MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014718	CG	4	8	539959	539966	0 %	0 %	50 %	50 %	312602594
11502	NC_014718	CGC	2	6	540048	540053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602594
11503	NC_014718	GGC	2	6	540063	540068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602594
11504	NC_014718	GTGCCG	2	12	540106	540117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602594
11505	NC_014718	GCCA	2	8	540168	540175	25 %	0 %	25 %	50 %	312602594
11506	NC_014718	AGCGC	2	10	540186	540195	20 %	0 %	40 %	40 %	312602594
11507	NC_014718	GTGCC	2	10	540293	540302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11508	NC_014718	TTGA	2	8	540335	540342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_014718	TGC	2	6	540357	540362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11510	NC_014718	GCA	2	6	540475	540480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11511	NC_014718	ACC	2	6	540504	540509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602595
11512	NC_014718	AAGC	2	8	540514	540521	50 %	0 %	25 %	25 %	312602595
11513	NC_014718	CAC	2	6	540530	540535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602595
11514	NC_014718	CGC	3	9	540587	540595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
11515	NC_014718	CG	3	6	540609	540614	0 %	0 %	50 %	50 %	312602595
11516	NC_014718	GTT	2	6	540666	540671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602595
11517	NC_014718	CGC	2	6	540693	540698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
11518	NC_014718	TGC	2	6	540755	540760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11519	NC_014718	CTA	2	6	540804	540809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602595
11520	NC_014718	TCG	2	6	540878	540883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11521	NC_014718	GCGCT	2	10	540896	540905	0 %	20 %	40 %	40 %	312602595
11522	NC_014718	CGG	2	6	540945	540950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602595
11523	NC_014718	CTG	2	6	541102	541107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11524	NC_014718	CGG	2	6	541125	541130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602595
11525	NC_014718	CTG	2	6	541138	541143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11526	NC_014718	TCG	2	6	541145	541150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11527	NC_014718	TGTT	2	8	541157	541164	0 %	75 %	25 %	0 %	312602595
11528	NC_014718	GCT	2	6	541185	541190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11529	NC_014718	GCC	2	6	541235	541240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
11530	NC_014718	GCC	2	6	541501	541506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
11531	NC_014718	TCG	2	6	541526	541531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11532	NC_014718	CGC	2	6	541575	541580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
11533	NC_014718	CGG	2	6	541683	541688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602595
11534	NC_014718	CGA	2	6	541700	541705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602595
11535	NC_014718	G	6	6	541737	541742	0 %	0 %	100 %	0 %	312602595
11536	NC_014718	GC	3	6	541789	541794	0 %	0 %	50 %	50 %	312602595
11537	NC_014718	CGG	2	6	541806	541811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602595
11538	NC_014718	TGA	2	6	541837	541842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602595
11539	NC_014718	GC	3	6	541850	541855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11540	NC_014718	CAT	2	6	541891	541896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_014718	CAT	2	6	541921	541926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_014718	CGC	2	6	541941	541946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11543	NC_014718	CGGC	2	8	541952	541959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_014718	GCC	2	6	541974	541979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_014718	GCGT	2	8	541991	541998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_014718	CCG	2	6	542026	542031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_014718	TTC	2	6	542046	542051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602596
11548	NC_014718	GCG	2	6	542086	542091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602596
11549	NC_014718	TGT	3	9	542115	542123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602596
11550	NC_014718	CGA	2	6	542201	542206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_014718	CGC	2	6	542282	542287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602597
11552	NC_014718	TCG	2	6	542290	542295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602597
11553	NC_014718	GAT	2	6	542344	542349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602597
11554	NC_014718	GC	4	8	542554	542561	0 %	0 %	50 %	50 %	312602597
11555	NC_014718	ATA	2	6	542586	542591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602597
11556	NC_014718	CGT	2	6	542615	542620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_014718	GCA	2	6	542749	542754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_014718	TGGAA	2	10	542795	542804	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_014718	CCG	2	6	542833	542838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11560	NC_014718	ATT	2	6	542860	542865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_014718	CAC	2	6	543033	543038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602598
11562	NC_014718	TCGA	2	8	543069	543076	25 %	25 %	25 %	25 %	312602598
11563	NC_014718	CG	4	8	543077	543084	0 %	0 %	50 %	50 %	312602598
11564	NC_014718	A	6	6	543103	543108	100 %	0 %	0 %	0 %	312602598
11565	NC_014718	GCC	2	6	543201	543206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602598
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11568	NC_014718	CAA	2	6	543275	543280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602598
11569	NC_014718	GCC	2	6	543372	543377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11570	NC_014718	GCA	2	6	543467	543472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_014718	ACGGCA	2	12	543475	543486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_014718	GAT	2	6	543513	543518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_014718	CGGCCC	2	12	543535	543546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_014718	ACGG	2	8	543606	543613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_014718	CGT	2	6	543664	543669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_014718	GGC	2	6	543718	543723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_014718	TCG	2	6	543751	543756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_014718	GCG	2	6	543769	543774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_014718	TGG	2	6	543780	543785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_014718	GCT	2	6	543798	543803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602599
11581	NC_014718	CA	3	6	543806	543811	50 %	0 %	0 %	50 %	312602599
11582	NC_014718	GGC	2	6	543881	543886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602599
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11586	NC_014718	AC	3	6	543982	543987	50 %	0 %	0 %	50 %	312602599
11587	NC_014718	CGGCGT	2	12	544000	544011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602599
11588	NC_014718	CCG	2	6	544021	544026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602599
