MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015067	AACAGC	2	12	311140	311151	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322690431
7002	NC_015067	AGC	2	6	311158	311163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7003	NC_015067	AACG	2	8	311181	311188	50 %	0 %	25 %	25 %	322690431
7004	NC_015067	CGGC	2	8	311335	311342	0 %	0 %	50 %	50 %	322690431
7005	NC_015067	AAC	2	6	311400	311405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
7006	NC_015067	CGC	2	6	311460	311465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
7007	NC_015067	CAG	2	6	311469	311474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7008	NC_015067	CAC	2	6	311480	311485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690431
7009	NC_015067	TGG	2	6	311491	311496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
7010	NC_015067	TGATC	2	10	311498	311507	20 %	40 %	20 %	20 %	322690431
7011	NC_015067	GGA	2	6	311519	311524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690431
7012	NC_015067	CCG	2	6	311572	311577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
7013	NC_015067	CGG	2	6	311639	311644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
7014	NC_015067	AGCCA	2	10	311673	311682	40 %	0 %	20 %	40 %	322690431
7015	NC_015067	GGC	2	6	311829	311834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
7016	NC_015067	GTGATG	2	12	311854	311865	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322690431
7017	NC_015067	TCGCAA	2	12	311931	311942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322690431
7018	NC_015067	CAAGC	2	10	311970	311979	40 %	0 %	20 %	40 %	322690431
7019	NC_015067	GCC	2	6	311991	311996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
7020	NC_015067	CAG	3	9	312021	312029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7021	NC_015067	GCA	2	6	312032	312037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7022	NC_015067	CCATGT	2	12	312064	312075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690431
7023	NC_015067	CTG	2	6	312076	312081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7024	NC_015067	TGA	2	6	312088	312093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690431
7025	NC_015067	GGT	2	6	312102	312107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
7026	NC_015067	GGT	3	9	312123	312131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
7027	NC_015067	GAAC	2	8	312166	312173	50 %	0 %	25 %	25 %	322690431
7028	NC_015067	CGGCAA	2	12	312206	312217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
7029	NC_015067	CAA	2	6	312242	312247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
7030	NC_015067	GGC	2	6	312285	312290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
7031	NC_015067	CAA	2	6	312399	312404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
7032	NC_015067	A	6	6	312403	312408	100 %	0 %	0 %	0 %	322690431
7033	NC_015067	CCG	2	6	312409	312414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
7034	NC_015067	A	6	6	312503	312508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_015067	TGT	3	9	312543	312551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_015067	CTT	2	6	312573	312578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_015067	TGT	3	9	312657	312665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_015067	CTT	2	6	312687	312692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
7039	NC_015067	GGC	2	6	312697	312702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7040	NC_015067	CGG	3	9	312752	312760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7041	NC_015067	CCA	2	6	312779	312784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
7042	NC_015067	GGC	2	6	312831	312836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7043	NC_015067	AGC	2	6	312861	312866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7044	NC_015067	GCT	2	6	312932	312937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7045	NC_015067	CAG	2	6	312960	312965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7046	NC_015067	GGC	2	6	312984	312989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7047	NC_015067	GGC	2	6	313017	313022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7048	NC_015067	CGGAAC	2	12	313031	313042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7049	NC_015067	CAG	2	6	313095	313100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7050	NC_015067	CCCAGA	2	12	313120	313131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690432
7051	NC_015067	GCGG	2	8	313137	313144	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
7052	NC_015067	GTC	2	6	313224	313229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7053	NC_015067	CAC	2	6	313311	313316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
7054	NC_015067	GCG	2	6	313336	313341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7055	NC_015067	CGG	2	6	313385	313390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7056	NC_015067	TGG	2	6	313442	313447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690432
7057	NC_015067	CAG	2	6	313452	313457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7058	NC_015067	GCG	3	9	313525	313533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7059	NC_015067	CAC	2	6	313584	313589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
7060	NC_015067	TCT	2	6	313613	313618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
7061	NC_015067	GGCA	2	8	313666	313673	25 %	0 %	50 %	25 %	322690432
7062	NC_015067	GC	3	6	313688	313693	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
7063	NC_015067	GAT	2	6	313722	313727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
7064	NC_015067	ATG	2	6	313852	313857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
