MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014722	CGG	2	6	608873	608878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14002	NC_014722	CT	3	6	608889	608894	0 %	50 %	0 %	50 %	312795383
14003	NC_014722	GCTG	2	8	608978	608985	0 %	25 %	50 %	25 %	312795383
14004	NC_014722	CCTGTT	2	12	609003	609014	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312795383
14005	NC_014722	CTG	2	6	609124	609129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14006	NC_014722	TGG	2	6	609154	609159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795383
14007	NC_014722	TGC	2	6	609164	609169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14008	NC_014722	ACG	2	6	609212	609217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14009	NC_014722	CG	3	6	609239	609244	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14010	NC_014722	GGC	2	6	609247	609252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14011	NC_014722	GCTCGT	2	12	609279	609290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14012	NC_014722	CGG	2	6	609354	609359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14013	NC_014722	CAT	2	6	609360	609365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795383
14014	NC_014722	GCA	2	6	609390	609395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14015	NC_014722	CGG	2	6	609411	609416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14016	NC_014722	TGC	2	6	609428	609433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14017	NC_014722	GGCGA	2	10	609499	609508	20 %	0 %	60 %	20 %	312795383
14018	NC_014722	GCG	2	6	609537	609542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14019	NC_014722	CGA	2	6	609543	609548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14020	NC_014722	GCG	2	6	609577	609582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14021	NC_014722	GAG	2	6	609625	609630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795383
14022	NC_014722	GCCG	2	8	609651	609658	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14023	NC_014722	GAAAAG	2	12	609688	609699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795383
14024	NC_014722	GCC	2	6	609741	609746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795383
14025	NC_014722	AAG	2	6	609829	609834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795383
14026	NC_014722	GTG	2	6	609862	609867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795383
14027	NC_014722	GCC	2	6	609868	609873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795383
14028	NC_014722	CG	3	6	609960	609965	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14029	NC_014722	GCC	2	6	610046	610051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795383
14030	NC_014722	GCT	2	6	610107	610112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14031	NC_014722	GT	3	6	610150	610155	0 %	50 %	50 %	0 %	312795383
14032	NC_014722	CTG	2	6	610180	610185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14033	NC_014722	TGGC	2	8	610187	610194	0 %	25 %	50 %	25 %	312795383
14034	NC_014722	GTCG	2	8	610212	610219	0 %	25 %	50 %	25 %	312795383
14035	NC_014722	GAT	2	6	610230	610235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795383
14036	NC_014722	GCT	2	6	610242	610247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14037	NC_014722	TCA	2	6	610277	610282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795383
14038	NC_014722	CTG	2	6	610333	610338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14039	NC_014722	GTC	2	6	610345	610350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14040	NC_014722	GGCC	2	8	610365	610372	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14041	NC_014722	GCG	2	6	610404	610409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
14042	NC_014722	TGA	2	6	610418	610423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795383
14043	NC_014722	ACA	2	6	610454	610459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795383
14044	NC_014722	CGA	2	6	610467	610472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
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14046	NC_014722	CGA	2	6	610485	610490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
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14049	NC_014722	TGA	2	6	610586	610591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795383
14050	NC_014722	GTC	2	6	610594	610599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14051	NC_014722	GGA	2	6	610611	610616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795383
14052	NC_014722	CG	3	6	610623	610628	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14053	NC_014722	GCGG	2	8	610644	610651	0 %	0 %	75 %	25 %	312795383
14054	NC_014722	GCT	2	6	610800	610805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14055	NC_014722	TGT	2	6	610820	610825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795383
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14057	NC_014722	CGA	2	6	610878	610883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14058	NC_014722	GTC	2	6	610897	610902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14059	NC_014722	TGGC	2	8	610961	610968	0 %	25 %	50 %	25 %	312795383
14060	NC_014722	GGC	2	6	610984	610989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795383
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14062	NC_014722	CCGCG	2	10	611112	611121	0 %	0 %	40 %	60 %	312795383
14063	NC_014722	GCT	2	6	611124	611129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795383
