MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014638	CAA	2	6	427347	427352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063778
10002	NC_014638	GCT	2	6	427383	427388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063778
10003	NC_014638	CGA	2	6	427401	427406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063778
10004	NC_014638	TCG	2	6	427513	427518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063779
10005	NC_014638	CGT	2	6	427563	427568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063779
10006	NC_014638	CCGA	2	8	427599	427606	25 %	0 %	25 %	50 %	311063779
10007	NC_014638	CCG	2	6	427636	427641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063779
10008	NC_014638	ATC	2	6	427668	427673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063779
10009	NC_014638	AGC	2	6	427675	427680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063779
10010	NC_014638	CAA	2	6	427682	427687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063779
10011	NC_014638	GCT	2	6	427688	427693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063779
10012	NC_014638	TCA	2	6	427753	427758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063779
10013	NC_014638	GGC	2	6	427763	427768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063779
10014	NC_014638	GCT	2	6	427889	427894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063779
10015	NC_014638	CG	3	6	427954	427959	0 %	0 %	50 %	50 %	311063779
10016	NC_014638	CGGG	2	8	428045	428052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10017	NC_014638	CCCG	2	8	428059	428066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10018	NC_014638	GTTTTT	2	12	428067	428078	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_014638	GCA	2	6	428097	428102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_014638	CG	3	6	428106	428111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_014638	GAA	2	6	428128	428133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_014638	TGG	2	6	428191	428196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014638	TACGA	2	10	428326	428335	40 %	20 %	20 %	20 %	311063780
10024	NC_014638	CGA	2	6	428367	428372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063780
10025	NC_014638	GTG	2	6	428428	428433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063780
10026	NC_014638	GCCTC	2	10	428471	428480	0 %	20 %	20 %	60 %	311063780
10027	NC_014638	ATG	2	6	428489	428494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063780
10028	NC_014638	CGC	2	6	428496	428501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063780
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10030	NC_014638	CGCA	2	8	428575	428582	25 %	0 %	25 %	50 %	311063780
10031	NC_014638	TCG	2	6	428603	428608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063780
10032	NC_014638	CGA	3	9	428619	428627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063780
10033	NC_014638	CGA	2	6	428637	428642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063780
10034	NC_014638	CCG	3	9	428645	428653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063780
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10038	NC_014638	TAC	2	6	428800	428805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063780
10039	NC_014638	CGC	2	6	428810	428815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063780
10040	NC_014638	CCG	2	6	428880	428885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063780
10041	NC_014638	GAAGA	2	10	428911	428920	60 %	0 %	40 %	0 %	311063780
10042	NC_014638	TTC	2	6	428962	428967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063780
10043	NC_014638	CA	4	8	428982	428989	50 %	0 %	0 %	50 %	311063780
10044	NC_014638	GGT	2	6	429003	429008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063780
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10050	NC_014638	GGC	2	6	429514	429519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063781
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10052	NC_014638	GGC	2	6	429610	429615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063781
10053	NC_014638	CGC	2	6	429639	429644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063781
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10056	NC_014638	GTG	2	6	429716	429721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063781
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10072	NC_014638	TCA	2	6	430362	430367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063781
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10081	NC_014638	CG	3	6	430701	430706	0 %	0 %	50 %	50 %	311063782
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10094	NC_014638	GTCG	2	8	431089	431096	0 %	25 %	50 %	25 %	311063782
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10102	NC_014638	TCG	3	9	431410	431418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063783
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10111	NC_014638	GGCG	2	8	431816	431823	0 %	0 %	75 %	25 %	311063783
10112	NC_014638	GC	3	6	431882	431887	0 %	0 %	50 %	50 %	311063783
10113	NC_014638	GC	3	6	431889	431894	0 %	0 %	50 %	50 %	311063783
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10117	NC_014638	CCG	2	6	432131	432136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_014638	TCA	2	6	432222	432227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063784
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10120	NC_014638	GCGA	2	8	432329	432336	25 %	0 %	50 %	25 %	311063784
10121	NC_014638	CCG	2	6	432345	432350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063784
10122	NC_014638	GCA	2	6	432438	432443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063784
