MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014718	AGC	2	6	469445	469450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10002	NC_014718	A	6	6	469456	469461	100 %	0 %	0 %	0 %	312602540
10003	NC_014718	GTGTTC	2	12	469462	469473	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312602540
10004	NC_014718	TGAC	2	8	469478	469485	25 %	25 %	25 %	25 %	312602540
10005	NC_014718	CGG	2	6	469528	469533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
10006	NC_014718	CG	3	6	469561	469566	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10007	NC_014718	AGC	2	6	469631	469636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10008	NC_014718	GCA	2	6	469671	469676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10009	NC_014718	GCG	2	6	469677	469682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
10010	NC_014718	GCGCC	2	10	469720	469729	0 %	0 %	40 %	60 %	312602540
10011	NC_014718	GCG	2	6	469754	469759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
10012	NC_014718	CG	3	6	469787	469792	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10013	NC_014718	CAC	2	6	469801	469806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602540
10014	NC_014718	CGAT	2	8	469862	469869	25 %	25 %	25 %	25 %	312602540
10015	NC_014718	CTG	2	6	469872	469877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10016	NC_014718	CAG	2	6	469962	469967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10017	NC_014718	CAG	2	6	469977	469982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10018	NC_014718	GCG	2	6	469994	469999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
10019	NC_014718	GCCAC	2	10	470026	470035	20 %	0 %	20 %	60 %	312602540
10020	NC_014718	AGC	3	9	470086	470094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10021	NC_014718	GC	4	8	470207	470214	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10022	NC_014718	CGC	2	6	470236	470241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602540
10023	NC_014718	TCAA	2	8	470248	470255	50 %	25 %	0 %	25 %	312602540
10024	NC_014718	AAG	2	6	470290	470295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602540
10025	NC_014718	CGC	2	6	470343	470348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602540
10026	NC_014718	CGT	2	6	470352	470357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10027	NC_014718	GCG	2	6	470372	470377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
10028	NC_014718	CAGG	2	8	470501	470508	25 %	0 %	50 %	25 %	312602540
10029	NC_014718	GC	4	8	470522	470529	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10030	NC_014718	CCA	2	6	470573	470578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602540
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10032	NC_014718	CCA	2	6	470860	470865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602540
10033	NC_014718	ACCG	2	8	470877	470884	25 %	0 %	25 %	50 %	312602540
10034	NC_014718	CCGG	2	8	470942	470949	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10035	NC_014718	GTTT	2	8	470967	470974	0 %	75 %	25 %	0 %	312602540
10036	NC_014718	GTC	2	6	470998	471003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10037	NC_014718	GTG	2	6	471010	471015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602540
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10039	NC_014718	AGG	2	6	471051	471056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602540
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10041	NC_014718	TCC	2	6	471102	471107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602540
10042	NC_014718	CAAT	2	8	471110	471117	50 %	25 %	0 %	25 %	312602540
10043	NC_014718	TTGAG	2	10	471121	471130	20 %	40 %	40 %	0 %	312602540
10044	NC_014718	GATC	2	8	471251	471258	25 %	25 %	25 %	25 %	312602540
10045	NC_014718	TTG	2	6	471373	471378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602540
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10049	NC_014718	CGC	2	6	471671	471676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602540
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10051	NC_014718	TGG	2	6	471886	471891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602540
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10053	NC_014718	GCT	2	6	471989	471994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
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10056	NC_014718	CCT	2	6	472100	472105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602540
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10058	NC_014718	CCG	2	6	472163	472168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602540
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10060	NC_014718	CGG	2	6	472263	472268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
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10063	NC_014718	AGC	2	6	472348	472353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602540
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10083	NC_014718	CTG	2	6	473145	473150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
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10106	NC_014718	GGTA	2	8	474342	474349	25 %	25 %	50 %	0 %	312602540
