MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 82625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014330	TCA	2	6	200209	200214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869821
6502	NC_014330	T	7	7	200235	200241	0 %	100 %	0 %	0 %	300869821
6503	NC_014330	TTA	2	6	200245	200250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869821
6504	NC_014330	CCA	2	6	200284	200289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300869821
6505	NC_014330	CT	3	6	200295	200300	0 %	50 %	0 %	50 %	300869821
6506	NC_014330	AAG	2	6	200424	200429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869821
6507	NC_014330	GAA	2	6	200453	200458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869821
6508	NC_014330	TCC	2	6	200475	200480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300869821
6509	NC_014330	AGA	2	6	200505	200510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869821
6510	NC_014330	TCA	2	6	200530	200535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869821
6511	NC_014330	T	8	8	200621	200628	0 %	100 %	0 %	0 %	300869821
6512	NC_014330	AAT	2	6	200649	200654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869821
6513	NC_014330	AAC	2	6	200682	200687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869821
6514	NC_014330	T	7	7	200692	200698	0 %	100 %	0 %	0 %	300869821
6515	NC_014330	ATAA	2	8	200701	200708	75 %	25 %	0 %	0 %	300869821
6516	NC_014330	T	6	6	200725	200730	0 %	100 %	0 %	0 %	300869822
6517	NC_014330	TAA	2	6	200756	200761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869822
6518	NC_014330	T	6	6	200764	200769	0 %	100 %	0 %	0 %	300869822
6519	NC_014330	TAA	2	6	200822	200827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869822
6520	NC_014330	TCA	2	6	200854	200859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869822
6521	NC_014330	ATTT	2	8	200865	200872	25 %	75 %	0 %	0 %	300869822
6522	NC_014330	T	7	7	200870	200876	0 %	100 %	0 %	0 %	300869822
6523	NC_014330	CT	3	6	201000	201005	0 %	50 %	0 %	50 %	300869822
6524	NC_014330	AGA	2	6	201006	201011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869822
6525	NC_014330	TC	3	6	201026	201031	0 %	50 %	0 %	50 %	300869822
6526	NC_014330	CCA	2	6	201035	201040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300869822
6527	NC_014330	AAT	2	6	201144	201149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869822
6528	NC_014330	TAATT	2	10	201213	201222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_014330	ATT	3	9	201220	201228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_014330	AAT	2	6	201229	201234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_014330	T	6	6	201296	201301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_014330	T	6	6	201312	201317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_014330	GTT	2	6	201318	201323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_014330	CGC	2	6	201332	201337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_014330	ATA	2	6	201378	201383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_014330	TAA	2	6	201397	201402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_014330	ATT	2	6	201408	201413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_014330	ATTT	2	8	201434	201441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_014330	TAT	2	6	201457	201462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_014330	ATT	2	6	201475	201480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_014330	TGC	2	6	201529	201534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869823
6542	NC_014330	TTC	2	6	201579	201584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869823
6543	NC_014330	CAA	2	6	201585	201590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869823
6544	NC_014330	GTA	2	6	201605	201610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869823
6545	NC_014330	TCA	2	6	201620	201625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869823
6546	NC_014330	AT	3	6	201641	201646	50 %	50 %	0 %	0 %	300869823
6547	NC_014330	AATA	2	8	201697	201704	75 %	25 %	0 %	0 %	300869823
6548	NC_014330	AAT	2	6	201757	201762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869823
6549	NC_014330	T	6	6	201787	201792	0 %	100 %	0 %	0 %	300869823
6550	NC_014330	AAC	2	6	201856	201861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869823
6551	NC_014330	CTT	2	6	201894	201899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869823
6552	NC_014330	GCAA	2	8	201922	201929	50 %	0 %	25 %	25 %	300869823
6553	NC_014330	CAT	3	9	201981	201989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869823
6554	NC_014330	TCA	2	6	202049	202054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869823
6555	NC_014330	GTC	2	6	202114	202119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869823
6556	NC_014330	TA	3	6	202164	202169	50 %	50 %	0 %	0 %	300869823
6557	NC_014330	AGC	2	6	202264	202269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869823
6558	NC_014330	AGC	3	9	202303	202311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869823
6559	NC_014330	CAT	2	6	202455	202460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869823
6560	NC_014330	AAT	2	6	202461	202466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869823
6561	NC_014330	TTA	2	6	202481	202486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869823
6562	NC_014330	TTTG	2	8	202531	202538	0 %	75 %	25 %	0 %	300869823
