MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015067	GAA	2	6	112048	112053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690279
2502	NC_015067	TCA	2	6	112107	112112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690279
2503	NC_015067	TGC	2	6	112121	112126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690279
2504	NC_015067	GCC	2	6	112130	112135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690279
2505	NC_015067	CATC	2	8	112180	112187	25 %	25 %	0 %	50 %	322690279
2506	NC_015067	CCA	2	6	112188	112193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690279
2507	NC_015067	ATG	4	12	112199	112210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690279
2508	NC_015067	GAT	2	6	112251	112256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690279
2509	NC_015067	CTG	2	6	112363	112368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690279
2510	NC_015067	GTGA	2	8	112380	112387	25 %	25 %	50 %	0 %	322690279
2511	NC_015067	TCG	2	6	112397	112402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690279
2512	NC_015067	GCG	2	6	112519	112524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690280
2513	NC_015067	CGG	2	6	112553	112558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690280
2514	NC_015067	TGC	2	6	112572	112577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690280
2515	NC_015067	TGT	2	6	112621	112626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690280
2516	NC_015067	CTT	2	6	112704	112709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690280
2517	NC_015067	CAG	2	6	112719	112724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690280
2518	NC_015067	GAT	2	6	112728	112733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690280
2519	NC_015067	TGT	2	6	112800	112805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015067	GT	3	6	112862	112867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015067	GCT	2	6	112899	112904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015067	A	6	6	113086	113091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015067	TGAG	2	8	113092	113099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015067	CTTT	2	8	113103	113110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_015067	GC	3	6	113179	113184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_015067	AAT	2	6	113194	113199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_015067	TC	3	6	113230	113235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_015067	CATA	2	8	113237	113244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_015067	GAC	2	6	113248	113253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_015067	CAC	2	6	113261	113266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_015067	ATG	2	6	113268	113273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015067	TG	4	8	113311	113318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015067	CGT	2	6	113343	113348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_015067	CGTC	2	8	113405	113412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_015067	CG	3	6	113428	113433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_015067	CAA	2	6	113471	113476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2537	NC_015067	TC	3	6	113483	113488	0 %	50 %	0 %	50 %	322690281
2538	NC_015067	GTGCT	2	10	113492	113501	0 %	40 %	40 %	20 %	322690281
2539	NC_015067	GCC	2	6	113512	113517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690281
2540	NC_015067	CGG	2	6	113520	113525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690281
2541	NC_015067	GCAG	2	8	113571	113578	25 %	0 %	50 %	25 %	322690281
2542	NC_015067	GCGG	2	8	113623	113630	0 %	0 %	75 %	25 %	322690281
2543	NC_015067	CGCAG	2	10	113643	113652	20 %	0 %	40 %	40 %	322690281
2544	NC_015067	CAC	2	6	113655	113660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690281
2545	NC_015067	AAGG	2	8	113770	113777	50 %	0 %	50 %	0 %	322690281
2546	NC_015067	GCTG	2	8	113813	113820	0 %	25 %	50 %	25 %	322690281
2547	NC_015067	CTG	2	6	113845	113850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2548	NC_015067	ACA	2	6	113858	113863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2549	NC_015067	GGA	2	6	114048	114053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
2550	NC_015067	CAA	2	6	114063	114068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2551	NC_015067	GCC	2	6	114166	114171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690281
2552	NC_015067	GGA	2	6	114198	114203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
2553	NC_015067	AGA	2	6	114374	114379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690281
2554	NC_015067	GGT	2	6	114397	114402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2555	NC_015067	CGG	2	6	114408	114413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690281
2556	NC_015067	ATGA	2	8	114415	114422	50 %	25 %	25 %	0 %	322690281
2557	NC_015067	TGG	2	6	114428	114433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2558	NC_015067	CAAGGA	2	12	114450	114461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322690281
2559	NC_015067	CAA	2	6	114543	114548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2560	NC_015067	TCG	2	6	114578	114583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2561	NC_015067	GATGCT	2	12	114622	114633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690281
2562	NC_015067	GTAT	2	8	114689	114696	25 %	50 %	25 %	0 %	322690281
2563	NC_015067	GGT	2	6	114703	114708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2564	NC_015067	ACA	2	6	114791	114796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2565	NC_015067	TAT	2	6	114853	114858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690281
2566	NC_015067	GGC	2	6	115006	115011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690281
2567	NC_015067	ACA	2	6	115067	115072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2568	NC_015067	GGA	3	9	115158	115166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
2569	NC_015067	CGA	2	6	115172	115177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2570	NC_015067	TCCGCA	2	12	115214	115225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690281
2571	NC_015067	TCG	2	6	115337	115342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2572	NC_015067	TGA	2	6	115377	115382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690281
2573	NC_015067	CCA	2	6	115442	115447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690281
2574	NC_015067	AGA	2	6	115511	115516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690281
2575	NC_015067	GAA	2	6	115527	115532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690281
2576	NC_015067	TCA	2	6	115538	115543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690281
2577	NC_015067	CGA	2	6	115551	115556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2578	NC_015067	ACA	2	6	115580	115585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2579	NC_015067	GATG	2	8	115701	115708	25 %	25 %	50 %	0 %	322690281
2580	NC_015067	GGGC	2	8	115715	115722	0 %	0 %	75 %	25 %	322690281
2581	NC_015067	GC	3	6	115721	115726	0 %	0 %	50 %	50 %	322690281
2582	NC_015067	GCC	2	6	115741	115746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690281
2583	NC_015067	TCA	2	6	115748	115753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690281
2584	NC_015067	AGG	2	6	115763	115768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