10107	NC_014718	TC	3	6	474464	474469	0 %	50 %	0 %	50 %	312602540
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10121	NC_014718	TCG	2	6	475352	475357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
10122	NC_014718	ATGC	2	8	475358	475365	25 %	25 %	25 %	25 %	312602540
10123	NC_014718	GCC	2	6	475507	475512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602540
10124	NC_014718	CCA	2	6	475577	475582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602540
10125	NC_014718	CAC	2	6	475635	475640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602540
10126	NC_014718	GC	3	6	475646	475651	0 %	0 %	50 %	50 %	312602540
10127	NC_014718	GCG	2	6	475681	475686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602540
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10130	NC_014718	GCT	2	6	475769	475774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
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10132	NC_014718	CCAT	2	8	476002	476009	25 %	25 %	0 %	50 %	312602540
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10134	NC_014718	GCT	2	6	476105	476110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602540
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10142	NC_014718	ACG	2	6	476537	476542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10144	NC_014718	GCG	2	6	476583	476588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_014718	TCA	2	6	476600	476605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10147	NC_014718	CG	3	6	476698	476703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10148	NC_014718	GC	3	6	476711	476716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10149	NC_014718	CAAG	2	8	476737	476744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10150	NC_014718	A	6	6	476752	476757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_014718	GGCGT	2	10	476782	476791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10152	NC_014718	ATG	2	6	477008	477013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602541
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10154	NC_014718	CAAA	2	8	477083	477090	75 %	0 %	0 %	25 %	312602541
10155	NC_014718	GCAC	2	8	477146	477153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10156	NC_014718	CTG	2	6	477164	477169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10159	NC_014718	CAT	2	6	477284	477289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10160	NC_014718	ATC	2	6	477305	477310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_014718	CTG	2	6	477432	477437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602542
10162	NC_014718	CG	3	6	477438	477443	0 %	0 %	50 %	50 %	312602542
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10173	NC_014718	ATT	2	6	477736	477741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10174	NC_014718	GCC	2	6	477768	477773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602543
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10196	NC_014718	AGC	3	9	478554	478562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10203	NC_014718	TGCGCG	2	12	478883	478894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602546
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10210	NC_014718	GCCG	2	8	479197	479204	0 %	0 %	50 %	50 %	312602548
10211	NC_014718	CCGGG	2	10	479233	479242	0 %	0 %	60 %	40 %	312602548
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10224	NC_014718	GGC	2	6	479747	479752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602549
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10226	NC_014718	CAGC	2	8	479812	479819	25 %	0 %	25 %	50 %	312602549
10227	NC_014718	TGCC	2	8	479846	479853	0 %	25 %	25 %	50 %	312602549
10228	NC_014718	TCAG	2	8	480025	480032	25 %	25 %	25 %	25 %	312602549
10229	NC_014718	ATT	2	6	480121	480126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_014718	TAC	2	6	480148	480153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10231	NC_014718	AGA	2	6	480178	480183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_014718	CTT	2	6	480239	480244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_014718	C	6	6	480307	480312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10234	NC_014718	GTCAT	2	10	480444	480453	20 %	40 %	20 %	20 %	312602550
10235	NC_014718	GCA	2	6	480455	480460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602550
10236	NC_014718	TCG	2	6	480540	480545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602550
10237	NC_014718	CGCA	2	8	480546	480553	25 %	0 %	25 %	50 %	312602550
10238	NC_014718	TCG	2	6	480589	480594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602550
10239	NC_014718	CGCGC	2	10	480595	480604	0 %	0 %	40 %	60 %	312602550
10240	NC_014718	CGAT	2	8	480644	480651	25 %	25 %	25 %	25 %	312602550
10241	NC_014718	CG	3	6	480663	480668	0 %	0 %	50 %	50 %	312602550
10242	NC_014718	CGC	2	6	480854	480859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10243	NC_014718	CG	3	6	480938	480943	0 %	0 %	50 %	50 %	312602551
10244	NC_014718	ATG	2	6	481002	481007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602551
