MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015067	CTG	2	6	560893	560898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690624
12502	NC_015067	CGC	2	6	561024	561029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690624
12503	NC_015067	GAAG	2	8	561042	561049	50 %	0 %	50 %	0 %	322690624
12504	NC_015067	CAT	2	6	561075	561080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690624
12505	NC_015067	TCCG	2	8	561081	561088	0 %	25 %	25 %	50 %	322690624
12506	NC_015067	TCC	2	6	561115	561120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690624
12507	NC_015067	GTG	2	6	561190	561195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690624
12508	NC_015067	CTC	2	6	561222	561227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690624
12509	NC_015067	GCG	2	6	561236	561241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690624
12510	NC_015067	ACC	2	6	561265	561270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690624
12511	NC_015067	AGGAAG	2	12	561272	561283	50 %	0 %	50 %	0 %	322690624
12512	NC_015067	CAA	2	6	561285	561290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690624
12513	NC_015067	TCC	2	6	561340	561345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690624
12514	NC_015067	ACC	2	6	561364	561369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690624
12515	NC_015067	TCT	2	6	561395	561400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690624
12516	NC_015067	CGG	2	6	561474	561479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690624
12517	NC_015067	AAG	2	6	561502	561507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690624
12518	NC_015067	CCG	2	6	561521	561526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690624
12519	NC_015067	GAC	2	6	561559	561564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690624
12520	NC_015067	AAG	2	6	561574	561579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690624
12521	NC_015067	CGC	2	6	561642	561647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690624
12522	NC_015067	GTTC	2	8	561667	561674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12523	NC_015067	GGT	2	6	561709	561714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_015067	CCA	2	6	561729	561734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_015067	GCG	2	6	561751	561756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_015067	TGTATA	2	12	561776	561787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_015067	TTG	2	6	561813	561818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_015067	GGC	2	6	561832	561837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_015067	AGA	3	9	561845	561853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_015067	GA	4	8	561852	561859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_015067	CAA	2	6	561870	561875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690625
12532	NC_015067	GCC	3	9	561892	561900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690625
12533	NC_015067	CCG	2	6	561923	561928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690625
12534	NC_015067	TCC	2	6	561982	561987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690625
12535	NC_015067	TCACCA	2	12	561995	562006	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322690625
12536	NC_015067	ACG	2	6	562010	562015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690625
12537	NC_015067	GAA	2	6	562026	562031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690625
12538	NC_015067	CGC	2	6	562044	562049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690625
12539	NC_015067	CTG	2	6	562051	562056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690625
12540	NC_015067	CCT	2	6	562103	562108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690625
12541	NC_015067	TCC	2	6	562216	562221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690625
12542	NC_015067	TCACCA	2	12	562280	562291	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322690625
12543	NC_015067	CAA	2	6	562443	562448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690625
12544	NC_015067	AAGA	2	8	562477	562484	75 %	0 %	25 %	0 %	322690625
12545	NC_015067	TCC	2	6	562498	562503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690625
12546	NC_015067	AGC	2	6	562505	562510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690625
12547	NC_015067	CCA	2	6	562520	562525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690625
12548	NC_015067	TCT	2	6	562553	562558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690625
12549	NC_015067	CGCCAT	2	12	562647	562658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690625
12550	NC_015067	ACC	2	6	562678	562683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690625
12551	NC_015067	GAC	2	6	562717	562722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690625
12552	NC_015067	TCC	2	6	562739	562744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690625
12553	NC_015067	GAA	2	6	562942	562947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690626
12554	NC_015067	GTG	2	6	563036	563041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690626
12555	NC_015067	CGC	2	6	563047	563052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690626
12556	NC_015067	ATC	2	6	563186	563191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
12557	NC_015067	CAT	2	6	563209	563214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
12558	NC_015067	TGC	2	6	563235	563240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690626
12559	NC_015067	GCG	2	6	563241	563246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690626
12560	NC_015067	TTC	2	6	563255	563260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690626
12561	NC_015067	TTC	2	6	563267	563272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690626
12562	NC_015067	GTG	2	6	563390	563395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690626
12563	NC_015067	CGC	2	6	563410	563415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690626
12564	NC_015067	GCC	2	6	563441	563446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690626
12565	NC_015067	CGTG	2	8	563461	563468	0 %	25 %	50 %	25 %	322690626
12566	NC_015067	GGC	2	6	563503	563508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690626
12567	NC_015067	TCA	2	6	563535	563540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
12568	NC_015067	TGC	2	6	563553	563558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690626
12569	NC_015067	CAT	3	9	563572	563580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
12570	NC_015067	ACC	2	6	563618	563623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690626
12571	NC_015067	CCG	2	6	563634	563639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690626
12572	NC_015067	CCA	2	6	563667	563672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690626
12573	NC_015067	GCT	2	6	563707	563712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690626
