MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015067	TC	3	6	1936230	1936235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43002	NC_015067	ATT	2	6	1936250	1936255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43003	NC_015067	T	7	7	1936254	1936260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_015067	AT	3	6	1936281	1936286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43005	NC_015067	TTG	2	6	1936477	1936482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_015067	CGG	2	6	1936525	1936530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43007	NC_015067	ATT	2	6	1936533	1936538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_015067	TGC	2	6	1936611	1936616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43009	NC_015067	CTCG	2	8	1936634	1936641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43010	NC_015067	ACAG	2	8	1936652	1936659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43011	NC_015067	GCG	2	6	1936704	1936709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691813
43012	NC_015067	GGCC	2	8	1936711	1936718	0 %	0 %	50 %	50 %	322691813
43013	NC_015067	GCA	2	6	1936759	1936764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43014	NC_015067	GAGCA	2	10	1936769	1936778	40 %	0 %	40 %	20 %	322691813
43015	NC_015067	CAT	2	6	1936781	1936786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691813
43016	NC_015067	AG	3	6	1936815	1936820	50 %	0 %	50 %	0 %	322691813
43017	NC_015067	CAT	2	6	1936871	1936876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691813
43018	NC_015067	GCA	2	6	1936882	1936887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43019	NC_015067	GTT	2	6	1936892	1936897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691813
43020	NC_015067	GAACAG	2	12	1936910	1936921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322691813
43021	NC_015067	GAA	2	6	1936967	1936972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691813
43022	NC_015067	CGC	2	6	1937003	1937008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691813
43023	NC_015067	AGC	2	6	1937013	1937018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43024	NC_015067	GAA	2	6	1937057	1937062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691813
43025	NC_015067	GA	3	6	1937071	1937076	50 %	0 %	50 %	0 %	322691813
43026	NC_015067	GCA	2	6	1937078	1937083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43027	NC_015067	GAT	3	9	1937087	1937095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691813
43028	NC_015067	GCATG	2	10	1937119	1937128	20 %	20 %	40 %	20 %	322691813
43029	NC_015067	CAG	2	6	1937153	1937158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43030	NC_015067	CGGC	2	8	1937161	1937168	0 %	0 %	50 %	50 %	322691813
43031	NC_015067	CCA	2	6	1937266	1937271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691813
43032	NC_015067	CCAA	2	8	1937333	1937340	50 %	0 %	0 %	50 %	322691813
43033	NC_015067	GGC	2	6	1937366	1937371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691813
43034	NC_015067	TGC	2	6	1937410	1937415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691813
43035	NC_015067	GAT	2	6	1937447	1937452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691813
43036	NC_015067	AAC	2	6	1937498	1937503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691813
43037	NC_015067	GATGGT	2	12	1937504	1937515	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322691813
43038	NC_015067	CTT	2	6	1937585	1937590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691813
43039	NC_015067	CG	3	6	1937606	1937611	0 %	0 %	50 %	50 %	322691813
43040	NC_015067	CCTT	2	8	1937655	1937662	0 %	50 %	0 %	50 %	322691814
43041	NC_015067	CAC	2	6	1937739	1937744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691814
43042	NC_015067	CAT	3	9	1937779	1937787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691814
43043	NC_015067	TCGGA	2	10	1937811	1937820	20 %	20 %	40 %	20 %	322691814
43044	NC_015067	CGA	2	6	1937862	1937867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691814
43045	NC_015067	AGC	2	6	1937873	1937878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691814
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43047	NC_015067	TGCG	2	8	1937955	1937962	0 %	25 %	50 %	25 %	322691814
43048	NC_015067	GCG	2	6	1937996	1938001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691814
43049	NC_015067	TGT	2	6	1938015	1938020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691814
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43052	NC_015067	GAT	2	6	1938157	1938162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691814
43053	NC_015067	GAT	2	6	1938271	1938276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691814
43054	NC_015067	TAA	2	6	1938345	1938350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691814
43055	NC_015067	CGA	2	6	1938372	1938377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691814
43056	NC_015067	CGC	2	6	1938396	1938401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691814
43057	NC_015067	GTG	2	6	1938419	1938424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691814
43058	NC_015067	GAA	2	6	1938433	1938438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691814
43059	NC_015067	AATA	2	8	1938444	1938451	75 %	25 %	0 %	0 %	322691814
43060	NC_015067	ATG	2	6	1938458	1938463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691814
43061	NC_015067	GAA	2	6	1938465	1938470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691814
43062	NC_015067	TGT	2	6	1938598	1938603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691814
43063	NC_015067	ATG	2	6	1938699	1938704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43064	NC_015067	AAAGG	2	10	1938720	1938729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43065	NC_015067	TG	3	6	1938757	1938762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43066	NC_015067	GGAA	2	8	1938782	1938789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43067	NC_015067	ACAG	2	8	1938815	1938822	50 %	0 %	25 %	25 %	322691815
