MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014638	GGT	2	6	677374	677379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063949
16003	NC_014638	CCA	2	6	677421	677426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063949
16004	NC_014638	AAGGC	2	10	677433	677442	40 %	0 %	40 %	20 %	311063949
16005	NC_014638	TGC	2	6	677472	677477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16006	NC_014638	GGCG	2	8	677515	677522	0 %	0 %	75 %	25 %	311063949
16007	NC_014638	GCG	2	6	677623	677628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063949
16008	NC_014638	GGA	2	6	677914	677919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063949
16009	NC_014638	CAT	2	6	677935	677940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063949
16010	NC_014638	ACG	2	6	677997	678002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16011	NC_014638	GAG	2	6	678026	678031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063949
16012	NC_014638	CG	3	6	678036	678041	0 %	0 %	50 %	50 %	311063949
16013	NC_014638	TCG	2	6	678042	678047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16014	NC_014638	CAA	2	6	678052	678057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063949
16015	NC_014638	GGC	2	6	678094	678099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063949
16016	NC_014638	CCG	2	6	678126	678131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063949
16017	NC_014638	GAC	2	6	678149	678154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16018	NC_014638	CTG	2	6	678155	678160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16019	NC_014638	TGC	2	6	678177	678182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16020	NC_014638	GCT	2	6	678208	678213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16021	NC_014638	ACG	2	6	678219	678224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16022	NC_014638	GCT	2	6	678232	678237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
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16024	NC_014638	CGC	2	6	678325	678330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063949
16025	NC_014638	TCG	2	6	678336	678341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063949
16026	NC_014638	CGAT	2	8	678348	678355	25 %	25 %	25 %	25 %	311063949
16027	NC_014638	GACG	2	8	678358	678365	25 %	0 %	50 %	25 %	311063949
16028	NC_014638	ATG	2	6	678396	678401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063949
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16030	NC_014638	TCA	2	6	678517	678522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_014638	GT	3	6	678539	678544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_014638	AG	3	6	678584	678589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_014638	TGG	2	6	678602	678607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063950
16034	NC_014638	TCG	2	6	678638	678643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063950
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16044	NC_014638	ACCA	2	8	679027	679034	50 %	0 %	0 %	50 %	311063950
16045	NC_014638	CAG	2	6	679090	679095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063950
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16050	NC_014638	CCA	2	6	679257	679262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063950
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16053	NC_014638	CGCCAT	2	12	679317	679328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311063950
16054	NC_014638	CAT	2	6	679341	679346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063950
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16057	NC_014638	GATT	2	8	679569	679576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_014638	CGG	2	6	679664	679669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_014638	C	6	6	679683	679688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16060	NC_014638	GGT	2	6	679721	679726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_014638	TCC	2	6	679745	679750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_014638	GC	3	6	679792	679797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_014638	TGT	2	6	679824	679829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_014638	TCG	2	6	679858	679863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_014638	GCAG	2	8	679907	679914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16101	NC_014638	TGGGT	2	10	680903	680912	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_014638	ACCCA	2	10	680935	680944	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16103	NC_014638	CG	3	6	680959	680964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16104	NC_014638	GCA	2	6	681015	681020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063952
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16116	NC_014638	TTCG	2	8	681763	681770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16117	NC_014638	GTT	2	6	681817	681822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_014638	AGG	2	6	681844	681849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_014638	ATG	2	6	681855	681860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_014638	GTC	2	6	681901	681906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_014638	ATG	2	6	681907	681912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_014638	CGA	2	6	682025	682030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_014638	GAT	2	6	682103	682108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063953
16124	NC_014638	CTG	2	6	682116	682121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063953
