MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 106632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015136	CTG	2	6	600232	600237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16002	NC_015136	CCCGCA	2	12	600263	600274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	323524907
16003	NC_015136	CCCGCA	2	12	600281	600292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	323524907
16004	NC_015136	CCTGCA	5	30	600293	600322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	323524907
16005	NC_015136	ACACCT	2	12	600344	600355	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	323524907
16006	NC_015136	TCA	2	6	600462	600467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524907
16007	NC_015136	CCG	2	6	600483	600488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524907
16008	NC_015136	AAC	2	6	600509	600514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524907
16009	NC_015136	ACG	2	6	600536	600541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16010	NC_015136	CAG	2	6	600702	600707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16011	NC_015136	TGC	2	6	600762	600767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16012	NC_015136	CGA	2	6	600889	600894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16013	NC_015136	CTACAC	2	12	600928	600939	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	323524907
16014	NC_015136	CTA	2	6	601054	601059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524907
16015	NC_015136	CAG	2	6	601148	601153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16016	NC_015136	ACT	2	6	601158	601163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524907
16017	NC_015136	GAGCC	2	10	601178	601187	20 %	0 %	40 %	40 %	323524907
16018	NC_015136	TCG	2	6	601215	601220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16019	NC_015136	CATT	2	8	601246	601253	25 %	50 %	0 %	25 %	323524907
16020	NC_015136	GTC	2	6	601271	601276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16021	NC_015136	CAC	2	6	601318	601323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524907
16022	NC_015136	GC	3	6	601344	601349	0 %	0 %	50 %	50 %	323524907
16023	NC_015136	CCG	2	6	601421	601426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524907
16024	NC_015136	CGGATC	2	12	601440	601451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16025	NC_015136	GCAG	2	8	601507	601514	25 %	0 %	50 %	25 %	323524907
16026	NC_015136	CTT	2	6	601534	601539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524907
16027	NC_015136	GTT	2	6	601606	601611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524907
16028	NC_015136	TCGC	2	8	601633	601640	0 %	25 %	25 %	50 %	323524907
16029	NC_015136	CAT	2	6	601642	601647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524907
16030	NC_015136	CGG	3	9	601654	601662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524907
16031	NC_015136	CAC	2	6	601672	601677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524907
16032	NC_015136	GTT	2	6	601678	601683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524907
16033	NC_015136	GTTC	2	8	601719	601726	0 %	50 %	25 %	25 %	323524907
16034	NC_015136	CGA	2	6	601761	601766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16035	NC_015136	TC	3	6	601768	601773	0 %	50 %	0 %	50 %	323524907
16036	NC_015136	CGA	2	6	601800	601805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16037	NC_015136	CGGCAA	2	12	601891	601902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16038	NC_015136	CGA	2	6	601944	601949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16039	NC_015136	GCG	3	9	601950	601958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524907
16040	NC_015136	CGA	2	6	601977	601982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16041	NC_015136	ACGCTG	2	12	602084	602095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	323524907
16042	NC_015136	AAC	2	6	602123	602128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524907
16043	NC_015136	GAA	2	6	602140	602145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524907
16044	NC_015136	CTG	2	6	602207	602212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_015136	GCGCA	2	10	602260	602269	20 %	0 %	40 %	40 %	323524908
16046	NC_015136	CG	4	8	602335	602342	0 %	0 %	50 %	50 %	323524908
16047	NC_015136	CGA	2	6	602371	602376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524908
16048	NC_015136	CGGC	2	8	602434	602441	0 %	0 %	50 %	50 %	323524908
16049	NC_015136	CGGCTG	2	12	602459	602470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	323524908
16050	NC_015136	TGCG	2	8	602481	602488	0 %	25 %	50 %	25 %	323524908
16051	NC_015136	GC	3	6	602495	602500	0 %	0 %	50 %	50 %	323524908
16052	NC_015136	CGC	2	6	602506	602511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524908
16053	NC_015136	TCG	3	9	602523	602531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524908
16054	NC_015136	CG	3	6	602550	602555	0 %	0 %	50 %	50 %	323524908
16055	NC_015136	ACG	2	6	602562	602567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524908
16056	NC_015136	TGCT	2	8	602601	602608	0 %	50 %	25 %	25 %	323524908
16057	NC_015136	GAC	2	6	602651	602656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524908
16058	NC_015136	CTGC	2	8	602680	602687	0 %	25 %	25 %	50 %	323524908
16059	NC_015136	ATT	2	6	602696	602701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	323524908
16060	NC_015136	TTCG	2	8	602738	602745	0 %	50 %	25 %	25 %	323524908
16061	NC_015136	GC	3	6	602849	602854	0 %	0 %	50 %	50 %	323524908
16062	NC_015136	GTAC	2	8	602872	602879	25 %	25 %	25 %	25 %	323524908
16063	NC_015136	CG	3	6	602983	602988	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16064	NC_015136	GTA	2	6	602990	602995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524909
16065	NC_015136	GGC	2	6	603052	603057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16066	NC_015136	AG	3	6	603065	603070	50 %	0 %	50 %	0 %	323524909
