MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015067	ATC	2	6	628487	628492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690678
14002	NC_015067	GCC	2	6	628496	628501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14003	NC_015067	CCG	2	6	628545	628550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14004	NC_015067	CCGG	2	8	628598	628605	0 %	0 %	50 %	50 %	322690678
14005	NC_015067	TGC	2	6	628668	628673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690678
14006	NC_015067	ACCTC	2	10	628728	628737	20 %	20 %	0 %	60 %	322690678
14007	NC_015067	TTC	2	6	628746	628751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690678
14008	NC_015067	TGC	3	9	628752	628760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690678
14009	NC_015067	CAC	2	6	628798	628803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690678
14010	NC_015067	CAA	2	6	628816	628821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690678
14011	NC_015067	CCAT	2	8	628847	628854	25 %	25 %	0 %	50 %	322690678
14012	NC_015067	ACT	2	6	628944	628949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690678
14013	NC_015067	GAG	2	6	628952	628957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690678
14014	NC_015067	GAA	2	6	628963	628968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690678
14015	NC_015067	CGC	2	6	628972	628977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14016	NC_015067	GAAG	2	8	628987	628994	50 %	0 %	50 %	0 %	322690678
14017	NC_015067	CAA	2	6	629020	629025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690678
14018	NC_015067	GTG	2	6	629042	629047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690678
14019	NC_015067	CAC	2	6	629143	629148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690678
14020	NC_015067	CTC	2	6	629164	629169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690678
14021	NC_015067	CGG	2	6	629176	629181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690678
14022	NC_015067	TCC	2	6	629240	629245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690678
14023	NC_015067	CAG	2	6	629261	629266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690678
14024	NC_015067	CCA	2	6	629292	629297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690678
14025	NC_015067	GC	3	6	629313	629318	0 %	0 %	50 %	50 %	322690678
14026	NC_015067	CTCG	2	8	629326	629333	0 %	25 %	25 %	50 %	322690678
14027	NC_015067	ACC	2	6	629337	629342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690678
14028	NC_015067	AAG	2	6	629381	629386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690678
14029	NC_015067	CGA	2	6	629449	629454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690678
14030	NC_015067	TTCA	2	8	629528	629535	25 %	50 %	0 %	25 %	322690678
14031	NC_015067	CCG	2	6	629595	629600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14032	NC_015067	CCA	2	6	629604	629609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690678
14033	NC_015067	CGC	2	6	629616	629621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14034	NC_015067	TGA	3	9	629626	629634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690678
14035	NC_015067	CAG	2	6	629636	629641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690678
14036	NC_015067	GAAC	2	8	629701	629708	50 %	0 %	25 %	25 %	322690678
14037	NC_015067	ACA	2	6	629790	629795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690678
14038	NC_015067	CTT	2	6	629896	629901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690678
14039	NC_015067	GCC	2	6	629912	629917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14040	NC_015067	CAA	2	6	630004	630009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690678
14041	NC_015067	ATCT	2	8	630047	630054	25 %	50 %	0 %	25 %	322690678
14042	NC_015067	TTGC	2	8	630110	630117	0 %	50 %	25 %	25 %	322690678
14043	NC_015067	CCG	2	6	630147	630152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690678
14044	NC_015067	ACAG	2	8	630194	630201	50 %	0 %	25 %	25 %	322690678
14045	NC_015067	TAG	2	6	630204	630209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690678
14046	NC_015067	CTGT	2	8	630211	630218	0 %	50 %	25 %	25 %	322690678
14047	NC_015067	AAC	2	6	630332	630337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690679
14048	NC_015067	GAA	2	6	630339	630344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690679
14049	NC_015067	CG	3	6	630385	630390	0 %	0 %	50 %	50 %	322690679
14050	NC_015067	TGG	2	6	630503	630508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690679
14051	NC_015067	GTG	2	6	630625	630630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690679
14052	NC_015067	TCA	2	6	630632	630637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690679
14053	NC_015067	TGC	2	6	630659	630664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690679
14054	NC_015067	CTG	2	6	630832	630837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690679
14055	NC_015067	TCT	2	6	630857	630862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690679
14056	NC_015067	GGC	2	6	630871	630876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14057	NC_015067	GC	3	6	630897	630902	0 %	0 %	50 %	50 %	322690679
14058	NC_015067	GGC	2	6	630903	630908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14059	NC_015067	CGG	2	6	630939	630944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14060	NC_015067	CGC	2	6	630994	630999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690679
14061	NC_015067	TAT	2	6	631158	631163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690679
14062	NC_015067	GCC	2	6	631215	631220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690679
