MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014718	GCA	2	6	332197	332202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602407
7002	NC_014718	GTG	2	6	332247	332252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602407
7003	NC_014718	GAA	2	6	332301	332306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602407
7004	NC_014718	CCGT	2	8	332350	332357	0 %	25 %	25 %	50 %	312602407
7005	NC_014718	TCG	2	6	332405	332410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602407
7006	NC_014718	TC	3	6	332425	332430	0 %	50 %	0 %	50 %	312602407
7007	NC_014718	GCT	2	6	332505	332510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_014718	ATA	2	6	332563	332568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_014718	CCA	2	6	332656	332661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_014718	AGC	2	6	332699	332704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_014718	CCA	2	6	332705	332710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_014718	CG	3	6	332738	332743	0 %	0 %	50 %	50 %	312602408
7013	NC_014718	ATG	2	6	332772	332777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602408
7014	NC_014718	TCGA	2	8	332791	332798	25 %	25 %	25 %	25 %	312602408
7015	NC_014718	ATGCA	2	10	332809	332818	40 %	20 %	20 %	20 %	312602408
7016	NC_014718	GGC	2	6	332845	332850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602408
7017	NC_014718	GCT	2	6	332887	332892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602408
7018	NC_014718	GGC	2	6	332903	332908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602408
7019	NC_014718	GCA	2	6	332926	332931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602408
7020	NC_014718	AGC	2	6	333030	333035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_014718	GCA	2	6	333040	333045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_014718	CGA	2	6	333052	333057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_014718	CG	3	6	333081	333086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_014718	AGCC	2	8	333107	333114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_014718	CAG	2	6	333136	333141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_014718	CA	3	6	333227	333232	50 %	0 %	0 %	50 %	312602409
7027	NC_014718	TGA	2	6	333355	333360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602409
7028	NC_014718	TTCGCC	2	12	333438	333449	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312602409
7029	NC_014718	T	6	6	333489	333494	0 %	100 %	0 %	0 %	312602409
7030	NC_014718	TC	3	6	333529	333534	0 %	50 %	0 %	50 %	312602409
7031	NC_014718	AT	4	8	333604	333611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_014718	TGC	2	6	333634	333639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_014718	TG	3	6	333647	333652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_014718	CCTA	2	8	333653	333660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_014718	A	6	6	333695	333700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_014718	AAG	2	6	333708	333713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_014718	AC	3	6	333768	333773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_014718	TGC	2	6	333969	333974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602410
7039	NC_014718	TGCA	2	8	333996	334003	25 %	25 %	25 %	25 %	312602410
7040	NC_014718	CAA	2	6	334053	334058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602411
7041	NC_014718	GT	3	6	334084	334089	0 %	50 %	50 %	0 %	312602411
7042	NC_014718	GCT	2	6	334118	334123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602411
7043	NC_014718	CCATG	2	10	334180	334189	20 %	20 %	20 %	40 %	312602411
7044	NC_014718	TG	3	6	334221	334226	0 %	50 %	50 %	0 %	312602411
7045	NC_014718	ACC	2	6	334236	334241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602411
7046	NC_014718	GCCA	2	8	334303	334310	25 %	0 %	25 %	50 %	312602411
7047	NC_014718	ATGG	2	8	334331	334338	25 %	25 %	50 %	0 %	312602411
7048	NC_014718	GCT	2	6	334364	334369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602411
7049	NC_014718	CGC	2	6	334393	334398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_014718	GCTTC	2	10	334493	334502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7051	NC_014718	TG	3	6	334587	334592	0 %	50 %	50 %	0 %	312602412
7052	NC_014718	CTG	2	6	334614	334619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602412
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7054	NC_014718	GCC	2	6	334705	334710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602412
7055	NC_014718	CAG	2	6	334721	334726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602412
7056	NC_014718	CAG	2	6	334767	334772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602412
7057	NC_014718	TCG	2	6	334777	334782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602412
7058	NC_014718	CCAA	2	8	334836	334843	50 %	0 %	0 %	50 %	312602412
7059	NC_014718	GTCA	2	8	334858	334865	25 %	25 %	25 %	25 %	312602412
7060	NC_014718	GCT	2	6	334870	334875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602412
7061	NC_014718	GCA	2	6	334909	334914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602412
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7063	NC_014718	CGG	2	6	334998	335003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602412