16125	NC_014638	CTG	2	6	682140	682145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063953
16126	NC_014638	GAT	2	6	682275	682280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063953
16127	NC_014638	GCA	2	6	682325	682330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063953
16128	NC_014638	CTT	2	6	682402	682407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_014638	CCG	2	6	682417	682422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16130	NC_014638	CTG	2	6	682446	682451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_014638	TGA	2	6	682552	682557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063954
16132	NC_014638	TCG	2	6	682570	682575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063954
16133	NC_014638	GT	4	8	682581	682588	0 %	50 %	50 %	0 %	311063954
16134	NC_014638	CAC	2	6	682609	682614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063954
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16139	NC_014638	TGAAG	2	10	682977	682986	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16140	NC_014638	CTGG	2	8	683267	683274	0 %	25 %	50 %	25 %	311063955
16141	NC_014638	GA	3	6	683324	683329	50 %	0 %	50 %	0 %	311063955
16142	NC_014638	GATGTT	2	12	683339	683350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	311063955
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16157	NC_014638	GAT	2	6	684074	684079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063955
16158	NC_014638	CCA	2	6	684097	684102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063955
16159	NC_014638	AG	3	6	684391	684396	50 %	0 %	50 %	0 %	311063955
16160	NC_014638	TACC	2	8	684409	684416	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16161	NC_014638	GCC	2	6	684505	684510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063956
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16164	NC_014638	TCCG	2	8	684747	684754	0 %	25 %	25 %	50 %	311063956
16165	NC_014638	CGA	2	6	684824	684829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063956
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16201	NC_014638	GC	3	6	686380	686385	0 %	0 %	50 %	50 %	311063956
16202	NC_014638	GC	3	6	686497	686502	0 %	0 %	50 %	50 %	311063956
16203	NC_014638	TGG	2	6	686528	686533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063956
16204	NC_014638	TGGG	2	8	686557	686564	0 %	25 %	75 %	0 %	311063956
16205	NC_014638	GCCG	2	8	686577	686584	0 %	0 %	50 %	50 %	311063956
16206	NC_014638	TC	3	6	686707	686712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16207	NC_014638	GGA	2	6	686802	686807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16208	NC_014638	A	6	6	686828	686833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16209	NC_014638	GTG	2	6	686871	686876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16210	NC_014638	AGG	2	6	686902	686907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16211	NC_014638	GAC	2	6	686921	686926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063957
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16221	NC_014638	CCAG	2	8	687444	687451	25 %	0 %	25 %	50 %	311063958
16222	NC_014638	GGCC	2	8	687534	687541	0 %	0 %	50 %	50 %	311063958
16223	NC_014638	GCCGC	2	10	687562	687571	0 %	0 %	40 %	60 %	311063958
16224	NC_014638	CGC	2	6	687672	687677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063958
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16226	NC_014638	ATCG	2	8	687715	687722	25 %	25 %	25 %	25 %	311063958
16227	NC_014638	ACG	2	6	687800	687805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063958
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16229	NC_014638	CAGC	2	8	687831	687838	25 %	0 %	25 %	50 %	311063958
16230	NC_014638	GGA	2	6	687909	687914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063958
16231	NC_014638	CG	3	6	687955	687960	0 %	0 %	50 %	50 %	311063958
16232	NC_014638	GAC	2	6	687972	687977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063958
16233	NC_014638	TCG	2	6	687998	688003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063958
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16237	NC_014638	TGG	2	6	688151	688156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063958
16238	NC_014638	AAGAC	2	10	688178	688187	60 %	0 %	20 %	20 %	311063958
16239	NC_014638	GCCG	2	8	688227	688234	0 %	0 %	50 %	50 %	311063958
16240	NC_014638	CGA	2	6	688251	688256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063958
16241	NC_014638	TTC	2	6	688267	688272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063958
16242	NC_014638	CG	3	6	688283	688288	0 %	0 %	50 %	50 %	311063958
16243	NC_014638	GGCCG	2	10	688299	688308	0 %	0 %	60 %	40 %	311063958
16244	NC_014638	GCG	2	6	688352	688357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063958
16245	NC_014638	CTGC	2	8	688375	688382	0 %	25 %	25 %	50 %	311063958
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16247	NC_014638	CGG	2	6	688470	688475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063958
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16252	NC_014638	CGG	2	6	688582	688587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063959
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16300	NC_014638	GGT	2	6	690535	690540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063960
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16303	NC_014638	TCG	2	6	690618	690623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063960
16304	NC_014638	CGG	2	6	690645	690650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063960
16305	NC_014638	CGG	2	6	690703	690708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063960