10123	NC_014638	CCA	2	6	432489	432494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063784
10124	NC_014638	GCA	2	6	432534	432539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063784
10125	NC_014638	ATC	2	6	432587	432592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063784
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10127	NC_014638	GCA	2	6	432759	432764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063784
10128	NC_014638	CGT	2	6	432769	432774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063784
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10131	NC_014638	CGC	2	6	432952	432957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063784
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10139	NC_014638	CGA	2	6	433149	433154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063784
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10142	NC_014638	GCC	2	6	433454	433459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10143	NC_014638	TGA	2	6	433467	433472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10145	NC_014638	GTT	2	6	433564	433569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10147	NC_014638	GTTT	2	8	433587	433594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_014638	TGA	3	9	433676	433684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10193	NC_014638	C	11	11	435757	435767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10227	NC_014638	GACC	2	8	436710	436717	25 %	0 %	25 %	50 %	311063786
10228	NC_014638	TCT	2	6	436758	436763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063786
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10231	NC_014638	CTG	2	6	436903	436908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063786
10232	NC_014638	CGG	2	6	436911	436916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063786
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10238	NC_014638	CGG	2	6	437099	437104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063787
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10287	NC_014638	GGC	2	6	439386	439391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10288	NC_014638	CCGATA	2	12	439420	439431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10291	NC_014638	CTG	2	6	439669	439674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063789
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10341	NC_014638	CAG	2	6	441469	441474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063791
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10354	NC_014638	GTC	2	6	442072	442077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063791
10355	NC_014638	TGGTC	2	10	442086	442095	0 %	40 %	40 %	20 %	311063791
10356	NC_014638	GCA	2	6	442233	442238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063791
10357	NC_014638	GAC	2	6	442258	442263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063791
10358	NC_014638	ATG	2	6	442265	442270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063791
10359	NC_014638	CCGGCG	2	12	442292	442303	0 %	0 %	50 %	50 %	311063791
10360	NC_014638	TG	3	6	442333	442338	0 %	50 %	50 %	0 %	311063791
10361	NC_014638	CG	3	6	442348	442353	0 %	0 %	50 %	50 %	311063791
10362	NC_014638	CGA	2	6	442368	442373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063791
10363	NC_014638	CGT	2	6	442388	442393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063791
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10371	NC_014638	GCC	2	6	442659	442664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063791
10372	NC_014638	CG	3	6	442694	442699	0 %	0 %	50 %	50 %	311063791
10373	NC_014638	GCA	2	6	442731	442736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063791
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10387	NC_014638	CGC	2	6	443240	443245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063791
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10465	NC_014638	TGT	2	6	446365	446370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063794
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10469	NC_014638	TCA	2	6	446422	446427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063794
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10475	NC_014638	CTGG	2	8	446579	446586	0 %	25 %	50 %	25 %	311063794
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10478	NC_014638	AGC	2	6	446706	446711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063794
10479	NC_014638	GCC	3	9	446745	446753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063794
10480	NC_014638	GCA	2	6	446833	446838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063794
10481	NC_014638	TCG	2	6	446847	446852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063794
10482	NC_014638	GCA	2	6	446902	446907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063794
10483	NC_014638	CGA	2	6	446914	446919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063794
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10491	NC_014638	TGCA	2	8	447211	447218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10492	NC_014638	CGT	2	6	447232	447237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10496	NC_014638	GATCG	2	10	447374	447383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10497	NC_014638	GCG	2	6	447396	447401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10498	NC_014638	GACG	2	8	447409	447416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10499	NC_014638	TGC	2	6	447464	447469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_014638	CTA	2	6	447510	447515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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