MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015067	TCA	2	6	514879	514884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11502	NC_015067	GAG	2	6	514974	514979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690597
11503	NC_015067	TGC	2	6	514999	515004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11504	NC_015067	TGG	2	6	515059	515064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690597
11505	NC_015067	AAGGC	2	10	515065	515074	40 %	0 %	40 %	20 %	322690597
11506	NC_015067	GCC	2	6	515084	515089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11507	NC_015067	GCC	2	6	515100	515105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11508	NC_015067	CCG	2	6	515155	515160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11509	NC_015067	CGCT	2	8	515178	515185	0 %	25 %	25 %	50 %	322690597
11510	NC_015067	GAT	2	6	515186	515191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690597
11511	NC_015067	ACA	2	6	515200	515205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690597
11512	NC_015067	GCCG	2	8	515213	515220	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
11513	NC_015067	TAC	2	6	515268	515273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11514	NC_015067	AGGGCC	2	12	515299	515310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322690597
11515	NC_015067	TGC	2	6	515407	515412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11516	NC_015067	GAA	2	6	515414	515419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690597
11517	NC_015067	CG	3	6	515452	515457	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
11518	NC_015067	GTC	2	6	515472	515477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11519	NC_015067	GAA	2	6	515481	515486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690597
11520	NC_015067	ACG	2	6	515494	515499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11521	NC_015067	CCT	2	6	515518	515523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690597
11522	NC_015067	CCGA	2	8	515553	515560	25 %	0 %	25 %	50 %	322690597
11523	NC_015067	TCG	2	6	515608	515613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11524	NC_015067	CAG	2	6	515640	515645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11525	NC_015067	GCC	2	6	515649	515654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11526	NC_015067	GCC	2	6	515735	515740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11527	NC_015067	CGA	2	6	515747	515752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11528	NC_015067	CCG	2	6	515866	515871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11529	NC_015067	GAG	2	6	515889	515894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690597
11530	NC_015067	CGACC	2	10	515900	515909	20 %	0 %	20 %	60 %	322690597
11531	NC_015067	CAT	2	6	515921	515926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11532	NC_015067	ATG	2	6	515952	515957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690597
11533	NC_015067	CGT	2	6	516144	516149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11534	NC_015067	ACG	2	6	516238	516243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11535	NC_015067	GCC	2	6	516264	516269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11536	NC_015067	CGC	2	6	516296	516301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11537	NC_015067	CGA	2	6	516347	516352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11538	NC_015067	GCG	2	6	516442	516447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690597
11539	NC_015067	CCA	2	6	516478	516483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690597
11540	NC_015067	TCG	2	6	516517	516522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11541	NC_015067	TTCC	2	8	516566	516573	0 %	50 %	0 %	50 %	322690597
11542	NC_015067	GGT	2	6	516579	516584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690597
11543	NC_015067	GCA	2	6	516685	516690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11544	NC_015067	ATC	2	6	516723	516728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11545	NC_015067	GAAG	2	8	516758	516765	50 %	0 %	50 %	0 %	322690597
11546	NC_015067	AAG	2	6	516879	516884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690597
11547	NC_015067	GC	3	6	516905	516910	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
11548	NC_015067	GGA	2	6	516929	516934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690597
11549	NC_015067	CAT	2	6	517022	517027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11550	NC_015067	CTG	2	6	517047	517052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11551	NC_015067	TGG	2	6	517063	517068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690597
11552	NC_015067	GTCG	2	8	517128	517135	0 %	25 %	50 %	25 %	322690597
11553	NC_015067	CCG	2	6	517189	517194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11554	NC_015067	ACC	2	6	517209	517214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690597
11555	NC_015067	GCC	2	6	517230	517235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690597
11556	NC_015067	CGA	2	6	517250	517255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11557	NC_015067	TCA	2	6	517279	517284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
11558	NC_015067	CCGG	2	8	517299	517306	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
11559	NC_015067	CG	3	6	517316	517321	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
11560	NC_015067	GCG	2	6	517390	517395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690597
11561	NC_015067	CGA	2	6	517484	517489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11562	NC_015067	GAT	2	6	517500	517505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690597
11563	NC_015067	GAG	2	6	517539	517544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690597
11564	NC_015067	GCAG	2	8	517679	517686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_015067	GAA	2	6	517730	517735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690598
11566	NC_015067	GC	3	6	517762	517767	0 %	0 %	50 %	50 %	322690598
11567	NC_015067	TGA	2	6	517816	517821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690598
11568	NC_015067	GC	3	6	517861	517866	0 %	0 %	50 %	50 %	322690598
11569	NC_015067	GGC	2	6	517886	517891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690598
11570	NC_015067	CGGGT	2	10	517911	517920	0 %	20 %	60 %	20 %	322690598
11571	NC_015067	GCA	2	6	518026	518031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690598
11572	NC_015067	TCT	2	6	518038	518043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690598
