MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014722	GCA	2	6	480975	480980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795240
11002	NC_014722	AGG	2	6	480986	480991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795240
11003	NC_014722	GGAA	2	8	481020	481027	50 %	0 %	50 %	0 %	312795240
11004	NC_014722	GGCAG	2	10	481038	481047	20 %	0 %	60 %	20 %	312795240
11005	NC_014722	GAC	2	6	481055	481060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795240
11006	NC_014722	CAG	2	6	481085	481090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795240
11007	NC_014722	GCT	2	6	481114	481119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795240
11008	NC_014722	A	6	6	481131	481136	100 %	0 %	0 %	0 %	312795240
11009	NC_014722	AGG	2	6	481212	481217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795240
11010	NC_014722	T	7	7	481256	481262	0 %	100 %	0 %	0 %	312795240
11011	NC_014722	T	7	7	481295	481301	0 %	100 %	0 %	0 %	312795240
11012	NC_014722	TAT	2	6	481446	481451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_014722	TGG	2	6	481487	481492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_014722	TTAC	2	8	481622	481629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_014722	GGA	2	6	481757	481762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_014722	TGC	2	6	481851	481856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_014722	A	6	6	481858	481863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_014722	GAA	2	6	481995	482000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795241
11019	NC_014722	GGA	2	6	482058	482063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795242
11020	NC_014722	GTT	2	6	482088	482093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795242
11021	NC_014722	GCG	2	6	482113	482118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795242
11022	NC_014722	GCG	2	6	482167	482172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795242
11023	NC_014722	GTT	2	6	482223	482228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795242
11024	NC_014722	CGG	2	6	482234	482239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795242
11025	NC_014722	GCT	2	6	482261	482266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795242
11026	NC_014722	TTG	2	6	482329	482334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795243
11027	NC_014722	TTGT	2	8	482353	482360	0 %	75 %	25 %	0 %	312795243
11028	NC_014722	GGT	2	6	482398	482403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795243
11029	NC_014722	TAT	2	6	482410	482415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795243
11030	NC_014722	GTG	2	6	482442	482447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795243
11031	NC_014722	TGC	2	6	482463	482468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795243
11032	NC_014722	TG	3	6	482495	482500	0 %	50 %	50 %	0 %	312795243
11033	NC_014722	AGG	2	6	482566	482571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795244
11034	NC_014722	AAAG	2	8	482572	482579	75 %	0 %	25 %	0 %	312795244
11035	NC_014722	CGG	2	6	482611	482616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795244
11036	NC_014722	GAAG	2	8	482636	482643	50 %	0 %	50 %	0 %	312795244
11037	NC_014722	GCA	2	6	482681	482686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795244
11038	NC_014722	AGGC	2	8	482725	482732	25 %	0 %	50 %	25 %	312795244
11039	NC_014722	TGC	2	6	482748	482753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795244
11040	NC_014722	CGA	2	6	482760	482765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_014722	AG	3	6	482796	482801	50 %	0 %	50 %	0 %	312795245
11042	NC_014722	CGGC	3	12	482925	482936	0 %	0 %	50 %	50 %	312795245
11043	NC_014722	CGC	2	6	482942	482947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795245
11044	NC_014722	C	6	6	482980	482985	0 %	0 %	0 %	100 %	312795245
11045	NC_014722	A	6	6	482986	482991	100 %	0 %	0 %	0 %	312795245
11046	NC_014722	GAA	2	6	483041	483046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_014722	GAAGA	2	10	483252	483261	60 %	0 %	40 %	0 %	312795246
11048	NC_014722	A	6	6	483293	483298	100 %	0 %	0 %	0 %	312795246
11049	NC_014722	GCT	2	6	483399	483404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11050	NC_014722	GAG	2	6	483437	483442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795247
11051	NC_014722	GCT	2	6	483454	483459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11052	NC_014722	ACC	2	6	483474	483479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795247
11053	NC_014722	GACG	2	8	483695	483702	25 %	0 %	50 %	25 %	312795247
11054	NC_014722	CGA	2	6	483727	483732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11055	NC_014722	GCA	2	6	483802	483807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11056	NC_014722	ATC	2	6	483809	483814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795247
11057	NC_014722	GGCC	2	8	483824	483831	0 %	0 %	50 %	50 %	312795247
11058	NC_014722	CGA	2	6	483873	483878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11059	NC_014722	CAG	2	6	483938	483943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795247
11060	NC_014722	GGA	2	6	484006	484011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795247
11061	NC_014722	CGAC	2	8	484035	484042	25 %	0 %	25 %	50 %	312795247
