MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014722	GCT	2	6	674432	674437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795452
15502	NC_014722	CGC	2	6	674449	674454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795452
15503	NC_014722	GCA	2	6	674488	674493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795452
15504	NC_014722	CGCGC	2	10	674520	674529	0 %	0 %	40 %	60 %	312795452
15505	NC_014722	GGC	2	6	674597	674602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795452
15506	NC_014722	GGT	2	6	674630	674635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795452
15507	NC_014722	CG	3	6	674661	674666	0 %	0 %	50 %	50 %	312795452
15508	NC_014722	TGG	2	6	674668	674673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795452
15509	NC_014722	GCC	2	6	674682	674687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795452
15510	NC_014722	GCG	2	6	674701	674706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795452
15511	NC_014722	GCA	3	9	674729	674737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795452
15512	NC_014722	CGC	2	6	674750	674755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795452
15513	NC_014722	TCG	2	6	674791	674796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795452
15514	NC_014722	GC	4	8	674807	674814	0 %	0 %	50 %	50 %	312795452
15515	NC_014722	GCG	2	6	674820	674825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795452
15516	NC_014722	CGG	2	6	674843	674848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795452
15517	NC_014722	CTA	2	6	674928	674933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795452
15518	NC_014722	GTGC	2	8	674970	674977	0 %	25 %	50 %	25 %	312795452
15519	NC_014722	CG	3	6	675020	675025	0 %	0 %	50 %	50 %	312795452
15520	NC_014722	GC	3	6	675034	675039	0 %	0 %	50 %	50 %	312795452
15521	NC_014722	GCG	2	6	675066	675071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795452
15522	NC_014722	TAT	2	6	675103	675108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795452
15523	NC_014722	ACCTCG	2	12	675114	675125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312795452
15524	NC_014722	CG	4	8	675135	675142	0 %	0 %	50 %	50 %	312795452
15525	NC_014722	GCCT	2	8	675156	675163	0 %	25 %	25 %	50 %	312795453
15526	NC_014722	CTG	3	9	675191	675199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15527	NC_014722	ACG	2	6	675221	675226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15528	NC_014722	AAC	2	6	675279	675284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795453
15529	NC_014722	GCA	2	6	675298	675303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15530	NC_014722	CGC	2	6	675307	675312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795453
15531	NC_014722	GCGG	2	8	675361	675368	0 %	0 %	75 %	25 %	312795453
15532	NC_014722	GTT	2	6	675370	675375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795453
15533	NC_014722	GCG	2	6	675432	675437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
15534	NC_014722	CCG	2	6	675548	675553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795453
15535	NC_014722	CG	3	6	675578	675583	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15536	NC_014722	GCT	2	6	675634	675639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15537	NC_014722	TGG	2	6	675654	675659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795453
15538	NC_014722	GGC	2	6	675668	675673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
15539	NC_014722	GGT	2	6	675679	675684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795453
15540	NC_014722	CGTGCA	2	12	675754	675765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15541	NC_014722	GGC	2	6	675777	675782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
15542	NC_014722	GCCG	2	8	675793	675800	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15543	NC_014722	GC	3	6	675807	675812	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15544	NC_014722	GCCGG	2	10	675823	675832	0 %	0 %	60 %	40 %	312795453
15545	NC_014722	TCG	3	9	675834	675842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15546	NC_014722	TCG	2	6	675854	675859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15547	NC_014722	CGGC	2	8	675876	675883	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15548	NC_014722	GC	3	6	675882	675887	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15549	NC_014722	CGGG	2	8	675919	675926	0 %	0 %	75 %	25 %	312795453
15550	NC_014722	TGA	2	6	675984	675989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795453
15551	NC_014722	CGA	2	6	675994	675999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795453
15552	NC_014722	GAT	2	6	676028	676033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795453
15553	NC_014722	CGC	2	6	676099	676104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795453
15554	NC_014722	GTT	2	6	676105	676110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795453
15555	NC_014722	CGC	2	6	676174	676179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795453
15556	NC_014722	ACT	2	6	676230	676235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795453
15557	NC_014722	GCC	2	6	676246	676251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795453
15558	NC_014722	ATG	2	6	676287	676292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795453