11573	NC_015067	GAG	3	9	518064	518072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690598
11574	NC_015067	CGG	2	6	518107	518112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690598
11575	NC_015067	GGTGT	2	10	518118	518127	0 %	40 %	60 %	0 %	322690598
11576	NC_015067	GCG	3	9	518154	518162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690598
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11579	NC_015067	GCG	2	6	518373	518378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690599
11580	NC_015067	GGT	3	9	518504	518512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690599
11581	NC_015067	CGG	2	6	518524	518529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690599
11582	NC_015067	TGG	2	6	518545	518550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690599
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11584	NC_015067	GCC	2	6	518568	518573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690599
11585	NC_015067	GCT	2	6	518584	518589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690599
11586	NC_015067	CGG	3	9	518599	518607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690599
11587	NC_015067	GCT	2	6	518608	518613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690599
11588	NC_015067	GCC	2	6	518616	518621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690599
11589	NC_015067	GCC	2	6	518651	518656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690599
11590	NC_015067	CAG	2	6	518807	518812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690599
11591	NC_015067	GCA	2	6	518850	518855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690599
11592	NC_015067	CCT	2	6	518877	518882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_015067	ATG	2	6	518989	518994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690600
11594	NC_015067	CCGC	2	8	519047	519054	0 %	0 %	25 %	75 %	322690600
11595	NC_015067	GCC	2	6	519065	519070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690600
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11598	NC_015067	GAT	2	6	519166	519171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690600
11599	NC_015067	ATG	2	6	519209	519214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690600
11600	NC_015067	TGA	2	6	519240	519245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690600
11601	NC_015067	CGCCTC	2	12	519262	519273	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322690600
11602	NC_015067	CTT	2	6	519303	519308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690600
11603	NC_015067	GCG	2	6	519347	519352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690600
11604	NC_015067	ATC	2	6	519466	519471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690600
11605	NC_015067	AGC	2	6	519487	519492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690600
11606	NC_015067	CGC	2	6	519561	519566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690600
11607	NC_015067	GTC	2	6	519616	519621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690600
11608	NC_015067	GGC	2	6	519649	519654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690600
11609	NC_015067	CGC	2	6	519696	519701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690600
11610	NC_015067	GCC	3	9	519706	519714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690600
11611	NC_015067	TTG	2	6	519742	519747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690600
11612	NC_015067	GTT	2	6	519766	519771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690600
11613	NC_015067	CTT	2	6	519840	519845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690601
11614	NC_015067	CGT	2	6	519864	519869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690601
11615	NC_015067	TGC	2	6	519879	519884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690601
11616	NC_015067	TCC	2	6	519935	519940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690601
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11618	NC_015067	TGG	2	6	520001	520006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690601
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11737	NC_015067	GCT	2	6	525657	525662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690604
11738	NC_015067	GGA	2	6	525675	525680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690604
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11815	NC_015067	TGA	2	6	529826	529831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690604
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11820	NC_015067	AGT	2	6	529923	529928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690604
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11835	NC_015067	CCT	2	6	530702	530707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690604
11836	NC_015067	GGC	2	6	530786	530791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690604
11837	NC_015067	CAA	2	6	530822	530827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690604
11838	NC_015067	AGC	2	6	530836	530841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690604
11839	NC_015067	GGC	2	6	530891	530896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690604
11840	NC_015067	CGA	2	6	530920	530925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690604
11841	NC_015067	TGT	2	6	531028	531033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11842	NC_015067	CGC	2	6	531048	531053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11843	NC_015067	GC	3	6	531261	531266	0 %	0 %	50 %	50 %	322690605
11844	NC_015067	TGC	2	6	531279	531284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690605
11845	NC_015067	CCG	2	6	531363	531368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690605
11846	NC_015067	GGAA	2	8	531394	531401	50 %	0 %	50 %	0 %	322690605
11847	NC_015067	ATT	2	6	531439	531444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690605
11848	NC_015067	GTT	2	6	531448	531453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690605
11849	NC_015067	TCA	2	6	531455	531460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690605
11850	NC_015067	CGC	2	6	531562	531567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690605
11851	NC_015067	TGATC	2	10	531621	531630	20 %	40 %	20 %	20 %	322690605
11852	NC_015067	AGT	2	6	531765	531770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690605
11853	NC_015067	GCA	2	6	531804	531809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690605
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