MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_015067	CTC	2	6	2269966	2269971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692044
50502	NC_015067	CA	3	6	2269994	2269999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50503	NC_015067	CCA	2	6	2270007	2270012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50504	NC_015067	AC	3	6	2270091	2270096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50505	NC_015067	GT	3	6	2270098	2270103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50506	NC_015067	GTGC	2	8	2270114	2270121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50507	NC_015067	T	6	6	2270129	2270134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50508	NC_015067	GCG	2	6	2270135	2270140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50509	NC_015067	GCG	2	6	2270172	2270177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50510	NC_015067	TTC	2	6	2270354	2270359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692045
50511	NC_015067	CAT	2	6	2270374	2270379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
50512	NC_015067	TCAG	2	8	2270435	2270442	25 %	25 %	25 %	25 %	322692045
50513	NC_015067	CAT	2	6	2270460	2270465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
50514	NC_015067	GTG	2	6	2270483	2270488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692045
50515	NC_015067	GA	3	6	2270502	2270507	50 %	0 %	50 %	0 %	322692045
50516	NC_015067	CTT	2	6	2270512	2270517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692045
50517	NC_015067	CTT	2	6	2270563	2270568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692045
50518	NC_015067	AGT	2	6	2270601	2270606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692045
50519	NC_015067	CAT	2	6	2270665	2270670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
50520	NC_015067	GGTC	2	8	2270706	2270713	0 %	25 %	50 %	25 %	322692045
50521	NC_015067	CAT	2	6	2270772	2270777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
50522	NC_015067	TGGG	2	8	2270798	2270805	0 %	25 %	75 %	0 %	322692045
50523	NC_015067	GGT	2	6	2270809	2270814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692045
50524	NC_015067	TCT	2	6	2270841	2270846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692045
50525	NC_015067	TGG	2	6	2270874	2270879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692045
50526	NC_015067	GCT	2	6	2270883	2270888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
50527	NC_015067	GTC	2	6	2270899	2270904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
50528	NC_015067	TAG	2	6	2270915	2270920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692045
50529	NC_015067	CGG	2	6	2270976	2270981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692045
50530	NC_015067	GTC	2	6	2271028	2271033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
50531	NC_015067	TTG	2	6	2271125	2271130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692045
50532	NC_015067	ACC	2	6	2271170	2271175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692045
50533	NC_015067	TGGT	2	8	2271203	2271210	0 %	50 %	50 %	0 %	322692045
50534	NC_015067	CGG	2	6	2271243	2271248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692045
50535	NC_015067	CTT	2	6	2271253	2271258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692045
50536	NC_015067	GTA	2	6	2271451	2271456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692045
50537	NC_015067	GTC	2	6	2271472	2271477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
50538	NC_015067	GCC	2	6	2271533	2271538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692045
50539	NC_015067	TCA	2	6	2271567	2271572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
50540	NC_015067	TCG	2	6	2271591	2271596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
50541	NC_015067	CTT	2	6	2271677	2271682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50542	NC_015067	ATC	2	6	2271716	2271721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50543	NC_015067	CAA	2	6	2271738	2271743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50544	NC_015067	A	7	7	2271853	2271859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50545	NC_015067	CAC	2	6	2271912	2271917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50546	NC_015067	GCCC	2	8	2271929	2271936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50547	NC_015067	GCA	3	9	2271937	2271945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50548	NC_015067	AGT	2	6	2272031	2272036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692046
50549	NC_015067	GCA	2	6	2272052	2272057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50550	NC_015067	CG	3	6	2272060	2272065	0 %	0 %	50 %	50 %	322692046
50551	NC_015067	CCA	2	6	2272124	2272129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692046
50552	NC_015067	CAG	2	6	2272152	2272157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50553	NC_015067	GCT	2	6	2272195	2272200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50554	NC_015067	AAGGT	2	10	2272250	2272259	40 %	20 %	40 %	0 %	322692046
50555	NC_015067	AGCG	2	8	2272291	2272298	25 %	0 %	50 %	25 %	322692046
50556	NC_015067	CA	3	6	2272312	2272317	50 %	0 %	0 %	50 %	322692046
50557	NC_015067	CTCA	2	8	2272338	2272345	25 %	25 %	0 %	50 %	322692046
50558	NC_015067	CTG	2	6	2272347	2272352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50559	NC_015067	CTCGG	2	10	2272365	2272374	0 %	20 %	40 %	40 %	322692046
50560	NC_015067	AC	3	6	2272403	2272408	50 %	0 %	0 %	50 %	322692046
50561	NC_015067	AC	3	6	2272469	2272474	50 %	0 %	0 %	50 %	322692046
50562	NC_015067	CTGC	2	8	2272529	2272536	0 %	25 %	25 %	50 %	322692046
50563	NC_015067	TGC	2	6	2272579	2272584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50564	NC_015067	GCA	2	6	2272616	2272621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692046
50565	NC_015067	GCC	2	6	2272638	2272643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692046
50566	NC_015067	CCA	2	6	2272724	2272729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50567	NC_015067	GAT	2	6	2272753	2272758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50568	NC_015067	CGA	2	6	2272788	2272793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692047
50569	NC_015067	CGA	2	6	2272851	2272856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692047
50570	NC_015067	TCA	2	6	2272916	2272921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692047
50571	NC_015067	GAT	2	6	2272971	2272976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692047
50572	NC_015067	GGC	2	6	2273019	2273024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692047
50573	NC_015067	CGC	2	6	2273030	2273035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692047
50574	NC_015067	CGC	2	6	2273061	2273066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692047
50575	NC_015067	TCG	2	6	2273126	2273131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692047
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50577	NC_015067	GAT	2	6	2273172	2273177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50578	NC_015067	CTGA	2	8	2273190	2273197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50579	NC_015067	CA	3	6	2273271	2273276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50580	NC_015067	CAA	2	6	2273356	2273361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692048
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50582	NC_015067	CGA	3	9	2273414	2273422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
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50584	NC_015067	CCA	2	6	2273512	2273517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692048
50585	NC_015067	CGA	2	6	2273588	2273593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
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50587	NC_015067	CGA	2	6	2273642	2273647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
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50589	NC_015067	CCG	2	6	2273722	2273727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692048
50590	NC_015067	CT	3	6	2273762	2273767	0 %	50 %	0 %	50 %	322692048
50591	NC_015067	CAA	2	6	2273771	2273776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692048
