MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015067	CGA	2	6	400957	400962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690508
9002	NC_015067	GC	3	6	400977	400982	0 %	0 %	50 %	50 %	322690508
9003	NC_015067	CAG	2	6	401051	401056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690508
9004	NC_015067	CCA	2	6	401116	401121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690508
9005	NC_015067	GGC	2	6	401177	401182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690508
9006	NC_015067	TGA	2	6	401188	401193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690508
9007	NC_015067	GCA	2	6	401251	401256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690508
9008	NC_015067	TTG	2	6	401259	401264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690508
9009	NC_015067	GCT	2	6	401266	401271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690508
9010	NC_015067	TGA	2	6	401272	401277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690508
9011	NC_015067	CGG	2	6	401305	401310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690508
9012	NC_015067	GA	3	6	401323	401328	50 %	0 %	50 %	0 %	322690508
9013	NC_015067	CGG	2	6	401379	401384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690508
9014	NC_015067	CCA	2	6	401428	401433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690508
9015	NC_015067	TCTCC	2	10	401495	401504	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9016	NC_015067	GCTC	2	8	401510	401517	0 %	25 %	25 %	50 %	322690509
9017	NC_015067	GCG	2	6	401527	401532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9018	NC_015067	GCC	2	6	401592	401597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690509
9019	NC_015067	TCG	2	6	401632	401637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690509
9020	NC_015067	CGG	2	6	401648	401653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9021	NC_015067	GGC	2	6	401739	401744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9022	NC_015067	CG	3	6	401766	401771	0 %	0 %	50 %	50 %	322690509
9023	NC_015067	TGA	2	6	401804	401809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690509
9024	NC_015067	GCG	2	6	401825	401830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9025	NC_015067	GCC	2	6	401848	401853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690509
9026	NC_015067	AGT	2	6	401900	401905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690509
9027	NC_015067	GTT	2	6	401955	401960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690509
9028	NC_015067	CGG	2	6	401999	402004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9029	NC_015067	CTC	2	6	402009	402014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690509
9030	NC_015067	GGAA	2	8	402026	402033	50 %	0 %	50 %	0 %	322690509
9031	NC_015067	CTT	2	6	402060	402065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690509
9032	NC_015067	GGA	2	6	402144	402149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690509
9033	NC_015067	TGG	2	6	402227	402232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690509
9034	NC_015067	AG	3	6	402249	402254	50 %	0 %	50 %	0 %	322690509
9035	NC_015067	CTT	2	6	402255	402260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690509
9036	NC_015067	GTCG	2	8	402288	402295	0 %	25 %	50 %	25 %	322690509
9037	NC_015067	CCA	2	6	402345	402350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690509
9038	NC_015067	GTC	2	6	402408	402413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690509
9039	NC_015067	CGGT	2	8	402506	402513	0 %	25 %	50 %	25 %	322690509
9040	NC_015067	GTC	2	6	402543	402548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690509
9041	NC_015067	GC	3	6	402580	402585	0 %	0 %	50 %	50 %	322690509
9042	NC_015067	TTC	2	6	402637	402642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690509
9043	NC_015067	ATG	2	6	402658	402663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690509
9044	NC_015067	GCGG	2	8	402741	402748	0 %	0 %	75 %	25 %	322690509
9045	NC_015067	CGC	2	6	402749	402754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690509
9046	NC_015067	GA	3	6	402785	402790	50 %	0 %	50 %	0 %	322690509
9047	NC_015067	CGC	2	6	402798	402803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690509
9048	NC_015067	TGG	3	9	402830	402838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690509
9049	NC_015067	AGT	2	6	402875	402880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690509
9050	NC_015067	ACC	2	6	402919	402924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690509
9051	NC_015067	GGC	2	6	402932	402937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9052	NC_015067	GTA	2	6	402951	402956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690509
9053	NC_015067	GC	3	6	402986	402991	0 %	0 %	50 %	50 %	322690509
9054	NC_015067	AGGA	2	8	403000	403007	50 %	0 %	50 %	0 %	322690509
9055	NC_015067	CCT	2	6	403046	403051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690509
9056	NC_015067	CGG	2	6	403217	403222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9057	NC_015067	CGG	2	6	403229	403234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690509
9058	NC_015067	CGC	2	6	403307	403312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690509
9059	NC_015067	TCC	2	6	403345	403350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690509
9060	NC_015067	CGAA	2	8	403353	403360	50 %	0 %	25 %	25 %	322690509
9061	NC_015067	TCT	2	6	403382	403387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690509
9062	NC_015067	CGA	2	6	403394	403399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690509
9063	NC_015067	TCG	2	6	403586	403591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_015067	CTTA	2	8	403632	403639	25 %	50 %	0 %	25 %	322690510
9065	NC_015067	GCC	2	6	403685	403690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690510
9066	NC_015067	CCGATG	2	12	403721	403732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322690510
9067	NC_015067	CG	4	8	403758	403765	0 %	0 %	50 %	50 %	322690510
9068	NC_015067	CTC	2	6	403816	403821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690510
9069	NC_015067	GTC	2	6	403903	403908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690510
9070	NC_015067	TCG	2	6	403937	403942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690510
9071	NC_015067	TTC	2	6	404003	404008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690510
9072	NC_015067	CGC	2	6	404013	404018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690510
9073	NC_015067	CAG	2	6	404041	404046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690510
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9075	NC_015067	GGTG	2	8	404259	404266	0 %	25 %	75 %	0 %	322690510
9076	NC_015067	GTG	2	6	404297	404302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690510
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9079	NC_015067	TTG	2	6	404364	404369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_015067	TGTGT	4	20	404393	404412	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_015067	TGCGA	2	10	404417	404426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9082	NC_015067	TTCA	2	8	404484	404491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9083	NC_015067	GCA	2	6	404627	404632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690511
