MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014722	CG	3	6	546843	546848	0 %	0 %	50 %	50 %	312795326
12502	NC_014722	GC	3	6	546863	546868	0 %	0 %	50 %	50 %	312795326
12503	NC_014722	TGC	2	6	546909	546914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795326
12504	NC_014722	CGGT	2	8	546972	546979	0 %	25 %	50 %	25 %	312795326
12505	NC_014722	GCG	2	6	547004	547009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795326
12506	NC_014722	CG	3	6	547035	547040	0 %	0 %	50 %	50 %	312795326
12507	NC_014722	GTCG	2	8	547156	547163	0 %	25 %	50 %	25 %	312795326
12508	NC_014722	GCA	2	6	547198	547203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795326
12509	NC_014722	AACG	2	8	547244	547251	50 %	0 %	25 %	25 %	312795326
12510	NC_014722	GGTC	2	8	547252	547259	0 %	25 %	50 %	25 %	312795326
12511	NC_014722	GC	3	6	547302	547307	0 %	0 %	50 %	50 %	312795326
12512	NC_014722	AGC	2	6	547314	547319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795326
12513	NC_014722	CGC	2	6	547358	547363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_014722	CGA	2	6	547389	547394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_014722	GCG	2	6	547499	547504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_014722	TTC	2	6	547512	547517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_014722	CGC	3	9	547531	547539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_014722	GA	3	6	547547	547552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_014722	CT	3	6	547615	547620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_014722	CAC	2	6	547772	547777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_014722	AGC	2	6	547794	547799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_014722	CACT	2	8	547816	547823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_014722	CAC	2	6	547860	547865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_014722	GCG	2	6	547866	547871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_014722	GAG	2	6	548090	548095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_014722	GGC	2	6	548133	548138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_014722	CGA	2	6	548148	548153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_014722	TGC	2	6	548256	548261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795327
12529	NC_014722	TGT	2	6	548289	548294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795327
12530	NC_014722	GATGGC	2	12	548319	548330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312795327
12531	NC_014722	CG	3	6	548345	548350	0 %	0 %	50 %	50 %	312795327
12532	NC_014722	AGGT	2	8	548479	548486	25 %	25 %	50 %	0 %	312795328
12533	NC_014722	GTG	2	6	548509	548514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795328
12534	NC_014722	CG	3	6	548544	548549	0 %	0 %	50 %	50 %	312795328
12535	NC_014722	GCCCAG	2	12	548601	548612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795328
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12538	NC_014722	CCGC	2	8	548987	548994	0 %	0 %	25 %	75 %	312795328
12539	NC_014722	GCG	2	6	549025	549030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795328
12540	NC_014722	CTGCG	2	10	549051	549060	0 %	20 %	40 %	40 %	312795328
12541	NC_014722	T	6	6	549104	549109	0 %	100 %	0 %	0 %	312795328
12542	NC_014722	GAT	2	6	549123	549128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795328
12543	NC_014722	TGCCG	2	10	549161	549170	0 %	20 %	40 %	40 %	312795328
12544	NC_014722	TCC	2	6	549196	549201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795328
12545	NC_014722	GAT	2	6	549207	549212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795328
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12548	NC_014722	AT	3	6	549319	549324	50 %	50 %	0 %	0 %	312795328
12549	NC_014722	T	6	6	549348	549353	0 %	100 %	0 %	0 %	312795328
12550	NC_014722	ATT	2	6	549439	549444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_014722	CGG	2	6	549454	549459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_014722	GC	3	6	549506	549511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12553	NC_014722	CGA	2	6	549573	549578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12557	NC_014722	GC	3	6	549751	549756	0 %	0 %	50 %	50 %	312795329
12558	NC_014722	GGA	2	6	549831	549836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795329
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12560	NC_014722	TGC	2	6	549980	549985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795329
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12562	NC_014722	GGC	2	6	550150	550155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795329
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12565	NC_014722	CTG	2	6	550213	550218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795329
12566	NC_014722	TGC	2	6	550235	550240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795329
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12570	NC_014722	GCA	2	6	550407	550412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795329
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12593	NC_014722	GCCG	2	8	551447	551454	0 %	0 %	50 %	50 %	312795330
12594	NC_014722	CGA	2	6	551462	551467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795330
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12602	NC_014722	CGG	2	6	551761	551766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795330
12603	NC_014722	GCCA	2	8	551788	551795	25 %	0 %	25 %	50 %	312795330
12604	NC_014722	CGT	2	6	551806	551811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795330
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12606	NC_014722	CGC	2	6	551865	551870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795331
