MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_015067	CGT	2	6	1802387	1802392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691696
40003	NC_015067	ACC	2	6	1802413	1802418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691696
40004	NC_015067	TGA	2	6	1802453	1802458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691696
40005	NC_015067	CAC	2	6	1802478	1802483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691696
40006	NC_015067	CCTT	2	8	1802524	1802531	0 %	50 %	0 %	50 %	322691696
40007	NC_015067	GAG	2	6	1802548	1802553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691696
40008	NC_015067	GAAC	2	8	1802664	1802671	50 %	0 %	25 %	25 %	322691696
40009	NC_015067	GCC	2	6	1802751	1802756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691696
40010	NC_015067	CGG	2	6	1802768	1802773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691696
40011	NC_015067	CCA	2	6	1802822	1802827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691696
40012	NC_015067	GGT	2	6	1802850	1802855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691696
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40014	NC_015067	GGC	2	6	1802946	1802951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691696
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40017	NC_015067	TGG	3	9	1803029	1803037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691696
40018	NC_015067	GC	3	6	1803071	1803076	0 %	0 %	50 %	50 %	322691696
40019	NC_015067	GATGTG	2	12	1803090	1803101	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322691696
40020	NC_015067	TGG	2	6	1803109	1803114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691696
40021	NC_015067	TTG	2	6	1803118	1803123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691696
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40057	NC_015067	ACC	2	6	1804230	1804235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40058	NC_015067	CGAGG	2	10	1804250	1804259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40059	NC_015067	CTA	2	6	1804331	1804336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691697
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40069	NC_015067	GGT	2	6	1805129	1805134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40070	NC_015067	CGC	2	6	1805272	1805277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691698
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40090	NC_015067	GA	3	6	1806499	1806504	50 %	0 %	50 %	0 %	322691698
40091	NC_015067	AC	3	6	1806559	1806564	50 %	0 %	0 %	50 %	322691698
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40103	NC_015067	GGGTC	2	10	1807204	1807213	0 %	20 %	60 %	20 %	322691698
40104	NC_015067	TTGG	2	8	1807409	1807416	0 %	50 %	50 %	0 %	322691698
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40111	NC_015067	GT	3	6	1807822	1807827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40112	NC_015067	GAC	2	6	1807875	1807880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40114	NC_015067	TTC	2	6	1807930	1807935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40115	NC_015067	TCT	2	6	1807952	1807957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40116	NC_015067	CAT	2	6	1807976	1807981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40117	NC_015067	TCA	3	9	1808015	1808023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40118	NC_015067	TCA	2	6	1808056	1808061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40119	NC_015067	ACT	2	6	1808089	1808094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691699
40120	NC_015067	ACCG	2	8	1808124	1808131	25 %	0 %	25 %	50 %	322691699
40121	NC_015067	CTGC	2	8	1808233	1808240	0 %	25 %	25 %	50 %	322691699
40122	NC_015067	CGC	2	6	1808244	1808249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691699
40123	NC_015067	ACC	2	6	1808254	1808259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691699
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40126	NC_015067	GTTC	2	8	1808463	1808470	0 %	50 %	25 %	25 %	322691699
40127	NC_015067	GTG	2	6	1808482	1808487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691699
40128	NC_015067	CGA	2	6	1808589	1808594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691699
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40131	NC_015067	GGT	2	6	1808799	1808804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691699
40132	NC_015067	ATC	2	6	1808848	1808853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691699
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40142	NC_015067	GGT	2	6	1809333	1809338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691699
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40147	NC_015067	TA	4	8	1809487	1809494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40148	NC_015067	CAT	2	6	1809502	1809507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691700
40149	NC_015067	GAG	2	6	1809596	1809601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691700
40150	NC_015067	GC	3	6	1809602	1809607	0 %	0 %	50 %	50 %	322691700
40151	NC_015067	CGG	2	6	1809643	1809648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691700
40152	NC_015067	GC	3	6	1809703	1809708	0 %	0 %	50 %	50 %	322691700
40153	NC_015067	ACG	2	6	1809723	1809728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691700
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40156	NC_015067	GTG	2	6	1809886	1809891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40157	NC_015067	GCA	2	6	1809906	1809911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40159	NC_015067	CGCC	2	8	1809988	1809995	0 %	0 %	25 %	75 %	322691701
40160	NC_015067	GAC	2	6	1810025	1810030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691701
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40176	NC_015067	TTG	2	6	1810491	1810496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40177	NC_015067	TC	3	6	1810516	1810521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40178	NC_015067	AG	4	8	1810554	1810561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40179	NC_015067	T	6	6	1810566	1810571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40217	NC_015067	GC	3	6	1812115	1812120	0 %	0 %	50 %	50 %	322691702
40218	NC_015067	CAT	2	6	1812280	1812285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691702
40219	NC_015067	CG	3	6	1812483	1812488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40220	NC_015067	CAG	2	6	1812570	1812575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40221	NC_015067	CGG	2	6	1812582	1812587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691703
40222	NC_015067	TCG	2	6	1812608	1812613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691703
