MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52117	NC_015067	CTGTT	2	10	2348058	2348067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52118	NC_015067	AAAAG	2	10	2348246	2348255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52119	NC_015067	AG	3	6	2348293	2348298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52120	NC_015067	GATCTT	2	12	2348410	2348421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322692088
52121	NC_015067	GTG	2	6	2348468	2348473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692088
52122	NC_015067	TGA	2	6	2348526	2348531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692088
52123	NC_015067	GTC	2	6	2348602	2348607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692088
52124	NC_015067	CGG	2	6	2348667	2348672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692088
52125	NC_015067	TTG	2	6	2348678	2348683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692088
52126	NC_015067	ACC	2	6	2348738	2348743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692088
52127	NC_015067	GGGT	2	8	2348744	2348751	0 %	25 %	75 %	0 %	322692088
52128	NC_015067	CGA	2	6	2348787	2348792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692088
52129	NC_015067	CTG	2	6	2348836	2348841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692088
52130	NC_015067	TGA	2	6	2348856	2348861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692088
52131	NC_015067	GCGAT	2	10	2348864	2348873	20 %	20 %	40 %	20 %	322692088
52132	NC_015067	GTG	2	6	2348918	2348923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692088
52133	NC_015067	AGC	2	6	2348944	2348949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692088
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52136	NC_015067	TGT	2	6	2349192	2349197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692088
52137	NC_015067	GTG	2	6	2349272	2349277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692088
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52140	NC_015067	CGA	2	6	2349372	2349377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692088
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52142	NC_015067	T	6	6	2349615	2349620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52143	NC_015067	ACT	2	6	2349656	2349661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52144	NC_015067	TG	3	6	2349735	2349740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52145	NC_015067	GCGG	2	8	2349875	2349882	0 %	0 %	75 %	25 %	322692089
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52147	NC_015067	CTG	2	6	2350011	2350016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692089
52148	NC_015067	CGG	2	6	2350120	2350125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692089
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52151	NC_015067	A	7	7	2350232	2350238	100 %	0 %	0 %	0 %	322692089
52152	NC_015067	GTC	2	6	2350304	2350309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692089
52153	NC_015067	GGC	2	6	2350310	2350315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692089
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52155	NC_015067	GA	3	6	2350446	2350451	50 %	0 %	50 %	0 %	322692089
52156	NC_015067	TGA	2	6	2350561	2350566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692089
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52169	NC_015067	CGG	2	6	2351047	2351052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52170	NC_015067	GTC	3	9	2351093	2351101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692090
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52188	NC_015067	CTC	2	6	2352127	2352132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52189	NC_015067	TTG	2	6	2352177	2352182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52192	NC_015067	CT	3	6	2352232	2352237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52193	NC_015067	AAC	2	6	2352274	2352279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52194	NC_015067	CT	3	6	2352282	2352287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52195	NC_015067	GTT	2	6	2352289	2352294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52196	NC_015067	TGCG	2	8	2352298	2352305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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52199	NC_015067	GCGGAT	2	12	2352438	2352449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322692091
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52201	NC_015067	GTG	2	6	2352511	2352516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692091
52202	NC_015067	GAA	2	6	2352528	2352533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692091
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52205	NC_015067	GGC	2	6	2352654	2352659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692091
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52217	NC_015067	TGG	2	6	2353484	2353489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692091
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52219	NC_015067	TCT	2	6	2353517	2353522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692091
52220	NC_015067	GTC	2	6	2353530	2353535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692091
52221	NC_015067	CCA	2	6	2353538	2353543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692091
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52225	NC_015067	TC	3	6	2353718	2353723	0 %	50 %	0 %	50 %	322692091
52226	NC_015067	GTG	2	6	2353755	2353760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692091
52227	NC_015067	CCGCGC	2	12	2353775	2353786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692091
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52232	NC_015067	GCCAC	2	10	2353921	2353930	20 %	0 %	20 %	60 %	322692091
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52234	NC_015067	CG	3	6	2353967	2353972	0 %	0 %	50 %	50 %	322692091
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52331	NC_015067	TTTTA	2	10	2358436	2358445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52332	NC_015067	GAG	2	6	2358458	2358463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52337	NC_015067	ACC	2	6	2358762	2358767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692097