14064	NC_014722	GC	3	6	611200	611205	0 %	0 %	50 %	50 %	312795383
14065	NC_014722	GAC	2	6	611212	611217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795383
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14067	NC_014722	TGA	2	6	611323	611328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795384
14068	NC_014722	ATTG	2	8	611372	611379	25 %	50 %	25 %	0 %	312795384
14069	NC_014722	GCC	2	6	611385	611390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795384
14070	NC_014722	CGG	2	6	611492	611497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795384
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14078	NC_014722	CG	3	6	612025	612030	0 %	0 %	50 %	50 %	312795384
14079	NC_014722	GGC	2	6	612056	612061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795385
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14085	NC_014722	GAC	2	6	612279	612284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795386
14086	NC_014722	GC	3	6	612289	612294	0 %	0 %	50 %	50 %	312795386
14087	NC_014722	GCC	2	6	612301	612306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795386
14088	NC_014722	CG	4	8	612394	612401	0 %	0 %	50 %	50 %	312795386
14089	NC_014722	GGC	2	6	612404	612409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795386
14090	NC_014722	CGA	2	6	612426	612431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795386
14091	NC_014722	CAA	2	6	612444	612449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795386
14092	NC_014722	CAG	2	6	612454	612459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795386
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14097	NC_014722	GCGT	2	8	612615	612622	0 %	25 %	50 %	25 %	312795386
14098	NC_014722	GCG	2	6	612635	612640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795386
14099	NC_014722	GC	4	8	612659	612666	0 %	0 %	50 %	50 %	312795386
14100	NC_014722	GACG	2	8	612694	612701	25 %	0 %	50 %	25 %	312795386
14101	NC_014722	CAA	2	6	612711	612716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795386
14102	NC_014722	TCG	2	6	612725	612730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795386
14103	NC_014722	CGC	2	6	612735	612740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795386
14104	NC_014722	TCGA	2	8	612760	612767	25 %	25 %	25 %	25 %	312795386
14105	NC_014722	CGGCG	2	10	612780	612789	0 %	0 %	60 %	40 %	312795386
14106	NC_014722	GCG	2	6	612821	612826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795386
14107	NC_014722	GC	3	6	612943	612948	0 %	0 %	50 %	50 %	312795386
14108	NC_014722	GGA	2	6	612969	612974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795386
14109	NC_014722	CGCGC	2	10	612994	613003	0 %	0 %	40 %	60 %	312795386
14110	NC_014722	GCG	2	6	613132	613137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795386
14111	NC_014722	CGGTGC	2	12	613169	613180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312795386
14112	NC_014722	TGA	2	6	613205	613210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795386
14113	NC_014722	CG	3	6	613328	613333	0 %	0 %	50 %	50 %	312795386
14114	NC_014722	AGA	2	6	613343	613348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795386
14115	NC_014722	GCG	2	6	613454	613459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795386
14116	NC_014722	GCA	2	6	613470	613475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_014722	GGTAA	2	10	613549	613558	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_014722	GCT	2	6	613609	613614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_014722	CGC	2	6	613675	613680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795387
14120	NC_014722	CGC	2	6	613742	613747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795387
14121	NC_014722	CGA	2	6	613831	613836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795387
14122	NC_014722	GGA	2	6	613861	613866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795387
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14225	NC_014722	TGCG	2	8	618881	618888	0 %	25 %	50 %	25 %	312795393
14226	NC_014722	GC	3	6	618891	618896	0 %	0 %	50 %	50 %	312795393
14227	NC_014722	GC	3	6	618922	618927	0 %	0 %	50 %	50 %	312795393
14228	NC_014722	AAT	2	6	619098	619103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312795393
14229	NC_014722	ACG	2	6	619205	619210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14230	NC_014722	TGA	2	6	619237	619242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_014722	GAC	2	6	619265	619270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14232	NC_014722	ACG	2	6	619277	619282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_014722	TTC	2	6	619300	619305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14234	NC_014722	CGAT	2	8	619330	619337	25 %	25 %	25 %	25 %	312795394
14235	NC_014722	TGC	2	6	619369	619374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795394
14236	NC_014722	CGC	2	6	619394	619399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795394
14237	NC_014722	CGG	2	6	619466	619471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795394
14238	NC_014722	TGCT	2	8	619546	619553	0 %	50 %	25 %	25 %	312795394
14239	NC_014722	GAT	2	6	619562	619567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795394
14240	NC_014722	CGC	2	6	619568	619573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795394
14241	NC_014722	GTT	2	6	619616	619621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795394
14242	NC_014722	GAT	2	6	619640	619645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795394
