1108886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323525346
28732	NC_015136	GGC	2	6	1108892	1108897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525346
28733	NC_015136	GGC	2	6	1108917	1108922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525346
28734	NC_015136	CAT	2	6	1108969	1108974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525346
28735	NC_015136	TATC	2	8	1109057	1109064	25 %	50 %	0 %	25 %	323525346
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28848	NC_015136	GAT	2	6	1115694	1115699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28852	NC_015136	CCG	2	6	1116070	1116075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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28854	NC_015136	TCA	2	6	1116116	1116121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28856	NC_015136	GCAG	2	8	1116187	1116194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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28858	NC_015136	ACG	2	6	1116324	1116329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28860	NC_015136	CTGGA	2	10	1116411	1116420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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28863	NC_015136	GGC	2	6	1116669	1116674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28977	NC_015136	AGCG	3	12	1122828	1122839	25 %	0 %	50 %	25 %	323525356
28978	NC_015136	TGG	2	6	1122875	1122880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323525356
28979	NC_015136	GCTGC	2	10	1122882	1122891	0 %	20 %	40 %	40 %	323525356
28980	NC_015136	TCG	2	6	1122892	1122897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323525356
28981	NC_015136	ATC	2	6	1122977	1122982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323525356
28982	NC_015136	CTGC	2	8	1123083	1123090	0 %	25 %	25 %	50 %	323525356
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28984	NC_015136	CG	3	6	1123124	1123129	0 %	0 %	50 %	50 %	323525356
28985	NC_015136	GTT	2	6	1123167	1123172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323525356
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28989	NC_015136	GCTCG	2	10	1123269	1123278	0 %	20 %	40 %	40 %	323525356
28990	NC_015136	GC	3	6	1123284	1123289	0 %	0 %	50 %	50 %	323525356
28991	NC_015136	TCT	2	6	1123425	1123430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323525356
28992	NC_015136	GCG	2	6	1123450	1123455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323525356
28993	NC_015136	CG	3	6	1123684	1123689	0 %	0 %	50 %	50 %	323525356
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28995	NC_015136	TCCTG	2	10	1123776	1123785	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28996	NC_015136	GCTCG	2	10	1123921	1123930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28997	NC_015136	TCCG	2	8	1124003	1124010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28998	NC_015136	CACGA	2	10	1124054	1124063	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28999	NC_015136	TC	3	6	1124166	1124171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29000	NC_015136	AGT	2	6	1124180	1124185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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