7064	NC_014718	GCG	2	6	335040	335045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602412
7065	NC_014718	GAG	2	6	335053	335058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602412
7066	NC_014718	TTG	2	6	335098	335103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602412
7067	NC_014718	GCC	3	9	335234	335242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602413
7068	NC_014718	GCC	2	6	335283	335288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602413
7069	NC_014718	TCA	2	6	335292	335297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602413
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7071	NC_014718	CAC	2	6	335464	335469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602413
7072	NC_014718	CAGCG	2	10	335516	335525	20 %	0 %	40 %	40 %	312602413
7073	NC_014718	GCA	2	6	335595	335600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602413
7074	NC_014718	AGCC	2	8	335756	335763	25 %	0 %	25 %	50 %	312602413
7075	NC_014718	TCC	2	6	335853	335858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_014718	GTG	2	6	335901	335906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_014718	CCG	2	6	335938	335943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_014718	TCAA	2	8	336027	336034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7079	NC_014718	GTC	2	6	336076	336081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602414
7080	NC_014718	CG	3	6	336160	336165	0 %	0 %	50 %	50 %	312602414
7081	NC_014718	GC	3	6	336191	336196	0 %	0 %	50 %	50 %	312602414
7082	NC_014718	GC	3	6	336236	336241	0 %	0 %	50 %	50 %	312602415
7083	NC_014718	GATCT	2	10	336258	336267	20 %	40 %	20 %	20 %	312602415
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7087	NC_014718	GCGT	2	8	336468	336475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_014718	ACTG	2	8	336498	336505	25 %	25 %	25 %	25 %	312602417
7089	NC_014718	GC	3	6	336650	336655	0 %	0 %	50 %	50 %	312602417
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7092	NC_014718	GC	3	6	336681	336686	0 %	0 %	50 %	50 %	312602417
7093	NC_014718	GC	3	6	336702	336707	0 %	0 %	50 %	50 %	312602417
7094	NC_014718	CCCG	2	8	336739	336746	0 %	0 %	25 %	75 %	312602417
7095	NC_014718	GC	3	6	336800	336805	0 %	0 %	50 %	50 %	312602417
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7098	NC_014718	GAT	2	6	337034	337039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602417
7099	NC_014718	TTG	2	6	337151	337156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602417
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7102	NC_014718	TGC	2	6	337271	337276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602417
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7104	NC_014718	AGCC	2	8	337391	337398	25 %	0 %	25 %	50 %	312602417
7105	NC_014718	GC	3	6	337420	337425	0 %	0 %	50 %	50 %	312602417
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7109	NC_014718	CG	3	6	337713	337718	0 %	0 %	50 %	50 %	312602418
7110	NC_014718	CGC	2	6	337758	337763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602418
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7118	NC_014718	TTGC	2	8	338161	338168	0 %	50 %	25 %	25 %	312602419
7119	NC_014718	GGCT	2	8	338250	338257	0 %	25 %	50 %	25 %	312602420
7120	NC_014718	GGC	2	6	338376	338381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602420
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7122	NC_014718	CTG	2	6	338412	338417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602420
7123	NC_014718	CGCTG	2	10	338488	338497	0 %	20 %	40 %	40 %	312602420
7124	NC_014718	GTG	2	6	338544	338549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602420
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7126	NC_014718	TGA	2	6	338716	338721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602420
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7156	NC_014718	CG	3	6	339881	339886	0 %	0 %	50 %	50 %	312602423
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7249	NC_014718	CGT	2	6	344992	344997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602430
7250	NC_014718	CCA	2	6	345003	345008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602430
7251	NC_014718	GAC	2	6	345055	345060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602430
7252	NC_014718	GGGAA	2	10	345169	345178	40 %	0 %	60 %	0 %	312602430
7253	NC_014718	CCA	2	6	345237	345242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602430
7254	NC_014718	GCC	2	6	345258	345263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602430
7255	NC_014718	CGC	2	6	345296	345301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602430
7256	NC_014718	TCGCC	2	10	345343	345352	0 %	20 %	20 %	60 %	312602430
7257	NC_014718	GGC	2	6	345402	345407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602430
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7260	NC_014718	CG	3	6	345706	345711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7261	NC_014718	AGGC	2	8	345730	345737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7262	NC_014718	CGG	2	6	345741	345746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7263	NC_014718	T	7	7	345756	345762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7264	NC_014718	GTG	2	6	345778	345783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7265	NC_014718	CAA	2	6	345784	345789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7266	NC_014718	CAG	2	6	345812	345817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7270	NC_014718	CTA	2	6	346054	346059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602431