12574	NC_015067	CTG	2	6	563735	563740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690626
12575	NC_015067	CGCC	2	8	563803	563810	0 %	0 %	25 %	75 %	322690626
12576	NC_015067	AGC	2	6	563829	563834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690626
12577	NC_015067	GGC	2	6	563980	563985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690627
12578	NC_015067	CTG	2	6	564003	564008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690627
12579	NC_015067	CGG	2	6	564166	564171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690627
12580	NC_015067	TGC	2	6	564234	564239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690627
12581	NC_015067	CGC	2	6	564262	564267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690627
12582	NC_015067	GCA	2	6	564361	564366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690627
12583	NC_015067	GCC	2	6	564380	564385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690627
12584	NC_015067	TGGCCG	2	12	564393	564404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690627
12585	NC_015067	GGT	2	6	564461	564466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690627
12586	NC_015067	CAG	3	9	564467	564475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690627
12587	NC_015067	TGG	2	6	564558	564563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690627
12588	NC_015067	AAGG	2	8	564596	564603	50 %	0 %	50 %	0 %	322690627
12589	NC_015067	CGG	2	6	564676	564681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690627
12590	NC_015067	GGC	2	6	564698	564703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690627
12591	NC_015067	CAT	2	6	564709	564714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690627
12592	NC_015067	ACC	2	6	564717	564722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690627
12593	NC_015067	CTT	2	6	564745	564750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690627
12594	NC_015067	GCA	2	6	564751	564756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690627
12595	NC_015067	GTT	2	6	564775	564780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_015067	TGA	2	6	564801	564806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_015067	T	7	7	564819	564825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_015067	GAA	2	6	564854	564859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_015067	GGC	2	6	564921	564926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_015067	AAT	2	6	564947	564952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_015067	TG	3	6	564975	564980	0 %	50 %	50 %	0 %	322690628
12602	NC_015067	CTGC	2	8	565036	565043	0 %	25 %	25 %	50 %	322690628
12603	NC_015067	GGT	2	6	565117	565122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690628
12604	NC_015067	AAG	2	6	565130	565135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690628
12605	NC_015067	GCCG	2	8	565136	565143	0 %	0 %	50 %	50 %	322690628
12606	NC_015067	GAA	2	6	565147	565152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690628
12607	NC_015067	CCA	2	6	565221	565226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690628
12608	NC_015067	CGAGC	2	10	565231	565240	20 %	0 %	40 %	40 %	322690628
12609	NC_015067	CAT	2	6	565285	565290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690628
12610	NC_015067	CAT	2	6	565300	565305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690628
12611	NC_015067	GCT	2	6	565390	565395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690628
12612	NC_015067	CGC	2	6	565457	565462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12613	NC_015067	GCC	2	6	565509	565514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12614	NC_015067	CGC	2	6	565548	565553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12615	NC_015067	CGC	2	6	565600	565605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12616	NC_015067	GC	3	6	565624	565629	0 %	0 %	50 %	50 %	322690628
12617	NC_015067	CCG	2	6	565665	565670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12618	NC_015067	GCC	2	6	565748	565753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690628
12619	NC_015067	GGC	2	6	565760	565765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690628
12620	NC_015067	GGC	2	6	565847	565852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690628
12621	NC_015067	TGA	2	6	565861	565866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690628
12622	NC_015067	CGA	2	6	565876	565881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690628
12623	NC_015067	ATC	2	6	565907	565912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690628
12624	NC_015067	GTG	2	6	566051	566056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690628
12625	NC_015067	CG	4	8	566107	566114	0 %	0 %	50 %	50 %	322690628
12626	NC_015067	CG	3	6	566166	566171	0 %	0 %	50 %	50 %	322690628
12627	NC_015067	AC	4	8	566190	566197	50 %	0 %	0 %	50 %	322690628
12628	NC_015067	CCA	2	6	566223	566228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690628
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12635	NC_015067	TGG	2	6	566553	566558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690628
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12662	NC_015067	CAAGC	2	10	567731	567740	40 %	0 %	20 %	40 %	322690630
12663	NC_015067	TCAG	2	8	567741	567748	25 %	25 %	25 %	25 %	322690630
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12683	NC_015067	GGC	2	6	568604	568609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690631
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12690	NC_015067	TGGA	2	8	569242	569249	25 %	25 %	50 %	0 %	322690632
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12699	NC_015067	CGTG	2	8	569436	569443	0 %	25 %	50 %	25 %	322690632
12700	NC_015067	TTC	2	6	569519	569524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690632
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12712	NC_015067	GAT	3	9	570123	570131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12713	NC_015067	TGA	2	6	570148	570153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690633
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12726	NC_015067	GTG	2	6	570543	570548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690633
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12732	NC_015067	ATC	2	6	570738	570743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690633
12733	NC_015067	GCT	2	6	570812	570817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690633
12734	NC_015067	GCC	2	6	570822	570827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690633
12735	NC_015067	GTT	2	6	570878	570883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690633
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12737	NC_015067	AAC	2	6	570933	570938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690633
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12975	NC_015067	A	8	8	582142	582149	100 %	0 %	0 %	0 %	322690641
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