MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

< Previous12...949596979899100101102103104105106Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015067	CCA	2	6	2178162	2178167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692000
48502	NC_015067	CCA	2	6	2178222	2178227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692000
48503	NC_015067	CGG	2	6	2178295	2178300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692000
48504	NC_015067	CGG	2	6	2178331	2178336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692000
48505	NC_015067	ACA	2	6	2178429	2178434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692000
48506	NC_015067	TCC	2	6	2178440	2178445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692000
48507	NC_015067	ACC	2	6	2178455	2178460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692000
48508	NC_015067	CAA	2	6	2178493	2178498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692000
48509	NC_015067	GGC	2	6	2178526	2178531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692000
48510	NC_015067	CCG	2	6	2178597	2178602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692000
48511	NC_015067	GCC	2	6	2178620	2178625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692000
48512	NC_015067	GTG	2	6	2178737	2178742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692000
48513	NC_015067	TACA	2	8	2178763	2178770	50 %	25 %	0 %	25 %	322692000
48514	NC_015067	AAG	2	6	2178791	2178796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692000
48515	NC_015067	CG	4	8	2178885	2178892	0 %	0 %	50 %	50 %	322692000
48516	NC_015067	GTTG	2	8	2178910	2178917	0 %	50 %	50 %	0 %	322692000
48517	NC_015067	GCG	2	6	2178924	2178929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692000
48518	NC_015067	GAC	2	6	2178977	2178982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692000
48519	NC_015067	TGGTC	2	10	2179081	2179090	0 %	40 %	40 %	20 %	322692000
48520	NC_015067	CGC	2	6	2179102	2179107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692000
48521	NC_015067	GCCAT	2	10	2179137	2179146	20 %	20 %	20 %	40 %	322692000
48522	NC_015067	ATCCTG	2	12	2179199	2179210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322692000
48523	NC_015067	GCC	2	6	2179220	2179225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692000
48524	NC_015067	TTC	2	6	2179238	2179243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692000
48525	NC_015067	CGC	2	6	2179261	2179266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692000
48526	NC_015067	CAA	2	6	2179297	2179302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692000
48527	NC_015067	GAC	2	6	2179303	2179308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692000
48528	NC_015067	CAC	2	6	2179309	2179314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692000
48529	NC_015067	CGA	2	6	2179318	2179323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692000
48530	NC_015067	AAC	2	6	2179351	2179356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692001
48531	NC_015067	CTGAGA	2	12	2179406	2179417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322692001
48532	NC_015067	TGA	2	6	2179482	2179487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692001
48533	NC_015067	CGA	2	6	2179548	2179553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48534	NC_015067	CCG	2	6	2179598	2179603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692001
48535	NC_015067	GCC	2	6	2179621	2179626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692001
48536	NC_015067	CCA	2	6	2179715	2179720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692001
48537	NC_015067	ATCG	2	8	2179738	2179745	25 %	25 %	25 %	25 %	322692001
48538	NC_015067	TGG	2	6	2179751	2179756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692001
48539	NC_015067	GCG	2	6	2179757	2179762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692001
48540	NC_015067	CGA	2	6	2179767	2179772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48541	NC_015067	TCT	2	6	2179865	2179870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692001
48542	NC_015067	GCT	2	6	2179893	2179898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48543	NC_015067	CGA	2	6	2179905	2179910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48544	NC_015067	CCG	2	6	2179928	2179933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692001
48545	NC_015067	CG	3	6	2179945	2179950	0 %	0 %	50 %	50 %	322692001
48546	NC_015067	TGA	2	6	2179961	2179966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692001
48547	NC_015067	TGA	2	6	2179997	2180002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692001
48548	NC_015067	TTG	2	6	2180018	2180023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692001
48549	NC_015067	CTG	2	6	2180179	2180184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48550	NC_015067	CCA	2	6	2180207	2180212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692001
48551	NC_015067	GCG	2	6	2180213	2180218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692001
48552	NC_015067	GCA	2	6	2180244	2180249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48553	NC_015067	TGG	2	6	2180255	2180260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692001
48554	NC_015067	CCGAGG	2	12	2180282	2180293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322692001
48555	NC_015067	CGA	2	6	2180304	2180309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48556	NC_015067	CGC	2	6	2180352	2180357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692001
48557	NC_015067	CG	3	6	2180417	2180422	0 %	0 %	50 %	50 %	322692001
48558	NC_015067	AGC	2	6	2180433	2180438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692001
48559	NC_015067	AC	3	6	2180441	2180446	50 %	0 %	0 %	50 %	322692001
48560	NC_015067	TGC	2	6	2180518	2180523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48561	NC_015067	AT	3	6	2180592	2180597	50 %	50 %	0 %	0 %	322692002
48562	NC_015067	CGA	2	6	2180616	2180621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692002
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48564	NC_015067	CGC	2	6	2180737	2180742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692002
48565	NC_015067	CGG	2	6	2180790	2180795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692002
48566	NC_015067	GCC	2	6	2180802	2180807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692002
48567	NC_015067	CGA	2	6	2180817	2180822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692002
48568	NC_015067	CGG	2	6	2180838	2180843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692002
48569	NC_015067	CTG	2	6	2180845	2180850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692002
48570	NC_015067	CGA	2	6	2180964	2180969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692002
48571	NC_015067	CG	3	6	2181026	2181031	0 %	0 %	50 %	50 %	322692002
48572	NC_015067	CCA	2	6	2181061	2181066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692002
48573	NC_015067	GTG	2	6	2181100	2181105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692002
48574	NC_015067	GCC	2	6	2181138	2181143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692002
