MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014718	CATC	2	8	308525	308532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_014718	GTGA	2	8	308535	308542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_014718	ATA	2	6	308614	308619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_014718	CAT	2	6	308630	308635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_014718	GCGTT	2	10	308671	308680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6506	NC_014718	TAAA	2	8	308795	308802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_014718	GA	3	6	308914	308919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_014718	GCT	2	6	308967	308972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_014718	GCA	2	6	309063	309068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6510	NC_014718	ACA	2	6	309092	309097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602378
6511	NC_014718	GAT	2	6	309208	309213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602378
6512	NC_014718	CAG	2	6	309322	309327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6513	NC_014718	T	6	6	309353	309358	0 %	100 %	0 %	0 %	312602378
6514	NC_014718	GTT	2	6	309366	309371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6515	NC_014718	ATGG	2	8	309424	309431	25 %	25 %	50 %	0 %	312602378
6516	NC_014718	TG	3	6	309482	309487	0 %	50 %	50 %	0 %	312602378
6517	NC_014718	CGGG	2	8	309488	309495	0 %	0 %	75 %	25 %	312602378
6518	NC_014718	GGTTC	2	10	309517	309526	0 %	40 %	40 %	20 %	312602378
6519	NC_014718	ACG	2	6	309625	309630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6520	NC_014718	GTG	2	6	309793	309798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6521	NC_014718	GTC	2	6	309903	309908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6522	NC_014718	TAC	2	6	309911	309916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602378
6523	NC_014718	GCG	2	6	309975	309980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602378
6524	NC_014718	GCC	2	6	309993	309998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602378
6525	NC_014718	CAG	2	6	310187	310192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6526	NC_014718	GTTCG	2	10	310222	310231	0 %	40 %	40 %	20 %	312602378
6527	NC_014718	GGA	2	6	310290	310295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602378
6528	NC_014718	GCA	2	6	310329	310334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6529	NC_014718	CCA	2	6	310347	310352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602378
6530	NC_014718	CCA	2	6	310359	310364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602378
6531	NC_014718	TG	3	6	310519	310524	0 %	50 %	50 %	0 %	312602378
6532	NC_014718	CTG	2	6	310552	310557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6533	NC_014718	GCG	2	6	310639	310644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602378
6534	NC_014718	AC	3	6	310727	310732	50 %	0 %	0 %	50 %	312602378
6535	NC_014718	CGA	2	6	310940	310945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6536	NC_014718	TTG	2	6	310966	310971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6537	NC_014718	TGT	2	6	311135	311140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6538	NC_014718	GGA	2	6	311143	311148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602378
6539	NC_014718	AGC	2	6	311151	311156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6540	NC_014718	AAAGC	2	10	311188	311197	60 %	0 %	20 %	20 %	312602378
6541	NC_014718	GCA	2	6	311199	311204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6542	NC_014718	GGCC	2	8	311296	311303	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6543	NC_014718	ATCT	2	8	311320	311327	25 %	50 %	0 %	25 %	312602378
6544	NC_014718	TGG	2	6	311382	311387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6545	NC_014718	GT	3	6	311443	311448	0 %	50 %	50 %	0 %	312602378
6546	NC_014718	CGTT	2	8	311453	311460	0 %	50 %	25 %	25 %	312602378
6547	NC_014718	TGG	2	6	311681	311686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6548	NC_014718	CGG	2	6	311815	311820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602378
6549	NC_014718	GAC	2	6	311889	311894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6550	NC_014718	GCT	2	6	311916	311921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6551	NC_014718	AGA	2	6	311930	311935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602378
6552	NC_014718	GTC	2	6	311939	311944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6553	NC_014718	TTC	2	6	311953	311958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602378
6554	NC_014718	GCT	2	6	311976	311981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6555	NC_014718	GTT	2	6	312039	312044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6556	NC_014718	AC	3	6	312047	312052	50 %	0 %	0 %	50 %	312602378
6557	NC_014718	GTG	3	9	312097	312105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6558	NC_014718	ATCGT	2	10	312188	312197	20 %	40 %	20 %	20 %	312602378
6559	NC_014718	CCA	2	6	312273	312278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602378
6560	NC_014718	CG	3	6	312335	312340	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6561	NC_014718	CAG	2	6	312370	312375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6562	NC_014718	GGT	2	6	312441	312446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6563	NC_014718	GCT	2	6	312459	312464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6564	NC_014718	GCA	2	6	312522	312527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6565	NC_014718	CA	3	6	312541	312546	50 %	0 %	0 %	50 %	312602378
6566	NC_014718	TGC	2	6	312572	312577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6567	NC_014718	GCTG	2	8	312608	312615	0 %	25 %	50 %	25 %	312602378
6568	NC_014718	GTT	2	6	312624	312629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6569	NC_014718	GATC	2	8	312642	312649	25 %	25 %	25 %	25 %	312602378
6570	NC_014718	GCG	2	6	312718	312723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602378
6571	NC_014718	TGG	2	6	312740	312745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6572	NC_014718	TTC	2	6	312787	312792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602378
6573	NC_014718	AGC	2	6	312797	312802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6574	NC_014718	GAG	2	6	312814	312819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602378
6575	NC_014718	GTTTG	2	10	312831	312840	0 %	60 %	40 %	0 %	312602378
6576	NC_014718	AGG	2	6	312883	312888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602378
6577	NC_014718	ACGC	2	8	312919	312926	25 %	0 %	25 %	50 %	312602378
6578	NC_014718	GC	3	6	312985	312990	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6579	NC_014718	GGT	2	6	313008	313013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6580	NC_014718	GTT	2	6	313074	313079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