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9085	NC_015067	GC	3	6	404672	404677	0 %	0 %	50 %	50 %	322690511
9086	NC_015067	TTCG	2	8	404719	404726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9087	NC_015067	GC	3	6	404785	404790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9088	NC_015067	TGA	2	6	404877	404882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690512
9089	NC_015067	ATC	2	6	404988	404993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690512
9090	NC_015067	CAG	2	6	405023	405028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690512
9091	NC_015067	GAT	2	6	405062	405067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690512
9092	NC_015067	TCG	2	6	405075	405080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690512
9093	NC_015067	CTT	2	6	405083	405088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690512
9094	NC_015067	GCC	2	6	405095	405100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690512
9095	NC_015067	GAA	2	6	405137	405142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690512
9096	NC_015067	GGC	2	6	405220	405225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690512
9097	NC_015067	AATCG	2	10	405248	405257	40 %	20 %	20 %	20 %	322690512
9098	NC_015067	CCTT	2	8	405285	405292	0 %	50 %	0 %	50 %	322690512
9099	NC_015067	GC	3	6	405363	405368	0 %	0 %	50 %	50 %	322690512
9100	NC_015067	CG	3	6	405564	405569	0 %	0 %	50 %	50 %	322690513
9101	NC_015067	CTGA	2	8	405609	405616	25 %	25 %	25 %	25 %	322690513
9102	NC_015067	GCT	2	6	405626	405631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690513
9103	NC_015067	CG	4	8	405717	405724	0 %	0 %	50 %	50 %	322690513
9104	NC_015067	GGCC	2	8	405758	405765	0 %	0 %	50 %	50 %	322690513
9105	NC_015067	CGA	2	6	405827	405832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690513
9106	NC_015067	GC	3	6	405895	405900	0 %	0 %	50 %	50 %	322690513
9107	NC_015067	GCA	2	6	405914	405919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690513
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9109	NC_015067	TCG	2	6	405952	405957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690513
9110	NC_015067	CTTCG	2	10	405996	406005	0 %	40 %	20 %	40 %	322690513
9111	NC_015067	GCC	2	6	406012	406017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690513
9112	NC_015067	GAT	2	6	406029	406034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690513
9113	NC_015067	GTG	2	6	406045	406050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690513
9114	NC_015067	GTC	3	9	406080	406088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690513
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9117	NC_015067	GCT	2	6	406180	406185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690513
9118	NC_015067	GCG	2	6	406231	406236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690513
9119	NC_015067	GGC	2	6	406237	406242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690513
9120	NC_015067	GGTG	2	8	406269	406276	0 %	25 %	75 %	0 %	322690513
9121	NC_015067	GCG	2	6	406336	406341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690513
9122	NC_015067	GGT	2	6	406379	406384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690513
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9147	NC_015067	GGT	2	6	407477	407482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9240	NC_015067	TCG	3	9	412518	412526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690522
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9243	NC_015067	TCG	2	6	412743	412748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690522
9244	NC_015067	TCTG	2	8	412774	412781	0 %	50 %	25 %	25 %	322690522
9245	NC_015067	AAT	2	6	412817	412822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690522
9246	NC_015067	GCT	3	9	412825	412833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690522
9247	NC_015067	CG	3	6	412870	412875	0 %	0 %	50 %	50 %	322690522
9248	NC_015067	GCC	2	6	412886	412891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690522
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9254	NC_015067	GTC	2	6	413270	413275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9256	NC_015067	CTT	2	6	413421	413426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9257	NC_015067	ACGA	2	8	413471	413478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9258	NC_015067	GTGGC	2	10	413505	413514	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9259	NC_015067	TCA	2	6	413571	413576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9260	NC_015067	GGC	2	6	413607	413612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9261	NC_015067	GCC	2	6	413648	413653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9262	NC_015067	TCG	2	6	413656	413661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9263	NC_015067	GC	3	6	413665	413670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9264	NC_015067	GAG	2	6	413749	413754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690523
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9275	NC_015067	CTG	2	6	414238	414243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690523
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9295	NC_015067	CAG	2	6	415157	415162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690524
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9322	NC_015067	GGAC	2	8	416314	416321	25 %	0 %	50 %	25 %	322690524
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9346	NC_015067	CCG	2	6	417754	417759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9347	NC_015067	CAT	2	6	417811	417816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690526
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9356	NC_015067	GCA	2	6	418347	418352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690526
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9358	NC_015067	CCA	2	6	418383	418388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690526
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9361	NC_015067	GAAA	2	8	418462	418469	75 %	0 %	25 %	0 %	322690526
9362	NC_015067	CGGT	2	8	418514	418521	0 %	25 %	50 %	25 %	322690526
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9488	NC_015067	GCCG	2	8	424281	424288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9489	NC_015067	CAAGC	2	10	424324	424333	40 %	0 %	20 %	40 %	322690531
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9491	NC_015067	CCA	2	6	424378	424383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690531
9492	NC_015067	CG	4	8	424486	424493	0 %	0 %	50 %	50 %	322690531
9493	NC_015067	CCG	2	6	424504	424509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690531
9494	NC_015067	TTC	2	6	424547	424552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690531
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9497	NC_015067	TGA	2	6	424617	424622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690531
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