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10247	NC_014718	CGC	2	6	481142	481147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602551
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10311	NC_014718	GCA	3	9	483623	483631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602555
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10313	NC_014718	GGC	2	6	483823	483828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602555
10314	NC_014718	A	8	8	483832	483839	100 %	0 %	0 %	0 %	312602555
10315	NC_014718	CATCG	2	10	483858	483867	20 %	20 %	20 %	40 %	312602555
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10318	NC_014718	CG	4	8	483995	484002	0 %	0 %	50 %	50 %	312602555
10319	NC_014718	CCA	2	6	484013	484018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602555
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10322	NC_014718	CG	3	6	484076	484081	0 %	0 %	50 %	50 %	312602555
10323	NC_014718	TCG	2	6	484096	484101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602555
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10326	NC_014718	CTC	2	6	484274	484279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602556
10327	NC_014718	CG	3	6	484300	484305	0 %	0 %	50 %	50 %	312602556
10328	NC_014718	CGC	2	6	484325	484330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602556
10329	NC_014718	TGA	2	6	484360	484365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602556
10330	NC_014718	CGT	2	6	484412	484417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602556
10331	NC_014718	GATT	2	8	484459	484466	25 %	50 %	25 %	0 %	312602556
10332	NC_014718	T	6	6	484486	484491	0 %	100 %	0 %	0 %	312602556
10333	NC_014718	CG	3	6	484501	484506	0 %	0 %	50 %	50 %	312602556
10334	NC_014718	GC	3	6	484580	484585	0 %	0 %	50 %	50 %	312602556
10335	NC_014718	CTT	2	6	484604	484609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602556
10336	NC_014718	TCG	2	6	484629	484634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602556
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10338	NC_014718	CG	3	6	484771	484776	0 %	0 %	50 %	50 %	312602556
10339	NC_014718	GTC	2	6	484796	484801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602556
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10341	NC_014718	CACTT	2	10	484845	484854	20 %	40 %	0 %	40 %	312602556
10342	NC_014718	CCG	2	6	484896	484901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602556
10343	NC_014718	ATC	2	6	485061	485066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602556
10344	NC_014718	CGG	2	6	485072	485077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602556
10345	NC_014718	TCGA	2	8	485085	485092	25 %	25 %	25 %	25 %	312602556
10346	NC_014718	CTTC	2	8	485125	485132	0 %	50 %	0 %	50 %	312602556
10347	NC_014718	GGCC	2	8	485136	485143	0 %	0 %	50 %	50 %	312602556
10348	NC_014718	CTC	2	6	485174	485179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602556
10349	NC_014718	CGC	2	6	485198	485203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602556
10350	NC_014718	CGAG	2	8	485212	485219	25 %	0 %	50 %	25 %	312602556
10351	NC_014718	ATC	2	6	485259	485264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602556
10352	NC_014718	GTCG	2	8	485306	485313	0 %	25 %	50 %	25 %	312602556
10353	NC_014718	ACG	2	6	485317	485322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602556
10354	NC_014718	CGG	2	6	485434	485439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602556
10355	NC_014718	GCC	2	6	485507	485512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602556
10356	NC_014718	ACG	2	6	485527	485532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602556
10357	NC_014718	CGC	2	6	485588	485593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10358	NC_014718	A	6	6	485606	485611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10359	NC_014718	CG	3	6	485696	485701	0 %	0 %	50 %	50 %	312602557
10360	NC_014718	AT	3	6	485759	485764	50 %	50 %	0 %	0 %	312602557
10361	NC_014718	GC	4	8	485809	485816	0 %	0 %	50 %	50 %	312602557
10362	NC_014718	CG	3	6	485875	485880	0 %	0 %	50 %	50 %	312602557
10363	NC_014718	GCCA	2	8	485892	485899	25 %	0 %	25 %	50 %	312602557
10364	NC_014718	ACGTGA	2	12	485981	485992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312602557
10365	NC_014718	CAAC	2	8	486039	486046	50 %	0 %	0 %	50 %	312602557
10366	NC_014718	CGC	2	6	486055	486060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602557
10367	NC_014718	CG	4	8	486137	486144	0 %	0 %	50 %	50 %	312602557
10368	NC_014718	GCCA	2	8	486151	486158	25 %	0 %	25 %	50 %	312602557
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10487	NC_014718	CG	3	6	491822	491827	0 %	0 %	50 %	50 %	312602564
10488	NC_014718	CAT	2	6	491892	491897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602564
10489	NC_014718	CGG	2	6	491936	491941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602564
10490	NC_014718	TGA	2	6	492179	492184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602564
10491	NC_014718	CCG	2	6	492211	492216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602564
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