16067	NC_015136	GGC	2	6	603080	603085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16068	NC_015136	GC	3	6	603084	603089	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16069	NC_015136	CTT	2	6	603122	603127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524909
16070	NC_015136	GC	3	6	603146	603151	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16071	NC_015136	GTG	2	6	603158	603163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524909
16072	NC_015136	GCGG	2	8	603284	603291	0 %	0 %	75 %	25 %	323524909
16073	NC_015136	CGC	2	6	603293	603298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16074	NC_015136	CG	3	6	603331	603336	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16075	NC_015136	CG	4	8	603349	603356	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16076	NC_015136	GCC	2	6	603370	603375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16077	NC_015136	CCG	2	6	603417	603422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16078	NC_015136	CCG	2	6	603474	603479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16079	NC_015136	CGTTGC	2	12	603501	603512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16080	NC_015136	GCA	2	6	603592	603597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16081	NC_015136	TGC	2	6	603621	603626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16082	NC_015136	CGG	2	6	603628	603633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16083	NC_015136	AAC	2	6	603692	603697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524909
16084	NC_015136	CGC	2	6	603751	603756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16085	NC_015136	CGC	2	6	603771	603776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16086	NC_015136	GAC	2	6	603896	603901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16087	NC_015136	GCG	2	6	604059	604064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16088	NC_015136	CG	3	6	604063	604068	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16089	NC_015136	CCG	2	6	604088	604093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16090	NC_015136	CGC	2	6	604114	604119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524909
16091	NC_015136	CGCA	2	8	604184	604191	25 %	0 %	25 %	50 %	323524909
16092	NC_015136	CTG	2	6	604214	604219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16093	NC_015136	CG	3	6	604283	604288	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16094	NC_015136	CGA	2	6	604291	604296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524909
16095	NC_015136	AG	3	6	604298	604303	50 %	0 %	50 %	0 %	323524909
16096	NC_015136	GTGC	2	8	604337	604344	0 %	25 %	50 %	25 %	323524909
16097	NC_015136	CGGC	2	8	604372	604379	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16098	NC_015136	CGG	2	6	604399	604404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16099	NC_015136	GGCGC	2	10	604427	604436	0 %	0 %	60 %	40 %	323524909
16100	NC_015136	CGG	2	6	604487	604492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524909
16101	NC_015136	GC	3	6	604498	604503	0 %	0 %	50 %	50 %	323524909
16102	NC_015136	GTG	2	6	604618	604623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524910
16103	NC_015136	CGG	2	6	604635	604640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524910
16104	NC_015136	GCCGT	2	10	604648	604657	0 %	20 %	40 %	40 %	323524910
16105	NC_015136	GTT	2	6	604677	604682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524910
16106	NC_015136	GTA	2	6	604698	604703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524910
16107	NC_015136	TGT	2	6	604718	604723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524910
16108	NC_015136	GC	3	6	604731	604736	0 %	0 %	50 %	50 %	323524910
16109	NC_015136	ATTCC	2	10	604806	604815	20 %	40 %	0 %	40 %	323524910
16110	NC_015136	TGA	2	6	604817	604822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524910
16111	NC_015136	CCGT	2	8	604882	604889	0 %	25 %	25 %	50 %	323524910
16112	NC_015136	GCC	2	6	604962	604967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524910
16113	NC_015136	AG	3	6	604994	604999	50 %	0 %	50 %	0 %	323524910
16114	NC_015136	GCC	2	6	605059	605064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524910
16115	NC_015136	TTG	2	6	605119	605124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524910
16116	NC_015136	GTCGA	2	10	605152	605161	20 %	20 %	40 %	20 %	323524910
16117	NC_015136	TGA	2	6	605162	605167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524910
16118	NC_015136	CAG	2	6	605289	605294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524910
16119	NC_015136	GTT	2	6	605301	605306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524910
16120	NC_015136	AGC	2	6	605335	605340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524910
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16122	NC_015136	GAC	2	6	605376	605381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524910
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16143	NC_015136	GCC	2	6	606368	606373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16144	NC_015136	GCG	2	6	606384	606389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16150	NC_015136	T	6	6	606864	606869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16151	NC_015136	GAA	2	6	606887	606892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16232	NC_015136	GTTC	2	8	610933	610940	0 %	50 %	25 %	25 %	323524913
16233	NC_015136	GCGG	2	8	610986	610993	0 %	0 %	75 %	25 %	323524913
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16236	NC_015136	GT	3	6	611086	611091	0 %	50 %	50 %	0 %	323524913
16237	NC_015136	CGG	2	6	611092	611097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524913
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16240	NC_015136	GCG	2	6	611226	611231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524913
16241	NC_015136	CGA	2	6	611237	611242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524913
