MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
2	NC_015067	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690194
3	NC_015067	TG	4	8	155	162	0 %	50 %	50 %	0 %	322690194
4	NC_015067	ACA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690194
5	NC_015067	CGGT	2	8	428	435	0 %	25 %	50 %	25 %	322690194
6	NC_015067	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
7	NC_015067	TGGCCG	2	12	539	550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690194
8	NC_015067	ACGTC	2	10	674	683	20 %	20 %	20 %	40 %	322690194
9	NC_015067	ACGA	2	8	694	701	50 %	0 %	25 %	25 %	322690194
10	NC_015067	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690194
11	NC_015067	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
12	NC_015067	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
13	NC_015067	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
14	NC_015067	GC	3	6	1103	1108	0 %	0 %	50 %	50 %	322690194
15	NC_015067	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
16	NC_015067	CAC	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
17	NC_015067	CAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690194
18	NC_015067	CAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
19	NC_015067	ATGC	2	8	1399	1406	25 %	25 %	25 %	25 %	322690194
20	NC_015067	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
21	NC_015067	AAGCA	2	10	1483	1492	60 %	0 %	20 %	20 %	322690194
22	NC_015067	GA	3	6	1516	1521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015067	GACT	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015067	TGG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015067	GAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015067	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015067	GA	3	6	1713	1718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015067	GCGA	2	8	1751	1758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015067	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015067	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015067	A	6	6	1848	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015067	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015067	TGT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015067	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015067	TTA	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015067	TTAC	2	8	2115	2122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015067	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015067	CGTA	2	8	2171	2178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015067	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015067	CA	3	6	2234	2239	50 %	0 %	0 %	50 %	322690195
41	NC_015067	CCA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
42	NC_015067	GCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
43	NC_015067	GCGT	2	8	2653	2660	0 %	25 %	50 %	25 %	322690195
44	NC_015067	GAA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690195
45	NC_015067	GTC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
46	NC_015067	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
47	NC_015067	GCT	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
48	NC_015067	GCCG	2	8	2923	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	322690195
49	NC_015067	CGG	2	6	2966	2971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690195
50	NC_015067	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
51	NC_015067	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
52	NC_015067	CCG	2	6	3116	3121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
53	NC_015067	CGA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
54	NC_015067	ATGG	2	8	3166	3173	25 %	25 %	50 %	0 %	322690195
55	NC_015067	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
56	NC_015067	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690195
57	NC_015067	CCG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
58	NC_015067	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
59	NC_015067	CAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
60	NC_015067	CGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
61	NC_015067	AAC	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
62	NC_015067	TGG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
63	NC_015067	CCA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690196
64	NC_015067	CG	3	6	3601	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	322690196
65	NC_015067	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
66	NC_015067	GTG	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
67	NC_015067	GTC	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690196
68	NC_015067	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690196
69	NC_015067	CGC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690196
70	NC_015067	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
71	NC_015067	TTG	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690196
72	NC_015067	CAA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690196
73	NC_015067	GATG	2	8	3924	3931	25 %	25 %	50 %	0 %	322690196
74	NC_015067	GC	3	6	3999	4004	0 %	0 %	50 %	50 %	322690196
75	NC_015067	CGA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
76	NC_015067	CGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
77	NC_015067	TCCGCA	2	12	4125	4136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690196
78	NC_015067	CCCG	2	8	4240	4247	0 %	0 %	25 %	75 %	322690196
79	NC_015067	GAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
80	NC_015067	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
81	NC_015067	CATCG	2	10	4477	4486	20 %	20 %	20 %	40 %	322690196
82	NC_015067	TGGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	75 %	0 %	322690196
83	NC_015067	A	6	6	4583	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	322690196
84	NC_015067	CGCC	2	8	4640	4647	0 %	0 %	25 %	75 %	322690197
85	NC_015067	GCCG	2	8	4673	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	322690197
86	NC_015067	CGC	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690197
87	NC_015067	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690197
88	NC_015067	CCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690197
89	NC_015067	GTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690197
90	NC_015067	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	322690197
91	NC_015067	ACCT	2	8	4974	4981	25 %	25 %	0 %	50 %	322690197
92	NC_015067	CCGGC	2	10	5050	5059	0 %	0 %	40 %	60 %	322690197
93	NC_015067	AC	3	6	5068	5073	50 %	0 %	0 %	50 %	322690197
94	NC_015067	CGG	3	9	5085	5093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690197
95	NC_015067	CAAA	2	8	5106	5113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015067	TCG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015067	AGA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015067	GGAA	2	8	5264	5271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015067	AGC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
100	NC_015067	GGC	2	6	5312	5317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
