MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015067	GAG	2	6	673030	673035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690713
15002	NC_015067	GCG	2	6	673042	673047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690713
15003	NC_015067	ATT	2	6	673238	673243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690713
15004	NC_015067	GCT	2	6	673263	673268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690713
15005	NC_015067	GATGT	2	10	673279	673288	20 %	40 %	40 %	0 %	322690713
15006	NC_015067	CGG	2	6	673304	673309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690713
15007	NC_015067	GCC	2	6	673384	673389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690713
15008	NC_015067	GTG	2	6	673397	673402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690713
15009	NC_015067	ATT	2	6	673411	673416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690713
15010	NC_015067	CG	3	6	673438	673443	0 %	0 %	50 %	50 %	322690713
15011	NC_015067	CGC	2	6	673600	673605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690713
15012	NC_015067	ACG	2	6	673637	673642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690713
15013	NC_015067	GGC	2	6	673690	673695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690713
15014	NC_015067	GGT	2	6	673726	673731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690713
15015	NC_015067	CTG	2	6	673732	673737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690713
15016	NC_015067	CCG	2	6	673781	673786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690713
15017	NC_015067	TTA	2	6	673841	673846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690713
15018	NC_015067	GTG	2	6	673871	673876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_015067	GTAT	2	8	673910	673917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_015067	CATA	2	8	673938	673945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15021	NC_015067	TCG	2	6	674061	674066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690714
15022	NC_015067	AGC	2	6	674147	674152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_015067	CAT	2	6	674272	674277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690715
15024	NC_015067	GCCG	2	8	674288	674295	0 %	0 %	50 %	50 %	322690715
15025	NC_015067	CG	3	6	674294	674299	0 %	0 %	50 %	50 %	322690715
15026	NC_015067	GC	3	6	674341	674346	0 %	0 %	50 %	50 %	322690715
15027	NC_015067	CGA	2	6	674362	674367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690715
15028	NC_015067	CCG	2	6	674371	674376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690715
15029	NC_015067	GC	3	6	674415	674420	0 %	0 %	50 %	50 %	322690715
15030	NC_015067	GC	3	6	674430	674435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15031	NC_015067	GTT	2	6	674558	674563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690716
15032	NC_015067	CCG	2	6	674564	674569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690716
15033	NC_015067	CAC	2	6	674596	674601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690716
15034	NC_015067	GGC	2	6	674647	674652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690716
15035	NC_015067	GTGC	2	8	674653	674660	0 %	25 %	50 %	25 %	322690716
15036	NC_015067	GTA	2	6	674752	674757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690716
15037	NC_015067	ATC	2	6	674833	674838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690716
15038	NC_015067	CGGT	2	8	674856	674863	0 %	25 %	50 %	25 %	322690716
15039	NC_015067	GGA	2	6	675046	675051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690716
15040	NC_015067	CCTGCA	2	12	675108	675119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690716
15041	NC_015067	CG	3	6	675184	675189	0 %	0 %	50 %	50 %	322690716
15042	NC_015067	GCC	2	6	675194	675199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690716
15043	NC_015067	GCC	2	6	675244	675249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690716
15044	NC_015067	TCA	2	6	675276	675281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690716
15045	NC_015067	GACC	2	8	675313	675320	25 %	0 %	25 %	50 %	322690716
15046	NC_015067	T	6	6	675405	675410	0 %	100 %	0 %	0 %	322690716
15047	NC_015067	CCA	2	6	675501	675506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690716
15048	NC_015067	TCA	2	6	675522	675527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690716
15049	NC_015067	TCG	2	6	675548	675553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690716
15050	NC_015067	GGC	2	6	675606	675611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690716
15051	NC_015067	TGA	2	6	675612	675617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690716
15052	NC_015067	CGT	2	6	675627	675632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690716
15053	NC_015067	GCC	2	6	675653	675658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690716
15054	NC_015067	CAG	3	9	675757	675765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690716
15055	NC_015067	CCGCT	2	10	675779	675788	0 %	20 %	20 %	60 %	322690716
15056	NC_015067	CAG	2	6	675796	675801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690716
15057	NC_015067	GAT	2	6	675996	676001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_015067	CGT	2	6	676050	676055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_015067	TG	3	6	676073	676078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_015067	CTT	2	6	676149	676154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690717
15061	NC_015067	CGG	2	6	676163	676168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690717
15062	NC_015067	GGA	2	6	676188	676193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690717
15063	NC_015067	GAT	2	6	676200	676205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690717
15064	NC_015067	TCG	2	6	676237	676242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690717
