MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014722	GTA	2	6	269760	269765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795044
6002	NC_014722	GTCC	2	8	269801	269808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_014722	GCCG	2	8	269874	269881	0 %	0 %	50 %	50 %	312795045
6004	NC_014722	CCG	2	6	270011	270016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795045
6005	NC_014722	TGC	2	6	270056	270061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795045
6006	NC_014722	TCC	2	6	270103	270108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014722	CGC	2	6	270133	270138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795046
6008	NC_014722	GCC	2	6	270182	270187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795046
6009	NC_014722	CG	3	6	270222	270227	0 %	0 %	50 %	50 %	312795046
6010	NC_014722	CG	3	6	270315	270320	0 %	0 %	50 %	50 %	312795046
6011	NC_014722	CGA	2	6	270378	270383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6012	NC_014722	GTC	2	6	270409	270414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6013	NC_014722	CAT	2	6	270487	270492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795046
6014	NC_014722	CCA	3	9	270502	270510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795046
6015	NC_014722	CTG	2	6	270523	270528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6016	NC_014722	TGC	2	6	270544	270549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6017	NC_014722	CAT	2	6	270559	270564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795046
6018	NC_014722	TGG	2	6	270593	270598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795046
6019	NC_014722	ATC	2	6	270623	270628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795046
6020	NC_014722	GC	4	8	270629	270636	0 %	0 %	50 %	50 %	312795046
6021	NC_014722	CG	3	6	270798	270803	0 %	0 %	50 %	50 %	312795046
6022	NC_014722	GTACAG	2	12	270829	270840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312795046
6023	NC_014722	CAG	2	6	270871	270876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6024	NC_014722	CGA	2	6	270936	270941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6025	NC_014722	TGC	2	6	270956	270961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6026	NC_014722	GTC	2	6	271024	271029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6027	NC_014722	GC	3	6	271039	271044	0 %	0 %	50 %	50 %	312795046
6028	NC_014722	GCT	3	9	271053	271061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795046
6029	NC_014722	AAG	2	6	271129	271134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795046
6030	NC_014722	TTC	2	6	271147	271152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_014722	ACCG	2	8	271168	271175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_014722	TAA	2	6	271182	271187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014722	CTG	3	9	271206	271214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014722	TGGCGG	2	12	271225	271236	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6035	NC_014722	G	6	6	271256	271261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014722	CGGGT	2	10	271264	271273	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6037	NC_014722	A	7	7	271290	271296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014722	TGCA	2	8	271352	271359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_014722	GCGG	2	8	271386	271393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_014722	GGC	2	6	271413	271418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014722	A	6	6	271439	271444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_014722	GTT	2	6	271445	271450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014722	CTG	3	9	271487	271495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_014722	GCGAC	2	10	271501	271510	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6045	NC_014722	AAT	2	6	271647	271652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014722	AGGT	2	8	271672	271679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014722	GA	3	6	271683	271688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014722	TTGAG	2	10	271707	271716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014722	GGC	2	6	271792	271797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014722	GGC	2	6	271842	271847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_014722	GAG	2	6	271936	271941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014722	G	6	6	271948	271953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_014722	GGC	2	6	271977	271982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014722	CGA	2	6	272026	272031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014722	GAC	2	6	272051	272056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014722	GCA	2	6	272100	272105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014722	GT	3	6	272153	272158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014722	GAA	2	6	272159	272164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014722	GAAA	2	8	272195	272202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014722	GAA	2	6	272240	272245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_014722	CAG	2	6	272268	272273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014722	GGA	2	6	272459	272464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014722	CCT	2	6	272484	272489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_014722	GTT	2	6	272578	272583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014722	GAT	2	6	272693	272698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014722	TACC	2	8	272730	272737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_014722	CTG	2	6	272756	272761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014722	TGC	2	6	272799	272804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014722	GTC	2	6	272811	272816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014722	TCGTG	2	10	272820	272829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6071	NC_014722	GGA	2	6	272918	272923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_014722	A	6	6	273029	273034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014722	AC	3	6	273138	273143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6074	NC_014722	AGG	2	6	273197	273202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014722	CAC	2	6	273208	273213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_014722	CCT	2	6	273279	273284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_014722	CAC	2	6	273428	273433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_014722	GTC	2	6	273532	273537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014722	CCA	2	6	273557	273562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_014722	GCAGT	2	10	273620	273629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6081	NC_014722	GAA	3	9	273657	273665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014722	TGG	2	6	273845	273850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014722	GAA	2	6	273871	273876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014722	AGT	2	6	274061	274066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014722	GCGA	2	8	274068	274075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_014722	GGC	2	6	274130	274135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014722	GTG	2	6	274168	274173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014722	G	6	6	274228	274233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014722	TCC	2	6	274238	274243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_014722	GGGAG	2	10	274310	274319	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014722	GCAT	2	8	274339	274346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_014722	GGA	2	6	274544	274549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014722	AAAC	2	8	274607	274614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_014722	TC	3	6	274630	274635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_014722	AAC	2	6	274799	274804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_014722	AGG	2	6	274872	274877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014722	AGC	2	6	274888	274893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014722	AAAG	2	8	274902	274909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_014722	GTC	2	6	274930	274935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_014722	GC	3	6	274984	274989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_014722	CGT	2	6	275222	275227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014722	G	6	6	275238	275243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_014722	GC	3	6	275318	275323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_014722	TGC	2	6	275353	275358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_014722	GA	3	6	275462	275467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_014722	AGG	2	6	275548	275553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_014722	TGG	2	6	275574	275579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014722	TAA	2	6	275591	275596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014722	ATG	2	6	275667	275672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014722	TTGA	2	8	275685	275692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014722	CGG	2	6	275705	275710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014722	TCC	2	6	275798	275803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_014722	TGA	2	6	275831	275836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_014722	ACC	2	6	275976	275981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_014722	GTTT	2	8	275985	275992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014722	TCC	2	6	276063	276068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_014722	GGA	2	6	276080	276085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014722	GGT	2	6	276200	276205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014722	CGG	2	6	276287	276292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_014722	CTCAT	2	10	276314	276323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6121	NC_014722	CGT	2	6	276395	276400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014722	C	6	6	276737	276742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6123	NC_014722	TGGC	2	8	276772	276779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_014722	GC	3	6	276778	276783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_014722	TGA	2	6	276812	276817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_014722	GAT	2	6	276879	276884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_014722	C	6	6	277014	277019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6128	NC_014722	CG	4	8	277029	277036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_014722	C	6	6	277058	277063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6130	NC_014722	GGC	2	6	277075	277080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_014722	CAC	2	6	277254	277259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795047
6132	NC_014722	AGC	2	6	277281	277286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795047
6133	NC_014722	TGGCT	2	10	277288	277297	0 %	40 %	40 %	20 %	312795047
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6243	NC_014722	GTGA	2	8	282571	282578	25 %	25 %	50 %	0 %	312795048
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6252	NC_014722	GGC	2	6	282913	282918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795048
6253	NC_014722	GTGA	2	8	283018	283025	25 %	25 %	50 %	0 %	312795048
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6370	NC_014722	GC	3	6	289154	289159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6375	NC_014722	GATG	2	8	289536	289543	25 %	25 %	50 %	0 %	312795052
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