MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015067	T	6	6	357248	357253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_015067	CCG	2	6	357334	357339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_015067	GC	3	6	357355	357360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_015067	TGG	2	6	357379	357384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_015067	ATG	2	6	357434	357439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015067	GC	3	6	357495	357500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_015067	GCT	2	6	357603	357608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_015067	TGA	2	6	357639	357644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015067	CG	4	8	357690	357697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_015067	GGGA	2	8	357743	357750	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_015067	CGG	2	6	357810	357815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_015067	TCA	2	6	357880	357885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_015067	CGG	2	6	357975	357980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_015067	GGC	2	6	358126	358131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_015067	CGG	2	6	358153	358158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_015067	TGC	2	6	358182	358187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_015067	GCAGGA	2	12	358252	358263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322690472
8018	NC_015067	CGA	2	6	358276	358281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8019	NC_015067	CGAG	2	8	358306	358313	25 %	0 %	50 %	25 %	322690472
8020	NC_015067	GTG	3	9	358332	358340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690472
8021	NC_015067	CCA	2	6	358342	358347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690472
8022	NC_015067	GAT	2	6	358358	358363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8023	NC_015067	GTA	2	6	358397	358402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8024	NC_015067	GAT	2	6	358424	358429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8025	NC_015067	GTA	2	6	358436	358441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8026	NC_015067	GCC	2	6	358463	358468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690472
8027	NC_015067	GAA	2	6	358523	358528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690472
8028	NC_015067	GAA	2	6	358535	358540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690472
8029	NC_015067	CCG	3	9	358564	358572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690472
8030	NC_015067	ATC	2	6	358575	358580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690472
8031	NC_015067	CGC	2	6	358598	358603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690472
8032	NC_015067	GGC	2	6	358606	358611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690472
8033	NC_015067	CCA	3	9	358660	358668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690472
8034	NC_015067	AGG	2	6	358702	358707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690472
8035	NC_015067	AGA	3	9	358744	358752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690472
8036	NC_015067	TTC	2	6	358782	358787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690472
8037	NC_015067	AGC	2	6	358890	358895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8038	NC_015067	CCAC	2	8	358909	358916	25 %	0 %	0 %	75 %	322690472
8039	NC_015067	TGA	3	9	358927	358935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8040	NC_015067	GC	3	6	358941	358946	0 %	0 %	50 %	50 %	322690472
8041	NC_015067	GCC	2	6	358982	358987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690472
8042	NC_015067	AGA	2	6	359005	359010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690472
8043	NC_015067	GAG	2	6	359055	359060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690472
8044	NC_015067	GAC	2	6	359153	359158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8045	NC_015067	GCA	2	6	359195	359200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
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8047	NC_015067	GAA	2	6	359231	359236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690472
8048	NC_015067	AGC	2	6	359286	359291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8049	NC_015067	CCG	2	6	359350	359355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690472
8050	NC_015067	CGG	2	6	359386	359391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690472
8051	NC_015067	CAG	2	6	359396	359401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8052	NC_015067	CGT	2	6	359422	359427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690472
8053	NC_015067	GAT	2	6	359429	359434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690472
8054	NC_015067	CTT	2	6	359438	359443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690472
8055	NC_015067	CTC	2	6	359512	359517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_015067	TAGGG	2	10	359555	359564	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015067	CGG	2	6	359582	359587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_015067	AAT	2	6	359591	359596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_015067	G	6	6	359672	359677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_015067	TCG	2	6	359719	359724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690473
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8062	NC_015067	CCG	2	6	359777	359782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690473
8063	NC_015067	CCGC	2	8	359857	359864	0 %	0 %	25 %	75 %	322690473
8064	NC_015067	GT	3	6	359872	359877	0 %	50 %	50 %	0 %	322690473
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8067	NC_015067	CG	3	6	359970	359975	0 %	0 %	50 %	50 %	322690473
8068	NC_015067	GTC	2	6	360015	360020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690473
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8070	NC_015067	GTC	2	6	360048	360053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690473
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8085	NC_015067	TCG	2	6	360722	360727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_015067	AAGG	2	8	360817	360824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_015067	CTG	2	6	360882	360887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_015067	ACT	2	6	360892	360897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_015067	CCG	2	6	360981	360986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_015067	TA	3	6	361034	361039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_015067	TG	3	6	361050	361055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_015067	CGG	2	6	361076	361081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_015067	CAT	2	6	361124	361129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690474
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8098	NC_015067	TGT	2	6	361375	361380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_015067	GAATA	2	10	361405	361414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_015067	CAC	2	6	361439	361444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690475
8101	NC_015067	TCGCT	2	10	361447	361456	0 %	40 %	20 %	40 %	322690475
8102	NC_015067	CAA	2	6	361463	361468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690475
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8110	NC_015067	TCGTA	2	10	361740	361749	20 %	40 %	20 %	20 %	322690475
8111	NC_015067	GC	3	6	361781	361786	0 %	0 %	50 %	50 %	322690475
8112	NC_015067	TGG	2	6	361798	361803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690475
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8119	NC_015067	CCG	2	6	362269	362274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690475
8120	NC_015067	ATCC	2	8	362300	362307	25 %	25 %	0 %	50 %	322690475
8121	NC_015067	TGC	2	6	362314	362319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690475
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8124	NC_015067	TTTCG	2	10	362441	362450	0 %	60 %	20 %	20 %	322690475
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8244	NC_015067	CA	3	6	368078	368083	50 %	0 %	0 %	50 %	322690479
8245	NC_015067	TGC	2	6	368182	368187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690479
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8247	NC_015067	CGT	2	6	368232	368237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690479
8248	NC_015067	TGA	2	6	368275	368280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690479
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8263	NC_015067	GCC	2	6	368689	368694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690479
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8265	NC_015067	ACGG	2	8	368766	368773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8266	NC_015067	GGT	2	6	368790	368795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8267	NC_015067	GA	4	8	368806	368813	50 %	0 %	50 %	0 %	322690480
8268	NC_015067	GGT	2	6	368889	368894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690480
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8301	NC_015067	CTA	2	6	370320	370325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690481
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8303	NC_015067	TGG	2	6	370511	370516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690482
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8334	NC_015067	CGT	2	6	371467	371472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690482
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8489	NC_015067	CG	3	6	378101	378106	0 %	0 %	50 %	50 %	322690487
8490	NC_015067	CAT	2	6	378123	378128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690487
8491	NC_015067	GCG	2	6	378176	378181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690487
8492	NC_015067	CGC	2	6	378206	378211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690487
8493	NC_015067	CGC	2	6	378215	378220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690487
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8497	NC_015067	CAGCC	2	10	378338	378347	20 %	0 %	20 %	60 %	322690487
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