MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

< Previous12...2930313233343536373839...105106Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_015067	CAT	2	6	744199	744204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690780
16502	NC_015067	CGC	2	6	744217	744222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690780
16503	NC_015067	CCG	2	6	744231	744236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690780
16504	NC_015067	T	6	6	744317	744322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_015067	TCA	2	6	744342	744347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_015067	T	6	6	744432	744437	0 %	100 %	0 %	0 %	322690781
16507	NC_015067	GCC	2	6	744478	744483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16508	NC_015067	TTGC	2	8	744552	744559	0 %	50 %	25 %	25 %	322690781
16509	NC_015067	TGC	2	6	744584	744589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16510	NC_015067	GCC	2	6	744600	744605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16511	NC_015067	CTG	2	6	744666	744671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16512	NC_015067	CG	3	6	744682	744687	0 %	0 %	50 %	50 %	322690781
16513	NC_015067	GCC	4	12	744690	744701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16514	NC_015067	CG	3	6	744793	744798	0 %	0 %	50 %	50 %	322690781
16515	NC_015067	TGC	2	6	744892	744897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16516	NC_015067	GGC	2	6	744900	744905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690781
16517	NC_015067	CGC	2	6	744908	744913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16518	NC_015067	CGC	2	6	744926	744931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16519	NC_015067	GC	3	6	745010	745015	0 %	0 %	50 %	50 %	322690781
16520	NC_015067	ATG	2	6	745029	745034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690781
16521	NC_015067	GAG	3	9	745069	745077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690781
16522	NC_015067	CGT	2	6	745094	745099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16523	NC_015067	ATC	3	9	745191	745199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690781
16524	NC_015067	CGC	2	6	745232	745237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16525	NC_015067	CGC	2	6	745265	745270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16526	NC_015067	CGC	3	9	745289	745297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16527	NC_015067	CGT	2	6	745313	745318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16528	NC_015067	CGT	2	6	745336	745341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690781
16529	NC_015067	CAT	2	6	745346	745351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690781
16530	NC_015067	CGC	2	6	745388	745393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690781
16531	NC_015067	GGT	2	6	745442	745447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690781
16532	NC_015067	CAT	2	6	745508	745513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690781
16533	NC_015067	TGGTCA	2	12	745567	745578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690781
16534	NC_015067	CGG	2	6	745601	745606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690781
16535	NC_015067	AGA	2	6	745645	745650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690781
16536	NC_015067	GCAC	2	8	745652	745659	25 %	0 %	25 %	50 %	322690781
16537	NC_015067	ACC	3	9	745686	745694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690781
16538	NC_015067	ACAGG	2	10	745713	745722	40 %	0 %	40 %	20 %	322690781
16539	NC_015067	GC	3	6	745724	745729	0 %	0 %	50 %	50 %	322690781
16540	NC_015067	CCG	2	6	745899	745904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690782
16541	NC_015067	GCGT	2	8	745909	745916	0 %	25 %	50 %	25 %	322690782
16542	NC_015067	CGA	2	6	745984	745989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690782
16543	NC_015067	ACG	2	6	746064	746069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690782
16544	NC_015067	CCG	2	6	746128	746133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690782
16545	NC_015067	TCG	2	6	746176	746181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690782
16546	NC_015067	GATC	2	8	746218	746225	25 %	25 %	25 %	25 %	322690782
16547	NC_015067	CCG	2	6	746244	746249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690782
16548	NC_015067	CGC	2	6	746284	746289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690782
16549	NC_015067	GTG	2	6	746312	746317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690783
16550	NC_015067	TCAGT	2	10	746344	746353	20 %	40 %	20 %	20 %	322690783
16551	NC_015067	CCG	2	6	746372	746377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690783
16552	NC_015067	CCG	2	6	746381	746386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690783
16553	NC_015067	GCCG	2	8	746442	746449	0 %	0 %	50 %	50 %	322690783
16554	NC_015067	CAG	2	6	746454	746459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690783
16555	NC_015067	AGGC	2	8	746469	746476	25 %	0 %	50 %	25 %	322690783
16556	NC_015067	CAT	2	6	746517	746522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690783
16557	NC_015067	GGC	2	6	746524	746529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690783
16558	NC_015067	CGC	2	6	746562	746567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690783
16559	NC_015067	TGA	2	6	746675	746680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690783
16560	NC_015067	TTC	2	6	746806	746811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690783
16561	NC_015067	CGC	3	9	746995	747003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690783