16306	NC_014638	CGG	2	6	690833	690838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16307	NC_014638	GAA	2	6	690860	690865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16308	NC_014638	CAGT	2	8	690884	690891	25 %	25 %	25 %	25 %	311063961
16309	NC_014638	CG	3	6	690900	690905	0 %	0 %	50 %	50 %	311063961
16310	NC_014638	CTTCG	2	10	690960	690969	0 %	40 %	20 %	40 %	311063961
16311	NC_014638	CGTCAC	2	12	690972	690983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311063961
16312	NC_014638	GAC	2	6	690994	690999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063961
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16314	NC_014638	GGCCCG	2	12	691068	691079	0 %	0 %	50 %	50 %	311063961
16315	NC_014638	CGCTG	2	10	691089	691098	0 %	20 %	40 %	40 %	311063961
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16317	NC_014638	CTG	2	6	691144	691149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063961
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16325	NC_014638	GGC	2	6	691576	691581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063961
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16327	NC_014638	GAG	2	6	691618	691623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063961
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16339	NC_014638	ACA	2	6	692150	692155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063962
16340	NC_014638	CGC	2	6	692234	692239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063962
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16344	NC_014638	CTG	2	6	692325	692330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063962
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16347	NC_014638	GAGC	2	8	692443	692450	25 %	0 %	50 %	25 %	311063962
16348	NC_014638	GA	3	6	692458	692463	50 %	0 %	50 %	0 %	311063962
16349	NC_014638	CGT	2	6	692501	692506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16350	NC_014638	CGA	2	6	692621	692626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16351	NC_014638	GGC	2	6	692636	692641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063962
16352	NC_014638	C	6	6	692647	692652	0 %	0 %	0 %	100 %	311063962
16353	NC_014638	CGA	2	6	692693	692698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16354	NC_014638	CGC	2	6	692720	692725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063962
16355	NC_014638	CGA	2	6	692768	692773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16356	NC_014638	GCAC	2	8	692845	692852	25 %	0 %	25 %	50 %	311063962
16357	NC_014638	TGA	2	6	692857	692862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063962
16358	NC_014638	CGC	2	6	692870	692875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063962
16359	NC_014638	CTG	2	6	692892	692897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16360	NC_014638	CCGCA	2	10	692952	692961	20 %	0 %	20 %	60 %	311063962
16361	NC_014638	CGGCG	2	10	692979	692988	0 %	0 %	60 %	40 %	311063962
16362	NC_014638	GAT	2	6	693009	693014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063962
16363	NC_014638	CCGTA	2	10	693087	693096	20 %	20 %	20 %	40 %	311063962
16364	NC_014638	CGGC	2	8	693169	693176	0 %	0 %	50 %	50 %	311063962
16365	NC_014638	GC	3	6	693253	693258	0 %	0 %	50 %	50 %	311063962
16366	NC_014638	GCG	2	6	693263	693268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063962
16367	NC_014638	GAC	2	6	693270	693275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16368	NC_014638	GAC	2	6	693360	693365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16369	NC_014638	TGC	2	6	693373	693378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16370	NC_014638	GAC	2	6	693425	693430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063962
16371	NC_014638	CGGA	2	8	693433	693440	25 %	0 %	50 %	25 %	311063962
16372	NC_014638	GCG	2	6	693636	693641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063963
16373	NC_014638	G	6	6	693672	693677	0 %	0 %	100 %	0 %	311063963
16374	NC_014638	TCCC	2	8	693715	693722	0 %	25 %	0 %	75 %	311063963
16375	NC_014638	CGA	2	6	693778	693783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063963
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16377	NC_014638	ATC	2	6	693884	693889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063963
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16387	NC_014638	CTG	2	6	694201	694206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063963
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16390	NC_014638	CGC	2	6	694303	694308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063963
16391	NC_014638	CA	4	8	694321	694328	50 %	0 %	0 %	50 %	311063963
16392	NC_014638	CAT	3	9	694342	694350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063963
16393	NC_014638	CGG	2	6	694351	694356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063963
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16399	NC_014638	TGA	2	6	694533	694538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063963
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16401	NC_014638	GCGTG	2	10	694615	694624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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16430	NC_014638	CGG	2	6	695646	695651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063964
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16434	NC_014638	CGA	2	6	695726	695731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063964
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16475	NC_014638	GGC	3	9	697378	697386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063965
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