MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014722	GGC	2	6	568094	568099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13002	NC_014722	GCGCG	2	10	568112	568121	0 %	0 %	60 %	40 %	312795348
13003	NC_014722	TGA	2	6	568141	568146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795348
13004	NC_014722	GTC	2	6	568230	568235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795348
13005	NC_014722	GGC	2	6	568275	568280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13006	NC_014722	CCG	2	6	568317	568322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795348
13007	NC_014722	TTC	2	6	568454	568459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795348
13008	NC_014722	CGT	2	6	568525	568530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795348
13009	NC_014722	CCAA	2	8	568620	568627	50 %	0 %	0 %	50 %	312795348
13010	NC_014722	GGC	2	6	568677	568682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13011	NC_014722	ACCG	2	8	568725	568732	25 %	0 %	25 %	50 %	312795348
13012	NC_014722	GGC	2	6	568753	568758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13013	NC_014722	CGC	2	6	568817	568822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795348
13014	NC_014722	CAC	2	6	568883	568888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795348
13015	NC_014722	CG	3	6	568892	568897	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13016	NC_014722	GCG	2	6	568964	568969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13017	NC_014722	CGG	2	6	568988	568993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13018	NC_014722	GCG	2	6	569154	569159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13019	NC_014722	TGGCG	2	10	569183	569192	0 %	20 %	60 %	20 %	312795348
13020	NC_014722	CG	3	6	569191	569196	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13021	NC_014722	GC	3	6	569339	569344	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13022	NC_014722	CGA	2	6	569369	569374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795348
13023	NC_014722	CGG	2	6	569397	569402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13024	NC_014722	CGG	2	6	569456	569461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
13025	NC_014722	GC	4	8	569479	569486	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13026	NC_014722	GC	3	6	569571	569576	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13027	NC_014722	ACA	2	6	569620	569625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795348
13028	NC_014722	TTGG	2	8	569653	569660	0 %	50 %	50 %	0 %	312795348
13029	NC_014722	CAG	2	6	569661	569666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795348
13030	NC_014722	GC	3	6	569679	569684	0 %	0 %	50 %	50 %	312795348
13031	NC_014722	GCCC	2	8	569714	569721	0 %	0 %	25 %	75 %	312795348
13032	NC_014722	CGC	2	6	569727	569732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795349
13033	NC_014722	CG	3	6	569735	569740	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13034	NC_014722	GCG	3	9	569738	569746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13035	NC_014722	GCC	4	12	569762	569773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795349
13036	NC_014722	TGC	2	6	569778	569783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795349
13037	NC_014722	GC	3	6	569825	569830	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13038	NC_014722	CG	4	8	569895	569902	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13039	NC_014722	GCG	2	6	569919	569924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13040	NC_014722	GCT	2	6	569926	569931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795349
13041	NC_014722	TGC	2	6	569949	569954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795349
13042	NC_014722	GCG	2	6	570006	570011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13043	NC_014722	CGG	2	6	570012	570017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13044	NC_014722	GTG	2	6	570052	570057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795349
13045	NC_014722	GC	3	6	570119	570124	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13046	NC_014722	CG	3	6	570125	570130	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13047	NC_014722	CG	3	6	570147	570152	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13048	NC_014722	CGC	2	6	570159	570164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795349
13049	NC_014722	GCT	3	9	570166	570174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795349
13050	NC_014722	ATG	2	6	570221	570226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795349
13051	NC_014722	GC	3	6	570241	570246	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13052	NC_014722	CGTG	2	8	570339	570346	0 %	25 %	50 %	25 %	312795349
13053	NC_014722	GC	5	10	570424	570433	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13054	NC_014722	CGT	2	6	570447	570452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795349
13055	NC_014722	GCG	3	9	570458	570466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13056	NC_014722	CGGC	2	8	570477	570484	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13057	NC_014722	TGG	2	6	570504	570509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795349
13058	NC_014722	CGG	3	9	570574	570582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795349
13059	NC_014722	CG	3	6	570610	570615	0 %	0 %	50 %	50 %	312795349
13060	NC_014722	GTG	2	6	570650	570655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795349
13061	NC_014722	TGT	2	6	570690	570695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795349
13062	NC_014722	CGGG	3	12	570715	570726	0 %	0 %	75 %	25 %	312795349
13063	NC_014722	GCT	2	6	570789	570794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795350
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13065	NC_014722	CG	3	6	570905	570910	0 %	0 %	50 %	50 %	312795350