7065	NC_015067	CGG	2	6	313865	313870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7066	NC_015067	ACC	2	6	313875	313880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
7067	NC_015067	TCG	2	6	313900	313905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7068	NC_015067	GGTCG	2	10	313926	313935	0 %	20 %	60 %	20 %	322690432
7069	NC_015067	CGGA	2	8	313952	313959	25 %	0 %	50 %	25 %	322690432
7070	NC_015067	GAA	2	6	314028	314033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690432
7071	NC_015067	ACGC	2	8	314088	314095	25 %	0 %	25 %	50 %	322690432
7072	NC_015067	CCG	2	6	314167	314172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690432
7073	NC_015067	TTC	2	6	314173	314178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
7074	NC_015067	GGTCGG	2	12	314250	314261	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322690432
7075	NC_015067	CGA	2	6	314297	314302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7076	NC_015067	GCGG	2	8	314310	314317	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
7077	NC_015067	CGGC	2	8	314356	314363	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
7078	NC_015067	GAT	2	6	314415	314420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
7079	NC_015067	CGGG	2	8	314421	314428	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
7080	NC_015067	CCA	2	6	314448	314453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
7081	NC_015067	CGG	2	6	314516	314521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7082	NC_015067	ACCTTG	2	12	314542	314553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690432
7083	NC_015067	TCG	2	6	314599	314604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
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7086	NC_015067	CG	3	6	314723	314728	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
7087	NC_015067	CGG	2	6	314750	314755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7088	NC_015067	CTG	2	6	314790	314795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7089	NC_015067	TCT	2	6	315008	315013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
7090	NC_015067	CGG	2	6	315033	315038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7091	NC_015067	TAG	2	6	315085	315090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
7092	NC_015067	AGGC	2	8	315111	315118	25 %	0 %	50 %	25 %	322690432
7093	NC_015067	CGT	2	6	315149	315154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
7094	NC_015067	GC	3	6	315174	315179	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
7095	NC_015067	GCG	2	6	315242	315247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
7096	NC_015067	GTCC	2	8	315341	315348	0 %	25 %	25 %	50 %	322690432
7097	NC_015067	TGA	2	6	315386	315391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
7098	NC_015067	ACGA	2	8	315489	315496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7099	NC_015067	CCGT	2	8	315533	315540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_015067	GCG	2	6	315584	315589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690433
7101	NC_015067	ATC	2	6	315594	315599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690433
7102	NC_015067	TGG	2	6	315622	315627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690433
7103	NC_015067	GGC	2	6	315734	315739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690433
7104	NC_015067	CAT	2	6	315817	315822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690433
7105	NC_015067	TCA	2	6	315838	315843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690433
7106	NC_015067	CTG	2	6	315938	315943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690433
7107	NC_015067	TTC	2	6	315971	315976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690433
7108	NC_015067	ACC	2	6	315981	315986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690433
7109	NC_015067	CAG	2	6	316091	316096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690433
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7111	NC_015067	TCG	2	6	316191	316196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690433
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7113	NC_015067	GTT	2	6	316217	316222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690433
7114	NC_015067	CAG	2	6	316229	316234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690433
7115	NC_015067	CCT	2	6	316255	316260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690433
7116	NC_015067	GCC	2	6	316317	316322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690433
7117	NC_015067	GGTA	2	8	316417	316424	25 %	25 %	50 %	0 %	322690433
7118	NC_015067	GC	3	6	316430	316435	0 %	0 %	50 %	50 %	322690433
7119	NC_015067	GAC	2	6	316518	316523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690433
7120	NC_015067	GCA	2	6	316564	316569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690433
7121	NC_015067	ACC	2	6	316599	316604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690433
7122	NC_015067	GTG	2	6	316605	316610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690433
7123	NC_015067	CGAC	2	8	316624	316631	25 %	0 %	25 %	50 %	322690433
7124	NC_015067	TCG	2	6	316647	316652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690433
7125	NC_015067	TTG	2	6	316665	316670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690433
7126	NC_015067	TTG	2	6	316815	316820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690433
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7131	NC_015067	ATG	2	6	317127	317132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7241	NC_015067	CTT	2	6	322137	322142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690439