6563	NC_014330	T	6	6	202566	202571	0 %	100 %	0 %	0 %	300869823
6564	NC_014330	TTA	2	6	202586	202591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869823
6565	NC_014330	TG	3	6	202724	202729	0 %	50 %	50 %	0 %	300869823
6566	NC_014330	AAT	2	6	202751	202756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_014330	AT	3	6	202769	202774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_014330	ATA	2	6	202781	202786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_014330	A	6	6	202793	202798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_014330	TA	3	6	202832	202837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_014330	ATC	2	6	202926	202931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869824
6572	NC_014330	TTTCCT	2	12	203065	203076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869824
6573	NC_014330	TAT	2	6	203099	203104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869824
6574	NC_014330	AGA	2	6	203127	203132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869824
6575	NC_014330	TCT	3	9	203237	203245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869824
6576	NC_014330	ATC	2	6	203292	203297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869824
6577	NC_014330	ATTTT	2	10	203365	203374	20 %	80 %	0 %	0 %	300869824
6578	NC_014330	ACC	2	6	203500	203505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300869824
6579	NC_014330	ATA	2	6	203522	203527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869824
6580	NC_014330	ATC	2	6	203724	203729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869824
6581	NC_014330	AT	3	6	203744	203749	50 %	50 %	0 %	0 %	300869824
6582	NC_014330	TTA	2	6	203789	203794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869824
6583	NC_014330	GTA	2	6	203815	203820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869824
6584	NC_014330	GTA	2	6	203848	203853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869824
6585	NC_014330	CTATAG	2	12	203864	203875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869824
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6587	NC_014330	CAG	2	6	203921	203926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869824
6588	NC_014330	CT	3	6	203994	203999	0 %	50 %	0 %	50 %	300869824
6589	NC_014330	CAT	2	6	204083	204088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869824
6590	NC_014330	T	6	6	204105	204110	0 %	100 %	0 %	0 %	300869824
6591	NC_014330	CTTA	2	8	204153	204160	25 %	50 %	0 %	25 %	300869824
6592	NC_014330	ATC	3	9	204180	204188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869824
6593	NC_014330	AGT	2	6	204309	204314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869824
6594	NC_014330	TAAA	2	8	204354	204361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_014330	ACTAA	2	10	204403	204412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6596	NC_014330	TTA	2	6	204431	204436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_014330	T	6	6	204442	204447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_014330	A	6	6	204455	204460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_014330	A	6	6	204466	204471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_014330	TAAA	3	12	204509	204520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_014330	TCA	2	6	204587	204592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869825
6602	NC_014330	TCTT	2	8	204593	204600	0 %	75 %	0 %	25 %	300869825
6603	NC_014330	CT	3	6	204634	204639	0 %	50 %	0 %	50 %	300869825
6604	NC_014330	TAG	2	6	204647	204652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869825
6605	NC_014330	TC	4	8	204722	204729	0 %	50 %	0 %	50 %	300869825
6606	NC_014330	T	6	6	204735	204740	0 %	100 %	0 %	0 %	300869825
6607	NC_014330	TCT	2	6	204757	204762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869825
6608	NC_014330	TTC	2	6	204770	204775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869825
6609	NC_014330	CAG	2	6	204800	204805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869825
6610	NC_014330	TCA	2	6	204824	204829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869825
6611	NC_014330	CCG	2	6	204838	204843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300869825
6612	NC_014330	AT	3	6	204846	204851	50 %	50 %	0 %	0 %	300869825
6613	NC_014330	ATTTC	2	10	204866	204875	20 %	60 %	0 %	20 %	300869825
6614	NC_014330	CTA	2	6	204920	204925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869825
6615	NC_014330	ACC	2	6	204960	204965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300869825
6616	NC_014330	ATA	2	6	204968	204973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869825
6617	NC_014330	TCAGTT	2	12	204994	205005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300869825
6618	NC_014330	TCT	2	6	205006	205011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869825
6619	NC_014330	TGT	2	6	205017	205022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869825
6620	NC_014330	CTT	2	6	205150	205155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869825
6621	NC_014330	GT	3	6	205159	205164	0 %	50 %	50 %	0 %	300869825
6622	NC_014330	ATT	2	6	205186	205191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869825
6623	NC_014330	TAC	2	6	205212	205217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869825
6624	NC_014330	AT	3	6	205273	205278	50 %	50 %	0 %	0 %	300869825
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