13066	NC_014722	CGCT	2	8	570935	570942	0 %	25 %	25 %	50 %	312795350
13067	NC_014722	CG	3	6	570963	570968	0 %	0 %	50 %	50 %	312795350
13068	NC_014722	CAG	2	6	570988	570993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795350
13069	NC_014722	CTG	2	6	571033	571038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795350
13070	NC_014722	GGGCTG	2	12	571059	571070	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312795350
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13072	NC_014722	GGC	2	6	571110	571115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795350
13073	NC_014722	CG	4	8	571137	571144	0 %	0 %	50 %	50 %	312795350
13074	NC_014722	GCTGTC	2	12	571149	571160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795350
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13085	NC_014722	TGGGC	2	10	571396	571405	0 %	20 %	60 %	20 %	312795350
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13087	NC_014722	GTCA	2	8	571435	571442	25 %	25 %	25 %	25 %	312795350
13088	NC_014722	GC	3	6	571478	571483	0 %	0 %	50 %	50 %	312795350
13089	NC_014722	CGG	2	6	571635	571640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_014722	GTT	2	6	571674	571679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_014722	CGT	2	6	571715	571720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_014722	CAT	2	6	571728	571733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_014722	GTG	2	6	571743	571748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_014722	GCT	2	6	571776	571781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_014722	CGG	2	6	571806	571811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_014722	GC	3	6	571826	571831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_014722	CTG	2	6	571849	571854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795351
13098	NC_014722	CG	4	8	571932	571939	0 %	0 %	50 %	50 %	312795351
13099	NC_014722	CG	3	6	571942	571947	0 %	0 %	50 %	50 %	312795351
13100	NC_014722	GTC	2	6	571984	571989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795351
13101	NC_014722	GC	3	6	572022	572027	0 %	0 %	50 %	50 %	312795351
13102	NC_014722	CGCC	2	8	572132	572139	0 %	0 %	25 %	75 %	312795351
13103	NC_014722	TGA	2	6	572160	572165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795351
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13105	NC_014722	A	7	7	572210	572216	100 %	0 %	0 %	0 %	312795351
13106	NC_014722	GCG	2	6	572255	572260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795351
13107	NC_014722	CG	3	6	572289	572294	0 %	0 %	50 %	50 %	312795351
13108	NC_014722	AGC	2	6	572312	572317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795351
13109	NC_014722	CCA	2	6	572431	572436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795351
13110	NC_014722	GAC	2	6	572437	572442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795351
13111	NC_014722	CGC	2	6	572461	572466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795351
13112	NC_014722	TGC	2	6	572493	572498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795351
13113	NC_014722	GCG	2	6	572519	572524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795351
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13117	NC_014722	GTC	2	6	572659	572664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795351
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13120	NC_014722	GCG	2	6	572761	572766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795351
13121	NC_014722	GCG	2	6	572857	572862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_014722	CG	3	6	572864	572869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_014722	TCG	2	6	572914	572919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_014722	CG	4	8	572926	572933	0 %	0 %	50 %	50 %	312795352
13125	NC_014722	ACGC	2	8	572952	572959	25 %	0 %	25 %	50 %	312795352
13126	NC_014722	GCA	2	6	572997	573002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795352
13127	NC_014722	CG	3	6	573032	573037	0 %	0 %	50 %	50 %	312795352
13128	NC_014722	CTG	2	6	573065	573070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795352
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13130	NC_014722	GC	3	6	573119	573124	0 %	0 %	50 %	50 %	312795352
13131	NC_014722	AAG	2	6	573179	573184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795352
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13154	NC_014722	GC	3	6	574103	574108	0 %	0 %	50 %	50 %	312795354
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13231	NC_014722	GCT	2	6	577667	577672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795358
13232	NC_014722	GC	3	6	577717	577722	0 %	0 %	50 %	50 %	312795358
13233	NC_014722	GCGCAC	2	12	577736	577747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795358
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13238	NC_014722	TGA	2	6	577938	577943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795358
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13240	NC_014722	CGGC	2	8	577996	578003	0 %	0 %	50 %	50 %	312795358
13241	NC_014722	TGC	3	9	578013	578021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795358
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13243	NC_014722	CG	3	6	578058	578063	0 %	0 %	50 %	50 %	312795358
13244	NC_014722	GCT	2	6	578077	578082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795358
13245	NC_014722	CGG	2	6	578092	578097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795358
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13264	NC_014722	GC	3	6	578759	578764	0 %	0 %	50 %	50 %	312795359
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13344	NC_014722	CAGT	2	8	582079	582086	25 %	25 %	25 %	25 %	312795360
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13351	NC_014722	GCT	2	6	582296	582301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795360