14063	NC_015067	GAG	2	6	631222	631227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690679
14064	NC_015067	CGC	2	6	631235	631240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690679
14065	NC_015067	CGG	2	6	631256	631261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14066	NC_015067	GCG	2	6	631287	631292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14067	NC_015067	ACT	2	6	631306	631311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690679
14068	NC_015067	GCG	2	6	631354	631359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14069	NC_015067	TGA	2	6	631392	631397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690679
14070	NC_015067	CGAG	2	8	631427	631434	25 %	0 %	50 %	25 %	322690679
14071	NC_015067	GCG	2	6	631481	631486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690679
14072	NC_015067	GCC	2	6	631501	631506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690679
14073	NC_015067	GTACG	2	10	631530	631539	20 %	20 %	40 %	20 %	322690679
14074	NC_015067	AGG	2	6	631562	631567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690679
14075	NC_015067	TGG	2	6	631595	631600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690679
14076	NC_015067	TCA	2	6	631628	631633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690679
14077	NC_015067	CG	3	6	631670	631675	0 %	0 %	50 %	50 %	322690679
14078	NC_015067	CTG	2	6	631750	631755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690679
14079	NC_015067	CAT	2	6	631929	631934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690679
14080	NC_015067	TCGC	2	8	631958	631965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_015067	GATT	2	8	632025	632032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_015067	GCA	2	6	632303	632308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_015067	GAT	2	6	632387	632392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690680
14084	NC_015067	CGGAG	2	10	632426	632435	20 %	0 %	60 %	20 %	322690680
14085	NC_015067	CGA	2	6	632440	632445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14086	NC_015067	GCA	2	6	632446	632451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14087	NC_015067	GTA	2	6	632504	632509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690680
14088	NC_015067	TCG	2	6	632523	632528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14089	NC_015067	TGA	2	6	632557	632562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690680
14090	NC_015067	CGG	2	6	632755	632760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690680
14091	NC_015067	TCG	2	6	632853	632858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14092	NC_015067	TCG	2	6	632922	632927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14093	NC_015067	GC	3	6	632937	632942	0 %	0 %	50 %	50 %	322690680
14094	NC_015067	TCA	2	6	632995	633000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690680
14095	NC_015067	CGG	2	6	633049	633054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690680
14096	NC_015067	GC	3	6	633090	633095	0 %	0 %	50 %	50 %	322690680
14097	NC_015067	TGCC	2	8	633133	633140	0 %	25 %	25 %	50 %	322690680
14098	NC_015067	TGA	2	6	633157	633162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690680
14099	NC_015067	TGT	2	6	633241	633246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690680
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14101	NC_015067	GCG	2	6	633294	633299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690680
14102	NC_015067	CGG	3	9	633328	633336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690680
14103	NC_015067	TTC	2	6	633405	633410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690680
14104	NC_015067	GCG	2	6	633426	633431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690680
14105	NC_015067	GTG	2	6	633453	633458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690680
14106	NC_015067	TCG	2	6	633507	633512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14107	NC_015067	AGC	2	6	633528	633533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690680
14108	NC_015067	CG	4	8	633553	633560	0 %	0 %	50 %	50 %	322690680
14109	NC_015067	TGT	2	6	633592	633597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690680
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14111	NC_015067	CGG	2	6	633651	633656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690681
14112	NC_015067	GTT	2	6	633685	633690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690681
14113	NC_015067	AGC	2	6	633698	633703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690681
14114	NC_015067	TGT	2	6	633768	633773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690681
14115	NC_015067	CGG	2	6	633855	633860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690681
14116	NC_015067	GCC	3	9	633901	633909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690681
14117	NC_015067	CGCC	2	8	633936	633943	0 %	0 %	25 %	75 %	322690681
14118	NC_015067	GA	3	6	633954	633959	50 %	0 %	50 %	0 %	322690681
14119	NC_015067	TGG	2	6	633978	633983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690681
14120	NC_015067	AGC	2	6	633989	633994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690681
14121	NC_015067	CGC	2	6	634011	634016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690681
14122	NC_015067	TCG	2	6	634022	634027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690681
14123	NC_015067	TGG	2	6	634143	634148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690681
14124	NC_015067	CCGA	2	8	634181	634188	25 %	0 %	25 %	50 %	322690681
14125	NC_015067	TTCGTC	2	12	634207	634218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322690681