52338	NC_015067	TGA	2	6	2358922	2358927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692097
52339	NC_015067	ACG	2	6	2358994	2358999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692097
52340	NC_015067	GAT	2	6	2359033	2359038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692097
52341	NC_015067	TCA	2	6	2359062	2359067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692097
52342	NC_015067	CG	3	6	2359079	2359084	0 %	0 %	50 %	50 %	322692097
52343	NC_015067	TGA	2	6	2359114	2359119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692097
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52347	NC_015067	AT	3	6	2359601	2359606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52348	NC_015067	CAG	2	6	2359669	2359674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52349	NC_015067	AC	3	6	2359710	2359715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52350	NC_015067	GCC	2	6	2359751	2359756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692098
52351	NC_015067	GCG	2	6	2359768	2359773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692098
52352	NC_015067	ATG	2	6	2359787	2359792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692098
52353	NC_015067	TCA	2	6	2359893	2359898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692098
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52356	NC_015067	CTG	2	6	2360071	2360076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692098
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52358	NC_015067	GGCT	2	8	2360230	2360237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52359	NC_015067	CCG	2	6	2360251	2360256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52360	NC_015067	AG	3	6	2360438	2360443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52361	NC_015067	GA	3	6	2360477	2360482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52362	NC_015067	AAT	2	6	2360488	2360493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52363	NC_015067	TGGT	2	8	2360562	2360569	0 %	50 %	50 %	0 %	322692099
52364	NC_015067	CGGCT	2	10	2360588	2360597	0 %	20 %	40 %	40 %	322692099
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52422	NC_015067	G	6	6	2362522	2362527	0 %	0 %	100 %	0 %	322692099
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52424	NC_015067	GTGG	2	8	2362583	2362590	0 %	25 %	75 %	0 %	322692099
52425	NC_015067	GGCGCC	2	12	2362609	2362620	0 %	0 %	50 %	50 %	322692099
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52428	NC_015067	CA	3	6	2362748	2362753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52429	NC_015067	CA	3	6	2362765	2362770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52430	NC_015067	CGTT	2	8	2362791	2362798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52431	NC_015067	TCC	2	6	2362847	2362852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52432	NC_015067	ATG	2	6	2362868	2362873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52433	NC_015067	GAG	2	6	2362967	2362972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692100
52434	NC_015067	GCC	2	6	2362973	2362978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692100
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52436	NC_015067	GCAG	2	8	2362996	2363003	25 %	0 %	50 %	25 %	322692100
52437	NC_015067	AGC	2	6	2363016	2363021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692100
52438	NC_015067	CAT	2	6	2363026	2363031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692100
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52443	NC_015067	CAG	3	9	2363116	2363124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692100
52444	NC_015067	AGCAA	2	10	2363130	2363139	60 %	0 %	20 %	20 %	322692100
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52448	NC_015067	AAC	2	6	2363393	2363398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692100
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52450	NC_015067	ATG	2	6	2363457	2363462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692100
52451	NC_015067	ACC	2	6	2363472	2363477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692100
52452	NC_015067	AAC	2	6	2363549	2363554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692100
52453	NC_015067	GCC	2	6	2363603	2363608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692100
52454	NC_015067	GCG	2	6	2363609	2363614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692100
52455	NC_015067	CAA	2	6	2363656	2363661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692100
52456	NC_015067	TCC	2	6	2363708	2363713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692100
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52458	NC_015067	TGG	2	6	2363778	2363783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692100
52459	NC_015067	CCAT	2	8	2363843	2363850	25 %	25 %	0 %	50 %	322692100
52460	NC_015067	CCT	2	6	2363880	2363885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692100
52461	NC_015067	TGC	2	6	2363888	2363893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52462	NC_015067	CGC	2	6	2363911	2363916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52463	NC_015067	CGGCT	2	10	2363937	2363946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52464	NC_015067	GCC	2	6	2364045	2364050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52465	NC_015067	GTC	2	6	2364064	2364069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52466	NC_015067	TCG	2	6	2364091	2364096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52467	NC_015067	A	6	6	2364102	2364107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52468	NC_015067	TAT	2	6	2364113	2364118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52469	NC_015067	TC	3	6	2364262	2364267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52470	NC_015067	C	7	7	2364271	2364277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52471	NC_015067	TTTTC	2	10	2364278	2364287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52472	NC_015067	T	7	7	2364288	2364294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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