101	NC_015067	CAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
102	NC_015067	CG	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	322690198
103	NC_015067	CAC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
104	NC_015067	TCG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690198
105	NC_015067	CGA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
106	NC_015067	GCCA	2	8	5535	5542	25 %	0 %	25 %	50 %	322690198
107	NC_015067	GTG	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690198
108	NC_015067	TGA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
109	NC_015067	CGG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
110	NC_015067	CGG	4	12	5681	5692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
111	NC_015067	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
112	NC_015067	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
113	NC_015067	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
114	NC_015067	CGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
115	NC_015067	CGA	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
116	NC_015067	CGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
117	NC_015067	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
118	NC_015067	CCG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
119	NC_015067	CCA	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
120	NC_015067	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
121	NC_015067	GAG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690198
122	NC_015067	CCGCG	2	10	6299	6308	0 %	0 %	40 %	60 %	322690198
123	NC_015067	CG	3	6	6332	6337	0 %	0 %	50 %	50 %	322690198
124	NC_015067	CAAGGA	2	12	6353	6364	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322690198
125	NC_015067	CGA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
126	NC_015067	CGTG	2	8	6386	6393	0 %	25 %	50 %	25 %	322690198
127	NC_015067	CCG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
128	NC_015067	AGACCA	2	12	6448	6459	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322690198
129	NC_015067	TGA	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
130	NC_015067	CAT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
131	NC_015067	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
132	NC_015067	AAG	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690198
133	NC_015067	CGC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
134	NC_015067	CCG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
135	NC_015067	AAC	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
136	NC_015067	GGC	2	6	6729	6734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
137	NC_015067	GC	3	6	6806	6811	0 %	0 %	50 %	50 %	322690198
138	NC_015067	ATG	2	6	6825	6830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
139	NC_015067	CGG	3	9	6866	6874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
140	NC_015067	TCA	3	9	6919	6927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
141	NC_015067	GCCGAT	2	12	6930	6941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322690198
142	NC_015067	TTC	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690198
143	NC_015067	GAT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
144	NC_015067	CCG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
145	NC_015067	TACGTG	2	12	7017	7028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690198
146	NC_015067	GCC	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
147	NC_015067	AAGGC	2	10	7117	7126	40 %	0 %	40 %	20 %	322690198
148	NC_015067	ACC	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
149	NC_015067	CGC	3	9	7259	7267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
150	NC_015067	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
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152	NC_015067	TCC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_015067	CCTC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_015067	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015067	ACA	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
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158	NC_015067	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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160	NC_015067	GC	3	6	7623	7628	0 %	0 %	50 %	50 %	322690199
161	NC_015067	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
162	NC_015067	ACG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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188	NC_015067	GACACC	2	12	8743	8754	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690199
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247	NC_015067	TG	3	6	10817	10822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_015067	GAC	2	6	10915	10920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_015067	CGT	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_015067	CGT	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_015067	GCC	2	6	11067	11072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_015067	CA	3	6	11086	11091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
254	NC_015067	GTG	2	6	11092	11097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015067	G	7	7	11132	11138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015067	T	6	6	11212	11217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015067	TTG	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015067	T	7	7	11246	11252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015067	CAG	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_015067	GTT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015067	AG	3	6	11393	11398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015067	ATT	2	6	11418	11423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690201
263	NC_015067	TGC	2	6	11426	11431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690201
264	NC_015067	CAC	2	6	11516	11521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690201
265	NC_015067	CAG	2	6	11522	11527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690201
266	NC_015067	AAC	2	6	11577	11582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690201
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269	NC_015067	CAT	2	6	11711	11716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690201
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281	NC_015067	CAC	2	6	12229	12234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690202
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391	NC_015067	GCA	2	6	17350	17355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690205
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393	NC_015067	TTGA	2	8	17455	17462	25 %	50 %	25 %	0 %	322690205
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455	NC_015067	A	7	7	20382	20388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015067	GGA	2	6	20427	20432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_015067	CGG	2	6	22121	22126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690210
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