14126	NC_015067	CGG	2	6	634236	634241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690681
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14130	NC_015067	TTG	2	6	634430	634435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690681
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14135	NC_015067	GAC	2	6	634600	634605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690681
14136	NC_015067	TTGG	2	8	634657	634664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_015067	TGG	2	6	634766	634771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_015067	GTC	2	6	634899	634904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690682
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14140	NC_015067	TGG	3	9	635078	635086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690682
14141	NC_015067	GCG	2	6	635120	635125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690682
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14149	NC_015067	CTG	2	6	635366	635371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690682
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14154	NC_015067	CGGG	2	8	635514	635521	0 %	0 %	75 %	25 %	322690682
14155	NC_015067	GTT	2	6	635562	635567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690682
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14164	NC_015067	GATGA	2	10	636129	636138	40 %	20 %	40 %	0 %	322690682
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14166	NC_015067	CTAT	2	8	636319	636326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14167	NC_015067	CGG	2	6	636340	636345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14168	NC_015067	TGT	2	6	636356	636361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14169	NC_015067	GTG	2	6	636365	636370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14170	NC_015067	TTG	2	6	636375	636380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14171	NC_015067	TGG	2	6	636458	636463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14172	NC_015067	TGTGG	2	10	636469	636478	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14173	NC_015067	CCG	2	6	636528	636533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14174	NC_015067	TAT	2	6	636634	636639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14175	NC_015067	TCG	2	6	636653	636658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14181	NC_015067	GCT	3	9	636987	636995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690683
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14184	NC_015067	GTG	2	6	637096	637101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690683
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14190	NC_015067	GCA	2	6	637410	637415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690683
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14212	NC_015067	TGC	2	6	638329	638334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690684
14213	NC_015067	TGC	2	6	638349	638354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690684
14214	NC_015067	TGA	2	6	638362	638367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690684
14215	NC_015067	TCGC	2	8	638371	638378	0 %	25 %	25 %	50 %	322690684
14216	NC_015067	ATG	2	6	638450	638455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14217	NC_015067	ACTT	2	8	638468	638475	25 %	50 %	0 %	25 %	322690685
14218	NC_015067	GGT	2	6	638494	638499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690685
14219	NC_015067	GCCA	2	8	638507	638514	25 %	0 %	25 %	50 %	322690685
14220	NC_015067	CTT	2	6	638527	638532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690685
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14222	NC_015067	CAT	3	9	638760	638768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690685
14223	NC_015067	GTC	2	6	638782	638787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14224	NC_015067	TGG	2	6	638868	638873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690685
14225	NC_015067	TCTT	2	8	638891	638898	0 %	75 %	0 %	25 %	322690685
14226	NC_015067	ACG	2	6	638903	638908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14227	NC_015067	GTA	2	6	638923	638928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690685
14228	NC_015067	CTT	2	6	638950	638955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690685
14229	NC_015067	TCG	2	6	638960	638965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14230	NC_015067	CTG	2	6	638977	638982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14231	NC_015067	TGCGG	2	10	639031	639040	0 %	20 %	60 %	20 %	322690685
14232	NC_015067	CAC	2	6	639046	639051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690685
14233	NC_015067	CTT	2	6	639058	639063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690685
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14235	NC_015067	CTG	2	6	639199	639204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14236	NC_015067	GTC	2	6	639211	639216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690685
14237	NC_015067	CGG	2	6	639222	639227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690685
14238	NC_015067	TCCTC	2	10	639339	639348	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14239	NC_015067	CGGA	2	8	639496	639503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14241	NC_015067	CTGGC	2	10	639604	639613	0 %	20 %	40 %	40 %	322690686
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14481	NC_015067	GTC	2	6	649581	649586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690695
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14484	NC_015067	TCGT	2	8	649662	649669	0 %	50 %	25 %	25 %	322690695
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