15559	NC_014722	ATT	2	6	676386	676391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795453
15560	NC_014722	CGG	2	6	676432	676437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
15561	NC_014722	CCGG	2	8	676438	676445	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
15562	NC_014722	CGGT	2	8	676458	676465	0 %	25 %	50 %	25 %	312795453
15563	NC_014722	CGTTT	2	10	676466	676475	0 %	60 %	20 %	20 %	312795453
15564	NC_014722	TCA	2	6	676540	676545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_014722	TGG	2	6	676591	676596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
15566	NC_014722	TTG	2	6	676617	676622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795454
15567	NC_014722	GCG	2	6	676627	676632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
15568	NC_014722	GGC	2	6	676646	676651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
15569	NC_014722	GGC	2	6	676655	676660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
15570	NC_014722	GAC	2	6	676683	676688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795454
15571	NC_014722	CGC	2	6	676691	676696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795454
15572	NC_014722	TGG	2	6	676699	676704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
15573	NC_014722	AGG	2	6	676786	676791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795454
15574	NC_014722	GCGCG	2	10	676835	676844	0 %	0 %	60 %	40 %	312795454
15575	NC_014722	TGG	2	6	676846	676851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
15576	NC_014722	GC	3	6	676859	676864	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
15577	NC_014722	GCC	2	6	676874	676879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795454
15578	NC_014722	CG	3	6	676968	676973	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
15579	NC_014722	CG	4	8	677054	677061	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
15580	NC_014722	GC	3	6	677077	677082	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
15581	NC_014722	GCG	2	6	677094	677099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
15582	NC_014722	GC	3	6	677103	677108	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
15583	NC_014722	CGG	2	6	677275	677280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
15584	NC_014722	CATTT	2	10	677419	677428	20 %	60 %	0 %	20 %	312795455
15585	NC_014722	GC	3	6	677511	677516	0 %	0 %	50 %	50 %	312795455
15586	NC_014722	GTC	2	6	677566	677571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15587	NC_014722	GGCG	2	8	677646	677653	0 %	0 %	75 %	25 %	312795455
15588	NC_014722	CG	3	6	677711	677716	0 %	0 %	50 %	50 %	312795455
15589	NC_014722	ACA	2	6	677765	677770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795455
15590	NC_014722	GGC	2	6	677809	677814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795455
15591	NC_014722	ACG	2	6	677887	677892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15592	NC_014722	CAA	2	6	677946	677951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795455
15593	NC_014722	CGT	2	6	677952	677957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15594	NC_014722	CGCGC	2	10	677963	677972	0 %	0 %	40 %	60 %	312795455
15595	NC_014722	GC	3	6	678000	678005	0 %	0 %	50 %	50 %	312795455
15596	NC_014722	GCT	2	6	678009	678014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15597	NC_014722	GAAG	2	8	678024	678031	50 %	0 %	50 %	0 %	312795455
15598	NC_014722	CGT	2	6	678048	678053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15599	NC_014722	GAA	2	6	678054	678059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
15600	NC_014722	CGTT	2	8	678077	678084	0 %	50 %	25 %	25 %	312795455
15601	NC_014722	CGG	2	6	678090	678095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795455
15602	NC_014722	TGC	2	6	678107	678112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15603	NC_014722	CGT	2	6	678133	678138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15604	NC_014722	CTGT	2	8	678160	678167	0 %	50 %	25 %	25 %	312795455
15605	NC_014722	AAG	2	6	678173	678178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
15606	NC_014722	GAA	2	6	678210	678215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
15607	NC_014722	GT	3	6	678218	678223	0 %	50 %	50 %	0 %	312795455
15608	NC_014722	AGC	2	6	678236	678241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15609	NC_014722	CGA	2	6	678246	678251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15610	NC_014722	TCG	2	6	678335	678340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15611	NC_014722	AGTCG	2	10	678342	678351	20 %	20 %	40 %	20 %	312795455
15612	NC_014722	TGGAC	2	10	678383	678392	20 %	20 %	40 %	20 %	312795455
15613	NC_014722	CAA	2	6	678393	678398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795455
15614	NC_014722	GGT	2	6	678417	678422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795455
15615	NC_014722	CGA	2	6	678462	678467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15616	NC_014722	CCG	3	9	678471	678479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795455
15617	NC_014722	AAG	2	6	678541	678546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
15618	NC_014722	CGGG	2	8	678608	678615	0 %	0 %	75 %	25 %	312795455
15619	NC_014722	AAG	2	6	678685	678690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