48575	NC_015067	CGAGC	2	10	2181175	2181184	20 %	0 %	40 %	40 %	322692002
48576	NC_015067	GA	3	6	2181194	2181199	50 %	0 %	50 %	0 %	322692002
48577	NC_015067	GAT	2	6	2181279	2181284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692002
48578	NC_015067	C	6	6	2181303	2181308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48579	NC_015067	GAT	2	6	2181405	2181410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692003
48580	NC_015067	CGG	2	6	2181476	2181481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692003
48581	NC_015067	GTC	2	6	2181492	2181497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692003
48582	NC_015067	CGG	2	6	2181530	2181535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692003
48583	NC_015067	TCT	2	6	2181587	2181592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692003
48584	NC_015067	CGG	2	6	2181599	2181604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692003
48585	NC_015067	TCG	2	6	2181703	2181708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692003
48586	NC_015067	GAAGCC	2	12	2181714	2181725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692003
48587	NC_015067	GAA	2	6	2181747	2181752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692003
48588	NC_015067	GCC	2	6	2181771	2181776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692003
48589	NC_015067	ATG	2	6	2181907	2181912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692003
48590	NC_015067	TCG	2	6	2181967	2181972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692003
48591	NC_015067	GGGT	2	8	2182043	2182050	0 %	25 %	75 %	0 %	322692003
48592	NC_015067	CAT	2	6	2182112	2182117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692003
48593	NC_015067	GCG	2	6	2182258	2182263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48594	NC_015067	GGC	2	6	2182350	2182355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48595	NC_015067	CGG	2	6	2182415	2182420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48596	NC_015067	CGG	2	6	2182457	2182462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48597	NC_015067	GTG	2	6	2182498	2182503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692004
48598	NC_015067	CGG	2	6	2182520	2182525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48599	NC_015067	GCG	2	6	2182602	2182607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48600	NC_015067	TGG	2	6	2182873	2182878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692004
48601	NC_015067	TCC	2	6	2182954	2182959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692004
48602	NC_015067	TCG	2	6	2182984	2182989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692004
48603	NC_015067	CCA	2	6	2183010	2183015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692004
48604	NC_015067	GC	3	6	2183023	2183028	0 %	0 %	50 %	50 %	322692004
48605	NC_015067	GGT	2	6	2183033	2183038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692004
48606	NC_015067	GAA	2	6	2183052	2183057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692004
48607	NC_015067	TGT	2	6	2183108	2183113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692004
48608	NC_015067	CGG	2	6	2183249	2183254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692004
48609	NC_015067	AACC	2	8	2183269	2183276	50 %	0 %	0 %	50 %	322692004
48610	NC_015067	GAA	2	6	2183307	2183312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692004
48611	NC_015067	GGT	3	9	2183400	2183408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692004
48612	NC_015067	ATC	2	6	2183410	2183415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692004
48613	NC_015067	ACC	2	6	2183512	2183517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692004
48614	NC_015067	GCCG	2	8	2183643	2183650	0 %	0 %	50 %	50 %	322692004
48615	NC_015067	ACAG	2	8	2183653	2183660	50 %	0 %	25 %	25 %	322692004
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48848	NC_015067	CGTTGT	2	12	2192985	2192996	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322692010
48849	NC_015067	GCGG	2	8	2193007	2193014	0 %	0 %	75 %	25 %	322692010
48850	NC_015067	GTCGAT	2	12	2193028	2193039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322692010
48851	NC_015067	CG	3	6	2193086	2193091	0 %	0 %	50 %	50 %	322692010
48852	NC_015067	CAG	2	6	2193097	2193102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692010
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48854	NC_015067	CGG	2	6	2193238	2193243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48855	NC_015067	TCCCA	2	10	2193316	2193325	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
48856	NC_015067	ACG	2	6	2193330	2193335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48857	NC_015067	TTC	2	6	2193380	2193385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48858	NC_015067	CAAG	2	8	2193400	2193407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48859	NC_015067	GCA	2	6	2193441	2193446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48860	NC_015067	CA	3	6	2193463	2193468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48861	NC_015067	CCA	2	6	2193470	2193475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48894	NC_015067	GCG	2	6	2194750	2194755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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48905	NC_015067	CAG	3	9	2195405	2195413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692012
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48913	NC_015067	CCGA	2	8	2195814	2195821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48914	NC_015067	CGC	2	6	2195926	2195931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692013
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48952	NC_015067	CGG	2	6	2197895	2197900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
48953	NC_015067	TGCA	2	8	2197962	2197969	25 %	25 %	25 %	25 %	322692013
48954	NC_015067	CGGTGA	2	12	2198071	2198082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322692013
48955	NC_015067	CAA	2	6	2198154	2198159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48956	NC_015067	CG	3	6	2198189	2198194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48957	NC_015067	AGC	2	6	2198195	2198200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48958	NC_015067	CGA	2	6	2198275	2198280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48959	NC_015067	TAC	2	6	2198296	2198301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48960	NC_015067	ATCA	2	8	2198337	2198344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48961	NC_015067	CGTA	2	8	2198392	2198399	25 %	25 %	25 %	25 %	322692014
48962	NC_015067	CAA	2	6	2198412	2198417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692014
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48964	NC_015067	CGG	2	6	2198447	2198452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692014
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48995	NC_015067	CGCTA	2	10	2200031	2200040	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48996	NC_015067	CGA	2	6	2200089	2200094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692015
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