MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015067	GAGG	2	8	1869076	1869083	25 %	0 %	75 %	0 %	322691756
41502	NC_015067	CGA	2	6	1869102	1869107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41503	NC_015067	CGA	2	6	1869204	1869209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41504	NC_015067	CGA	2	6	1869216	1869221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41505	NC_015067	CAG	2	6	1869271	1869276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41506	NC_015067	CA	4	8	1869279	1869286	50 %	0 %	0 %	50 %	322691756
41507	NC_015067	AACC	2	8	1869309	1869316	50 %	0 %	0 %	50 %	322691756
41508	NC_015067	GAT	2	6	1869337	1869342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691756
41509	NC_015067	GAT	2	6	1869367	1869372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691756
41510	NC_015067	CTG	2	6	1869385	1869390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41511	NC_015067	CAG	2	6	1869418	1869423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41512	NC_015067	TTG	2	6	1869452	1869457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691756
41513	NC_015067	CAG	2	6	1869469	1869474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691756
41514	NC_015067	TCT	2	6	1869485	1869490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691756
41515	NC_015067	GCG	2	6	1869512	1869517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691756
41516	NC_015067	TCA	2	6	1869519	1869524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691756
41517	NC_015067	TCA	2	6	1869557	1869562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691757
41518	NC_015067	TTC	2	6	1869583	1869588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691757
41519	NC_015067	GAC	2	6	1869603	1869608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41520	NC_015067	GGA	2	6	1869663	1869668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691757
41521	NC_015067	GAT	2	6	1869708	1869713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
41522	NC_015067	GAGGAT	2	12	1869765	1869776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	322691757
41523	NC_015067	AGC	2	6	1869805	1869810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41524	NC_015067	CTG	2	6	1869816	1869821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41525	NC_015067	ACC	2	6	1869825	1869830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691757
41526	NC_015067	GTC	2	6	1869918	1869923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41527	NC_015067	TC	3	6	1869971	1869976	0 %	50 %	0 %	50 %	322691757
41528	NC_015067	GCA	2	6	1869986	1869991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41529	NC_015067	CGA	2	6	1870181	1870186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41530	NC_015067	GAT	2	6	1870247	1870252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
41531	NC_015067	GGT	2	6	1870304	1870309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691757
41532	NC_015067	GAC	2	6	1870331	1870336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41533	NC_015067	CCA	2	6	1870337	1870342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691757
41534	NC_015067	TTC	2	6	1870356	1870361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691757
41535	NC_015067	GCG	2	6	1870370	1870375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691757
41536	NC_015067	ATG	2	6	1870420	1870425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
41537	NC_015067	GGC	2	6	1870443	1870448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691757
41538	NC_015067	TGA	3	9	1870469	1870477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
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41540	NC_015067	CGA	2	6	1870613	1870618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41541	NC_015067	GCT	3	9	1870619	1870627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41542	NC_015067	AGC	2	6	1870687	1870692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691757
41543	NC_015067	TTC	2	6	1870693	1870698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691757
41544	NC_015067	TGA	2	6	1870804	1870809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
41545	NC_015067	AC	3	6	1870907	1870912	50 %	0 %	0 %	50 %	322691757
41546	NC_015067	TCA	2	6	1870925	1870930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691757
41547	NC_015067	CGC	2	6	1870955	1870960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691757
41548	NC_015067	CGC	2	6	1870976	1870981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691757
41549	NC_015067	GACCG	2	10	1871016	1871025	20 %	0 %	40 %	40 %	322691757
41550	NC_015067	TGA	2	6	1871067	1871072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691757
41551	NC_015067	CAC	2	6	1871078	1871083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41552	NC_015067	GCG	2	6	1871114	1871119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41553	NC_015067	TGTT	2	8	1871148	1871155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41554	NC_015067	TGA	2	6	1871167	1871172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41555	NC_015067	ACT	2	6	1871175	1871180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691758
41556	NC_015067	TCG	2	6	1871189	1871194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41557	NC_015067	AGC	2	6	1871267	1871272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41558	NC_015067	GGACG	2	10	1871275	1871284	20 %	0 %	60 %	20 %	322691758
41559	NC_015067	TGT	4	12	1871289	1871300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691758
41560	NC_015067	CGA	2	6	1871346	1871351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41561	NC_015067	CAGC	2	8	1871370	1871377	25 %	0 %	25 %	50 %	322691758
41562	NC_015067	CGT	2	6	1871541	1871546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691758
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41564	NC_015067	TCA	2	6	1871640	1871645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691758
41565	NC_015067	TCT	2	6	1871652	1871657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691758
41566	NC_015067	GCA	2	6	1871745	1871750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41567	NC_015067	GAA	2	6	1871767	1871772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691758
41568	NC_015067	GTT	2	6	1871782	1871787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691758
41569	NC_015067	GTA	2	6	1871911	1871916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691758