2585	NC_015067	GCT	2	6	115794	115799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2586	NC_015067	GGT	2	6	115818	115823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2587	NC_015067	CGG	2	6	115898	115903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_015067	AGAA	2	8	115935	115942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015067	TAT	2	6	115943	115948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690282
2590	NC_015067	ACT	2	6	115962	115967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
2591	NC_015067	CGC	2	6	116000	116005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690282
2592	NC_015067	GCT	2	6	116027	116032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2593	NC_015067	TCT	2	6	116044	116049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690282
2594	NC_015067	GAC	2	6	116079	116084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2595	NC_015067	CTGG	2	8	116158	116165	0 %	25 %	50 %	25 %	322690282
2596	NC_015067	CTG	2	6	116173	116178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2597	NC_015067	CTA	2	6	116306	116311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
2598	NC_015067	TGG	2	6	116336	116341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690282
2599	NC_015067	CGA	3	9	116441	116449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2600	NC_015067	CCA	2	6	116458	116463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690282
2601	NC_015067	CAC	2	6	116504	116509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690282
2602	NC_015067	AAG	2	6	116535	116540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690282
2603	NC_015067	ACA	2	6	116548	116553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690282
2604	NC_015067	GCA	2	6	116642	116647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2605	NC_015067	CAC	2	6	116660	116665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690282
2606	NC_015067	TAC	2	6	116789	116794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
2607	NC_015067	ACT	2	6	116811	116816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
2608	NC_015067	ACA	2	6	116833	116838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690282
2609	NC_015067	CCA	2	6	116923	116928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690282
2610	NC_015067	GCC	2	6	117033	117038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690282
2611	NC_015067	TTC	2	6	117117	117122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690282
2612	NC_015067	GTC	2	6	117123	117128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2613	NC_015067	TTG	2	6	117157	117162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690282
2614	NC_015067	CCGGCT	2	12	117187	117198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690282
2615	NC_015067	GCG	2	6	117238	117243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690282
2616	NC_015067	ACA	2	6	117373	117378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690282
2617	NC_015067	GGT	2	6	117422	117427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690282
2618	NC_015067	GTC	2	6	117465	117470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2619	NC_015067	TC	4	8	117469	117476	0 %	50 %	0 %	50 %	322690282
2620	NC_015067	TGA	2	6	117482	117487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690282
2621	NC_015067	CGA	2	6	117584	117589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2622	NC_015067	AAGGTG	2	12	117594	117605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	322690282
2623	NC_015067	GCC	2	6	117654	117659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690282
2624	NC_015067	GACCCC	2	12	117710	117721	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690282
2625	NC_015067	AGGTGA	2	12	117817	117828	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	322690282
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2628	NC_015067	CGTC	2	8	117970	117977	0 %	25 %	25 %	50 %	322690282
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2642	NC_015067	GCG	2	6	118545	118550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2643	NC_015067	GGTC	2	8	118622	118629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2644	NC_015067	CCG	2	6	118655	118660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2645	NC_015067	GAA	2	6	118700	118705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_015067	AATG	2	8	118713	118720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_015067	TCA	2	6	118764	118769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2664	NC_015067	CGGC	2	8	119800	119807	0 %	0 %	50 %	50 %	322690284
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2696	NC_015067	CGGGC	2	10	121297	121306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2734	NC_015067	CG	3	6	123602	123607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2735	NC_015067	TTC	2	6	123629	123634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2736	NC_015067	CGG	2	6	123775	123780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2737	NC_015067	CAT	2	6	123802	123807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690287
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2740	NC_015067	CG	3	6	123895	123900	0 %	0 %	50 %	50 %	322690287
2741	NC_015067	CGG	2	6	123907	123912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690287
2742	NC_015067	CAA	2	6	123913	123918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690287
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2744	NC_015067	CTG	2	6	123965	123970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690287
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2747	NC_015067	CA	3	6	124110	124115	50 %	0 %	0 %	50 %	322690287
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2755	NC_015067	CTG	2	6	124370	124375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690287
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2858	NC_015067	GAAA	2	8	128410	128417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2859	NC_015067	GCC	2	6	128440	128445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2860	NC_015067	GACCA	2	10	128476	128485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2861	NC_015067	GCT	2	6	128490	128495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2862	NC_015067	AAG	2	6	128527	128532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2863	NC_015067	GA	3	6	128566	128571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2864	NC_015067	AATG	2	8	128577	128584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2865	NC_015067	GAA	2	6	128673	128678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690291
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2988	NC_015067	CGC	2	6	133379	133384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2989	NC_015067	GCCGTG	2	12	133411	133422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690293
2990	NC_015067	GCTC	2	8	133436	133443	0 %	25 %	25 %	50 %	322690293
2991	NC_015067	CCG	2	6	133478	133483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2992	NC_015067	GC	3	6	133508	133513	0 %	0 %	50 %	50 %	322690293
2993	NC_015067	ACG	3	9	133544	133552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690293
2994	NC_015067	GCC	2	6	133656	133661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2995	NC_015067	CG	3	6	133703	133708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2996	NC_015067	CGGGC	2	10	133750	133759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2997	NC_015067	GACCG	2	10	133766	133775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2998	NC_015067	CGA	2	6	133848	133853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2999	NC_015067	GC	3	6	133894	133899	0 %	0 %	50 %	50 %	322690294
3000	NC_015067	AAC	2	6	133939	133944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690294

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