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12608	NC_014722	GCT	2	6	551902	551907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795331
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12610	NC_014722	GT	3	6	551932	551937	0 %	50 %	50 %	0 %	312795331
12611	NC_014722	GCC	2	6	551957	551962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795331
12612	NC_014722	GCA	2	6	552112	552117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795331
12613	NC_014722	GCTG	2	8	552229	552236	0 %	25 %	50 %	25 %	312795331
12614	NC_014722	GC	3	6	552237	552242	0 %	0 %	50 %	50 %	312795331
12615	NC_014722	GCG	2	6	552262	552267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795331
12616	NC_014722	ACG	2	6	552390	552395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795331
12617	NC_014722	GC	3	6	552416	552421	0 %	0 %	50 %	50 %	312795331
12618	NC_014722	CG	4	8	552453	552460	0 %	0 %	50 %	50 %	312795331
12619	NC_014722	TCG	2	6	552478	552483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795331
12620	NC_014722	TGG	3	9	552494	552502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795331
12621	NC_014722	GC	3	6	552540	552545	0 %	0 %	50 %	50 %	312795331
12622	NC_014722	GAC	2	6	552579	552584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795331
12623	NC_014722	ACC	2	6	552613	552618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795332
12624	NC_014722	ACC	2	6	552647	552652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795332
12625	NC_014722	GCT	2	6	552720	552725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795332
12626	NC_014722	CGG	2	6	552732	552737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795332
12627	NC_014722	GTC	2	6	552748	552753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795332
12628	NC_014722	TGC	2	6	552755	552760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795332
12629	NC_014722	CGCA	2	8	552799	552806	25 %	0 %	25 %	50 %	312795332
12630	NC_014722	CCG	2	6	552873	552878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795332
12631	NC_014722	GC	3	6	552893	552898	0 %	0 %	50 %	50 %	312795332
12632	NC_014722	TGCGGC	2	12	552944	552955	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312795332
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12640	NC_014722	CG	3	6	553233	553238	0 %	0 %	50 %	50 %	312795332
12641	NC_014722	CTA	2	6	553263	553268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795332
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12650	NC_014722	GC	3	6	553750	553755	0 %	0 %	50 %	50 %	312795333
12651	NC_014722	CGAT	2	8	553824	553831	25 %	25 %	25 %	25 %	312795333
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12658	NC_014722	TCG	2	6	554061	554066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795333
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12664	NC_014722	GC	3	6	554337	554342	0 %	0 %	50 %	50 %	312795333
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12678	NC_014722	ATG	2	6	555054	555059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795334
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12680	NC_014722	CGGT	2	8	555111	555118	0 %	25 %	50 %	25 %	312795334
12681	NC_014722	TCA	2	6	555153	555158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795334
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12685	NC_014722	GCG	2	6	555213	555218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795334
12686	NC_014722	CGA	2	6	555241	555246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795334
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12690	NC_014722	CGA	2	6	555403	555408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795334
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12693	NC_014722	GCCG	2	8	555494	555501	0 %	0 %	50 %	50 %	312795334
12694	NC_014722	TCG	2	6	555525	555530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795334
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12698	NC_014722	CTG	2	6	555629	555634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795334
12699	NC_014722	CG	3	6	555657	555662	0 %	0 %	50 %	50 %	312795334
12700	NC_014722	GGC	2	6	555677	555682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795334
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12703	NC_014722	TGC	2	6	555741	555746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795334
12704	NC_014722	CGC	2	6	555751	555756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795334
12705	NC_014722	CGG	2	6	555771	555776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795334
12706	NC_014722	CAT	2	6	555777	555782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795334
12707	NC_014722	CCG	2	6	555813	555818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12708	NC_014722	GGT	2	6	555858	555863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12709	NC_014722	GTTAGC	2	12	555895	555906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12710	NC_014722	GC	3	6	555921	555926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12711	NC_014722	GCA	2	6	555929	555934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12712	NC_014722	GAC	2	6	555975	555980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795335
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12714	NC_014722	GTCGC	2	10	556040	556049	0 %	20 %	40 %	40 %	312795335
12715	NC_014722	GCC	2	6	556055	556060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795335
12716	NC_014722	CTG	2	6	556184	556189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795335
12717	NC_014722	CG	3	6	556190	556195	0 %	0 %	50 %	50 %	312795335
12718	NC_014722	GCG	3	9	556193	556201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795335
12719	NC_014722	GCGAC	2	10	556213	556222	20 %	0 %	40 %	40 %	312795335