16242	NC_015136	GGC	2	6	611367	611372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524913
16243	NC_015136	TCG	2	6	611382	611387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524913
16244	NC_015136	TG	3	6	611396	611401	0 %	50 %	50 %	0 %	323524913
16245	NC_015136	GCC	2	6	611409	611414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16246	NC_015136	CGC	2	6	611448	611453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16247	NC_015136	CGG	2	6	611459	611464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16248	NC_015136	TGC	2	6	611542	611547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16251	NC_015136	TCAC	2	8	611711	611718	25 %	25 %	0 %	50 %	323524914
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16261	NC_015136	G	6	6	612382	612387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16335	NC_015136	TTC	2	6	615392	615397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16336	NC_015136	AGGGT	2	10	615435	615444	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16337	NC_015136	CCATG	2	10	615460	615469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16338	NC_015136	ATT	2	6	615502	615507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16339	NC_015136	CGG	2	6	615602	615607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16348	NC_015136	TG	3	6	616124	616129	0 %	50 %	50 %	0 %	323524918
16349	NC_015136	CGC	2	6	616253	616258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524918
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16351	NC_015136	TGT	2	6	616420	616425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524918
16352	NC_015136	CGA	2	6	616478	616483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524918
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16355	NC_015136	GGC	2	6	616724	616729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16356	NC_015136	GTT	2	6	616735	616740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16357	NC_015136	GGC	2	6	616744	616749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16358	NC_015136	ACG	2	6	616781	616786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16359	NC_015136	ACG	2	6	616881	616886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524919
16360	NC_015136	GC	4	8	616888	616895	0 %	0 %	50 %	50 %	323524919
16361	NC_015136	GCC	2	6	616977	616982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524919
16362	NC_015136	CGA	2	6	617063	617068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524919
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16364	NC_015136	AGC	2	6	617140	617145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524919
16365	NC_015136	CTC	2	6	617185	617190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524920
16366	NC_015136	GC	3	6	617227	617232	0 %	0 %	50 %	50 %	323524920
16367	NC_015136	GCA	2	6	617237	617242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524920
16368	NC_015136	GT	3	6	617267	617272	0 %	50 %	50 %	0 %	323524920
16369	NC_015136	CGC	2	6	617282	617287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524920
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16375	NC_015136	GC	3	6	617547	617552	0 %	0 %	50 %	50 %	323524920
16376	NC_015136	TCG	2	6	617667	617672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524920
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16378	NC_015136	T	6	6	617819	617824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16380	NC_015136	TCG	2	6	617920	617925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16381	NC_015136	CGA	2	6	618176	618181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16382	NC_015136	TCG	2	6	618193	618198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16383	NC_015136	TGC	2	6	618238	618243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16385	NC_015136	CTC	2	6	618337	618342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524921
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16403	NC_015136	AGA	2	6	619141	619146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16404	NC_015136	AG	3	6	619187	619192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16405	NC_015136	GCA	2	6	619206	619211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16406	NC_015136	CGCGG	2	10	619244	619253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16407	NC_015136	CAG	2	6	619260	619265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16481	NC_015136	CG	3	6	622326	622331	0 %	0 %	50 %	50 %	323524925
16482	NC_015136	GCGA	2	8	622356	622363	25 %	0 %	50 %	25 %	323524925
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16484	NC_015136	CGGCG	2	10	622396	622405	0 %	0 %	60 %	40 %	323524925
16485	NC_015136	TCC	2	6	622473	622478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524925
16486	NC_015136	CCA	2	6	622519	622524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524925
16487	NC_015136	CGGC	2	8	622531	622538	0 %	0 %	50 %	50 %	323524925
16488	NC_015136	GGCGC	2	10	622555	622564	0 %	0 %	60 %	40 %	323524925
16489	NC_015136	CG	3	6	622565	622570	0 %	0 %	50 %	50 %	323524925
16490	NC_015136	CGA	2	6	622580	622585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524925
16491	NC_015136	ACCAC	2	10	622609	622618	40 %	0 %	0 %	60 %	323524925
16492	NC_015136	GCA	2	6	622684	622689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524925
16493	NC_015136	TCGCA	2	10	622705	622714	20 %	20 %	20 %	40 %	323524925
16494	NC_015136	CGCT	2	8	622738	622745	0 %	25 %	25 %	50 %	323524925
16495	NC_015136	CCGGG	2	10	622816	622825	0 %	0 %	60 %	40 %	323524925
16496	NC_015136	ACC	2	6	622838	622843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524925
16497	NC_015136	TGGT	2	8	622963	622970	0 %	50 %	50 %	0 %	323524925
16498	NC_015136	CCT	2	6	622997	623002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524926
16499	NC_015136	CGCT	2	8	623175	623182	0 %	25 %	25 %	50 %	323524926
16500	NC_015136	GGA	2	6	623194	623199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323524926

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