16562	NC_015067	ACG	2	6	747011	747016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690783
16563	NC_015067	GTG	2	6	747046	747051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690783
16564	NC_015067	CGC	3	9	747233	747241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690784
16565	NC_015067	CGTT	2	8	747279	747286	0 %	50 %	25 %	25 %	322690784
16566	NC_015067	CGC	2	6	747340	747345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690784
16567	NC_015067	GCT	2	6	747386	747391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690784
16568	NC_015067	CAC	2	6	747422	747427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690784
16569	NC_015067	AGA	2	6	747473	747478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690784
16570	NC_015067	CCG	2	6	747484	747489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690784
16571	NC_015067	ATT	2	6	747491	747496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690784
16572	NC_015067	CAT	2	6	747527	747532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690784
16573	NC_015067	GTG	2	6	747597	747602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690784
16574	NC_015067	GGT	2	6	747623	747628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690784
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16576	NC_015067	GCCG	2	8	747737	747744	0 %	0 %	50 %	50 %	322690784
16577	NC_015067	GC	3	6	747769	747774	0 %	0 %	50 %	50 %	322690784
16578	NC_015067	CAG	3	9	747844	747852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690784
16579	NC_015067	TGCC	2	8	747871	747878	0 %	25 %	25 %	50 %	322690784
16580	NC_015067	ACC	2	6	747968	747973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690784
16581	NC_015067	GAT	2	6	747989	747994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690784
16582	NC_015067	GCCG	2	8	748004	748011	0 %	0 %	50 %	50 %	322690784
16583	NC_015067	GCGGTC	2	12	748032	748043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690784
16584	NC_015067	TCG	2	6	748101	748106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690784
16585	NC_015067	TTG	2	6	748111	748116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690784
16586	NC_015067	GAG	2	6	748125	748130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690784
16587	NC_015067	AAC	2	6	748146	748151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690784
16588	NC_015067	GCC	2	6	748218	748223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690784
16589	NC_015067	TCG	2	6	748227	748232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690784
16590	NC_015067	TTC	3	9	748233	748241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690784
16591	NC_015067	GGAA	2	8	748244	748251	50 %	0 %	50 %	0 %	322690784
16592	NC_015067	GTG	3	9	748293	748301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690784
16593	NC_015067	ACC	2	6	748368	748373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690784
16594	NC_015067	GCC	2	6	748389	748394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690784
16595	NC_015067	TGT	2	6	748452	748457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16596	NC_015067	GGC	2	6	748608	748613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690785
16597	NC_015067	ACG	2	6	748619	748624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16598	NC_015067	CAA	2	6	748625	748630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690785
16599	NC_015067	CGATC	2	10	748643	748652	20 %	20 %	20 %	40 %	322690785
16600	NC_015067	AGCC	2	8	748784	748791	25 %	0 %	25 %	50 %	322690785
16601	NC_015067	GCA	2	6	748795	748800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16602	NC_015067	GTG	2	6	748815	748820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690785
16603	NC_015067	CAT	2	6	748832	748837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690785
16604	NC_015067	TTC	2	6	748848	748853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690785
16605	NC_015067	TCA	2	6	748867	748872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690785
16606	NC_015067	GCT	2	6	748961	748966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16607	NC_015067	CTGG	2	8	748994	749001	0 %	25 %	50 %	25 %	322690785
16608	NC_015067	CCA	2	6	749035	749040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690785
16609	NC_015067	CGC	2	6	749097	749102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690785
16610	NC_015067	GTG	2	6	749109	749114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690785
16611	NC_015067	TCG	2	6	749125	749130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16612	NC_015067	CAC	2	6	749204	749209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690785
16613	NC_015067	TGC	2	6	749251	749256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16614	NC_015067	CGC	2	6	749276	749281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690785
16615	NC_015067	TGC	2	6	749290	749295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690785
16616	NC_015067	GAT	2	6	749459	749464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690785
16617	NC_015067	CCT	2	6	749512	749517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690785
16618	NC_015067	CCG	2	6	749521	749526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690785
16619	NC_015067	TCA	2	6	749551	749556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690785
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16683	NC_015067	CCGG	2	8	752533	752540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16684	NC_015067	CG	3	6	752565	752570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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