MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015067	CCCG	2	8	491859	491866	0 %	0 %	25 %	75 %	322690581
11002	NC_015067	GCT	2	6	491908	491913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690581
11003	NC_015067	GT	3	6	491967	491972	0 %	50 %	50 %	0 %	322690581
11004	NC_015067	CG	4	8	491980	491987	0 %	0 %	50 %	50 %	322690581
11005	NC_015067	TCC	2	6	492083	492088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690581
11006	NC_015067	TC	3	6	492105	492110	0 %	50 %	0 %	50 %	322690581
11007	NC_015067	GGC	3	9	492161	492169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
11008	NC_015067	AAG	2	6	492212	492217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690581
11009	NC_015067	CG	3	6	492248	492253	0 %	0 %	50 %	50 %	322690581
11010	NC_015067	CGG	2	6	492298	492303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
11011	NC_015067	GGC	2	6	492311	492316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
11012	NC_015067	CTG	2	6	492317	492322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690581
11013	NC_015067	ACG	2	6	492543	492548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690581
11014	NC_015067	GGC	2	6	492577	492582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
11015	NC_015067	CGC	3	9	492595	492603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690581
11016	NC_015067	ACC	2	6	492626	492631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690581
11017	NC_015067	TGGC	2	8	492674	492681	0 %	25 %	50 %	25 %	322690581
11018	NC_015067	CCG	2	6	492693	492698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690581
11019	NC_015067	CGG	2	6	492739	492744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
11020	NC_015067	GCTC	2	8	492814	492821	0 %	25 %	25 %	50 %	322690581
11021	NC_015067	ACG	2	6	493090	493095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690582
11022	NC_015067	CTG	2	6	493155	493160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
11023	NC_015067	TCGACC	2	12	493174	493185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690582
11024	NC_015067	CGC	2	6	493231	493236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
11025	NC_015067	GTG	2	6	493263	493268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
11026	NC_015067	CGG	2	6	493304	493309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690582
11027	NC_015067	AGG	2	6	493333	493338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690582
11028	NC_015067	GTG	2	6	493383	493388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
11029	NC_015067	AAG	2	6	493419	493424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
11030	NC_015067	AAG	2	6	493443	493448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
11031	NC_015067	TCG	2	6	493486	493491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
11032	NC_015067	CCA	2	6	493549	493554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690582
11033	NC_015067	GTG	2	6	493641	493646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
11034	NC_015067	GGC	2	6	493647	493652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690582
11035	NC_015067	CGA	2	6	493688	493693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690582
11036	NC_015067	CCG	2	6	493765	493770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
11037	NC_015067	CCG	2	6	493780	493785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
11038	NC_015067	TGC	2	6	493789	493794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
11039	NC_015067	TGA	2	6	493811	493816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690582
11040	NC_015067	AAG	2	6	493824	493829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
11041	NC_015067	CCG	2	6	493837	493842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
11042	NC_015067	GAG	2	6	493857	493862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690582
11043	NC_015067	CT	3	6	493962	493967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_015067	TGCA	2	8	493977	493984	25 %	25 %	25 %	25 %	322690583
11045	NC_015067	GCA	2	6	494014	494019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11046	NC_015067	GAT	2	6	494046	494051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690583
11047	NC_015067	TTG	2	6	494127	494132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690583
11048	NC_015067	GAT	2	6	494160	494165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690583
11049	NC_015067	AGCCG	2	10	494244	494253	20 %	0 %	40 %	40 %	322690583
11050	NC_015067	AGC	2	6	494256	494261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11051	NC_015067	CAGCG	2	10	494287	494296	20 %	0 %	40 %	40 %	322690583
11052	NC_015067	GGTGGG	2	12	494297	494308	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	322690583
11053	NC_015067	CATC	2	8	494335	494342	25 %	25 %	0 %	50 %	322690583
11054	NC_015067	AGC	2	6	494356	494361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11055	NC_015067	GCA	2	6	494487	494492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11056	NC_015067	GGGC	2	8	494527	494534	0 %	0 %	75 %	25 %	322690583
11057	NC_015067	AGC	2	6	494596	494601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11058	NC_015067	GAA	2	6	494718	494723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690583
11059	NC_015067	TGG	2	6	494742	494747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690583
11060	NC_015067	CTTGG	2	10	494769	494778	0 %	40 %	40 %	20 %	322690583
11061	NC_015067	GCG	2	6	494835	494840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
11062	NC_015067	GCG	2	6	494843	494848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
11063	NC_015067	GGC	2	6	494865	494870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
11064	NC_015067	TGC	2	6	494875	494880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11065	NC_015067	AGA	2	6	494947	494952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690583
11066	NC_015067	TCG	2	6	495031	495036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690583
11067	NC_015067	GCG	2	6	495057	495062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