40223	NC_015067	TTC	2	6	1812664	1812669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691703
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40225	NC_015067	CGCCA	2	10	1812742	1812751	20 %	0 %	20 %	60 %	322691703
40226	NC_015067	GTT	2	6	1812805	1812810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691703
40227	NC_015067	AGT	2	6	1812824	1812829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691703
40228	NC_015067	CGC	2	6	1812846	1812851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691703
40229	NC_015067	TGA	2	6	1812873	1812878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691703
40230	NC_015067	CGA	2	6	1812885	1812890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691703
40231	NC_015067	CAC	2	6	1812925	1812930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691703
40232	NC_015067	ATCA	2	8	1812943	1812950	50 %	25 %	0 %	25 %	322691703
40233	NC_015067	CG	3	6	1812957	1812962	0 %	0 %	50 %	50 %	322691703
40234	NC_015067	CAA	2	6	1813008	1813013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691703
40235	NC_015067	TCC	2	6	1813027	1813032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691703
40236	NC_015067	TTG	2	6	1813156	1813161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40237	NC_015067	GCG	2	6	1813180	1813185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40238	NC_015067	CGC	2	6	1813212	1813217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40239	NC_015067	CAT	2	6	1813307	1813312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691704
40240	NC_015067	CGA	2	6	1813319	1813324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691704
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40248	NC_015067	TCG	2	6	1813835	1813840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691705
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40254	NC_015067	TCA	2	6	1814126	1814131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40255	NC_015067	CGA	2	6	1814197	1814202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40256	NC_015067	ACG	2	6	1814250	1814255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40257	NC_015067	CAT	2	6	1814286	1814291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40259	NC_015067	GGA	2	6	1814489	1814494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40260	NC_015067	GCA	2	6	1814499	1814504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40262	NC_015067	CGC	2	6	1814551	1814556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40263	NC_015067	CA	3	6	1814616	1814621	50 %	0 %	0 %	50 %	322691706
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40267	NC_015067	CTGC	2	8	1814696	1814703	0 %	25 %	25 %	50 %	322691706
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40351	NC_015067	TGGCCG	2	12	1818483	1818494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691709
40352	NC_015067	TCA	2	6	1818555	1818560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691709
40353	NC_015067	GCG	2	6	1818599	1818604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691709
40354	NC_015067	GC	3	6	1818669	1818674	0 %	0 %	50 %	50 %	322691709
40355	NC_015067	CCG	2	6	1818771	1818776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691709
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40377	NC_015067	GAAC	2	8	1819679	1819686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40378	NC_015067	CCGT	2	8	1819702	1819709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40379	NC_015067	CAA	2	6	1819725	1819730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40380	NC_015067	ATGAC	2	10	1819774	1819783	40 %	20 %	20 %	20 %	322691711
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40382	NC_015067	CGA	2	6	1819820	1819825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691711
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40406	NC_015067	CTGCA	2	10	1820800	1820809	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40407	NC_015067	CCA	2	6	1820817	1820822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40408	NC_015067	ATA	2	6	1820825	1820830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40409	NC_015067	AAG	2	6	1820935	1820940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40432	NC_015067	CTT	2	6	1821605	1821610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691713
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40443	NC_015067	TGA	2	6	1822136	1822141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691713
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40448	NC_015067	GCT	3	9	1822640	1822648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691713
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40451	NC_015067	TCA	2	6	1822795	1822800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691713
40452	NC_015067	CCA	2	6	1822817	1822822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691713
40453	NC_015067	TGG	2	6	1822857	1822862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691713
40454	NC_015067	GTG	2	6	1822894	1822899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691713
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40456	NC_015067	GTG	2	6	1822960	1822965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691713
40457	NC_015067	CGAT	2	8	1822972	1822979	25 %	25 %	25 %	25 %	322691713
40458	NC_015067	T	6	6	1823001	1823006	0 %	100 %	0 %	0 %	322691713
40459	NC_015067	CG	3	6	1823017	1823022	0 %	0 %	50 %	50 %	322691713
40460	NC_015067	TGA	2	6	1823050	1823055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691713
40461	NC_015067	GGC	2	6	1823058	1823063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691713
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40463	NC_015067	CAGC	2	8	1823318	1823325	25 %	0 %	25 %	50 %	322691713
40464	NC_015067	ACCA	2	8	1823361	1823368	50 %	0 %	0 %	50 %	322691713
40465	NC_015067	GCGT	2	8	1823381	1823388	0 %	25 %	50 %	25 %	322691713
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40467	NC_015067	CTG	2	6	1823507	1823512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691713
40468	NC_015067	CCA	2	6	1823534	1823539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691713
40469	NC_015067	CCGG	2	8	1823554	1823561	0 %	0 %	50 %	50 %	322691713
40470	NC_015067	GCC	2	6	1823595	1823600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691713
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40472	NC_015067	CCA	2	6	1823707	1823712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691713
40473	NC_015067	CTG	2	6	1823862	1823867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691713
40474	NC_015067	ACG	2	6	1823877	1823882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691713
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