50592	NC_015067	TTC	2	6	2273898	2273903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692048
50593	NC_015067	CGA	2	6	2273957	2273962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
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50599	NC_015067	CCG	2	6	2274238	2274243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50600	NC_015067	CAA	2	6	2274256	2274261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50601	NC_015067	CAAC	2	8	2274291	2274298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50602	NC_015067	CAG	2	6	2274328	2274333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50603	NC_015067	GTG	2	6	2274345	2274350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50604	NC_015067	CCGTTG	2	12	2274458	2274469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50605	NC_015067	TGC	2	6	2274491	2274496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
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50609	NC_015067	CGG	2	6	2274717	2274722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
50610	NC_015067	TGC	2	6	2274740	2274745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
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50616	NC_015067	GAT	2	6	2274994	2274999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692049
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50723	NC_015067	CG	4	8	2280541	2280548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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50732	NC_015067	GCA	2	6	2280874	2280879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
50733	NC_015067	GGCCCG	2	12	2280899	2280910	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
50734	NC_015067	TGG	2	6	2280943	2280948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692052
50735	NC_015067	TCC	2	6	2281055	2281060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692052
50736	NC_015067	CGTGAT	2	12	2281061	2281072	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322692052
50737	NC_015067	GCCG	2	8	2281089	2281096	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
50738	NC_015067	GCG	2	6	2281232	2281237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
50739	NC_015067	GCC	2	6	2281250	2281255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692052
50740	NC_015067	GC	3	6	2281259	2281264	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
50741	NC_015067	CTG	2	6	2281293	2281298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
50742	NC_015067	CGA	2	6	2281370	2281375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
50743	NC_015067	TGCCGT	2	12	2281393	2281404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
50744	NC_015067	CGCC	2	8	2281555	2281562	0 %	0 %	25 %	75 %	322692052
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50746	NC_015067	GGA	2	6	2281616	2281621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692052
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50749	NC_015067	CG	3	6	2281707	2281712	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
50750	NC_015067	GGC	2	6	2281778	2281783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
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50752	NC_015067	CGG	2	6	2281907	2281912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
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50757	NC_015067	CGC	2	6	2282018	2282023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50758	NC_015067	CG	3	6	2282027	2282032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50759	NC_015067	CCTGAC	2	12	2282077	2282088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322692053
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50762	NC_015067	CGCCTG	2	12	2282192	2282203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322692053
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50764	NC_015067	CCG	2	6	2282271	2282276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692053
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50804	NC_015067	G	9	9	2283899	2283907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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50812	NC_015067	GT	3	6	2284106	2284111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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50825	NC_015067	ACC	2	6	2285467	2285472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50831	NC_015067	CGGC	2	8	2285930	2285937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50832	NC_015067	CTA	2	6	2285966	2285971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50834	NC_015067	GGC	2	6	2286061	2286066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50836	NC_015067	GGT	2	6	2286321	2286326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50838	NC_015067	CCT	2	6	2286416	2286421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50839	NC_015067	GAC	2	6	2286477	2286482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50840	NC_015067	CGA	3	9	2286503	2286511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50841	NC_015067	CCG	2	6	2286522	2286527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50842	NC_015067	GA	3	6	2286659	2286664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50843	NC_015067	C	6	6	2286715	2286720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50844	NC_015067	TCC	2	6	2286745	2286750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50845	NC_015067	ATC	2	6	2286789	2286794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50846	NC_015067	CTCCC	2	10	2286978	2286987	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
50847	NC_015067	GCCG	2	8	2287208	2287215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50848	NC_015067	CG	3	6	2287253	2287258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50849	NC_015067	CAT	2	6	2287295	2287300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50850	NC_015067	TCGC	2	8	2287307	2287314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50851	NC_015067	ACT	2	6	2287316	2287321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50852	NC_015067	C	6	6	2287372	2287377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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50854	NC_015067	GGC	2	6	2287451	2287456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50982	NC_015067	GAC	3	9	2294631	2294639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50983	NC_015067	CAC	2	6	2294644	2294649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50984	NC_015067	TTC	2	6	2294718	2294723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50985	NC_015067	CCG	2	6	2294751	2294756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50986	NC_015067	CTC	2	6	2294935	2294940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50987	NC_015067	TTC	2	6	2294982	2294987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50988	NC_015067	GCCC	2	8	2295047	2295054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50989	NC_015067	CGA	2	6	2295103	2295108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50990	NC_015067	AAT	2	6	2295133	2295138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50991	NC_015067	GCT	2	6	2295173	2295178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50992	NC_015067	ACTC	2	8	2295214	2295221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50993	NC_015067	CTG	2	6	2295321	2295326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50994	NC_015067	CCG	2	6	2295420	2295425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50995	NC_015067	CCCAT	2	10	2295446	2295455	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50996	NC_015067	AGA	2	6	2295473	2295478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50997	NC_015067	ACC	2	6	2295508	2295513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50998	NC_015067	GGTC	2	8	2295546	2295553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50999	NC_015067	CAC	2	6	2295581	2295586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51000	NC_015067	CAAG	2	8	2295587	2295594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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