6581	NC_014718	GC	3	6	313134	313139	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6582	NC_014718	GGCT	2	8	313151	313158	0 %	25 %	50 %	25 %	312602378
6583	NC_014718	GCT	2	6	313161	313166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6584	NC_014718	CGCTGG	2	12	313184	313195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602378
6585	NC_014718	GCT	2	6	313242	313247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6586	NC_014718	GCT	2	6	313305	313310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6587	NC_014718	TGA	2	6	313353	313358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602378
6588	NC_014718	GCA	2	6	313431	313436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6589	NC_014718	GAA	2	6	313513	313518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602378
6590	NC_014718	TGC	2	6	313526	313531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6591	NC_014718	CAA	2	6	313552	313557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602378
6592	NC_014718	GC	3	6	313640	313645	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6593	NC_014718	CCG	2	6	313671	313676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602378
6594	NC_014718	GTG	2	6	313729	313734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6595	NC_014718	TGG	3	9	313763	313771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6596	NC_014718	G	7	7	313795	313801	0 %	0 %	100 %	0 %	312602378
6597	NC_014718	GGA	2	6	313854	313859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602378
6598	NC_014718	GCC	2	6	313908	313913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602378
6599	NC_014718	GCGT	2	8	313928	313935	0 %	25 %	50 %	25 %	312602378
6600	NC_014718	GCAA	2	8	313984	313991	50 %	0 %	25 %	25 %	312602378
6601	NC_014718	TGA	2	6	314057	314062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602378
6602	NC_014718	GTG	2	6	314072	314077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6603	NC_014718	ATT	2	6	314084	314089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602378
6604	NC_014718	GTC	2	6	314131	314136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6605	NC_014718	TTTG	2	8	314178	314185	0 %	75 %	25 %	0 %	312602378
6606	NC_014718	GC	3	6	314203	314208	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6607	NC_014718	GTG	2	6	314209	314214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6608	NC_014718	GTAT	2	8	314250	314257	25 %	50 %	25 %	0 %	312602378
6609	NC_014718	GCT	2	6	314329	314334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6610	NC_014718	TCAGG	2	10	314433	314442	20 %	20 %	40 %	20 %	312602378
6611	NC_014718	GTG	2	6	314443	314448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6612	NC_014718	CCGA	2	8	314461	314468	25 %	0 %	25 %	50 %	312602378
6613	NC_014718	GCA	2	6	314505	314510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6614	NC_014718	GGCC	2	8	314530	314537	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
6615	NC_014718	AC	4	8	314567	314574	50 %	0 %	0 %	50 %	312602378
6616	NC_014718	TGG	2	6	314616	314621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
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6618	NC_014718	TGG	2	6	314903	314908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6619	NC_014718	TGG	2	6	314915	314920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
6620	NC_014718	GCA	2	6	314965	314970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6621	NC_014718	AT	3	6	314982	314987	50 %	50 %	0 %	0 %	312602378
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6623	NC_014718	GCT	2	6	315150	315155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6624	NC_014718	ACG	2	6	315179	315184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
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6626	NC_014718	TGGG	2	8	315197	315204	0 %	25 %	75 %	0 %	312602378
6627	NC_014718	GCT	2	6	315210	315215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602378
6628	NC_014718	TGA	2	6	315227	315232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602378
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6630	NC_014718	GTT	2	6	315273	315278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602378
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6647	NC_014718	GC	3	6	315811	315816	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
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6653	NC_014718	GCA	2	6	316020	316025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
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6690	NC_014718	GCA	2	6	318271	318276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602380
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6702	NC_014718	GGCGAT	2	12	318712	318723	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312602380
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6709	NC_014718	CGGT	2	8	319045	319052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6710	NC_014718	TGC	2	6	319109	319114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602382
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6717	NC_014718	ACAA	2	8	319433	319440	75 %	0 %	0 %	25 %	312602383
6718	NC_014718	AAG	2	6	319478	319483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602383
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6731	NC_014718	GGAC	2	8	319980	319987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6732	NC_014718	CGC	2	6	320000	320005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6733	NC_014718	ACG	2	6	320011	320016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
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6736	NC_014718	GCA	2	6	320263	320268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
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6738	NC_014718	CAG	2	6	320352	320357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
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6740	NC_014718	CGA	2	6	320399	320404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6741	NC_014718	GCTGGC	2	12	320433	320444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602385
6742	NC_014718	CGC	2	6	320451	320456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602385
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6744	NC_014718	TGC	2	6	320518	320523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602385
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6995	NC_014718	CGC	2	6	331932	331937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602407
6996	NC_014718	ACG	2	6	331978	331983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602407
6997	NC_014718	ATTG	2	8	332009	332016	25 %	50 %	25 %	0 %	312602407
6998	NC_014718	CAA	2	6	332099	332104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602407
6999	NC_014718	GGC	2	6	332139	332144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602407
7000	NC_014718	CGT	2	6	332156	332161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602407

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