15065	NC_015067	GGA	2	6	676333	676338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_015067	CGG	2	6	676418	676423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_015067	GC	3	6	676427	676432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15068	NC_015067	GCATG	2	10	676452	676461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15069	NC_015067	TGA	2	6	676583	676588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_015067	GGC	3	9	676610	676618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_015067	GCG	2	6	676679	676684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690718
15072	NC_015067	GCA	2	6	676777	676782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690718
15073	NC_015067	TCG	2	6	676838	676843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690718
15074	NC_015067	CATCA	2	10	676868	676877	40 %	20 %	0 %	40 %	322690718
15075	NC_015067	CTG	2	6	676880	676885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690718
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15078	NC_015067	GCT	2	6	676963	676968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690718
15079	NC_015067	GCG	3	9	677003	677011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690718
15080	NC_015067	CGA	2	6	677031	677036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690719
15081	NC_015067	GC	3	6	677068	677073	0 %	0 %	50 %	50 %	322690719
15082	NC_015067	ACATCG	2	12	677090	677101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322690719
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15085	NC_015067	GACT	2	8	677234	677241	25 %	25 %	25 %	25 %	322690719
15086	NC_015067	AGCC	2	8	677244	677251	25 %	0 %	25 %	50 %	322690719
15087	NC_015067	TGC	2	6	677270	677275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690719
15088	NC_015067	GCCG	2	8	677280	677287	0 %	0 %	50 %	50 %	322690719
15089	NC_015067	GC	3	6	677416	677421	0 %	0 %	50 %	50 %	322690719
15090	NC_015067	GGC	2	6	677442	677447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690719
15091	NC_015067	GCTG	2	8	677467	677474	0 %	25 %	50 %	25 %	322690719
15092	NC_015067	CGGC	2	8	677522	677529	0 %	0 %	50 %	50 %	322690719
15093	NC_015067	CCGGCA	2	12	677546	677557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690719
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15095	NC_015067	CGA	2	6	677610	677615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690719
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15100	NC_015067	GAA	2	6	677778	677783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690719
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15103	NC_015067	GCG	2	6	677921	677926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690719
15104	NC_015067	CGC	2	6	677943	677948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690719
15105	NC_015067	CGG	3	9	678008	678016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690719
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15108	NC_015067	GCT	2	6	678108	678113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690719
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15110	NC_015067	CCAT	2	8	678244	678251	25 %	25 %	0 %	50 %	322690719
15111	NC_015067	GCT	2	6	678279	678284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690719
15112	NC_015067	TGG	2	6	678302	678307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690719
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15116	NC_015067	AGT	2	6	678454	678459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690719
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15118	NC_015067	TCCGGC	2	12	678631	678642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690719
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15120	NC_015067	CGT	2	6	678745	678750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690719
15121	NC_015067	ACG	2	6	678821	678826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690719
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15123	NC_015067	GGC	2	6	678855	678860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690719
15124	NC_015067	GGC	2	6	678868	678873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690719
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15198	NC_015067	GC	3	6	682899	682904	0 %	0 %	50 %	50 %	322690724
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15201	NC_015067	TGG	2	6	683141	683146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15202	NC_015067	GCC	2	6	683169	683174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15227	NC_015067	CGC	2	6	684392	684397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15228	NC_015067	GGC	2	6	684415	684420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15229	NC_015067	CG	3	6	684451	684456	0 %	0 %	50 %	50 %	322690726
15230	NC_015067	GCA	2	6	684469	684474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690726
15231	NC_015067	CTG	2	6	684497	684502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690726
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15235	NC_015067	CAA	2	6	684655	684660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690726
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15237	NC_015067	CAA	2	6	684862	684867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690726
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15362	NC_015067	GGAA	2	8	692125	692132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15363	NC_015067	CAT	2	6	692135	692140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690736
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15482	NC_015067	CG	3	6	697553	697558	0 %	0 %	50 %	50 %	322690740
15483	NC_015067	TCA	2	6	697619	697624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690740
15484	NC_015067	GC	3	6	697629	697634	0 %	0 %	50 %	50 %	322690740
15485	NC_015067	CT	3	6	697680	697685	0 %	50 %	0 %	50 %	322690740
15486	NC_015067	CGCCTG	2	12	697686	697697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690740
15487	NC_015067	CGAC	2	8	697712	697719	25 %	0 %	25 %	50 %	322690740
15488	NC_015067	GTC	2	6	697923	697928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690740
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