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7243	NC_015067	GTT	2	6	322401	322406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690439
7244	NC_015067	CGG	2	6	322443	322448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690439
7245	NC_015067	GCG	2	6	322477	322482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690439
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7268	NC_015067	CA	3	6	323640	323645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7269	NC_015067	ATG	2	6	323682	323687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690440
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7312	NC_015067	GAT	2	6	325696	325701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7344	NC_015067	GCA	2	6	327547	327552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7346	NC_015067	GAG	2	6	327683	327688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7347	NC_015067	A	7	7	327691	327697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7348	NC_015067	TGCC	2	8	327724	327731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7349	NC_015067	GAA	2	6	327760	327765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7350	NC_015067	AGG	2	6	327768	327773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7351	NC_015067	AGGC	2	8	327820	327827	25 %	0 %	50 %	25 %	322690442
7352	NC_015067	TGA	2	6	327845	327850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690442
7353	NC_015067	CTTC	2	8	327851	327858	0 %	50 %	0 %	50 %	322690442
7354	NC_015067	ATT	2	6	327903	327908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690442
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7357	NC_015067	GAT	2	6	328082	328087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690442
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7364	NC_015067	CTG	2	6	328299	328304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690442
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7366	NC_015067	CCTG	2	8	328402	328409	0 %	25 %	25 %	50 %	322690442
7367	NC_015067	CAA	2	6	328442	328447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690442
7368	NC_015067	GGTG	2	8	328463	328470	0 %	25 %	75 %	0 %	322690442
7369	NC_015067	GGT	2	6	328485	328490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690442
7370	NC_015067	TCG	2	6	328516	328521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690442
7371	NC_015067	CGC	2	6	328606	328611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7372	NC_015067	GACC	2	8	328640	328647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7373	NC_015067	ATC	2	6	328702	328707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690443
7374	NC_015067	CAT	2	6	328851	328856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690443
7375	NC_015067	TCG	2	6	328901	328906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690443
7376	NC_015067	ATC	2	6	328915	328920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690443
7377	NC_015067	AGG	2	6	328969	328974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7378	NC_015067	TGA	2	6	328978	328983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690444
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7381	NC_015067	TTC	2	6	329082	329087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690444
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7385	NC_015067	CGA	2	6	329174	329179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690444
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7394	NC_015067	GAT	2	6	329468	329473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690444
7395	NC_015067	CGA	2	6	329474	329479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690444
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7400	NC_015067	CCCG	2	8	329699	329706	0 %	0 %	25 %	75 %	322690445
7401	NC_015067	TGAC	2	8	329777	329784	25 %	25 %	25 %	25 %	322690445
7402	NC_015067	CCG	2	6	329793	329798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690445
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7404	NC_015067	ATG	2	6	329854	329859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690445
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7417	NC_015067	CGA	2	6	330489	330494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690446
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7486	NC_015067	CAT	2	6	334202	334207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690448
7487	NC_015067	CGA	2	6	334223	334228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690448
7488	NC_015067	ACC	2	6	334248	334253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690448
7489	NC_015067	GCCG	2	8	334340	334347	0 %	0 %	50 %	50 %	322690448
7490	NC_015067	ACG	3	9	334390	334398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690448
7491	NC_015067	CGG	2	6	334424	334429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690448
7492	NC_015067	CGA	2	6	334433	334438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690448
7493	NC_015067	A	6	6	334494	334499	100 %	0 %	0 %	0 %	322690449
7494	NC_015067	TCG	2	6	334518	334523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690449
7495	NC_015067	ACC	2	6	334530	334535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690449
7496	NC_015067	TG	3	6	334537	334542	0 %	50 %	50 %	0 %	322690449
7497	NC_015067	GGCGA	2	10	334547	334556	20 %	0 %	60 %	20 %	322690449
7498	NC_015067	GGC	2	6	334583	334588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690449
7499	NC_015067	ACG	2	6	334746	334751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690449
7500	NC_015067	CCG	2	6	334767	334772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690449

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