MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_015067	TGC	2	6	2022007	2022012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691893
45002	NC_015067	ATTG	2	8	2022038	2022045	25 %	50 %	25 %	0 %	322691893
45003	NC_015067	GCC	2	6	2022057	2022062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691893
45004	NC_015067	GCCA	2	8	2022091	2022098	25 %	0 %	25 %	50 %	322691893
45005	NC_015067	GTT	2	6	2022102	2022107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691893
45006	NC_015067	TCA	2	6	2022136	2022141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691893
45007	NC_015067	GGCG	2	8	2022193	2022200	0 %	0 %	75 %	25 %	322691893
45008	NC_015067	TGG	2	6	2022205	2022210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691893
45009	NC_015067	AGA	2	6	2022396	2022401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691894
45010	NC_015067	CCA	2	6	2022421	2022426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691894
45011	NC_015067	GAA	2	6	2022458	2022463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691894
45012	NC_015067	CA	3	6	2022504	2022509	50 %	0 %	0 %	50 %	322691894
45013	NC_015067	GGC	2	6	2022532	2022537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691894
45014	NC_015067	GATG	2	8	2022682	2022689	25 %	25 %	50 %	0 %	322691894
45015	NC_015067	GTGG	2	8	2022692	2022699	0 %	25 %	75 %	0 %	322691894
45016	NC_015067	CGC	2	6	2022887	2022892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691894
45017	NC_015067	GCCG	2	8	2022952	2022959	0 %	0 %	50 %	50 %	322691894
45018	NC_015067	ATG	2	6	2022966	2022971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691894
45019	NC_015067	GCCG	2	8	2022973	2022980	0 %	0 %	50 %	50 %	322691894
45020	NC_015067	CGG	2	6	2023007	2023012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691894
45021	NC_015067	GGCC	3	12	2023038	2023049	0 %	0 %	50 %	50 %	322691894
45022	NC_015067	ACCA	2	8	2023075	2023082	50 %	0 %	0 %	50 %	322691894
45023	NC_015067	GCG	2	6	2023159	2023164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45024	NC_015067	GGA	2	6	2023228	2023233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45025	NC_015067	CCTA	2	8	2023242	2023249	25 %	25 %	0 %	50 %	322691895
45026	NC_015067	CAG	2	6	2023290	2023295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691895
45027	NC_015067	GAC	2	6	2023305	2023310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691895
45028	NC_015067	CCG	2	6	2023363	2023368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691895
45029	NC_015067	ACG	2	6	2023453	2023458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45030	NC_015067	CGG	2	6	2023466	2023471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45031	NC_015067	CTGT	2	8	2023500	2023507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45032	NC_015067	GCC	2	6	2023628	2023633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45033	NC_015067	GC	3	6	2023635	2023640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45034	NC_015067	GCG	2	6	2023649	2023654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45035	NC_015067	CTG	2	6	2023687	2023692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691896
45036	NC_015067	GTG	2	6	2023743	2023748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691896
45037	NC_015067	TGG	3	9	2023762	2023770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691896
45038	NC_015067	CCGC	2	8	2023771	2023778	0 %	0 %	25 %	75 %	322691896
45039	NC_015067	ATT	2	6	2023797	2023802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691896
45040	NC_015067	GCC	2	6	2023806	2023811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691896
45041	NC_015067	TGG	2	6	2023879	2023884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691896
45042	NC_015067	AGC	2	6	2023910	2023915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691896
45043	NC_015067	ACCG	2	8	2023958	2023965	25 %	0 %	25 %	50 %	322691896
45044	NC_015067	CGA	2	6	2024003	2024008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691896
45045	NC_015067	CCG	2	6	2024041	2024046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691896
45046	NC_015067	TGA	2	6	2024092	2024097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691896
45047	NC_015067	CGAC	2	8	2024138	2024145	25 %	0 %	25 %	50 %	322691896
45048	NC_015067	GCC	2	6	2024162	2024167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691896
45049	NC_015067	GCG	2	6	2024355	2024360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691897
45050	NC_015067	GTC	3	9	2024383	2024391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691897
45051	NC_015067	GTT	2	6	2024400	2024405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691897
45052	NC_015067	GGTC	2	8	2024406	2024413	0 %	25 %	50 %	25 %	322691897
45053	NC_015067	TCA	2	6	2024469	2024474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691897
45054	NC_015067	GGC	2	6	2024601	2024606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691898
45055	NC_015067	TCA	2	6	2024621	2024626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691898
45056	NC_015067	CAC	2	6	2024751	2024756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691898
45057	NC_015067	CAG	2	6	2024795	2024800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45058	NC_015067	CG	4	8	2024812	2024819	0 %	0 %	50 %	50 %	322691898
45059	NC_015067	TCG	2	6	2024836	2024841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45060	NC_015067	GCC	2	6	2024853	2024858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691898
45061	NC_015067	GTC	2	6	2024889	2024894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45062	NC_015067	TTC	2	6	2024955	2024960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691898
45063	NC_015067	CTG	2	6	2025069	2025074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45064	NC_015067	CGTG	2	8	2025086	2025093	0 %	25 %	50 %	25 %	322691898
45065	NC_015067	AACC	2	8	2025159	2025166	50 %	0 %	0 %	50 %	322691898
45066	NC_015067	TGCC	2	8	2025203	2025210	0 %	25 %	25 %	50 %	322691898
45067	NC_015067	GGAA	2	8	2025282	2025289	50 %	0 %	50 %	0 %	322691898
45068	NC_015067	CGG	2	6	2025302	2025307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691898
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45071	NC_015067	GGCT	2	8	2025346	2025353	0 %	25 %	50 %	25 %	322691898
45072	NC_015067	CCA	2	6	2025359	2025364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691898
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45075	NC_015067	CAT	2	6	2025443	2025448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691898