12720	NC_014722	GAT	2	6	556338	556343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795335
12721	NC_014722	CAGCG	2	10	556387	556396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12722	NC_014722	AAT	2	6	556399	556404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12723	NC_014722	AGAT	2	8	556414	556421	50 %	25 %	25 %	0 %	312795336
12724	NC_014722	GCG	2	6	556435	556440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795336
12725	NC_014722	AAC	2	6	556495	556500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795336
12726	NC_014722	ATG	2	6	556519	556524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795336
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12728	NC_014722	CGA	2	6	556544	556549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12729	NC_014722	TGC	2	6	556681	556686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12730	NC_014722	TCCGG	2	10	556715	556724	0 %	20 %	40 %	40 %	312795336
12731	NC_014722	CGG	2	6	556838	556843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795336
12732	NC_014722	CAT	2	6	556853	556858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795336
12733	NC_014722	AGC	2	6	556885	556890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12734	NC_014722	CGA	2	6	557100	557105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12735	NC_014722	GAT	2	6	557157	557162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795336
12736	NC_014722	ACG	2	6	557185	557190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12737	NC_014722	GC	3	6	557222	557227	0 %	0 %	50 %	50 %	312795336
12738	NC_014722	GCC	2	6	557275	557280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795336
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12740	NC_014722	GAT	2	6	557325	557330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795336
12741	NC_014722	GCA	2	6	557354	557359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
12742	NC_014722	GCA	2	6	557366	557371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
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12860	NC_014722	CGG	2	6	561844	561849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795340
12861	NC_014722	GCA	2	6	561871	561876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795340
12862	NC_014722	TCG	2	6	561883	561888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795340
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12922	NC_014722	CG	4	8	564514	564521	0 %	0 %	50 %	50 %	312795343
12923	NC_014722	GAC	2	6	564527	564532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795343
12924	NC_014722	CGGC	2	8	564666	564673	0 %	0 %	50 %	50 %	312795343
12925	NC_014722	ACGC	2	8	564676	564683	25 %	0 %	25 %	50 %	312795343
12926	NC_014722	GCG	2	6	564728	564733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12927	NC_014722	GGGGCG	2	12	564740	564751	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12928	NC_014722	GCCG	2	8	564760	564767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12929	NC_014722	GAT	2	6	564770	564775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12932	NC_014722	CAT	3	9	564893	564901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795344
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12948	NC_014722	TGAT	2	8	565539	565546	25 %	50 %	25 %	0 %	312795344
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12951	NC_014722	GTG	2	6	565713	565718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12966	NC_014722	TGC	2	6	566367	566372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12967	NC_014722	CAGG	2	8	566430	566437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12968	NC_014722	TCAT	2	8	566557	566564	25 %	50 %	0 %	25 %	312795346
12969	NC_014722	TCC	2	6	566587	566592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795346
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12973	NC_014722	CGCGG	2	10	566700	566709	0 %	0 %	60 %	40 %	312795346
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12975	NC_014722	TCG	2	6	566822	566827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795346
12976	NC_014722	CGGGCG	2	12	566857	566868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795346
12977	NC_014722	TGG	2	6	567218	567223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795347
12978	NC_014722	CTAC	2	8	567293	567300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12979	NC_014722	CG	3	6	567337	567342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12980	NC_014722	T	7	7	567422	567428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12981	NC_014722	CCG	2	6	567446	567451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12982	NC_014722	GCG	2	6	567465	567470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12983	NC_014722	GTGC	2	8	567471	567478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12984	NC_014722	GGCCG	2	10	567501	567510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12985	NC_014722	GCCGC	2	10	567570	567579	0 %	0 %	40 %	60 %	312795348
12986	NC_014722	CAA	2	6	567629	567634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795348
12987	NC_014722	GCAGCG	2	12	567660	567671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312795348
12988	NC_014722	CGA	2	6	567728	567733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795348
12989	NC_014722	CCG	2	6	567737	567742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795348
12990	NC_014722	GGC	2	6	567794	567799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
12991	NC_014722	GCG	2	6	567831	567836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795348
12992	NC_014722	CTG	2	6	567847	567852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795348
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