15620	NC_014722	CGA	2	6	678693	678698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15621	NC_014722	AGC	2	6	678758	678763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15622	NC_014722	TCG	2	6	678815	678820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
15623	NC_014722	ACGC	2	8	678926	678933	25 %	0 %	25 %	50 %	312795455
15624	NC_014722	GAAG	2	8	678942	678949	50 %	0 %	50 %	0 %	312795455
15625	NC_014722	TCA	2	6	678971	678976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795455
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15627	NC_014722	AGC	2	6	679034	679039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
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15634	NC_014722	TTA	2	6	679551	679556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15635	NC_014722	CGG	2	6	679571	679576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15636	NC_014722	GGC	2	6	679581	679586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15638	NC_014722	CGGCC	2	10	679699	679708	0 %	0 %	40 %	60 %	312795457
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15640	NC_014722	GCTT	2	8	679939	679946	0 %	50 %	25 %	25 %	312795457
15641	NC_014722	CGG	2	6	679969	679974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795457
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15644	NC_014722	GCC	2	6	680054	680059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795457
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15649	NC_014722	GGGCT	2	10	680160	680169	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15650	NC_014722	TGT	2	6	680200	680205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795458
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15652	NC_014722	GAC	2	6	680318	680323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795458
15653	NC_014722	ATTT	2	8	680347	680354	25 %	75 %	0 %	0 %	312795458
15654	NC_014722	CGGCG	2	10	680358	680367	0 %	0 %	60 %	40 %	312795458
15655	NC_014722	CG	3	6	680376	680381	0 %	0 %	50 %	50 %	312795458
15656	NC_014722	TCA	2	6	680390	680395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795458
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15658	NC_014722	GCCA	2	8	680420	680427	25 %	0 %	25 %	50 %	312795458
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15730	NC_014722	GC	3	6	683512	683517	0 %	0 %	50 %	50 %	312795460
15731	NC_014722	TGC	2	6	683538	683543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795460
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15734	NC_014722	ATG	2	6	683622	683627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795460
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15738	NC_014722	CGA	3	9	683764	683772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795460
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15853	NC_014722	CAG	2	6	688715	688720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15854	NC_014722	GC	3	6	688735	688740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15855	NC_014722	TAC	2	6	688759	688764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15856	NC_014722	A	6	6	688875	688880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15857	NC_014722	GCG	3	9	688890	688898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15858	NC_014722	GTC	2	6	688917	688922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795466
15859	NC_014722	T	6	6	688928	688933	0 %	100 %	0 %	0 %	312795466
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15981	NC_014722	CCG	2	6	694530	694535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795471
15982	NC_014722	ACA	2	6	694594	694599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795471
15983	NC_014722	TG	3	6	694665	694670	0 %	50 %	50 %	0 %	312795471
15984	NC_014722	GCC	2	6	694688	694693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795471
15985	NC_014722	GC	4	8	694723	694730	0 %	0 %	50 %	50 %	312795471
15986	NC_014722	GCAG	2	8	694738	694745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15987	NC_014722	GCA	2	6	694816	694821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15988	NC_014722	TGC	2	6	694849	694854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15989	NC_014722	TGC	2	6	694881	694886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15990	NC_014722	CGC	2	6	695068	695073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795472
15991	NC_014722	GTA	2	6	695149	695154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795472
15992	NC_014722	CCTAT	2	10	695161	695170	20 %	40 %	0 %	40 %	312795472
15993	NC_014722	TATTGT	2	12	695186	695197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312795472
15994	NC_014722	A	6	6	695216	695221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15995	NC_014722	CTA	2	6	695400	695405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795473
15996	NC_014722	TCG	2	6	695450	695455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795473
15997	NC_014722	GC	3	6	695575	695580	0 %	0 %	50 %	50 %	312795473
15998	NC_014722	GGA	2	6	695670	695675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795473
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16000	NC_014722	CTG	2	6	695760	695765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795473

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