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45077	NC_015067	GCA	2	6	2025514	2025519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45078	NC_015067	GCT	2	6	2025551	2025556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45079	NC_015067	CAC	3	9	2025594	2025602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691898
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45083	NC_015067	CAGC	2	8	2025677	2025684	25 %	0 %	25 %	50 %	322691898
45084	NC_015067	GCG	2	6	2025703	2025708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691898
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45087	NC_015067	AC	3	6	2025788	2025793	50 %	0 %	0 %	50 %	322691898
45088	NC_015067	GC	3	6	2025796	2025801	0 %	0 %	50 %	50 %	322691898
45089	NC_015067	GGC	2	6	2025863	2025868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691898
45090	NC_015067	GAT	2	6	2025975	2025980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691898
45091	NC_015067	GGT	2	6	2026011	2026016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691898
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45101	NC_015067	GAT	2	6	2026293	2026298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691898
45102	NC_015067	TCG	2	6	2026300	2026305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
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45106	NC_015067	GC	3	6	2026409	2026414	0 %	0 %	50 %	50 %	322691898
45107	NC_015067	GCA	2	6	2026421	2026426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45108	NC_015067	GGC	3	9	2026448	2026456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691898
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45115	NC_015067	GCA	2	6	2026694	2026699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691898
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45118	NC_015067	GTGG	2	8	2026881	2026888	0 %	25 %	75 %	0 %	322691898
45119	NC_015067	TCG	2	6	2027020	2027025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45120	NC_015067	GCT	2	6	2027084	2027089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
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45124	NC_015067	GCA	2	6	2027308	2027313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691898
45125	NC_015067	GCGG	2	8	2027424	2027431	0 %	0 %	75 %	25 %	322691898
45126	NC_015067	TCG	2	6	2027434	2027439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691898
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45220	NC_015067	CG	3	6	2032016	2032021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45221	NC_015067	CCTT	2	8	2032022	2032029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45222	NC_015067	GT	3	6	2032036	2032041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45223	NC_015067	GTT	2	6	2032059	2032064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45224	NC_015067	ATT	2	6	2032069	2032074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45225	NC_015067	CAGT	2	8	2032079	2032086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45226	NC_015067	CG	3	6	2032162	2032167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45227	NC_015067	GCA	2	6	2032215	2032220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45228	NC_015067	AG	3	6	2032262	2032267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45229	NC_015067	TTC	2	6	2032280	2032285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691903
45230	NC_015067	GGCC	2	8	2032327	2032334	0 %	0 %	50 %	50 %	322691903
45231	NC_015067	TTC	2	6	2032343	2032348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691903
45232	NC_015067	CAT	2	6	2032360	2032365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691903
45233	NC_015067	CGT	2	6	2032366	2032371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691903
45234	NC_015067	GCG	2	6	2032410	2032415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691903
45235	NC_015067	CCA	2	6	2032425	2032430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691903
45236	NC_015067	CAT	2	6	2032441	2032446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691903
45237	NC_015067	GCC	2	6	2032493	2032498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691903
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45239	NC_015067	GCA	2	6	2032558	2032563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691903
45240	NC_015067	TCA	2	6	2032605	2032610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691903
45241	NC_015067	GAT	2	6	2032630	2032635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691903
45242	NC_015067	CGG	3	9	2032672	2032680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691903
45243	NC_015067	GCC	3	9	2032754	2032762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691903
45244	NC_015067	TGA	2	6	2032863	2032868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691903
45245	NC_015067	TGC	2	6	2032884	2032889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691903
45246	NC_015067	GCCATC	2	12	2032892	2032903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322691903
45247	NC_015067	ACC	2	6	2032904	2032909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691903
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45263	NC_015067	TCG	2	6	2033418	2033423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691903
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45274	NC_015067	TGT	2	6	2033750	2033755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45337	NC_015067	GCG	2	6	2036408	2036413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691904
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45341	NC_015067	GAT	2	6	2036524	2036529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691904
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45343	NC_015067	CGG	2	6	2036570	2036575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691904
45344	NC_015067	TCT	2	6	2036610	2036615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691904
45345	NC_015067	GAA	2	6	2036638	2036643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691904
45346	NC_015067	CGG	2	6	2036670	2036675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691904
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45466	NC_015067	AAT	2	6	2041622	2041627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45467	NC_015067	AATG	2	8	2041705	2041712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45468	NC_015067	CAAG	2	8	2041902	2041909	50 %	0 %	25 %	25 %	322691908
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