11062	NC_014722	GTGG	2	8	484181	484188	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_014722	GTG	2	6	484224	484229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_014722	TCC	2	6	484249	484254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_014722	AATG	2	8	484272	484279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_014722	GTT	2	6	484297	484302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_014722	CTT	2	6	484314	484319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_014722	TTGCTA	2	12	484330	484341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11069	NC_014722	G	7	7	484351	484357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_014722	G	6	6	484445	484450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_014722	TGTT	2	8	484473	484480	0 %	75 %	25 %	0 %	312795248
11072	NC_014722	A	6	6	484502	484507	100 %	0 %	0 %	0 %	312795248
11073	NC_014722	TAT	2	6	484508	484513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795248
11074	NC_014722	ACG	2	6	484809	484814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_014722	CAG	2	6	484901	484906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_014722	GTAA	2	8	484908	484915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_014722	CAA	2	6	484948	484953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_014722	GGT	2	6	484968	484973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_014722	TGC	2	6	485060	485065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_014722	AT	3	6	485173	485178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_014722	AGC	2	6	485193	485198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_014722	CAA	2	6	485216	485221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_014722	CTA	2	6	485225	485230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_014722	TGG	2	6	485258	485263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_014722	GGC	2	6	485286	485291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_014722	ATTT	2	8	485342	485349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_014722	CGT	2	6	485449	485454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_014722	CGA	2	6	485515	485520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_014722	TGGA	2	8	485521	485528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_014722	TTTA	2	8	485565	485572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_014722	GTT	2	6	485594	485599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_014722	TCA	2	6	485676	485681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_014722	GTT	3	9	485687	485695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_014722	GCT	2	6	485783	485788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795249
11095	NC_014722	GA	3	6	485817	485822	50 %	0 %	50 %	0 %	312795249
11096	NC_014722	GCA	3	9	485856	485864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795249
11097	NC_014722	GGA	2	6	485882	485887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795249
11098	NC_014722	TGC	2	6	485914	485919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795249
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11105	NC_014722	AGG	2	6	486266	486271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795249
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11107	NC_014722	GGGA	2	8	486300	486307	25 %	0 %	75 %	0 %	312795249
11108	NC_014722	GCA	2	6	486336	486341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795250
11109	NC_014722	GTTTG	2	10	486342	486351	0 %	60 %	40 %	0 %	312795250
11110	NC_014722	CGG	2	6	486365	486370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795250
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11112	NC_014722	GCG	2	6	486475	486480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795250
11113	NC_014722	GCG	2	6	486490	486495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795250
11114	NC_014722	GTGG	2	8	486579	486586	0 %	25 %	75 %	0 %	312795250
11115	NC_014722	TGGGA	2	10	486591	486600	20 %	20 %	60 %	0 %	312795250
11116	NC_014722	GCC	2	6	486615	486620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795250
11117	NC_014722	CAT	2	6	486632	486637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795250
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11119	NC_014722	GAAAT	2	10	486716	486725	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_014722	GCT	2	6	486838	486843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795251
11121	NC_014722	TGG	2	6	486891	486896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795251
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11372	NC_014722	TGG	2	6	498729	498734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795273
11373	NC_014722	GTT	2	6	498753	498758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795273
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11482	NC_014722	GCA	2	6	502790	502795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795278
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11491	NC_014722	CCAGCA	2	12	503003	503014	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312795278
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11494	NC_014722	GCA	2	6	503333	503338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795278
11495	NC_014722	GCA	3	9	503357	503365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795278
11496	NC_014722	CAC	2	6	503385	503390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795278
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