11068	NC_015067	CA	3	6	495199	495204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11069	NC_015067	CGA	2	6	495271	495276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_015067	AGCCGA	2	12	495384	495395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690584
11071	NC_015067	TCT	2	6	495446	495451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690584
11072	NC_015067	CTT	2	6	495515	495520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690584
11073	NC_015067	GCT	2	6	495537	495542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690584
11074	NC_015067	TCCA	2	8	495544	495551	25 %	25 %	0 %	50 %	322690584
11075	NC_015067	TGG	2	6	495597	495602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690584
11076	NC_015067	CG	3	6	495641	495646	0 %	0 %	50 %	50 %	322690584
11077	NC_015067	CTGG	2	8	495651	495658	0 %	25 %	50 %	25 %	322690584
11078	NC_015067	ATG	2	6	495662	495667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690584
11079	NC_015067	TGA	2	6	495684	495689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690584
11080	NC_015067	GCC	2	6	495731	495736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690584
11081	NC_015067	CAA	2	6	495744	495749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690584
11082	NC_015067	TGG	2	6	495893	495898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690584
11083	NC_015067	GGAT	2	8	495949	495956	25 %	25 %	50 %	0 %	322690584
11084	NC_015067	CGAT	2	8	495970	495977	25 %	25 %	25 %	25 %	322690584
11085	NC_015067	CAT	2	6	495978	495983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690584
11086	NC_015067	TGA	2	6	496069	496074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_015067	AAG	2	6	496145	496150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690585
11088	NC_015067	GCG	3	9	496209	496217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690585
11089	NC_015067	GGC	2	6	496219	496224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690585
11090	NC_015067	GTT	2	6	496231	496236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690585
11091	NC_015067	GCC	2	6	496265	496270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690585
11092	NC_015067	CGA	2	6	496338	496343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11093	NC_015067	CG	3	6	496348	496353	0 %	0 %	50 %	50 %	322690585
11094	NC_015067	TCG	2	6	496398	496403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11095	NC_015067	GAA	2	6	496411	496416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690585
11096	NC_015067	GCA	2	6	496432	496437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11097	NC_015067	GTG	2	6	496442	496447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690585
11098	NC_015067	GC	3	6	496448	496453	0 %	0 %	50 %	50 %	322690585
11099	NC_015067	TGCG	2	8	496503	496510	0 %	25 %	50 %	25 %	322690585
11100	NC_015067	ACCT	2	8	496520	496527	25 %	25 %	0 %	50 %	322690585
11101	NC_015067	CAG	2	6	496541	496546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11102	NC_015067	GGT	2	6	496547	496552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690585
11103	NC_015067	TCG	2	6	496553	496558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11104	NC_015067	CAG	2	6	496565	496570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11105	NC_015067	TGC	2	6	496584	496589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11106	NC_015067	AAG	2	6	496694	496699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690585
11107	NC_015067	CAA	2	6	496750	496755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690585
11108	NC_015067	CCG	3	9	496800	496808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690585
11109	NC_015067	GTG	2	6	496817	496822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690585
11110	NC_015067	CCA	2	6	496830	496835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690585
11111	NC_015067	TGC	2	6	496932	496937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11112	NC_015067	AGGA	2	8	496938	496945	50 %	0 %	50 %	0 %	322690585
11113	NC_015067	GCATC	2	10	497071	497080	20 %	20 %	20 %	40 %	322690585
11114	NC_015067	GAA	2	6	497090	497095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690585
11115	NC_015067	GCT	2	6	497125	497130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
11116	NC_015067	AGG	2	6	497133	497138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690585
11117	NC_015067	CAC	2	6	497155	497160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690585
11118	NC_015067	GAT	2	6	497185	497190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690585
11119	NC_015067	CG	3	6	497197	497202	0 %	0 %	50 %	50 %	322690585
11120	NC_015067	CCA	2	6	497334	497339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690585
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11123	NC_015067	ACT	2	6	497612	497617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690585
11124	NC_015067	CGC	2	6	497689	497694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690585
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11126	NC_015067	GAT	2	6	497740	497745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690585
11127	NC_015067	TGCAA	2	10	497811	497820	40 %	20 %	20 %	20 %	322690585
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11154	NC_015067	TGGTC	2	10	499389	499398	0 %	40 %	40 %	20 %	322690586
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11247	NC_015067	CTG	2	6	503760	503765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690590
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11353	NC_015067	GCT	2	6	507832	507837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11355	NC_015067	GC	3	6	507902	507907	0 %	0 %	50 %	50 %	322690594
11356	NC_015067	CAG	2	6	507971	507976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690594
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11479	NC_015067	TTC	2	6	513825	513830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690597
11480	NC_015067	CTG	2	6	513858	513863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690597
11481	NC_015067	CCT	2	6	513904	513909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690597
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