MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015067	TCGGC	2	10	2000001	2000010	0 %	20 %	40 %	40 %	322691875
44502	NC_015067	CTCG	2	8	2000035	2000042	0 %	25 %	25 %	50 %	322691875
44503	NC_015067	CGA	2	6	2000068	2000073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44504	NC_015067	GCA	2	6	2000104	2000109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44505	NC_015067	CAC	2	6	2000227	2000232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691875
44506	NC_015067	CATC	2	8	2000262	2000269	25 %	25 %	0 %	50 %	322691875
44507	NC_015067	CTG	2	6	2000273	2000278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44508	NC_015067	ACT	2	6	2000331	2000336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691875
44509	NC_015067	CCT	2	6	2000373	2000378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691875
44510	NC_015067	GCC	2	6	2000390	2000395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691875
44511	NC_015067	GCC	2	6	2000411	2000416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691875
44512	NC_015067	AAG	2	6	2000424	2000429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691875
44513	NC_015067	GC	3	6	2000443	2000448	0 %	0 %	50 %	50 %	322691875
44514	NC_015067	TCA	2	6	2000472	2000477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691875
44515	NC_015067	CA	3	6	2000495	2000500	50 %	0 %	0 %	50 %	322691875
44516	NC_015067	GGC	2	6	2000507	2000512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691875
44517	NC_015067	CTG	2	6	2000530	2000535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44518	NC_015067	CGA	2	6	2000545	2000550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44519	NC_015067	CTA	2	6	2000557	2000562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691875
44520	NC_015067	ACC	2	6	2000600	2000605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691875
44521	NC_015067	CAT	2	6	2000753	2000758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691875
44522	NC_015067	CTG	3	9	2000789	2000797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44523	NC_015067	GAATG	2	10	2000879	2000888	40 %	20 %	40 %	0 %	322691875
44524	NC_015067	CGG	2	6	2000935	2000940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691875
44525	NC_015067	ACG	2	6	2001060	2001065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44526	NC_015067	AAT	2	6	2001128	2001133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691875
44527	NC_015067	TCG	2	6	2001140	2001145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44528	NC_015067	GAT	2	6	2001185	2001190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691875
44529	NC_015067	GGC	2	6	2001217	2001222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691875
44530	NC_015067	TGC	3	9	2001240	2001248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44531	NC_015067	GAT	2	6	2001265	2001270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691875
44532	NC_015067	CGA	2	6	2001280	2001285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44533	NC_015067	CAA	3	9	2001307	2001315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691875
44534	NC_015067	CCA	2	6	2001369	2001374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691875
44535	NC_015067	CG	3	6	2001381	2001386	0 %	0 %	50 %	50 %	322691875
44536	NC_015067	TGG	2	6	2001417	2001422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691875
44537	NC_015067	CAC	2	6	2001449	2001454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691875
44538	NC_015067	TTC	2	6	2001461	2001466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691875
44539	NC_015067	CGTA	2	8	2001568	2001575	25 %	25 %	25 %	25 %	322691875
44540	NC_015067	GAC	2	6	2001641	2001646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44541	NC_015067	GCC	2	6	2001661	2001666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691875
44542	NC_015067	GCC	2	6	2001711	2001716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691875
44543	NC_015067	ACC	2	6	2001764	2001769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691875
44544	NC_015067	GCA	2	6	2001778	2001783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44545	NC_015067	GAA	2	6	2001821	2001826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691875
44546	NC_015067	CGC	2	6	2001904	2001909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691875
44547	NC_015067	GAT	2	6	2001971	2001976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691875
44548	NC_015067	CGA	2	6	2001994	2001999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691875
44549	NC_015067	TGA	2	6	2002035	2002040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691875
44550	NC_015067	ACACAA	2	12	2002072	2002083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44551	NC_015067	CTT	2	6	2002190	2002195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691876
44552	NC_015067	ACG	2	6	2002203	2002208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691876
44553	NC_015067	AGCC	2	8	2002228	2002235	25 %	0 %	25 %	50 %	322691876
44554	NC_015067	TTC	2	6	2002236	2002241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691876
44555	NC_015067	GCG	2	6	2002245	2002250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691876
44556	NC_015067	CGAT	2	8	2002263	2002270	25 %	25 %	25 %	25 %	322691876
44557	NC_015067	GGT	2	6	2002319	2002324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691876
