MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015067	GC	3	6	539368	539373	0 %	0 %	50 %	50 %	322690607
12002	NC_015067	ATG	2	6	539403	539408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690607
12003	NC_015067	CATCG	2	10	539428	539437	20 %	20 %	20 %	40 %	322690607
12004	NC_015067	GGC	2	6	539440	539445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690607
12005	NC_015067	GAT	2	6	539450	539455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690607
12006	NC_015067	GAT	2	6	539468	539473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690607
12007	NC_015067	GAA	2	6	539513	539518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690607
12008	NC_015067	GGA	2	6	539551	539556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690607
12009	NC_015067	CGA	2	6	539578	539583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12010	NC_015067	ATGT	2	8	539594	539601	25 %	50 %	25 %	0 %	322690607
12011	NC_015067	TGA	2	6	539631	539636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690607
12012	NC_015067	CGGG	2	8	539662	539669	0 %	0 %	75 %	25 %	322690607
12013	NC_015067	GTG	2	6	539678	539683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690607
12014	NC_015067	CGC	2	6	539698	539703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12015	NC_015067	TG	3	6	539777	539782	0 %	50 %	50 %	0 %	322690607
12016	NC_015067	GTG	2	6	539900	539905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690607
12017	NC_015067	GCC	2	6	539942	539947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12018	NC_015067	CGC	2	6	540019	540024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12019	NC_015067	AGC	2	6	540042	540047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12020	NC_015067	TGG	2	6	540087	540092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690607
12021	NC_015067	ACG	2	6	540093	540098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12022	NC_015067	GCC	2	6	540116	540121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12023	NC_015067	TGA	2	6	540136	540141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690607
12024	NC_015067	GAAC	2	8	540223	540230	50 %	0 %	25 %	25 %	322690607
12025	NC_015067	GAG	2	6	540233	540238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690607
12026	NC_015067	CGG	2	6	540288	540293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690607
12027	NC_015067	TCA	2	6	540333	540338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690607
12028	NC_015067	CAA	2	6	540515	540520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690607
12029	NC_015067	CCG	2	6	540528	540533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12030	NC_015067	CCG	2	6	540537	540542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690607
12031	NC_015067	AGC	2	6	540560	540565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12032	NC_015067	TGG	2	6	540588	540593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690607
12033	NC_015067	ATC	2	6	540616	540621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690607
12034	NC_015067	TCG	2	6	540660	540665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12035	NC_015067	CAC	2	6	540739	540744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690607
12036	NC_015067	GTC	2	6	540777	540782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12037	NC_015067	CCA	2	6	540786	540791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690607
12038	NC_015067	GAC	2	6	540797	540802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12039	NC_015067	CTG	3	9	540839	540847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12040	NC_015067	CT	3	6	540888	540893	0 %	50 %	0 %	50 %	322690607
12041	NC_015067	CGA	2	6	540910	540915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
12042	NC_015067	CG	3	6	540938	540943	0 %	0 %	50 %	50 %	322690607
12043	NC_015067	GA	3	6	541057	541062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_015067	CGA	2	6	541086	541091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_015067	GAC	2	6	541096	541101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_015067	GGGC	2	8	541178	541185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12047	NC_015067	CG	3	6	541233	541238	0 %	0 %	50 %	50 %	322690608
12048	NC_015067	GTC	2	6	541247	541252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
12049	NC_015067	TGC	2	6	541285	541290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
12050	NC_015067	ATG	2	6	541344	541349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690608
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12052	NC_015067	TCGCCT	2	12	541531	541542	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322690608
12053	NC_015067	GCT	2	6	541571	541576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
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12055	NC_015067	GCT	2	6	541679	541684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
12056	NC_015067	GCC	2	6	541707	541712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690608
12057	NC_015067	GGC	2	6	541748	541753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
12058	NC_015067	TGGC	2	8	541755	541762	0 %	25 %	50 %	25 %	322690608
12059	NC_015067	CGG	2	6	541817	541822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
12060	NC_015067	TTC	2	6	541830	541835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690608
12061	NC_015067	CTG	2	6	541906	541911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
12062	NC_015067	GCG	2	6	541957	541962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
12063	NC_015067	CCA	2	6	542065	542070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690608