11589	NC_014718	GCA	2	6	544062	544067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_014718	C	6	6	544131	544136	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11591	NC_014718	C	6	6	544179	544184	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11592	NC_014718	GC	3	6	544211	544216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_014718	CG	3	6	544231	544236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_014718	CAG	2	6	544261	544266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_014718	AG	3	6	544265	544270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_014718	AGC	2	6	544356	544361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602600
11597	NC_014718	GTTGC	2	10	544494	544503	0 %	40 %	40 %	20 %	312602600
11598	NC_014718	CGG	2	6	544518	544523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602600
11599	NC_014718	CGG	2	6	544545	544550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602600
11600	NC_014718	GC	3	6	544559	544564	0 %	0 %	50 %	50 %	312602600
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11602	NC_014718	CGC	2	6	544587	544592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602600
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11604	NC_014718	GCAA	2	8	544660	544667	50 %	0 %	25 %	25 %	312602600
11605	NC_014718	CGC	2	6	544721	544726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602600
11606	NC_014718	CG	3	6	544774	544779	0 %	0 %	50 %	50 %	312602600
11607	NC_014718	ACGA	2	8	544789	544796	50 %	0 %	25 %	25 %	312602600
11608	NC_014718	GAAG	2	8	544812	544819	50 %	0 %	50 %	0 %	312602600
11609	NC_014718	GCG	2	6	544859	544864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602600
11610	NC_014718	GCA	2	6	544879	544884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602600
11611	NC_014718	GCG	2	6	544892	544897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602600
11612	NC_014718	ACA	2	6	544904	544909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602600
11613	NC_014718	CCGG	2	8	544927	544934	0 %	0 %	50 %	50 %	312602600
11614	NC_014718	AC	3	6	544952	544957	50 %	0 %	0 %	50 %	312602600
11615	NC_014718	CGT	2	6	545040	545045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602600
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11617	NC_014718	CCG	2	6	545063	545068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602600
11618	NC_014718	GACC	2	8	545114	545121	25 %	0 %	25 %	50 %	312602601
11619	NC_014718	CTG	2	6	545148	545153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602601
11620	NC_014718	GC	4	8	545180	545187	0 %	0 %	50 %	50 %	312602601
11621	NC_014718	GC	3	6	545197	545202	0 %	0 %	50 %	50 %	312602601
11622	NC_014718	CGT	2	6	545207	545212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602601
11623	NC_014718	CGA	2	6	545215	545220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602601
11624	NC_014718	TGC	2	6	545248	545253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602601
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11743	NC_014718	AGCA	2	8	550727	550734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11744	NC_014718	AGGC	2	8	550782	550789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11745	NC_014718	GGCG	2	8	550935	550942	0 %	0 %	75 %	25 %	312602609
11746	NC_014718	GAC	2	6	550956	550961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602609
11747	NC_014718	GGC	2	6	550964	550969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602609
11748	NC_014718	CGA	2	6	551061	551066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602609
11749	NC_014718	GATT	2	8	551145	551152	25 %	50 %	25 %	0 %	312602609
11750	NC_014718	AGCG	2	8	551156	551163	25 %	0 %	50 %	25 %	312602610
11751	NC_014718	G	7	7	551195	551201	0 %	0 %	100 %	0 %	312602610
11752	NC_014718	CGC	2	6	551378	551383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602610
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11758	NC_014718	CGAA	2	8	551744	551751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11759	NC_014718	GGCA	2	8	551755	551762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11760	NC_014718	GCAC	2	8	551800	551807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11761	NC_014718	TGCC	2	8	551860	551867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11762	NC_014718	ATTT	2	8	551878	551885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11763	NC_014718	ACGG	2	8	551912	551919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11764	NC_014718	TGGGTC	2	12	551984	551995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312602611
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11769	NC_014718	TTG	2	6	552261	552266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11770	NC_014718	CGTG	2	8	552274	552281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11771	NC_014718	CGCT	2	8	552282	552289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11772	NC_014718	GCCG	2	8	552332	552339	0 %	0 %	50 %	50 %	312602612
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11784	NC_014718	TCT	2	6	552940	552945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602613
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11800	NC_014718	GC	3	6	553584	553589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11801	NC_014718	CGC	2	6	553650	553655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11805	NC_014718	GCC	2	6	553740	553745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11855	NC_014718	CGGCGC	2	12	555461	555472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11856	NC_014718	CGAAC	2	10	555537	555546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11857	NC_014718	CGACA	2	10	555559	555568	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11858	NC_014718	CG	4	8	555583	555590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11859	NC_014718	TCA	2	6	555623	555628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602617
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11863	NC_014718	GC	4	8	555797	555804	0 %	0 %	50 %	50 %	312602617
11864	NC_014718	TCG	2	6	555805	555810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602617
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11988	NC_014718	ATC	2	6	562238	562243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602629
11989	NC_014718	TC	3	6	562242	562247	0 %	50 %	0 %	50 %	312602629
11990	NC_014718	GAA	2	6	562287	562292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602630
11991	NC_014718	A	6	6	562291	562296	100 %	0 %	0 %	0 %	312602630
11992	NC_014718	CA	3	6	562357	562362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11993	NC_014718	TGC	2	6	562388	562393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_014718	GT	3	6	562401	562406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11995	NC_014718	TGG	2	6	562423	562428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_014718	CAC	3	9	562445	562453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11997	NC_014718	GTT	2	6	562469	562474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_014718	CTT	2	6	562514	562519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602631
11999	NC_014718	CAG	2	6	562520	562525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602631
12000	NC_014718	CTG	2	6	562639	562644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602631

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