MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_015067	TCG	2	6	1979562	1979567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44003	NC_015067	TGC	2	6	1979583	1979588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44004	NC_015067	GCCG	2	8	1979609	1979616	0 %	0 %	50 %	50 %	322691844
44005	NC_015067	TCG	2	6	1979682	1979687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44006	NC_015067	CAG	2	6	1979720	1979725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44007	NC_015067	GTG	2	6	1979760	1979765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691844
44008	NC_015067	GCA	2	6	1979805	1979810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44009	NC_015067	CAG	2	6	1979825	1979830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691844
44010	NC_015067	GGT	2	6	1979980	1979985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44011	NC_015067	TGGA	2	8	1980008	1980015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44012	NC_015067	CGA	2	6	1980041	1980046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691845
44013	NC_015067	GGA	2	6	1980053	1980058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691845
44014	NC_015067	AACC	2	8	1980099	1980106	50 %	0 %	0 %	50 %	322691845
44015	NC_015067	CTT	2	6	1980181	1980186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691845
44016	NC_015067	GCGG	2	8	1980208	1980215	0 %	0 %	75 %	25 %	322691845
44017	NC_015067	GCG	2	6	1980236	1980241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691845
44018	NC_015067	CGGA	2	8	1980309	1980316	25 %	0 %	50 %	25 %	322691845
44019	NC_015067	GTT	2	6	1980337	1980342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691845
44020	NC_015067	CGA	2	6	1980392	1980397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691845
44021	NC_015067	GCTT	2	8	1980413	1980420	0 %	50 %	25 %	25 %	322691845
44022	NC_015067	TGT	2	6	1980460	1980465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44023	NC_015067	ATC	2	6	1980490	1980495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44024	NC_015067	ACT	2	6	1980519	1980524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691846
44025	NC_015067	TGG	2	6	1980525	1980530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691846
44026	NC_015067	CTT	3	9	1980532	1980540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691846
44027	NC_015067	CGA	2	6	1980659	1980664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691846
44028	NC_015067	ACG	2	6	1980682	1980687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691846
44029	NC_015067	GCT	2	6	1980741	1980746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691846
44030	NC_015067	CTT	2	6	1980906	1980911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44031	NC_015067	GA	3	6	1981003	1981008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44032	NC_015067	GCT	2	6	1981057	1981062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691847
44033	NC_015067	CGG	2	6	1981104	1981109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691847
44034	NC_015067	CACGA	2	10	1981240	1981249	40 %	0 %	20 %	40 %	322691848
44035	NC_015067	GAT	2	6	1981425	1981430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44036	NC_015067	AC	3	6	1981450	1981455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44037	NC_015067	TA	3	6	1981467	1981472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44038	NC_015067	TTG	2	6	1981554	1981559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44039	NC_015067	CTA	2	6	1981575	1981580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691849
44040	NC_015067	TGA	2	6	1981592	1981597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691849
44041	NC_015067	TCG	2	6	1981612	1981617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691849
44042	NC_015067	ACG	2	6	1981639	1981644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691849
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44044	NC_015067	GTC	2	6	1981731	1981736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691849
44045	NC_015067	CGG	2	6	1981751	1981756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691849
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44047	NC_015067	CAG	2	6	1981776	1981781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691849
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44049	NC_015067	CCA	2	6	1981805	1981810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691849
44050	NC_015067	TCG	2	6	1981846	1981851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691849
44051	NC_015067	GCG	2	6	1981867	1981872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691849
44052	NC_015067	TTG	2	6	1981942	1981947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691849
44053	NC_015067	TGT	2	6	1982024	1982029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691849
44054	NC_015067	TGG	2	6	1982054	1982059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691849
44055	NC_015067	GAGCA	2	10	1982079	1982088	40 %	0 %	40 %	20 %	322691849
44056	NC_015067	ATG	2	6	1982122	1982127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691849
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44058	NC_015067	TTA	2	6	1982160	1982165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_015067	GAA	2	6	1982213	1982218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44060	NC_015067	CGT	2	6	1982228	1982233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44061	NC_015067	CTC	2	6	1982258	1982263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44062	NC_015067	GCC	2	6	1982269	1982274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44063	NC_015067	GCGG	2	8	1982283	1982290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44064	NC_015067	GTG	2	6	1982423	1982428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691850
44065	NC_015067	CAG	2	6	1982497	1982502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691850
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44067	NC_015067	TGG	2	6	1982556	1982561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691850
44068	NC_015067	GCC	2	6	1982590	1982595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691850
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44089	NC_015067	CAC	2	6	1983517	1983522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691850
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44094	NC_015067	GC	3	6	1983664	1983669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44095	NC_015067	CG	3	6	1983674	1983679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44096	NC_015067	AACG	2	8	1983693	1983700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44099	NC_015067	T	6	6	1983840	1983845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44100	NC_015067	GGCG	2	8	1983873	1983880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44101	NC_015067	CCG	2	6	1983937	1983942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691851
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44105	NC_015067	ACGAG	2	10	1984111	1984120	40 %	0 %	40 %	20 %	322691851
44106	NC_015067	TGA	2	6	1984127	1984132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691851
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44109	NC_015067	GGGC	2	8	1984325	1984332	0 %	0 %	75 %	25 %	322691851
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44113	NC_015067	GTG	2	6	1984526	1984531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691852
44114	NC_015067	TCAC	2	8	1984564	1984571	25 %	25 %	0 %	50 %	322691852
44115	NC_015067	CGG	2	6	1984584	1984589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691853
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44117	NC_015067	CGG	2	6	1984638	1984643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691853
44118	NC_015067	GC	3	6	1984649	1984654	0 %	0 %	50 %	50 %	322691853
44119	NC_015067	TCG	2	6	1984676	1984681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691853
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44129	NC_015067	CGT	2	6	1984896	1984901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691853
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44147	NC_015067	GCGAC	2	10	1985335	1985344	20 %	0 %	40 %	40 %	322691854
44148	NC_015067	TTG	2	6	1985353	1985358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691854
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44170	NC_015067	GAT	2	6	1986303	1986308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691856
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44174	NC_015067	CCG	2	6	1986652	1986657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44175	NC_015067	CTT	2	6	1986666	1986671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44179	NC_015067	GTC	2	6	1986951	1986956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691858
44180	NC_015067	TGG	2	6	1986959	1986964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691858
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44194	NC_015067	CTG	2	6	1987649	1987654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691859
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44213	NC_015067	CGT	2	6	1988361	1988366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691861
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44217	NC_015067	GGGT	2	8	1988423	1988430	0 %	25 %	75 %	0 %	322691861
44218	NC_015067	GCT	2	6	1988436	1988441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691861
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44220	NC_015067	CGGC	2	8	1988552	1988559	0 %	0 %	50 %	50 %	322691862
44221	NC_015067	CTT	2	6	1988700	1988705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691862
44222	NC_015067	AAG	2	6	1988707	1988712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691862
44223	NC_015067	TCT	2	6	1988732	1988737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691862
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44225	NC_015067	GCG	2	6	1988840	1988845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691863
44226	NC_015067	AC	3	6	1988872	1988877	50 %	0 %	0 %	50 %	322691863
44227	NC_015067	CCA	2	6	1989015	1989020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691863
44228	NC_015067	CG	3	6	1989048	1989053	0 %	0 %	50 %	50 %	322691863
44229	NC_015067	GCC	2	6	1989128	1989133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691863
44230	NC_015067	TGC	2	6	1989162	1989167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691863
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44232	NC_015067	CGG	2	6	1989265	1989270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691864
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44345	NC_015067	TCC	3	9	1993162	1993170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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