44558	NC_015067	GCC	3	9	2002325	2002333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691876
44559	NC_015067	GCA	2	6	2002405	2002410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691876
44560	NC_015067	CTC	2	6	2002427	2002432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691876
44561	NC_015067	CCT	2	6	2002495	2002500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691876
44562	NC_015067	GCG	2	6	2002502	2002507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691876
44563	NC_015067	GGTGCC	2	12	2002538	2002549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691876
44564	NC_015067	GGT	2	6	2002568	2002573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691876
44565	NC_015067	CTC	2	6	2002586	2002591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691876
44566	NC_015067	CTG	2	6	2002665	2002670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691877
44567	NC_015067	TTC	2	6	2002774	2002779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691877
44568	NC_015067	GCA	2	6	2002781	2002786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691877
44569	NC_015067	TGA	2	6	2002805	2002810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691877
44570	NC_015067	TTC	2	6	2002822	2002827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691877
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44572	NC_015067	ACG	2	6	2002851	2002856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691877
44573	NC_015067	ACC	2	6	2002860	2002865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691877
44574	NC_015067	TTG	2	6	2002903	2002908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691877
44575	NC_015067	TGA	3	9	2002934	2002942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691877
44576	NC_015067	GCA	2	6	2002997	2003002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691877
44577	NC_015067	CAC	2	6	2003034	2003039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691877
44578	NC_015067	GCT	2	6	2003141	2003146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44579	NC_015067	ACA	2	6	2003262	2003267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44580	NC_015067	TC	3	6	2003353	2003358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44581	NC_015067	CCAC	2	8	2003359	2003366	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44582	NC_015067	TC	3	6	2003409	2003414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44583	NC_015067	CTT	2	6	2003423	2003428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44584	NC_015067	GTT	2	6	2003617	2003622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691878
44585	NC_015067	GGC	2	6	2003674	2003679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
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44587	NC_015067	CGA	2	6	2003724	2003729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691878
44588	NC_015067	GCATC	2	10	2003802	2003811	20 %	20 %	20 %	40 %	322691878
44589	NC_015067	GGCCG	2	10	2003845	2003854	0 %	0 %	60 %	40 %	322691878
44590	NC_015067	CGG	2	6	2003907	2003912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44591	NC_015067	CGG	2	6	2003914	2003919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44592	NC_015067	CAC	2	6	2004061	2004066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691878
44593	NC_015067	CGC	2	6	2004090	2004095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691878
44594	NC_015067	ATG	2	6	2004131	2004136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691878
44595	NC_015067	GTA	2	6	2004145	2004150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691878
44596	NC_015067	CCAT	2	8	2004161	2004168	25 %	25 %	0 %	50 %	322691878
44597	NC_015067	CCA	2	6	2004190	2004195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691878
44598	NC_015067	GCACC	2	10	2004228	2004237	20 %	0 %	20 %	60 %	322691878
44599	NC_015067	CATGC	2	10	2004250	2004259	20 %	20 %	20 %	40 %	322691878
44600	NC_015067	GGT	2	6	2004286	2004291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691878
44601	NC_015067	GCG	2	6	2004312	2004317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44602	NC_015067	CGG	2	6	2004355	2004360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44603	NC_015067	CCA	2	6	2004400	2004405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691878
44604	NC_015067	ATG	2	6	2004449	2004454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691878
44605	NC_015067	ATGC	2	8	2004460	2004467	25 %	25 %	25 %	25 %	322691878
44606	NC_015067	GGA	2	6	2004493	2004498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691878
44607	NC_015067	GCT	2	6	2004501	2004506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691878
44608	NC_015067	CGG	2	6	2004507	2004512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44609	NC_015067	CCAG	2	8	2004522	2004529	25 %	0 %	25 %	50 %	322691878
44610	NC_015067	CTC	2	6	2004616	2004621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691878
44611	NC_015067	C	6	6	2004633	2004638	0 %	0 %	0 %	100 %	322691878
44612	NC_015067	CAC	2	6	2004656	2004661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691878
44613	NC_015067	CGG	2	6	2004726	2004731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691878
44614	NC_015067	CGGC	2	8	2004734	2004741	0 %	0 %	50 %	50 %	322691878
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