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7272	NC_014718	TCCGTA	2	12	346259	346270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312602432
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7283	NC_014718	ATC	2	6	346802	346807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602432
7284	NC_014718	TGC	2	6	346861	346866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7287	NC_014718	CG	3	6	347191	347196	0 %	0 %	50 %	50 %	312602433
7288	NC_014718	CGT	2	6	347224	347229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602433
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7307	NC_014718	TCC	2	6	347880	347885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7308	NC_014718	GCG	2	6	347973	347978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7309	NC_014718	AGCGC	2	10	348176	348185	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7310	NC_014718	CG	3	6	348189	348194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7311	NC_014718	CAG	2	6	348311	348316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602435
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7316	NC_014718	A	6	6	348512	348517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7317	NC_014718	ATG	2	6	348524	348529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7352	NC_014718	T	6	6	350812	350817	0 %	100 %	0 %	0 %	312602440
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7361	NC_014718	TCC	2	6	351310	351315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602440
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7363	NC_014718	CGTTGA	2	12	351335	351346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312602440
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7366	NC_014718	TCA	2	6	351535	351540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602440
7367	NC_014718	A	6	6	351559	351564	100 %	0 %	0 %	0 %	312602440
7368	NC_014718	CAAA	2	8	351582	351589	75 %	0 %	0 %	25 %	312602440
7369	NC_014718	A	6	6	351587	351592	100 %	0 %	0 %	0 %	312602440
7370	NC_014718	TAA	2	6	351716	351721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602440
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7372	NC_014718	CGC	2	6	351793	351798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602440
7373	NC_014718	ATA	2	6	351836	351841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602440
7374	NC_014718	AAT	2	6	351964	351969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602440
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7385	NC_014718	TCAA	2	8	352320	352327	50 %	25 %	0 %	25 %	312602442
7386	NC_014718	CGT	2	6	352354	352359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602442
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7394	NC_014718	CGA	2	6	352917	352922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602444
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7437	NC_014718	GCCT	2	8	355986	355993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7475	NC_014718	CTA	2	6	358502	358507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602450
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7479	NC_014718	GGCA	2	8	358671	358678	25 %	0 %	50 %	25 %	312602451
7480	NC_014718	TGGC	2	8	358762	358769	0 %	25 %	50 %	25 %	312602451
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7484	NC_014718	GCCG	3	12	359003	359014	0 %	0 %	50 %	50 %	312602452
7485	NC_014718	TCG	2	6	359174	359179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7486	NC_014718	CCG	2	6	359439	359444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7487	NC_014718	GGCC	2	8	359450	359457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7488	NC_014718	GC	3	6	359469	359474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7489	NC_014718	GCC	2	6	359682	359687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602453
7490	NC_014718	TGCG	2	8	359741	359748	0 %	25 %	50 %	25 %	312602453
7491	NC_014718	TTG	2	6	359750	359755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602453
7492	NC_014718	TGCT	2	8	359843	359850	0 %	50 %	25 %	25 %	312602453
7493	NC_014718	GCC	2	6	359922	359927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602453
7494	NC_014718	AAC	2	6	359948	359953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602453
7495	NC_014718	GTT	2	6	360072	360077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602453
7496	NC_014718	GCG	2	6	360138	360143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602453
7497	NC_014718	CAT	2	6	360147	360152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602453
7498	NC_014718	GCTA	2	8	360169	360176	25 %	25 %	25 %	25 %	312602453
7499	NC_014718	CAA	2	6	360229	360234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602453
7500	NC_014718	TGC	2	6	360254	360259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602453

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