12064	NC_015067	GC	3	6	542140	542145	0 %	0 %	50 %	50 %	322690608
12065	NC_015067	GCT	2	6	542207	542212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
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12067	NC_015067	CTG	2	6	542259	542264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
12068	NC_015067	CGG	2	6	542344	542349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
12069	NC_015067	ACC	2	6	542379	542384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690608
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12071	NC_015067	GCG	2	6	542528	542533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
12072	NC_015067	GATG	2	8	542561	542568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_015067	GGC	2	6	542572	542577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12074	NC_015067	TC	3	6	542588	542593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12075	NC_015067	ATG	2	6	542630	542635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_015067	ATT	2	6	542652	542657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_015067	TTC	2	6	542700	542705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12085	NC_015067	CCGT	2	8	543041	543048	0 %	25 %	25 %	50 %	322690609
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12100	NC_015067	AGT	2	6	543649	543654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_015067	CAGG	2	8	543668	543675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12102	NC_015067	GC	3	6	543679	543684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12103	NC_015067	CAA	2	6	543740	543745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_015067	GAGC	2	8	543796	543803	25 %	0 %	50 %	25 %	322690610
12105	NC_015067	CTT	2	6	543815	543820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690610
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12108	NC_015067	TGG	2	6	543945	543950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690610
12109	NC_015067	CAC	2	6	543958	543963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690610
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12111	NC_015067	TCG	2	6	544026	544031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
12112	NC_015067	CA	3	6	544071	544076	50 %	0 %	0 %	50 %	322690610
12113	NC_015067	TCG	2	6	544125	544130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
12114	NC_015067	TCG	2	6	544167	544172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
12115	NC_015067	CGA	2	6	544189	544194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
12116	NC_015067	CCG	2	6	544197	544202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690610
12117	NC_015067	ATC	2	6	544211	544216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690610
12118	NC_015067	AAGGTC	2	12	544247	544258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690610
12119	NC_015067	CGAC	2	8	544267	544274	25 %	0 %	25 %	50 %	322690610
12120	NC_015067	AGC	3	9	544341	544349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
12121	NC_015067	CAT	2	6	544420	544425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690610
12122	NC_015067	GCA	2	6	544459	544464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
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12126	NC_015067	TCAAGG	2	12	544587	544598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690610
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12129	NC_015067	CTG	2	6	544691	544696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
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12131	NC_015067	CAGAG	2	10	544746	544755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12132	NC_015067	CAC	2	6	544757	544762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12133	NC_015067	CAAG	2	8	544806	544813	50 %	0 %	25 %	25 %	322690611
12134	NC_015067	CG	4	8	544840	544847	0 %	0 %	50 %	50 %	322690611
12135	NC_015067	CAG	2	6	544922	544927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690611
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12139	NC_015067	CTG	2	6	545042	545047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
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12239	NC_015067	ATC	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690613
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12311	NC_015067	TCA	2	6	552813	552818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690616
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12343	NC_015067	GCGG	2	8	554025	554032	0 %	0 %	75 %	25 %	322690617
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12353	NC_015067	CGC	2	6	554328	554333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690617
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12478	NC_015067	ACTCCC	2	12	559505	559516	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	322690622
12479	NC_015067	GGC	2	6	559556	559561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690622
12480	NC_015067	CAG	2	6	559564	559569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690622
12481	NC_015067	TGG	2	6	559697	559702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690622
12482	NC_015067	GCG	2	6	559754	559759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690622
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12484	NC_015067	GGT	2	6	559868	559873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690622
12485	NC_015067	GGTT	2	8	559936	559943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12486	NC_015067	AT	3	6	559950	559955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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