14243	NC_014722	GTT	2	6	619658	619663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795394
14244	NC_014722	GCC	2	6	619683	619688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795394
14245	NC_014722	TGC	2	6	619690	619695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795394
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14248	NC_014722	CGT	2	6	619927	619932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795394
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14252	NC_014722	CGT	2	6	620141	620146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795394
14253	NC_014722	TGGC	2	8	620179	620186	0 %	25 %	50 %	25 %	312795394
14254	NC_014722	ATCG	2	8	620195	620202	25 %	25 %	25 %	25 %	312795394
14255	NC_014722	TCG	2	6	620248	620253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795394
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14260	NC_014722	CCG	2	6	620353	620358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795394
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14265	NC_014722	CGGCG	2	10	620648	620657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14266	NC_014722	CGT	2	6	620684	620689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14268	NC_014722	TTG	2	6	620731	620736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14269	NC_014722	ACT	2	6	620790	620795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14271	NC_014722	GC	3	6	620929	620934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14272	NC_014722	CGG	2	6	620943	620948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14273	NC_014722	GCG	2	6	620951	620956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14274	NC_014722	GC	3	6	620988	620993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14275	NC_014722	ATG	2	6	621016	621021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14276	NC_014722	CGA	2	6	621035	621040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795395
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14278	NC_014722	CG	4	8	621255	621262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14279	NC_014722	CG	4	8	621304	621311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14280	NC_014722	ATCG	2	8	621374	621381	25 %	25 %	25 %	25 %	312795396
14281	NC_014722	GTT	2	6	621404	621409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795396
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14284	NC_014722	GGCG	2	8	621636	621643	0 %	0 %	75 %	25 %	312795396
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14290	NC_014722	TGT	2	6	621944	621949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795397
14291	NC_014722	TAA	2	6	622098	622103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_014722	GCA	3	9	622150	622158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795398
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14295	NC_014722	ACGG	2	8	622365	622372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14296	NC_014722	TGC	2	6	622451	622456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14298	NC_014722	GCT	2	6	622480	622485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14300	NC_014722	CGT	2	6	622559	622564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14302	NC_014722	AAT	2	6	622635	622640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14303	NC_014722	GCG	2	6	622672	622677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795399
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14320	NC_014722	ACA	2	6	623521	623526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795399
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14332	NC_014722	GCG	2	6	623978	623983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795400
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14335	NC_014722	TCG	2	6	624098	624103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795400
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14337	NC_014722	TAG	3	9	624131	624139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795400
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14352	NC_014722	GCC	2	6	624852	624857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795401
14353	NC_014722	CG	3	6	624924	624929	0 %	0 %	50 %	50 %	312795401
14354	NC_014722	TGCG	2	8	624961	624968	0 %	25 %	50 %	25 %	312795401
14355	NC_014722	CGC	2	6	624987	624992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795401
14356	NC_014722	CG	4	8	625017	625024	0 %	0 %	50 %	50 %	312795401
14357	NC_014722	GCA	2	6	625025	625030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795401
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14359	NC_014722	AGCC	2	8	625048	625055	25 %	0 %	25 %	50 %	312795401
14360	NC_014722	CGC	2	6	625124	625129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795401
14361	NC_014722	CGG	2	6	625199	625204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795401
14362	NC_014722	GC	4	8	625338	625345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14363	NC_014722	CCG	2	6	625356	625361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14364	NC_014722	GCA	2	6	625500	625505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795402
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14366	NC_014722	TGA	2	6	625623	625628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795402
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14368	NC_014722	GCT	2	6	625717	625722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795402
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