41570	NC_015067	CGG	2	6	1871991	1871996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691758
41571	NC_015067	ACG	2	6	1872029	1872034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691758
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41573	NC_015067	CTG	2	6	1872076	1872081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41574	NC_015067	TCG	2	6	1872092	1872097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41575	NC_015067	GTT	2	6	1872148	1872153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691758
41576	NC_015067	CCA	2	6	1872260	1872265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691758
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41578	NC_015067	CGA	2	6	1872309	1872314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691758
41579	NC_015067	TCT	2	6	1872315	1872320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691758
41580	NC_015067	CCT	2	6	1872367	1872372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41581	NC_015067	TTAAG	2	10	1872424	1872433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41582	NC_015067	CGT	2	6	1872461	1872466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41583	NC_015067	T	7	7	1872496	1872502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41584	NC_015067	CAA	2	6	1872591	1872596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691759
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41586	NC_015067	CG	3	6	1872850	1872855	0 %	0 %	50 %	50 %	322691759
41587	NC_015067	ATC	2	6	1872896	1872901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691759
41588	NC_015067	TGC	2	6	1872963	1872968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691759
41589	NC_015067	TCA	2	6	1872969	1872974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691759
41590	NC_015067	AGC	2	6	1872986	1872991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691759
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41594	NC_015067	TA	3	6	1873224	1873229	50 %	50 %	0 %	0 %	322691759
41595	NC_015067	CAGC	2	8	1873233	1873240	25 %	0 %	25 %	50 %	322691759
41596	NC_015067	TCA	2	6	1873263	1873268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691759
41597	NC_015067	CATG	2	8	1873279	1873286	25 %	25 %	25 %	25 %	322691759
41598	NC_015067	CGT	2	6	1873378	1873383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691759
41599	NC_015067	CA	3	6	1873417	1873422	50 %	0 %	0 %	50 %	322691759
41600	NC_015067	CAT	2	6	1873486	1873491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691759
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41602	NC_015067	CGG	2	6	1873567	1873572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691759
41603	NC_015067	GAC	2	6	1873685	1873690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691759
41604	NC_015067	GC	3	6	1873695	1873700	0 %	0 %	50 %	50 %	322691759
41605	NC_015067	GGC	2	6	1873703	1873708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691759
41606	NC_015067	AAG	2	6	1873779	1873784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41607	NC_015067	AC	3	6	1873787	1873792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41608	NC_015067	CCT	2	6	1873812	1873817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691760
41609	NC_015067	CTG	2	6	1873818	1873823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691760
41610	NC_015067	GGA	2	6	1873829	1873834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691760
41611	NC_015067	TG	3	6	1873839	1873844	0 %	50 %	50 %	0 %	322691760
41612	NC_015067	TCG	2	6	1873855	1873860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691760
41613	NC_015067	TCCA	2	8	1873884	1873891	25 %	25 %	0 %	50 %	322691760
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41957	NC_015067	AGG	2	6	1889857	1889862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691772
41958	NC_015067	TGA	2	6	1889867	1889872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691772
41959	NC_015067	AGGG	2	8	1889935	1889942	25 %	0 %	75 %	0 %	322691772
41960	NC_015067	AGC	2	6	1889962	1889967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691772
41961	NC_015067	TGG	2	6	1890026	1890031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691772
41962	NC_015067	CAT	2	6	1890045	1890050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691772
41963	NC_015067	ATGGTC	2	12	1890073	1890084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322691772
41964	NC_015067	ACG	2	6	1890097	1890102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691772
41965	NC_015067	GGC	2	6	1890169	1890174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691772
41966	NC_015067	GAT	2	6	1890210	1890215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691772
41967	NC_015067	GCCG	2	8	1890219	1890226	0 %	0 %	50 %	50 %	322691772
41968	NC_015067	GAGCGT	2	12	1890285	1890296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322691772
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41982	NC_015067	GCCG	2	8	1890758	1890765	0 %	0 %	50 %	50 %	322691773
41983	NC_015067	GGC	2	6	1890788	1890793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691773
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41986	NC_015067	GTG	2	6	1891038	1891043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691773
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41989	NC_015067	CGG	2	6	1891178	1891183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691773
41990	NC_015067	GGCTGT	2	12	1891194	1891205	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322691773
41991	NC_015067	GCG	2	6	1891227	1891232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691773
41992	NC_015067	CAT	2	6	1891238	1891243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691773
41993	NC_015067	CGG	2	6	1891244	1891249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41994	NC_015067	CCA	2	6	1891303	1891308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41995	NC_015067	GCA	2	6	1891322	1891327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41997	NC_015067	GGAA	2	8	1891433	1891440	50 %	0 %	50 %	0 %	322691774
41998	NC_015067	AGC	2	6	1891489	1891494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691774
41999	NC_015067	ATG	2	6	1891531	1891536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691774
42000	NC_015067	TGA	2	6	1891574	1891579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691774

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