13352	NC_014722	TCGG	2	8	582354	582361	0 %	25 %	50 %	25 %	312795360
13353	NC_014722	GTG	2	6	582393	582398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795360
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13355	NC_014722	CAT	2	6	582506	582511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795360
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13359	NC_014722	GC	4	8	582594	582601	0 %	0 %	50 %	50 %	312795360
13360	NC_014722	CCG	3	9	582683	582691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795361
13361	NC_014722	CTC	2	6	582780	582785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795361
13362	NC_014722	GCC	2	6	582796	582801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795361
13363	NC_014722	CTCGC	2	10	582829	582838	0 %	20 %	20 %	60 %	312795361
13364	NC_014722	CGA	2	6	582893	582898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795361
13365	NC_014722	GC	3	6	582900	582905	0 %	0 %	50 %	50 %	312795361
13366	NC_014722	TCG	2	6	582931	582936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795361
13367	NC_014722	TGA	2	6	582941	582946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795361
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13369	NC_014722	GGCCGT	2	12	583011	583022	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312795361
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13373	NC_014722	CGA	2	6	583128	583133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795361
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13375	NC_014722	GGC	2	6	583320	583325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795361
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13384	NC_014722	GCA	2	6	583769	583774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795361
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13391	NC_014722	GCGTC	2	10	584015	584024	0 %	20 %	40 %	40 %	312795361
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13402	NC_014722	ACA	2	6	584390	584395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795361
13403	NC_014722	AGT	2	6	584420	584425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795361
13404	NC_014722	GC	4	8	584519	584526	0 %	0 %	50 %	50 %	312795361
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13415	NC_014722	CGC	2	6	584888	584893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13417	NC_014722	AAC	2	6	584951	584956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13418	NC_014722	GCC	2	6	584966	584971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13420	NC_014722	A	6	6	585002	585007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13421	NC_014722	CG	3	6	585024	585029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13422	NC_014722	GC	3	6	585072	585077	0 %	0 %	50 %	50 %	312795362
13423	NC_014722	TGT	2	6	585093	585098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795362
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13430	NC_014722	GCC	3	9	585517	585525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795362
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13433	NC_014722	GCG	2	6	585594	585599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795362
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13436	NC_014722	GACC	2	8	585637	585644	25 %	0 %	25 %	50 %	312795362
13437	NC_014722	ATGG	2	8	585701	585708	25 %	25 %	50 %	0 %	312795362
13438	NC_014722	GCACA	2	10	585718	585727	40 %	0 %	20 %	40 %	312795362
13439	NC_014722	CCG	2	6	585728	585733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795362
13440	NC_014722	GC	3	6	585778	585783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13441	NC_014722	GCAG	2	8	585794	585801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13442	NC_014722	GCT	2	6	585829	585834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13445	NC_014722	CG	3	6	585944	585949	0 %	0 %	50 %	50 %	312795363
13446	NC_014722	TGC	2	6	586046	586051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795363
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13449	NC_014722	GTG	2	6	586280	586285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795363
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13464	NC_014722	CGT	2	6	586803	586808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795363
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13471	NC_014722	GCT	2	6	587238	587243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795365
13472	NC_014722	CGG	2	6	587321	587326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795365
13473	NC_014722	GCC	2	6	587406	587411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795365
13474	NC_014722	GCG	2	6	587444	587449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795365
13475	NC_014722	TGGCG	2	10	587559	587568	0 %	20 %	60 %	20 %	312795365
13476	NC_014722	GGT	2	6	587616	587621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795365
13477	NC_014722	CG	3	6	587626	587631	0 %	0 %	50 %	50 %	312795365
13478	NC_014722	TAT	2	6	587659	587664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795365
13479	NC_014722	CAT	2	6	587706	587711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795365
13480	NC_014722	AAT	2	6	587717	587722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312795365
13481	NC_014722	GGC	3	9	587758	587766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795365
13482	NC_014722	GCC	2	6	587804	587809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13483	NC_014722	GCTACG	2	12	587951	587962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312795366
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13485	NC_014722	TCG	2	6	588014	588019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795366
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