43068	NC_015067	TTC	2	6	1938830	1938835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691815
43069	NC_015067	GGT	2	6	1938850	1938855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691815
43070	NC_015067	GGC	2	6	1938907	1938912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
43071	NC_015067	GGC	2	6	1938928	1938933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
43072	NC_015067	TGT	3	9	1938972	1938980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691815
43073	NC_015067	ATG	2	6	1939001	1939006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691815
43074	NC_015067	ACC	2	6	1939012	1939017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691815
43075	NC_015067	GAA	2	6	1939018	1939023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691815
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43077	NC_015067	CTTC	2	8	1939134	1939141	0 %	50 %	0 %	50 %	322691815
43078	NC_015067	TTC	2	6	1939154	1939159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691815
43079	NC_015067	CACGGC	2	12	1939162	1939173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322691815
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43086	NC_015067	GAC	2	6	1939438	1939443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691815
43087	NC_015067	ACCA	2	8	1939467	1939474	50 %	0 %	0 %	50 %	322691815
43088	NC_015067	GCCA	2	8	1939483	1939490	25 %	0 %	25 %	50 %	322691815
43089	NC_015067	TCA	2	6	1939514	1939519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691815
43090	NC_015067	ATG	2	6	1939532	1939537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691815
43091	NC_015067	GCG	2	6	1939547	1939552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
43092	NC_015067	GCG	2	6	1939568	1939573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
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43100	NC_015067	CCA	2	6	1940003	1940008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691815
43101	NC_015067	GGT	2	6	1940014	1940019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691815
43102	NC_015067	CCCATT	2	12	1940060	1940071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322691815
43103	NC_015067	GCT	2	6	1940072	1940077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691815
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43105	NC_015067	ATC	3	9	1940144	1940152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43106	NC_015067	TGA	2	6	1940159	1940164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43107	NC_015067	CG	3	6	1940219	1940224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43108	NC_015067	TTCAT	2	10	1940279	1940288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43109	NC_015067	CAA	2	6	1940355	1940360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43110	NC_015067	GCACC	2	10	1940455	1940464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43111	NC_015067	GTGC	2	8	1940530	1940537	0 %	25 %	50 %	25 %	322691816
43112	NC_015067	TCGCC	2	10	1940553	1940562	0 %	20 %	20 %	60 %	322691816
43113	NC_015067	TTG	2	6	1940641	1940646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43114	NC_015067	TGC	2	6	1940685	1940690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43115	NC_015067	AT	3	6	1940775	1940780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43116	NC_015067	CGG	2	6	1940789	1940794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43235	NC_015067	CGG	2	6	1945572	1945577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691820
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43350	NC_015067	CGT	2	6	1950874	1950879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691822
43351	NC_015067	TAA	2	6	1950935	1950940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43352	NC_015067	T	6	6	1950977	1950982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43353	NC_015067	GCAGG	2	10	1951067	1951076	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43354	NC_015067	GCCT	2	8	1951102	1951109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43355	NC_015067	CAT	3	9	1951112	1951120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43358	NC_015067	CAT	2	6	1951169	1951174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43362	NC_015067	C	11	11	1951442	1951452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43363	NC_015067	AGG	2	6	1951512	1951517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43364	NC_015067	CGA	2	6	1951593	1951598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691823
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43379	NC_015067	GGC	2	6	1952246	1952251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691823
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43467	NC_015067	GCA	2	6	1956090	1956095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691826
43468	NC_015067	GTG	2	6	1956124	1956129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691826
43469	NC_015067	CCGT	2	8	1956153	1956160	0 %	25 %	25 %	50 %	322691826
43470	NC_015067	CG	3	6	1956218	1956223	0 %	0 %	50 %	50 %	322691826
43471	NC_015067	GGC	2	6	1956249	1956254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691826
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43475	NC_015067	TGC	2	6	1956380	1956385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691826
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43483	NC_015067	AG	3	6	1956975	1956980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43498	NC_015067	GCCGAT	2	12	1957985	1957996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322691828
43499	NC_015067	GCA	2	6	1958002	1958007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691828
43500	NC_015067	GACGGC	2	12	1958028	1958039	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322691828

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